EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS037-18033 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC 
Coordinate
chr19:39155630-39158980 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr19:39157345-39157356TTAATTAAAAC-6.14
MEOX2MA0706.1chr19:39157553-39157563AGTAATTAAC+6.02
SOX10MA0442.2chr19:39157759-39157770GTCTTTGTTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr19:39156780-39156801TCCATTCCCTTTTCCTCCTTC-6.44
ZNF263MA0528.1chr19:39156784-39156805TTCCCTTTTCCTCCTTCCTCC-6.81
ZNF263MA0528.1chr19:39155888-39155909TCCACACCCACCTCCTCCACC-6
ZNF263MA0528.1chr19:39157573-39157594GGGGGAGGGGGTGAAGGAGAA+7.56
Number of super-enhancer constituents: 75             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39152475-39162940Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39152638-39159265Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39152471-39162993Aorta
SE_02393chr19:39153944-39159110Astrocytes
SE_02946chr19:39155086-39157682Bladder
SE_03166chr19:39153782-39156800Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39156876-39159036Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39152487-39159178Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39153820-39163196Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39137791-39163220Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39152418-39159241Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39152344-39163078Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39152357-39162990CD14
SE_13194chr19:39155958-39156682CD34_Primary_RO01480
SE_13194chr19:39156987-39159064CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39153767-39159377CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39153578-39156671CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14624chr19:39156755-39158872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39155160-39156072CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19537chr19:39156360-39159158CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39154025-39159199CD56
SE_20865chr19:39154299-39156301CD8_Memory_7pool
SE_20865chr19:39156686-39158406CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39154161-39159169CD8_primiary
SE_23062chr19:39153787-39159013Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39155479-39156334Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39156445-39157671Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39158513-39158952Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39155438-39156212Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39156323-39158180Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39138146-39159498Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39151219-39159772Esophagus
SE_27614chr19:39137681-39163004Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39147858-39163235Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39152459-39161422Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39153668-39161967Gastric
