EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS034-02067 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ECC-1 
Coordinate
chr1:159891480-159893220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6427499chr1159891917hg19
rs2789422chr1159892088hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr1:159892832-159892845AGCAGCTGTTTCT+6.28
Tcf12MA0521.1chr1:159892831-159892842CAGCAGCTGTT-6.32
YY1MA0095.2chr1:159892039-159892051CAACATGGCTGC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159887204-159896462Aorta
SE_02391chr1:159891163-159896016Astrocytes
SE_09609chr1:159888811-159896163CD14
SE_10233chr1:159889294-159896142CD19_Primary
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_11910chr1:159890466-159896330CD3
SE_12862chr1:159890202-159896191CD34_Primary_RO01480
SE_13325chr1:159887045-159896510CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159890274-159896187CD34_Primary_RO01549
SE_14513chr1:159890132-159896515CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15769chr1:159891344-159896220CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15949chr1:159891339-159896140CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16460chr1:159890826-159896099CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16913chr1:159890317-159896307CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17500chr1:159889525-159896840CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17880chr1:159889025-159896700CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19597chr1:159888663-159896506CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20057chr1:159890184-159896627CD56
SE_20849chr1:159889345-159896337CD8_Memory_7pool
SE_21561chr1:159891197-159896204CD8_Naive_7pool
SE_22506chr1:159889745-159896593CD8_primiary
SE_23567chr1:159891451-159896346Colon_Crypt_1
SE_23939chr1:159892115-159896031Colon_Crypt_2
SE_25013chr1:159890918-159896336Colon_Crypt_3
SE_30108chr1:159891067-159896091Fetal_Muscle
SE_31985chr1:159891083-159896707Gastric
SE_34858chr1:159890807-159896516HeLa
SE_36438chr1:159891272-159896570HMEC
SE_38165chr1:159890321-159896029HUVEC
SE_40207chr1:159890880-159896228K562
SE_41182chr1:159890906-159896421Left_Ventricle
SE_42315chr1:159887173-159896572Lung
SE_44957chr1:159891221-159895990NHLF
SE_47692chr1:159891560-159896059Pancreas
SE_48986chr1:159891201-159896458Right_Atrium
SE_49778chr1:159891574-159893172Right_Ventricle
SE_50509chr1:159888888-159896553Sigmoid_Colon
SE_52604chr1:159889149-159896485Small_Intestine
SE_53483chr1:159887801-159896526Spleen
SE_55434chr1:159890662-159896015Thymus
SE_58180chr1:159892507-159896090VACO_9m
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159890244-159896649NHEK
SE_65431chr1:159891110-159896368Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1159892447159892988
Enhancer Sequence
ATACACAGGA GGGTTTCTTT AACTTCGTTG GAGGAGCTTG ATTAGCAAGA ACTGGGTGGT 60
TTCCCGACCA ATGGCCTGAG TTGGCGGACC TCACTGTGGC AGTGTGTTCC CACCACACTC 120
ACCACCTGGG TCTGACACTC AGGGGCTGAG CAAGACCCGG GCATGGTATG GATGCCAAGG 180
GGAGCCAAGA ACCAAGAATG GGCCACAGTC CCCATTTTCT GTCCCATCCC CACCCTGGTT 240
TGGCTTTTCT CTCTTCTCCA AAACAGAGCT AGCTGTCAGG CTGCTCACGA AAGGGGACCC 300
CCAGGACAGG CATCTGCGTT CAAGGGGAAG AAAGAGAGCC ACCCCTTCTA ACCACATCTG 360
GCTCCAGGCC AGGTTGGCCT TCAGGGATGA AGTCACTCCA GCTCCCCCTC TCCCACACAC 420
CCAGGTTAAA CAATCCCGTC ACCCCCTCTC AATGGACCTT GGGGCTCTGC GAAATACAAG 480
GGGACCAGCC TGCCTCAAAC CCTCAACACC TCTCGGCCGC AGAGGCTGTG TCTTGGGCCA 540
GTCCCTCCCG TCCCGACTCC AACATGGCTG CTCCTTTTTA CCCCAGCTTA TCAAGCTGCA 600
CATTTCCGGC AGATCCTCCC CTAAATCAGT TATTTTTAAA CCTCATTAAG AGCAACCCGC 660
CCCCTCCACT TCCCCCAGCC CGAAAGCTGG GCCAGATAAA TGTCAGTCTG GGCCCCGACC 720
CACAGCGCCA GGCACACACA CCATCAGCTT GGGGAAGGCA GGCGGGGTGG GGTGGCTGAG 780
TTCTGAGGAG AAACCAAGAG AAGCATCCCT GCCCTTCCCA GAGGCCACTC CACCATAGAA 840
ACCTCTAACC TCTGATGCAC AGGGGAATGG CTGGAAGACA GGTAGGAAGA GGAAGGGGCT 900
AAGAGCTACT ACCACCAGTA AGCCCCCTTT CCGCAGCCCA GTTCCAGACC TCTCTCCTGG 960
GAGTGGCTGT GCTCAGGGCT GTTTCCAGGG ACCAAGTGGC CTGAGGCTCG GGGATCACCA 1020
TGGCACAGGT AAAGAAAGGG CAGGAGAATG ATTAACCTAG ACACTGGGGT TAAGAGCAGA 1080
GAGAAAGGCC TGAAGCCAGA CACTTCCAGT GCCCCCCAAC CCCCCAAGGC AGGACAAACT 1140
TGGCCTCCCA GACCCACCAC TGGGTGGAAA GTGGATGCTG AGGAACCCCC TCCACCGCCC 1200
AACGCTGGGG CCTGGACACA GCTGGCAGGG TCACGGCCTC CAGCTGCAGT GTATCTGCTC 1260
CACTCTGGGG CCATTGCCCT CAAGCTCTGA GGTGCCAGAG CCATAGGGCG GGGTCCTGAG 1320
AAGGGGCAGT TCCAACCAGG CCAGGCCTGG TCAGCAGCTG TTTCTCTTCC CCACCCCCAC 1380
GGGCAGGCAG AAGCTGATGG GCTGCGGCTG CTGGAGCTGG GAAGGCCCAC CCTAGGGACA 1440
CCCAGGGGAC CTGCCCCTGC CTTCCCTCAA ACATAAAGAA AACAGTAAGC AAGTTGCCTA 1500
CCAGGGTGAG AAGAGATATG CCCAGCTGGA AGACAGGTGT GGGGGACCCC CAGAGCTGGG 1560
GACCCCAAAG GAAGGTGACA GCTGAACAAC CTGGGGGATG GACTGGCAGG GAGCAACCTA 1620
AACCCTAGCG CTACTGCAGC TGTGAGAACA ACCCTCACCC TCACCCTGGA GTTACAATAG 1680
GCGGGAAACG GGGAGGGGCC ACGCAAGGCA CTCGGCCCCA CCCAGACCCT GGGCTGGAAG 1740