EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-01104 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr1:144926680-144930580 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:144930019-144930030CTAATTAATAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:144928098-144928116GGAAAGAAGGAAAGAAAA+6.33
IRF1MA0050.2chr1:144929296-144929317AAAGAAAAAGCAAAAGAAAAG-6.15
NFIL3MA0025.1chr1:144929113-144929124TTATGTAACGT+6.32
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.13
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.1
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.15
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.16
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00089chr1:144920722-144935091Adipose_Nuclei
SE_02777chr1:144927291-144928120Astrocytes
SE_02777chr1:144928561-144933593Astrocytes
SE_03153chr1:144927381-144928053Brain_Angular_Gyrus
SE_03153chr1:144929095-144933474Brain_Angular_Gyrus
SE_04539chr1:144925659-144934489Brain_Anterior_Caudate
SE_07393chr1:144926819-144933846Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07793chr1:144927003-144934899Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18717chr1:144921453-144938014CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_25738chr1:144924693-144933482DND41
SE_26266chr1:144920766-144933796Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27974chr1:144920641-144928497Fetal_Intestine
SE_27974chr1:144929716-144933812Fetal_Intestine
SE_28939chr1:144920546-144928637Fetal_Intestine_Large
SE_28939chr1:144929130-144933757Fetal_Intestine_Large
SE_38811chr1:144927061-144933285HUVEC
SE_45013chr1:144926640-144933471NHLF
SE_45547chr1:144921475-144934798Osteoblasts
SE_48047chr1:144930173-144934034Psoas_Muscle
SE_51073chr1:144925786-144934585Skeletal_Muscle
SE_55722chr1:144923321-144933760u87
SE_63039chr1:144924738-144942083Tonsil
SE_63706chr1:144927180-144928854HSMM
SE_63706chr1:144929163-144933352HSMM
SE_64855chr1:144928560-144933682NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1144927217144927550
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120551chr1144925161144933968
Enhancer Sequence
AGGAAACTTT ATAAACTAAC CATCTGATCC AATCCTATTT TACATACAAG GAAATGGAAA 60
CTTAGAGAAG TAATTAGTCC AAGGTTTCAT GGGAAATCAG GAAAAAGATC CAATTAAACT 120
GAACTGGATT TCCACTCAGG TTGGGAATGT ATCTCTCATT TCTATAAACC CATTGCCTAC 180
CATAATGCCG GGAATACTGC AGAGATCAAA AGTTTTTGTT TAATGAACAA ATAAGAACAA 240
TAAAAACAAA CAAAAACGAG CCTTTAGTGG CTCTCTTAGA AATAAGACTG TATATAACAT 300
ATATTCGAAC AGCAACTTTA AAGCCAAAGA ATGCCACAGG AAAATACATA ATGTATTTGA 360
ATCTCATATG AATCAATCTT GACATGAATA ATAATAAGAA ACCTCTTTTT CTATAAATAA 420
TGTACTGACC TAAAAGTTGG AAGATATTTG TTTCTTCTTT ATTTGTAATA ATTTACTATT 480
TTGCATCTCA GAAAAATGTC CTTGCAGGTA ACAGTCTGCT GAAAGAGCAC TTAGCAAGTC 540
CCACTAAGCC AACAACATAA TGAATTCTTG TGAAGTATCA AGTACATAAA ACAGTCACTC 600
CTACAATGAT AGTGTAGCCC ATGAAATAAG TAATACCTGA TTTGGTAGAA TCAGTGTTAC 660
TCTCTAGACA CTCAGGTACT AAAATCATGT GGAAATGATA ATATAATTTT AAATTAAGTC 720
ACTTTTGACT CAGAATTAGG ACAAAGGCTT TCCAGTATCA GAAAAGAGAA CCGCTTCCAG 780
GCCTAGTGTT GCACAATATG AGACTTTTTT TTAGGCTAAG GCCAGTTTTT AGACTTTTTG 840
TGTTAACAGC AGTTTTCTTG GCACTTTCTA GTCCTCACAG TAGTGAGTTA TAGATCTCAA 900
ACTGCTATAA TTGTCAACCC TATTGTTAAT AATAGGAGAC AGACAAGAAC CATTGACTAC 960
CATAAAATTA AAGGCCTAAT CTTTTACCAG CATCTAATGC CAACATCTTC CAAAGGGCCT 1020
GATCCACTTC ACATAACTAA AATAAGAGTG GGATAAATTT ACCATAGTCA CAAAGGAGCA 1080
