EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS031-17345 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Denditric_cell 
Coordinate
chr4:87951330-87953920 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:87952492-87952503TTAATTAAATC-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:87952489-87952502TAATTAATTAAAT+6
NR2F1MA0017.2chr4:87953249-87953262CAGAGGTCAAATG+6.25
POU2F2MA0507.1chr4:87953685-87953698ATATGCAAATAAG-6.57
Pou2f3MA0627.1chr4:87953683-87953699TAATATGCAAATAAGG+6.06
ZNF263MA0528.1chr4:87952599-87952620TTTTTCTTTTGTTCCTCCTCC-6.61
ZNF263MA0528.1chr4:87952602-87952623TTCTTTTGTTCCTCCTCCTTC-6.78
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00044chr4:87949652-87970431Adipose_Nuclei
SE_04495chr4:87950576-87954934Brain_Anterior_Caudate
SE_08128chr4:87950782-87956140Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_25899chr4:87949520-87955890Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27202chr4:87951703-87952753Esophagus
SE_28182chr4:87951720-87955276Fetal_Intestine
SE_29054chr4:87952887-87955752Fetal_Intestine_Large
SE_40923chr4:87949693-87952922Left_Ventricle
SE_40923chr4:87953044-87956575Left_Ventricle
SE_42369chr4:87949801-87952857Lung
SE_42369chr4:87952925-87955681Lung
SE_48291chr4:87949760-87952745Psoas_Muscle
SE_48291chr4:87953024-87953471Psoas_Muscle
SE_48846chr4:87949855-87952674Right_Atrium
SE_48846chr4:87953003-87953490Right_Atrium
SE_50046chr4:87950726-87954072RPMI-8402
SE_50812chr4:87951739-87952649Sigmoid_Colon
SE_50812chr4:87953609-87954762Sigmoid_Colon
SE_51125chr4:87947170-87964941Skeletal_Muscle
SE_53707chr4:87951314-87952803Spleen
SE_53707chr4:87953012-87953496Spleen
SE_53707chr4:87953642-87954935Spleen
SE_54652chr4:87949634-87962033Stomach_Smooth_Muscle
SE_61878chr4:87918796-87966556Toledo
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr48795137087951474
chr48795259587952845
chr48795169787952560
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I087028chr48794994187963049
Enhancer Sequence
CTAGTCCAGG GGTCAACAAA CCTTTTCTGT GAAGGACCAG ATGGTAAATA TTTTAGGCTT 60
TGCAGCCCAC GCGGTTTATG TTGCACCTAC TTAGCTCTGC TGTGGTGGGA CCAAAGCATC 120
CATAAACAAT ACGTAAGCAG ATGAGGATCA CTATGTTCCA ATGAATCTTT ATTTACAAAA 180
ATAGGTAGCT GGTCCAGATT TGGCCCATGA GCCATAGTTT GCCAATCCCT GGACTAGCCC 240
ATCCTTTTAT TTCTTGCTAA CTTTAAGGAA CATTTTAAAG TTGAAATTTA AAGATTGGCC 300
AGTGTTAAAT ATGAATGGTT AAAAAAATTC TCCCCCCTTT GCCGCTGGCA GTCTTACCCT 360
TCTTTAATTT TACTTACAAG TCTGAAACAC TGGTCTAAGC ATGTCAGGAA ATAAGCGAAC 420
AGTTTGGGGG TGGGAGTATG CAACTAAATA TTCGTTTAAA ACTTACACTG AGCTTTTTTT 480
