EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS037-24090 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC 
Coordinate
chr3:9444180-9446720 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr3:9444890-9444901TTTGATACATT-6.02
DMRT3MA0610.1chr3:9445365-9445376TTTGATACATT-6.02
Lhx3MA0135.1chr3:9446099-9446112TAATTAATTATTA+6.18
ZNF263MA0528.1chr3:9444745-9444766GGGGGAGGGGCAGGAGGTAGG+6.63
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00468chr3:9433413-9448423Adipose_Nuclei
SE_02635chr3:9443428-9444609Astrocytes
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SE_10033chr3:9446127-9447164CD14
SE_11428chr3:9430401-9445147CD20
SE_11428chr3:9445717-9455110CD20
SE_13428chr3:9443462-9445577CD34_Primary_RO01536
SE_14820chr3:9435756-9445558CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21174chr3:9443698-9445569CD8_Memory_7pool
SE_23692chr3:9444164-9444867Colon_Crypt_1
SE_23692chr3:9446259-9446665Colon_Crypt_1
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SE_26409chr3:9446025-9447249Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28273chr3:9436665-9445284Fetal_Intestine
SE_28273chr3:9446072-9447206Fetal_Intestine
SE_29321chr3:9436462-9445452Fetal_Intestine_Large
SE_29321chr3:9446017-9448093Fetal_Intestine_Large
SE_29846chr3:9443925-9445208Fetal_Muscle
SE_32110chr3:9444127-9444885Gastric
SE_32970chr3:9439344-9444760H1
SE_32970chr3:9444791-9446038H1
SE_36121chr3:9439434-9445120HMEC
SE_36121chr3:9446172-9448422HMEC
SE_40035chr3:9443588-9445450K562
SE_43142chr3:9444424-9444925Lung
SE_45129chr3:9443776-9444477NHLF
SE_46177chr3:9435338-9445215Osteoblasts
SE_50889chr3:9443962-9444883Sigmoid_Colon
SE_53276chr3:9443828-9444858Small_Intestine
SE_53276chr3:9446243-9446815Small_Intestine
SE_64403chr3:9439315-9445235NHEK
SE_64403chr3:9446095-9448184NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr394444009445331
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I009406chr394458859446084
GH03I009404chr394462859447084
Enhancer Sequence
TCTGCTTCTT GGAGTAATGT CTTAGTATTT TTAAAACACT TAAGTTTTTA CATCAGGCCA 60
GTTTTGCCTG ATGCTCATGT CTGTTGCTTT GGTTGGGCTG CTGCTTTCTC TTCTGTGTTC 120
TTATGGGTTC GTTGTGGTAT AAGGATTCCC ACAGCTTTCA TGGCAGTATG AAGTAATGAG 180
AAGCATTGCC TTAGCCATGT TAGTTACATG TATACTTTTG GCCTATGTTA TGAATCACAA 240
AAAGCGGTAG CTATAGGAAT GTATACAAAA TAGATTTCTG TCTGGGGAAT CAAGTTTTTG 300
ATTTGTGCTA CCTAATGGAG GGGAAAATGC TGAATTTCTT GCTGCTCTGT TTGAGAAATA 360
GATGGAAGCA TGGGAGGAGC CAGAGACCTC TGCAGCAGGA TTTGGTCTAA GTAGAAAAGG 420
