EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-00102 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr1:8519520-8522200 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs142472947chr18520488hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:8519840-8519852AAAAAAACAATC-6.44
ZNF263MA0528.1chr1:8521820-8521841GGAGGAGGAGGAAGAGGAGAA+10.13
ZNF263MA0528.1chr1:8521823-8521844GGAGGAGGAAGAGGAGAAGGA+10.17
ZNF263MA0528.1chr1:8521829-8521850GGAAGAGGAGAAGGAGGAGTA+6.43
ZNF263MA0528.1chr1:8521838-8521859GAAGGAGGAGTAGGAAGAACA+6.6
ZNF263MA0528.1chr1:8521832-8521853AGAGGAGAAGGAGGAGTAGGA+6.81
ZNF263MA0528.1chr1:8521835-8521856GGAGAAGGAGGAGTAGGAAGA+7.03
ZNF263MA0528.1chr1:8521826-8521847GGAGGAAGAGGAGAAGGAGGA+9.14
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8520929-8525113Adipose_Nuclei
SE_03947chr1:8520770-8521958Brain_Anterior_Caudate
SE_04978chr1:8519677-8527557Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07042chr1:8519863-8527416Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_54752chr1:8520897-8525539Stomach_Smooth_Muscle
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008459chr185196348526674
Enhancer Sequence
GTACCTACTA TGTGATGCAG TAGATACATT GTATCTATAT TTTGGGTTAA TGGCAAAGGT 60
TCCAAATGAA TTGTAAAAAT TTTCAAGTTA TAATTTCTTT AGAAAGATAA TTTCAATGTT 120
CTGACTCAAC TCACATGTAT GCAAACCTGT ACACATACGT AAGTTGACAA TGACATAAAA 180
CCACGTACGT ACATAAACAA AGACCAGAAG AGAGCAAGAA GCCAGCAAAT GAGACGATGA 240
AGCCAGACAC TGTGAGACGA CGTGTTAGTG GTGAGGTTTT AAATTCCCTT TAATGATTTT 300
AGGATGTTGT TCTAACAATA AAAAAAACAA TCTGCACAAA ACCCTAAAAA GAATAAGAAA 360
GTGAAAAGGT TCGTACTAGA TGACCTACAA GACTCTCCTA TCATCATTTT TGAATGACTA 420
CATAAAATGG TCAACAACTC TGGAAATTTT ACCATTCCTA AAATAAATAT AACTAACCCT 480
TCCCCTATAT TGTGGATGTA AAATTTTAAA ACAAAATCAC CAAGATTATT AGTATCTGAA 540
ATCCACGTAA CCATAACTAC AAGCTCTGAG AGCCTCTCTC CCTCTTTGTC ATTGTCCTCC 600
TTGCTGTTTT CACCTCCACA ACCTCCTGCT GCTATTGGAT CTTAACGGGG ATTTTGCTGT 660
GAATTCCATT TTCCTCAGCT GCCATGCAAA CAGTAAATAA AATTCATTGT ATTTTTGCCC 720
CACTAAGCAG CCCCGTCTTC TGGCACATTC AGATGCCTAG CTTGAAAAGA GTGAACAATG 780
AAAACAATGT TTTCTCAAGC AGACATTCCA AAAAGGGCAT AACAAAGGCA TCTGGAGATG 840
