EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS037-18035 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC 
Coordinate
chr19:39177710-39181230 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr19:39180298-39180313AGTTAATTTTTAATT-6.49
NFE2L1MA0089.2chr19:39179695-39179710ATATGACTCAGCAAT+7.68
NFYBMA0502.1chr19:39180631-39180646CACCTGACCAATCAG+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39177830-39177845TGAACTCCTGACCTC-6.22
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT+6.02
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 58             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39172709-39178176Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39180666-39181982Aorta
SE_05805chr19:39172836-39178090Brain_Hippocampus_Middle
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39179003-39180338CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39172843-39178692CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14624chr19:39179374-39180514CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39173158-39178239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_25779chr19:39179417-39180269Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39172863-39178234Esophagus
SE_26525chr19:39179021-39179809Esophagus
SE_26525chr19:39179873-39180389Esophagus
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_31384chr19:39172828-39178145Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39172846-39178074HUVEC
SE_40018chr19:39179218-39180516K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_40594chr19:39179201-39180442Left_Ventricle
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_42097chr19:39179722-39180563Lung
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39177919-39179043NHDF-Ad
SE_44161chr19:39179045-39180304NHDF-Ad
SE_44797chr19:39179102-39179721NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39172970-39178180Right_Atrium
SE_50056chr19:39172842-39178237Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39179021-39180428Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39179204-39179729Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51705chr19:39179740-39180298Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39179735-39180329Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39177711-39178272VACO_400
SE_56725chr19:39178407-39179038VACO_400
SE_56725chr19:39179083-39180391VACO_400
SE_56725chr19:39180720-39181485VACO_400
SE_58038chr19:39179862-39180220VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39179071-39179729HSMM
SE_63494chr19:39179752-39180316HSMM
SE_64225chr19:39179057-39180305NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193917865339178869
chr193917903439179144
chr193917945139180013
chr193917950339179787
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CTCTTGCCTC AGCCTCCTGA GTATCTGGGA TTACAGGCGT GTGCCACCAC GTCTGGCTAA 60
TTTTTCTGTA TTATTAGTAG AGACGGCTGG TCTCTACTAA TAGTTCAAGA CGGCTGGTCT 120
TGAACTCCTG ACCTCAAATG ATCCACCTGC CTCAGCCCCC CCAAAGTGCT GGGATTACAG 180
GCGTGAGCCC CTGCACCCAG CCCCTCTGGT TCTACTGAGA CCTCAGATCT TTCATTTATG 240
GAACAAGGGG GTTGGATTAG ATTGTTCGCT CTCAGCCCTC ACTTCATGTT AGACTCACTA 300
GGTGGACTTT GTCAAATGTC ATTGCCCAGG GCCCACCTTG AGGGAATCTG TCTCATTTTG 360
CCTGTGGTGA AATTCAGGTA TTTTTAAAAA GCTCCCAGGT CCCATACATC TATTGTCAAT 420
TGATTTTCAA CAAGGGTGCA GGACCATTCA ATGGGGGAAA GAATAGTGTT TTCAACAAAT 480
AGTGCAGGAA CAACTATTAA TAGATACCCA TCTGCAAAGA ATGAAGTTGA ACCTTTACCT 540
CACACCATAT ACAAAAATTA ACTCCAAACG GATCAGATAC CTAAATGTAA GAGCTAAAAC 600