AAGATTTTTG TTTCAAATTG CCAGCTGCTT ATGTCAGACT GACTCCCTTA TTATGCCTCC 480
AGTAGGCCTG TCAATATGGC CAAACAGCTA GATAAGTGCG GGGCAGGACA AAGGGCTCTT 540
TGCACAGCAG GGAGGCAATG TTGGTGGGGG AGGGGCAGGA GGTAGGAAAG GCAAGAGGAG 600
GAGGTTCTTT TCCCTGGGAG ATTATTCAGT TTGGCATACA ATTAAAGAAA TCATTTTTAG 660
TTCCCACTCA AGCATTGAAT TTTTGCCAAC CACATACTAT TAACCCCAAA TTTGATACAT 720
TTCAGAATAT CTTGTAGGGA TCCATTCTCG CCAAGGAAAA ATAAAAAAAT AAATAAAGCT 780
CTGTATAGGT TAAAATAAAA TAAATCCCAC ACTCTGCACC CTCCTAGGTG CAAGTCACCT 840
CCCGAGGAGA CCCGTTCTAG AGCTGAATTC TCATTAAGAA ATGGAAAAGA ATACTCTATC 900
TGAATAAAAA CACATTGTAA TACAATGTGT TTATTTGGGT TGGGATTGGA CCTGAACATG 960
TAGAATAATT TGTTTCCCTT TATGAAATAG TTGCTCGTAG TTGTCTACAA TTTTATTTCA 1020
TTAAGATAGG TAGCACATTA CAGCTTTCAT GTGTTGGGTT GCCATATGTA AAATGCTAAC 1080
TGAAGAAAGG CTACTTTTTA ATTTCAGCCT CATCCTTAGT TCCTGGAGAA CCTGATATTT 1140
CCTGGAGATT ACTCCCTCCC CCACCTTTTA GTTTAGGCAA CCTCTTTTGA TACATTTGTG 1200
TTCAGCTCGC ATACAAGTGG GATAGTTGCA TCCAGTTTAT TAAGACTTAG TATGAATCAT 1260
AGAGTTGGAA AAGATCTGTT GGTTATCTGG TCCTTTAAAC CAAAATCATA ATGAAATATT 1320
TTGAAATTTG GGTCCCTATT GAAGTTTTCA TTAAAATGTT AAAGGATCGG TGTTCTGAAC 1380
AACATTTTTA GTTACTTTTA AAATAAATGT TTTGCGTCAG TTCTTTTTTT AAAAATAAAG 1440
AATTTCATTT ATAGGCAAAT TAGCTGGCAA TTATTTGAAT TGTGATAGGA TTTCTCTTTT 1500
ATGAAGGAAT ATATGACAAG GTTTTTCAAA ATGCTTAATA TATTTTAAAA GACTTTAATT 1560
TTTAGAAATA ATTGGTTTGA ACAGTTTTCC AAGAGCACAT TTGTTGCTTG GGTTGAGGTA 1620
CCACCTATAT TGCAATGTTA CTAAACTAGC CTTAAAGTTT TCCCTTCTGT CTATACTGCA 1680
TGCAACAATA AAGGGAACTG GAATGTTAAT TTCCATTTAT GGATTAGCAG AGGAGATGTT 1740
TTAACCGATT AATAACCAAA AAACTGCCTT TCGTACACGT AATATTAAGC AAGCCTGACC 1800
AAGTTTTGTG TTATTTCTCT CTGTTAAAGA AAACTGGATG TGTTACTACT TAACATTATA 1860
TTGTTATTTA ATGGTCTTGG CAGTAATGAT ATAATATTTC GACCAAAAGA AATTTTGAGT 1920
AATTAATTAT TATTGTAATT AGTTGGAAGT TTCTCATCAG TAAAATAGCA ACAGCATTAA 1980
CACAAAATCT AGTGAGCTAT ATTTTATATT ACTACAGAAA TTTAGGGTAG TCATTTCTTT 2040
CTTTATAATT TATTCACATG GATTATTTCC ATAAATTTGT GGGACTAAAA TAGAAGCCAT 2100
CTAGTCAAGC ACCAGTCTCC ATACCAGACA GTTTTCTCTG CATGTGCTAT GACCCACATT 2160
GCCAGTATTA AACATCCTTT ACACCCTCCC CCTTCCCAGA TAATTAGAAA TCTCTTCAGG 2220
GTAGCTTCCA TTGCTCCTAT TACCTGGATC TTGCTAGAGG CTCTAAGAAG TTCCTGGTAA 2280
AAGTGAGACA GTAAGGGACC ACATTTTGAT TCCAAAGGTT TTGATAACTG TTAGGGCTCC 2340
CCAAACAGCT AATCTCATTT TCACCAAGAC TTAGCCAGCA GAGGGCTGGA ATGGAGGTGA 2400
AACACAAGCA CTGTACCTCA TCTTGCCTGT GCAGCTGCTC CACCTTATTT CCTGCTATTA 2460
TTATCTCACA ACGCCTCCTC CCATCAAAAA GAAACTAGGA CAAAGGGGGA AAATTGGATG 2520
GGCTAATGTG ATTTTTATTA 2540