TTTTTCTTCC CCGTTCCATT TCACATTGTT AATGTTGGCT CAGCAAACAG AATGATATGT 540
GGAAGTCTTG AAAACAGTGT AAAATCATTT GAATTAGGAG GTTAGGCCAG ACTTCACAGC 600
AAAGCTCTGT GTAACCAGCG TCCTGGTACT CTGTGCAGAC CCAGTGCTGA GTGACTCGCA 660
TTCCCAAGAT TGAGCCTCTT TTGGGCAATG AGGAGCAAAA GGGGTCTGGG AATGGTGATC 720
GGTTTTGTTT GTGTGATCAT CTGAGGCCCC AGTTGAGTGC ATTTGCATTC TAAACTCCCA 780
CATCCACACT CGGTTCATTT CCCGAAAACT GACAGTTTTC CACGTGCACA GTAATTTGAG 840
ATCGTTGTTT CAGGCTGAGG AAAGCCCACA GGCCGTTGTC TGGGGTGGGG GTAGGAGGGT 900
ATTGCAGGCT CTGAAAGATA ATTGAGGCAC TCCAGACCAG TGGAGTGGGT GGCTGCAAGA 960
CGTTATCGTC CCCACAGAGT ATCAGGCATG CTTTCGGACC CATCCTGTGA GAAATCTGAG 1020
TGGAGTAAGA CGGATGCAAA CACCCTATGG TGAATGATCA CTCCCCTACA AACTTAAGTG 1080
CTGTCTTGGG GCGGAGGCCT CTTTCTCTCT TGGAAACTTC TGCTCATCAT TCAAGATTCA 1140
GCTCAGATGT CCCTGTTCTT AATTAATTAA ATCACCCCAG GCTCCTCCAT TTAGAGTTCC 1200
TGTTTTTCTC CTTAGTCCTT TAGCACTTGT AATCAACCTC TACTATCACT CTTAGCATAT 1260
GTTTTTTTTT TTTTCTTTTG TTCCTCCTCC TTCATTTGTG TATCTCGCTA AATTGTGGAA 1320
TCCCTCACCT TTTTATCCCT AGGTCTAGCA CATAAGAGGA AGTCAATGTT TACTGGAAAT 1380
CAGGGGCTTT TCTGTTCTCA TTCTGTGAGG CTTACAACCT TGAAGTACAG AAAGCCATAG 1440
ATAAATGCAT TCCTGTTCTC AACTTTGACG TAAATAATAT TCAAAATACA ATTCTGTTTT 1500
GAAGAAATTA TTTTATAAAC AGGTCTTATA AAATATAAAT TGTCACAGTG TATCTGGTGG 1560
TAATGTTGAA TGTTTCCTTA TTGTTTACTT GCAGTGGATA TATTAGTGTC TGCTTTTCAG 1620
AGAGTAGAAA TGGAAACTTT ACAGCCTTAT CAAGAACTTA ACATTATTAA GGACTCTAAA 1680
AATTCTCAAG TGTATGTCTT TCTTAATTAC TTGAACTCTC AGATTCTAAT TTTTAGCGTT 1740
GGCTGAAGGT TAGAGGGATG CTTTAAGATT GATAAATACC TTTTGTTTTA TGCAAGTGAA 1800
CTGCCTATTG GTAGTGATGG TGAAAAGATG ATATATTCTG CATATAAATG TTGATAGCTG 1860
AGCCAAAATC CAGCCCAAAG AATCCTGACA AGCTTTGTAA GGCTCACAAC ACGGCTTAGC 1920
AGAGGTCAAA TGAAGGGAGA CTTCTGCAGA AAAACAATGA CTTACTGTTT AGCTTTAAGG 1980
AGATGCCAAT TATAGCGGGT AGTAGGAGGT GAGCTGGGGT TATGATGAAA ATGAGAATAT 2040
TTAGAAACAT GTAACTGTTG CTTGTTACCA TATAAAATAC CAATAGATGT TTCCAGCTTT 2100
CTTCTCCTAT AATAATCTCC CTGTTCTTCC TACTTGAAAT GTCTGTGGAA TGAAATGGAA 2160
CAAAATGAAA CTGCCTCTAG TTTTTATGAC ATTAAGCTTT CTTTCTGTAG AAACGAGTGT 2220
GGCGTGTGTA ATTAAATAAC CAAAGGGAAA GATAACCAAG ATCAAGATAT AAACAAAAGC 2280
GCTGATGGTT CTTTAAAAGC ATTTGTATGG ACAACTTATT CCTCCTTTTT TTGTTGTTGC 2340
TGTCTGCTTT GTGTAATATG CAAATAAGGT TAGGTATCTG CTTTGTAGTC CATGTGTTGT 2400
TTGCTAGGAG CCTAGAAAAA ACTTCTCAGT TGTAGGAATT TTGTCTCTTT TTATGAATGT 2460
GTCCACAGCA GCCTGTTTAA AATGTAATTG ACAGTGGTTT CTCCTTGTAG CAGTTGTTGA 2520
TTGGGGGGTT GGAGGATCCT TGACATTTAA TTTTGGATAT ACTCTCCCAT GATAGAATGA 2580
GCTTGAAGTG 2590