EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-00313 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr1:27050620-27053050 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr1:27051370-27051381TTTGATACATT-6.02
FOSL1MA0477.1chr1:27052625-27052636CATGAGTCACT-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:27052104-27052116TTTATTTTTAGA-6.07
MEF2CMA0497.1chr1:27052103-27052118TTTTATTTTTAGAAT-6.5
Nkx3-2MA0122.3chr1:27052441-27052454TTTAAGTGGTTCA-6.33
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09344chr1:27047193-27052209CD14
SE_09344chr1:27052587-27056819CD14
SE_11056chr1:27046750-27062864CD20
SE_13430chr1:27049071-27051485CD34_Primary_RO01536
SE_14400chr1:27052579-27055546CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18323chr1:27047608-27051992CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18323chr1:27052742-27061755CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr12705140027051697
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I026721chr12704820627052084
Enhancer Sequence
AAATTGAAAG CACAAGGAGT AATAATACTT AAATGTCCAA AAGCCAAGGT TATAGCTCTA 60
GGTTTACACT AGCCCCAACT AGTTAGCATT TAGGATGATA AAATGAGTAG TGGTCAAGAC 120
TTCTCCTCTC TGATGGACAC CTTTTTGGCA GCTCCTGGCC CAACCCTCTC TGTTCTTATT 180
CTTGCTGGCC CTTGGCACTG TTGAGTACTA AATTTAGCTC CTTAGGGTTG CCGCCTGGTC 240
ACTTCTTTCT ATTTCCTTGG ATTGGAACTG GAGCTTTCCT CAGTTGGACT TTTATTTAAA 300
TAAAATTATG AAGTTTCTCT TTCCTGGTGC CACTGCCACG GGTGGTACAT TTTTGTGAAT 360
GGTATATCTC TGCTTAGAAG TTTTGAGTTC TTGGCTCTGT CTTCTCTGCT CTCTCCTCGG 420
TCATGGTCAG ATGGAGAATT TGCAGCTATT TTAATCTGTG AGTTTCACAA AGTGGTTACT 480
TTGGGTTATA AGACATTCAG CCCAGGTCTA CCTTAAAAGT CTAGTCTGTT ATTTCAGCCG 540
TTTTTGGGGG TCATTTTGGT TTTCCTTGAT GCAATAAGAA GTTGTAAGAG GTTCCAGTAG 600
CCAGCTAGTC TGGAGGGTCT TGTAATTCTA TTGGCTTGGA GCAGGGGAAC TCCCTATGCA 660
AGGGGTCTGT CTGCTAGCTG TTTGTTCTGA ATATATTCGG AAGGACAAGC TGCTAGGCAT 720
CCTTGCCTTT GATGCCCCTA AACTGCATCT TTTGATACAT TTCATTTGGC AGGCAGTTTA 780
TAACATGGCC AGTGATCTGG AAGGAGGTGG TAAGTGGTAG ATGGAGATGA GGAGTTTTCT 840
TATGGCTCTT TCCCCCTTTT TTATTTTTAT TTTTTATGAA TGCAGGAGAG TATATAGCAG 900
GGGGCCCGAC TTTGCTGATC AAGGGGCAGC ATTTTCCTCT CAATTATGTG TCTCTGTGGC 960
AGAGCCTTTG CTTTTGAAGT GTAATCACAG TAATCTACTC CTGTGGTTTC CCATTGAAAG 1020
GATTTCCTCT GTCTTTCCCA GAGTGGAATC TCTGGCTTTT TGCAGCTAGG GTTTGGAGTT 1080
TCCATCCCCT GCCTTGTGCC TGCAGACTGC TGATACTGGC TTTTGTATCT TGCATGTAGG 1140
GATTTTTCTG GTCTGAAATT GCTACTTTCC AATAAAACTG ATTAGTGAAT ATTTAAGGCC 1200
CCTTCTCTGT TACGAGAGAT TGGGAGATGG CATTTCATCT GTAACTGCAA ATCACAAATA 1260
TTTCACGATG GTTTTAAATG TCATAAGTGT GAGTTATGTC CCTGCTCACC TCCCCTTCTG 1320
ATTTGAGCAG ATGTCTAACT TTTACATGAG ATCAGAATAA TCTGATTGTT TGAACTGAAT 1380
ATATATTTAG TTTGCCAAAT AAGCTGCATA TTCTGTTGAT CATAAGCCTT TTGTGATGGG 1440
AGGGAGTCAA AAATCTGACG ACCAGAAAAA GAAAGCATAT TAATTTTATT TTTAGAATAA 1500
AAATTTCTTT GATGTACATT TATTTTTGGT CTACAAAGAT TTCCTAAAGT TGAGGTGGGA 1560
CATTCCTTGA ACCCTTTATA GCCCCCATGT AAGTAGCTGT ACTCAATTGG GAGCGCAGGC 1620
CTCCGTGTGA GAGAGGAAAA GGTGACTTGT CCTTAGCCTT TTGTTTTTAA GCAGTGTATA 1680
TGAGGATGCC CCTGCAGTTC TGAAATTCTC TCTGGTATAA ACCTTTTTTT TTTTTTTTTT 1740
TTTGAGACAG AGTCCCACTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC GGTGGCACAA TCTCCGCTCG 1800
CTGCAGCTTC TGCCTTCTGG GTTTAAGTGG TTCACCTGCC TCAGCCTGCT GAGTAGCTGG 1860
GATTAACAGG CGTGCGCCAC CACGTCCGGC TAATTTTTGT ATTTTAGTAG AGACGGGGTT 1920
TCACCATATT GGCCAGGCTG GTCTGGAACT CCTGACCTCA AGTGATTCAC CTGCCTCAGT 1980
CTTCCAAAAT GTTGGGATTT ACAGGCATGA GTCACTGCGC CCAGCCTTGG GTTTGTTTTT 2040
TTTTGTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACAGAC TCTTGCTCTG CTGCCCAGGA TGGAGTGCAG 2100
TGGCTCGATC TCGGCTCGCT TCAGTCTTCG CCTCCCAGGT TCAAGTGATT CTCATACCTC 2160
AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA CTTATAGGCA TGTGCCGCCA CACCCAGCTA ATTTTTGTGT 2220
TTTTAGTAGA GATGAGGTTT TGCTATGTTA GGCAGGCTTG TCTCCCAACT CCTGGCCTCA 2280
AGTGATCCAC CTGCCTTGGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCGTGAG ACACTGCGCC 2340
CAGCCAGGTT ATTCTTAAAG TGTGCTTGTT CTCCCTTGAA TATTCTCATC CTTCTTTCTC 2400
ATCTTTCACT TCAGTCCAAC TTTTTTTCTA 2430