GACCTTGGCA TTGCAAGGTT TAAGGCAAAG ATCTTCTGTT CTTTGAATTT AGATAGAAAG 1140
GGAAATTGCA CATGGGCCAG AGCTCATTGC TGTTTACTAA GGGACCACAT CCCTCCCATC 1200
ATAGCTTTTC TAGTTCAGGG CCAGACAATA AAGAAGGGAA TTACCAGCTA GAAGAAGGCT 1260
TCAAACCTTT CTTTAGATAT CTGAACAGCC TTAGGTCCTC ATACATAAAT TCTGTAGAAG 1320
GGAAATAAAT TACTTTGTAT AATATCAGAA TATCAGTAAG CAGAACTACA CTGTTGCTAT 1380
TTTTCTTTAA TAAATAAGAA AGGAACAAAG AAAAAGACGG AAAGAAGGAA AGAAAAAAAA 1440
GAGGAAAAGC AATCAGGAGG AATCCTGATG TCAATATTTA ATAGTGCATA AAATATGGTA 1500
AGTGGAGGAT TAAACAAAGG AATCAAAATA ACCTTACAGA ACAATCTTGC TCTTTAAGAT 1560
AAAAGGTTTT CTCCATATTT GTGGCAGAAC TGAACTAAAG GAAACATTTT TTTCTTTCAT 1620
GGTTTCGTGT TTCTACAAAC TAAAAAAGAG AACTACCAAA AAAAATTATA TTATTTCTAT 1680
TCTTTCCATA TTTGTTCAGA GAAATAGACA AAAACCAGTC TGCCATTGTC CCATCTAGCA 1740
CTGGTTTTGT CATAAGGCTC TTAAGGAGCT TAAAAGTAAC CAGATTTAAA CAATAGATAC 1800
ACCGCCCATT TTATTTACAA ACATGTTGGG CCCAATTCAT CTATTTTCCC TGACATCCTA 1860
AATTATTAGA GAAAATGGCA TAATAATTAA ATGCCACATT TCTTGAAGCT GAATGACATT 1920
TTCTCCCACC TCCTAATTTT TGTTTTTCTA GAAACAGTAA ACAATGTAAG TCAAGTCACA 1980
GCAGAAAGGT CATACACTAC CATCTTAAAG CTCTAATGTC CAAATTTAGT GAAGTAAAGG 2040
GACTTGACCT GAAGATACAG TTACCATAGT TTATATGTGT TCATTCAGAT GACAATTTTT 2100
TTCACATAAT CTCTAAAGAA TCCTCCGAGC ATCCTTAGGT TAGAGAAAGA GGGCTCCTGG 2160
TTTAAAATAA GTACTTACTT AAATTAATAT ACTTCAGACA ATGGGGTTTA ATGTATAGAA 2220
TTAAAGTGTC TTGCCTGAGA ATGGTCAGAA ATCTTTGTCT CTGCATGGGC TACGTTAGTT 2280
AAACAAGGAA CTTTCCATAT CTCCAAATTG AGAGACTGCC TGAAGATGAT CTTTAAAATC 2340
CTTCTCCACT CCAAAATCCA GTCACCAAAA TATAGTATTT TATTTAAATA CGGAGAAAAA 2400
AAGATCTTGT TTTGGCTGTT ATTTTCTCAG TCTTTATGTA ACGTTCTACA ATATTGGTCA 2460
TATTTGGTGG CGGGCTGGGG GGACGAGTTT ATTTCCCATC CATCCTGGCC CAACTAATTT 2520
TAGACCCTAA TATGAAAACA CCATGTTTAA TTTGTAACAC CTATGTCTAG TCACAGAAAT 2580
ACTGTAAAGC CCAAATTTAG CTGCGAGGCT CCACTGAAAG AAAAAGCAAA AGAAAAGAAG 2640
TACACAGTGT TAAGCATACA GTGCTTAACA TTTTATACAA AATGAAAATG CACTGACTTT 2700
TTACCTTTCA TGACACTTTC ATCTATGCTG TTTCTCATCT ATGCTGCTTC TCATAATTTT 2760
GTGTAAATTT AAAAACTTTT CTCCTGTTTT CTGCTTAGGT TCTTATTGTG ATAGACAGTA 2820
TACATACCAT AGAACTACTT TCCAAAAATT TCAAGTGGCC ATCAACAATG TCACTTATCA 2880
AGCTCTAAAT TTCTGGAATG ACGTTGACCA GTAGCAGGCT TTCTAAAAAA TGCCTTCTAG 2940
ATCACATCTA CCTTTGTGAC AGTATTGTTA AATAAGTTGT ATCAAGTGGA ACATGCCAGA 3000
ATGTTTCACA AAGTTTATTG AAGCTAGCAT TTACTGTTGC TATAGAAACA AACTACCATA 3060
GTTGAATTTA AAAGGTTGGT ACAGAATCAA TTGGGCAGAC ACGAATAGCT CAAATTAAGC 3120
AATTAAGAAT TCAAGACTAT AATGAATGAA ACTCTCCTCT GATCCAATAA TGGGTTAATC 3180
CTTTCTTAAT ATCAAATATC TTCCAGTAGA ACTCAGTAGA GTTCTGGCTG TGAACAGTTT 3240
ATGCCTTAAT CTTTTGACTG ACAATACTGT ACTTGAATAC TTGAATTCCT GTCTCTTTTA 3300
TGAATGAGTC ATCACTAATC CTCAAATGAA CTATTAATTC TAATTAATAT GGTCCAGATG 3360
TTATAATACT TTACTGGTGG ATTAATAGGC TTTCCCCAAA CCTTTTACCT TATGCTCTAA 3420
TCATTTACAG GCATTTTGCG GATGAAGGCT TTAATGCTCC AGGAAGAACT AACTAGAGAA 3480
CTAACTGCCT TACAGAAAAC CATTGGGAGG AAACGTCTAT AAATCTGAAA ACAAGAACAA 3540
ATTTTAAAAG TTGGAAAAAA AAAAGAGGTA AGAGGAAAAG TTCTAGTGCC AGAAATGAGA 3600
TTAAATGTCT TCTTTTTATA GGAAAAAAGT GAAGTAGGAA TCTTTACCTT TTTGTTTTAA 3660
AAGGTATACA ATTTTGATAA TGGGAAAGTC AACAGATTTT ACAAAAAGGA TTGTGAAAAT 3720
CAAATTATCT GAGTGCAAAT CACGTTTACT AAATGAGACA GAGCAAAAGG TGCAGCAAAA 3780
ATGGGGTCAT GACTAATTTT CTCAAGTCCA GAATATTTCT AACCTCCACC TAGACCGAAA 3840
TCACGTGAAG CCAGAGGCCA GCTAGCTATA ATCAGAAAGG CACTATGTAG CCGTTTTGTA 3900