SE_34299chr19:39156593-39157741HCT-116
SE_34681chr19:39154095-39159230HeLa
SE_35812chr19:39151229-39162882HMEC
SE_36926chr19:39137778-39163235HSMMtube
SE_38012chr19:39153914-39159481HUVEC
SE_38896chr19:39153790-39159154IMR90
SE_40018chr19:39153934-39156156K562
SE_40018chr19:39157500-39158261K562
SE_40594chr19:39152445-39163189Left_Ventricle
SE_41601chr19:39155516-39156427LNCaP
SE_41601chr19:39156502-39157518LNCaP
SE_42097chr19:39152460-39159813Lung
SE_44161chr19:39153875-39159192NHDF-Ad
SE_44797chr19:39154153-39159187NHLF
SE_45660chr19:39153677-39159204Osteoblasts
SE_46686chr19:39154904-39158101Ovary
SE_46686chr19:39158510-39158977Ovary
SE_47108chr19:39136358-39164169Panc1
SE_47461chr19:39153806-39158493Pancreas
SE_48075chr19:39152482-39161384Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39152466-39159169Right_Atrium
SE_49449chr19:39155511-39157647Right_Ventricle
SE_50056chr19:39152482-39159167Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39137722-39163232Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39154051-39159183Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39152479-39159130Small_Intestine
SE_53291chr19:39152528-39163195Spleen
SE_54534chr19:39152596-39161466Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39156918-39157346Thymus
SE_55638chr19:39157659-39158272Thymus
SE_56336chr19:39157103-39158786u87
SE_56725chr19:39153774-39159133VACO_400
SE_57359chr19:39155511-39157683VACO_503
SE_58002chr19:39153735-39157662VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39153763-39159204HSMM
SE_64225chr19:39154092-39158984NHEK
SE_65266chr19:39153703-39158125Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39153706-39158870H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr193915626639158933
chr193915598039156191
Enhancer Sequence
GGTTAGCTGA TAGCACCCAG CCTACCCACC AAGATAGGAG GCAGCTCAGA TGTCACTGGG 60
ATTCGCAGTA CCACAGGCTG TCCCTGGGCC CAAGCAGTTA GCTAGCTGCA CCCCGGGAGG 120
GGGTGTTGAG AGCACTGAAG CTCCTGTGGG AGAGTGCCTT TGACATCCCC CACTCCCCAC 180
TGCCCAGAAC TAGGAGGTAG TGAAAGGTGT CAGTGGCAAG AAGGCTGGGC CAGAGCATGG 240
AGGGAGGCCG ACCTGGGCTC CACACCCACC TCCTCCACCA CCGGCTGGCT GTGCGACCCT 300
GGGCAGGTGG CGGGGGTTAA GCCTCAGTGT CCTTCTTTGA AAAGGGGCAT CATCCTATCC 360
TCAGTTTGAG GATTAGACGT GATAGTGCGC AGGAAGCACT CTGGTGCCTG GTACATTGTA 420
AGTGCTCAAT AAATGCAGCT TCCCAAAATG ATTTCAATGG CACATGGTCC TGCATCCAGG 480
TGGGATCTGC TACTTGAGTC TCCCCCTCAA AGGGGCCTGC TGAAATACGC AGCTCAGTGG 540
GAAACCAAAA CATACACCCC TTTCCTCCAG TGCTCCCCAG GAAGCGCCAA GTCCTGAGCC 600
CAGCCAGCAA CTTCGAAGAA GTGCCCTCCA ACAAGTGGCA GTGGGCACTT GAGCAAGTGA 660
CTTAACGCAG CCCTCTCCCC AGCCCCTGCA TCCATCTGGG CCTCATTATC TGGGAGGTGG 720
CTTCTTGTTT CAGAGTTACA GGCCCTGAAC AATTTTGTGT TGGGATGTGC CATAGGCAGT 780
GCCAGGAAGG TTCTTTCATG AGTAATTTAA CTTGTTACTA AGTTTGCTAT CAGCCGGGGG 840
GCTCTTTCCC CGGGTTCCCT TCTTTCCCTG GGTCCCCTTC CCCGCAAAGC AAAGTCCAAC 900