CTGCTGGGGA AAGACACCCT GCAAATAGTT GTGTGTATTC TGTGTAAGTA ATTCCTTGAC 900
CGGCCGCACG GGTTCACTGG ATTACAAATA TTTAGAAAAT TACTTTGCCA TCTCATGTCA 960
ATTTTGAAAG AAGGATTTTC ATTTATATTT ATGATAGACT GAGCTTTAAA TTGAAGGAAG 1020
ATTTAGATGT TTTAAAATTT ATGAGCTTGT AAATAAATCC ATGTACATGG CCAATTAAGG 1080
TTTATCACTA CCACAGATTA ACTATTTTTG GATAAAAATT TCAGAGCTTA TTTGTATCTA 1140
GATTGTTCAC CTCAATGTAT TACATCAAAA TTGATATAAA ATATTTAATG GGTAGTGTAT 1200
TTCAAGATAA AAGCTATAGT TACCCAAGAT GAAATAAAAA CACCCTGTAG TAACATGGTA 1260
AGCAACAGAA CCTTCACTTT GTGCAACACC TGGATTGTTG CGGAAAGCGA ATTCAACATG 1320
AAAATAATTT TAAAAACCAA AACGCAGCTA AGTGGATAGG AAGCAAAGAG TGAGATGCAC 1380
AGCTCACTGG AGCACCCAAT CTTACAATCT TGCAAGTCAA ACCAAACTCC ACAAGGAAAA 1440
TGCAGGCCCT GAATTTTAAA AAGAATTCAA TTAGCATCCC CAGTATTTCC ATAATCAACA 1500
GCTGAATGCT AATTAAGAGC ACAGCATCAA GCGGCAACGG AATCCCAGTG CAATAAGCAC 1560
CAACACAACA GCAGCAAATG CTACCTTCAG CTCGCATGCA TAAATAAACA GAATTAATAA 1620
CCACCCAAGC ATGGAAGGGT GACTTAATCT GTTTCGATTA GGTGCAGTTC AGCCTGGGGC 1680
CTTTATGTTA TATTTGAATG TGTTCATCAT GTTTAATTAA AAACCTAATA ATCTAAGATT 1740
TGTTTTGTTT GGGTTTTTTT TTTTAATGTT TTAATCTCTA TTTCCTCCTC TTTATCTTCC 1800
TAAGTTCTAC CAATCTGGAT GACTTCCTGA AAAGGAACAG TATTTTTAGC ATAATATATG 1860
TGAAATTGAT TAACCATCAA TGTAACTCTC AGAGGCAGAA GGCAGCCATT TACTTTGGCT 1920
CCACCCTTAC CCATACCTTG GTATTTAAAG CTTCACAAAC TGACCTAGCA TTTCTTCCAA 1980
AATGCTTCTC TGATCAAACC AAGTTTACTT AGCCTGAAAG ACATGACCCA GGTGTTGCTC 2040
ACAGACACTC GGCAAAAGCA AAATTAATTT GCAGTATCCG GTACAGAATT TGACAGAAAC 2100
TGGCACATTT TGGCTTCAGT TCAAGATTTG AAGTGTCTCA GCCCCAAAGC AACTTCAATT 2160
AGGAACATCA TACACGCACA CTGTCAGAGA AATAAACTGA GAGTTTGAGA TGAAAGGCCT 2220
CCTATTGTGT GATTCTGAGG TCTAAGATCT CCAGAATTCA TGATTATCTG AAAGACCTAG 2280
GAAAAAGAGG TCAGGTGATA GGAGGAGGAG GAAGAGGAGA AGGAGGAGTA GGAAGAACAA 2340
GAAGAAAGAG TTTAATGTGT GAGCTTTTTC CAAAAGTACT TTTATTATTA TTATTTTTTT 2400
TGGAGACAGA GTCTTGCTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGCCATGAT CACGGCTCAC 2460
TGCAGCCTCT AACCCCTGGA CTCAAGCGAT TCTCCAACCT CAGCCTCCCA AGTAACTGGG 2520
ACTACAGGCA CATGGCACCA TGTTCAGCTA TTTTATTATG TTTTTAATTT TTTTGTGGAG 2580
ACAAGGTCTT GCTGTGTTGA CCAGGCTCCA AAAGTAAAAT TTTTAAGGTT GGTTTCTGAG 2640
GCATGTAAAA GTTTTTCTCT TTAATGTGCT GATTCATAAC 2680