EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS030-00390 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CyT49 
Coordinate
chr1:20802270-20805170 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20803030-20803671Brain_Angular_Gyrus
SE_03446chr1:20803754-20804585Brain_Angular_Gyrus
SE_05163chr1:20802127-20814849Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20802438-20803173Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20803865-20804568Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_41848chr1:20804758-20805193LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
GGCCTCGGTT TCTTTGTATG TGAAATGGGC ATGATATATA GTTGTAACTG GCACACACCA 60
TAAACATGAT TCCTAGGGCT GCTGTGAGAA TTAAATAAGA AAATGTACAC GGAACACTTA 120
GCACTGTGGC ACATGACAAG AAGGCTATTA AGAAAATTTA AATAATGGAA AAAAAATAGA 180
ATACCGATAG TGATAACTGC GCACTCATAC AATGCCTTGG TTGCAGAGGT CATTCCCCCA 240
CATTACCTTG TGGGGTTTGA TCAGCAGTTC TGGAAGCACC TAGGGCAGGA ATCACCACCC 300
CAGGGTCACA GATGAGACTG CTGAGGTTCC CAGAGGACCC AAGCAGGGCT GCAGGTGCCC 360
TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT GCTCTCTGGT TCCGGAAAAG AATTCTGGGT GAAAGCGGGA 420
GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC CCCCAGGTAC CCCTGAGGTC TAACTCTGGA ACTCCTTGGA 480
TAATGAGAAA AGGGGGGCTT CGGAACCCAG GACGTGGGTT CCACATCCTG CGGGGGCAGG 540
GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC CAGACGCAGT AAATAATTCA CACAGATGAA CTGGAGATAA 600
GGGCGGCTTC GTGGAGGATC GAGTTCAGGT CGGAGGAGGC TCAGACGGCT GGGGGGACTT 660
GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA GGGGAAAATT CCTGGGACTC TGGCTGCCAG GAAAACACAG 720
TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT GCCACTCCCT GCCATTGGCG GGAGGGAGCT CCCCGGAACT 780
GCCCCGCGGG GCAACAGGCC TGGCCAGCCG CCTCCGCCCA GCCGTCCCCA TGGCAACCGG 840
CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA CGGACAACCG GATCCTCTGT CTCCCCTCCC CCACGGGAGG 900
CTGGGCGTCT TAGACTCCCA ACTGTGTTCT CTGGGAGCTT CCAGCTGCAG GAACCTACAG 960
AATCATCCTG TCTGACCCCC TCGTTTTATG GGAGTAGTTG AGACCACGGA CTCTGGGGAC 1020
CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG CCCCGCTCCA CCATTTCCTG CTGTAGGATC CTAGGCAGGG 1080
GACTTGGCCA CCCTGTGCCT CGGTGTTCAT TATCTGTAAA ATGGGGATGA TAATAAGTGA 1140
CTGTCTTATA GGGTTGTGAA AATTGAATGG ACTAAATGCA AAGAGGGCAG AGTGGTTACT 1200
GGTCTGTAGC CAGCACTGAG GAAGCATTAT TTTCCATGTT GGGAAGGTGA CGGTCACACA 1260
GCATGCTATT AGCAGATTTG GGATTGGAAT GCAGTTGCCA ATTCTTCCTA AAACACCCAG 1320
GGTGGCCACA TTGGGATTCT CCAAGGGTTA CCTGTGCTTC CTGCGGGCCC ACCCAACCCC 1380
CCTCTCTAAC CTCTTGACAG TCACAGTCAT TGAATTGTCT TTGACCAGGC AGTAAAATCC 1440
CTGAACCAGA AAAGGTCTTG CTCTAGCCAG CCCGGTCTCC CCAGTGCCAA GCACAAACCC 1500
GTTTCCTGCA CCTCCACTTT CCACCCCATG CCTGGTAGAG GAGTTGTTGA ATGAATATAG 1560
ATTTAATTAA TTAATTAGTT CATCTCCTCT ACCCAAACAC CCTCCCAGAG CAAGCTCCTG 1620
AAGCCCCTGG CCACCCAGCT CTCTCTCTTA CAGGACACCC CTTACGCTGA CCACTTCCTG 1680
CCATCAGCCC CCACCCCACC CCACTGCCAT CACCATGCTG TTCACAGTTC CCATGGCACA 1740
TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC CCTTCAGCCT GCCCTCCCTC ACTTCCCTCC CCGGTTAGTG 1800
ACCCTTTGTC CTCAAAATGG CTGTTTTGGG GTCAAGGACC CTCCTCCAGG TCCAGAGGTG 1860
TACATTTCCC CTGGGTTAAG GAAAAACCCT CCAATGTGAG AGGCAACAAA GTAAACCGTC 1920
CTCATCCCCC ATCCTGGGGG AGACAAATGG GGGCCTGGTA CTGCCACGAT GGGTGTAGGG 1980
GTAATCCAGC GGCTTTCTGG GACTCTCCAT CCCACTAGGG AGGTGGCAGG GGCTTTTGGA 2040
CGCAGAATCT CTGCCCTTAG GGGCCACCCC ACAAGCTCCA GCCCAGCTGC CAGGTTTCCT 2100
CGGATACGGC CCAGTCGCCT CTGATTTATT TTTGCATGTG GTTTGGGAGA ATCTCTGTTG 2160
CTGGAATAAC GACAACCTTT TTTTTTCTCT CTCTCTTTTC CTTCCCTCCA ATAGGCAGAC 2220
TTTATAAACC AGAGCAGCTG CCTGAAGGTT TCCAAGAAAA AAATTCTGCA CAGTTTCTAA 2280
CCAGGGTGAC AGTTCCCCTC CACAGGAAGT TACTTTTATT AATTTTTTTA TCTCTTCTTT 2340
TGTAAGACTA TATACTGGTC ATCAGGCAGC ACCTGTGGGC ATTTTCTTAT TTCCCCCCAC 2400
TGCTCCCATT TGCCTGGAAT TCATTATTAA ATCTAACTCA TAGTGGCCTT GCCCAACACA 2460
GGGGCGAAGT TCAAACTACT GAAAAATGGG TCACTCAAAT CGCCTGTGCA GAAGAATCCC 2520
AAATAATTTA TGGAGATACT CCTCCCTCAA GGCGGTGAAA CATAAATCCC TGTCCCTGAA 2580
GTGTGGGCTG TGCATAATGA TTTCCTTCTA TGGAGTATAG TATGGAAAGC AGGGGGAAAG 2640
AGTAATCTTG CAGGAGAGAA ACCTGACAAG CACTAGCTCA GCCAGATGGC CAAGGTCAAC 2700
ATCAGCAGCG ATCAGTCGTG TCTATAGCAT GGACACTTGA TATGATGTGA TGGAAACAGC 2760
ACATCACCCC CAAACCCATA ACCACAGTTG AACCATGAGA AAAACAGCAG ACAGACCCCA 2820
CCTGAGGGAC AGTCTACAAA TTACCTGACC AACAGTCCAT CAAAAGCAAG GAAAGTCTGA 2880
GAAACTACCA CAGCCAAGAG 2900