TCAAGTTAGA AACATCCCAC AGCCTGGAGT CAGGCTGCCC TCTCTTCAGT TGGTGTGTGA 960
TGTAGAAGCA GGAAGGGCTT CCCACTGATA ACCCTAAAAA TAACTGCCCA GAAATGCTGT 1020
CAGATGGGGC CAAGAGGTGC ACAGGAGCCT GTGCCCAGCT GCCGACCTGG AACGTGGGAC 1080
TTTCTAGAGG GCTTGGAGGA GCCCTGCCCC TTCCAGGCCT CTTCCCAACA GTGCTTCTCA 1140
CGCCTGCTGC TCCATTCCCT TTTCCTCCTT CCTCCCGCGC CCCCCCCTTT CCTGGGGTCA 1200
CTTCCTGATG CCATTCTTCA ACTTCGCCCC TGTCCCCCCC AAAAGCAATC AAATCCACAA 1260
CCTAATAAGG CAAAAGAATG AGGAGAATGT CCGCCTCCCA GCCTCTCCCC TAACAGGGTG 1320
CAGGCCTGAA GCAAATTTGG AAAATGTTAC AACGGAGTGA CAACCGATGG GGGCTGGGGG 1380
TGGGGCGGTG CAGCCTTGTT CAGGAGCTGC CCATTGTTGG CCTGAGGCAG GACCCTAAGG 1440
GAAGGCCACC CGGTTTGCGC TTTCCTGATC AGGCTGTTGA CACCCTTCTA GCACAAGAAA 1500
ATGTATGGAA AGTAACTGCC TGAGTCAGCT GCATCTCCAG TTGTGGGATC CACGTGCCAG 1560
GAGAACACGA AGTACACACA GGTCCGCAGT GGGAGCCCGC TCGGAGACAC CTCCCCGCCA 1620
TCACGGCTGG GACTGTGCAT ATCCAAACAC TTCTTGCCTC TGAGATGAGC AGTTTTCTTC 1680
CCCTTGACTG TGCCAGGGTT CAATTAGCCT GGGCATTAAT TAAAACTTGT CAACACTTAG 1740
AGTGGGGCCC CCAGAAATCT GTCACCCCTC CTAGATCATT ATCCCAGGCT AATCAACCCT 1800
CTCTAAGGCA GTTTCCATTC TTGACTTAGT GGGAGGGAGG AACAAGCCCC TCGGTGCTGG 1860
GGAGCTCTGG GGGAGGTAGG GACTGACTGG GCCCAACCCA CTTTGTTTTG GAAGGTCAAG 1920
CTTAGTAATT AACCTGAATG CTTGGGGGAG GGGGTGAAGG AGAAAGAACT GAGTCTAGGG 1980
ATGTGCCAGG TCTTTCAAAT TGCTAATTAT CAGCGAGCAT GAGGTCATCC GTAAATATAT 2040
CTAATTCTTT AGCTTGTAAT TAAGGTGCTC ATTAAAAGTG CAGGGAAGTC TTGTTTTCCT 2100
AAAAGGGGAA AAAAACAACA ACACAAAAAG TCTTTGTTTT GACCTGACAC GATGGCTCAG 2160
AACAGGGGGA GGACTCAAGG CACAGGACTA GTTTCCTGCC TTAAAGAGCC TTTACAGGAA 2220
ATTGACTGCA AACAGTATTG GTGACCCTGC CAAGGAGGCA AACCTAGGGT GATGTCATTG 2280
TTCGAAGCTG TCACCGCCAA GCCTCTGGCC TTGGGGCGAG GAGAGTTGGT GGGATTAAAA 2340
AATGAGTGTG TGTATGTGTG TGTGTGTTTA GCAGTCTCTA AAGAGGCGAG TCAAGGGAAA 2400
ATCCTAGCGG GAGAAAAATC ACAAGGGGTG GGGGGTGTCT CAGAAATATT CTTAGCTGGG 2460
TTCAACTTTC CTCGTTTTTC TAAGTTTAAA AAATCCTCTC TTACTATTTT TGCTCATCAA 2520
AATGCTGCTG CTTTTTCAGA GACAGCCTTT TTTGAGCCAT TCCCTATTTA GTGTTTTGGG 2580
TAATTGGCTG TTACAGTATG GAATTTGTGG CCCAAAGGCA GCGTGGTAAG TTAGACACTA 2640
GGTGCACGGT GCCCCATTGT TATGAAGTGT GGAAACTGAG ACGCTGGACT AGTCTGATGT 2700
ATCTGTTTCT TCCACCAAAA AAAAAAAAAA ACCATTTTGG AGAACTACCC AATGCCAGTG 2760
ACTTGGCATC TCTGAGTCGC TAATCTTCCC ATGTGCCTCC AGGAACCGTC TGGAGCGTCC 2820
CTGAAAAAAG GACAAGGTTT GTATCTTGTC ATTTTTCCTC TGGCTGGAAG TCTAAGAGGT 2880
ATAAACACAG TCTTAAAATG AAAGCAACAA AAATAAACTC AAAGCAGCCC TGCGTGAAGG 2940
CATTAATGCA AAATATGCAA GCTGGCTTCC TATTTATACG GCGGAAGGCA GTCAGAAGAG 3000
CCAGGCCTGG TTAAGGAAGG AGTTATGTCT CTGGAGGTGC CTGTTCCTTA GAATTACAAA 3060
TAAACCCTGG GTGATTACTC AGATGAGGTT GTAATGTGGT GTCTCATTTC ATGCTTTGCA 3120
CAGTCCAGTT TCTTGATGGA ACCAACGGCC TCTGAAATGC TAATGCAGGA TCAGGATACA 3180
GTTAGAGTGC CCCCCTTCCT GTGCCCCTCC TAACATCCTA ACAGCTTTAG AAGGAAGTTT 3240
GAAGATTAAA CAGGAGAGCC ATGTAAGTTT CCTGTGATCC TAGATCCTGT GATTTGTTAA 3300
TATTCTTTCT CTTCAATCCA CCTGACATTT ACCCAGATAC CATATTAGGC 3350