TGTAAAACTC TTAGAAGAAA ACACAAGTGT AAATCTCATG ACCTTGGGTT AGGCAATGGT 660
TATTAGATAT GACAGCAGAA ACACAACCGA AGAAAAATAG ATAAATCAGA CTGTTTCAAA 720
ACTGGAAACT TTTTGCTTCA AAGGACACTA TTAAAGTAAA AGGACAACCC GCAGAATATT 780
TACAAATTGT ATATCTGATA AGGGTCTACT GTCCAAAATG TATAAAGGAC TCTTAAATTC 840
AACAGTAAAA AGACACACCA GTTAAAAATG GGCAAAGGAT TCAAATAGAC ACTTCTCCAA 900
AGAAGATCTA CAAATGGTCA ATAAGCACAT GAAAAGGTGT TCGATGTCAT TACTAATTAG 960
GGCAAATCAA AACCATAACC ACTACAAATG GTCAATAAGC ACATGAAAAG GTGTTCAATG 1020
TCATTACTAA TTAGGGCAAA TCAAAACCAT AACGTGGTTG GGCCTGGTGG CTCATGTCCA 1080
TAATTCCAAC ATTTTTGGAG GTAGAAGTGG GAGGATGGCT TGGGGCCACG AATTGGAGAC 1140
CAGCCTGGGC ATCATAGTGA GACCCTGCCT CTACAGAGAA TTAAAATAAA AAATTAGGCC 1200
GGGTATGGTG GCTCATGCCT GTAATCCTAG CACTTTGGGA GGCCGAGGCG AGTGGATCAC 1260
CTGAGGTCAG GAGTTTGAGA CCAGCCTGGC AAACATGGTG AATGAAACCT TGTCTCTACC 1320
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA ACCCACAAAA ATTAGCTGGA CATGGTGGTG GGCGCCTGTT 1380
GTCCCAGCTA GTGGGGAGGC TGAGGTGGGA GAATCGCTTG AACCTGGGTG GGAGAGGTTG 1440
CATTGAGCCG AGATCACGCC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAGGGTGAG ACCCTGTCTC 1500
TAAATAATAA TAAAAATGAG AAATTGGCCA GGTGTAGTAG CATATTCCTG GGAGGCTGAG 1560
GTGGGCAGAT TGCTTGAGCC CAGGAGTTCA AGGCTGCAGT GAGCTATGAT GACACCACTG 1620
TACTCCAGCC TGGGCAACAG AGTAAGACCC CAACCCTAAA ACAAAAAAAA ACAGAAAACC 1680
ACAATGAGAT ACCACTGCAC ACCCACCATG ATGGCTATAA TCAGAAAGTC AGATAATAAG 1740
TATTGACTAG GATGGGAGAA ATCAGAACCC TCACATTGCT GGTCAAAGTG TAATGTGGTG 1800
CAGCTTCTTG GGAAAACAGT CTGGCAGTTC CTCAAAATTT AAACATGTTT TGTATTTTTA 1860
GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTCACCCAG GCTGGTCTTG TCTCAGCCTC CCAAAGTGTT 1920
GGAATTACAG GCATGAGCCA CCACGCCCAG CCAAGTTCCT CAAATTTTTA AATATAAGAG 1980
GTATCATATG ACTCAGCAAT TTTACTCCTA GGTATATGCC CAAGGCAGTT GAAAACATGT 2040
CCACATAAAA CTTGTACATG AATATTCACG GTGGTGCTAA TATCCAAAAG ATAGAAGCAA 2100
CACAAATAAT GCCCATCAGC CAATGAATTG ATAAATAAAA TGTGGTATAT CCATACAATG 2160
GAATGTTATT CAGACAGGAA CGAAGTACTG GTACATGCTA CAACATGGCT GAACCTTGAA 2220
AACATGCTAA GGAGAAGCCA AACTCAAAGA TCATATACCA TATGGTTCCA CTTATATGAA 2280
ATGCCCAGAA TAGGTAAATT GCAAGAGACG AAAGAAAGGT AGGTTAGTGG TTGCCAGGGG 2340
CTGGGGGCTG GGTAGGAGGG AAGTGGGGTT GGAGAGTAAC TGTACCAGTT TTGCGGTGGT 2400
AGACATGTTC CTTGTATTTT TGGTTTTTTG TTTTGTTTTG TTGTTTTGAG ATAAGGTCTC 2460
ACTGTCGCCC AGGCTAGAGT GCAGTGGCGC TGTCATAGCT CACTGTAGCC TCGAATTCCC 2520
AGGCTTAAGT GTTCCTCCCA CCTCAGCCTT CTGAGTAGCT GGGACTACAG GCAAGAGTCA 2580
CCATACCCAG TTAATTTTTA ATTTTTTTTT TCTTTTTCTT TGAGATGGAG TCTCGCTCTG 2640
TTGCCCAGGC TGGAGTGCAG TGGCGCGATC TTGGCTCATT GCAACCTTTG CCTCCCGGGT 2700
TCAAGCGATT CTCCTGCCTC AGTCTCCTGA GTAGCTGGAA CTACAGGCGT GCGCCACCAT 2760
GCCCGGCTAC TTTTTGTATT ATTAGTTAGA GACGAGGTTT CACCATGTTG GCCATGAGAG 2820
ACAGGACTAG CTGGATTTCC TAGGCCGACT AAGAATTGCT AAGCCTAGCT GGGGAAGGTG 2880
ATCGCACCCA CCTTTAAACA CCGGGCTTGT AACTCAGCTC ACACCTGACC AATCAGGCAG 2940
TAAAGAGGGC TCATTAAAAT ACCAATTAGG TTAAAAGCAG GAGGTAAAGA AATAGTCAAA 3000
TCATCTATCA TCTGAGAGCA CAGGAGGAGG GACAATGATT GGGATATAAA CCCCAGGCAT 3060
TTGAGGCGGG AGTGGGCCAC CCCCTTTGGT TCCCCTCCCA CTGTATGGAA GCTCTGTTTT 3120
CACTCTATTA AATCTTGCAA CTGCACACTC TTCTGGTCCA CGTTTGTTTT GGCTTGAGCT 3180
GAGCTTTCGC TCACCATCCT TCACTGCTGT TCACCGCCAT CACAGACCCA CTGTTGACTT 3240
CCACCCCTCC GGATCCAGCA GGGTGTCTGC TGCATTTCTG ATCCAGCGAG GCGCCCATTG 3300
CTGCTCATTC GGGCTAGAGG CTCGCCATTG TTCCTGTGCG GCTCAGTGCT CGAGTTTGTC 3360
CTAATCGAGC TAAACACTAG TCGCTGGGTT CCATGGTTCT CTTCCATGAC CCACGGCTTC 3420
TAATAGAGCT ATAACACTCA CTGCATGGCC CAAGGTTCAA TTCCTTGGAA TCCGTGAGGC 3480
CAAGAATGTT AGGTCAGAGA ACAAAAGGCT TGCTGCCATC 3520