EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS029-00162 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CUTLL1 
Coordinate
chr1:12232370-12236020 
TF binding sites/motifs
Number: 43             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB3MA0638.1chr1:12235443-12235457CTGCCACGTCACCC+6.73
FOXP1MA0481.2chr1:12233024-12233036TTCTGTTTACTT-7.22
FOXP2MA0593.1chr1:12233025-12233036TCTGTTTACTT-6.32
GATA2MA0036.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.14
Gata1MA0035.3chr1:12232427-12232438TTCTTATCTGT+6.62
RESTMA0138.2chr1:12235219-12235240TTCAGGAGCAAGGCCAGAGGC+6.06
SP1MA0079.4chr1:12235246-12235261AGTGGGCGGGGCCTG-6.76
SP2MA0516.2chr1:12235245-12235262GAGTGGGCGGGGCCTGG-6.64
SP4MA0685.1chr1:12235244-12235261GGAGTGGGCGGGGCCTG-7.2
Stat4MA0518.1chr1:12233725-12233739CGTTTTCCTGGAAG-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:12234302-12234323TTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC-6.47
ZNF263MA0528.1chr1:12234206-12234227TTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:12234209-12234230TTCTTCTTCTTCTCCTTCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr1:12234212-12234233TTCTTCTTCTCCTTCTCCTTC-7.12
ZNF263MA0528.1chr1:12234215-12234236TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.13
ZNF263MA0528.1chr1:12234299-12234320TCCTTCTCCTTCTCCTTCTTC-7.15
ZNF263MA0528.1chr1:12234221-12234242TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234227-12234248TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234233-12234254TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234239-12234260TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234245-12234266TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234251-12234272TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234257-12234278TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234263-12234284TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234269-12234290TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234275-12234296TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234281-12234302TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234287-12234308TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234293-12234314TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234218-12234239TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234224-12234245TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234230-12234251TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234236-12234257TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234242-12234263TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234248-12234269TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234254-12234275TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234260-12234281TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234266-12234287TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234272-12234293TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234278-12234299TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234284-12234305TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234290-12234311TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234296-12234317TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00369chr1:12226565-12247198Adipose_Nuclei
SE_01471chr1:12232095-12234188Adrenal_Gland
SE_01471chr1:12234592-12236046Adrenal_Gland
SE_04546chr1:12232368-12233932Brain_Anterior_Caudate
SE_04546chr1:12234570-12236102Brain_Anterior_Caudate
SE_06521chr1:12231395-12234253Brain_Hippocampus_Middle
SE_06521chr1:12234379-12243644Brain_Hippocampus_Middle
SE_09154chr1:12224797-12249846CD14
SE_10696chr1:12231624-12233979CD19_Primary
SE_11902chr1:12231048-12236114CD3
SE_14553chr1:12231008-12236205CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15480chr1:12231304-12235464CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16369chr1:12231214-12235920CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16946chr1:12231228-12235850CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17650chr1:12231292-12241643CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17827chr1:12231021-12246713CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18389chr1:12226183-12250288CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19117chr1:12225970-12243644CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20048chr1:12231058-12236137CD56
SE_20873chr1:12231198-12236438CD8_Memory_7pool
SE_22347chr1:12226250-12242299CD8_primiary
SE_26251chr1:12232165-12234254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26251chr1:12234361-12236001Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27503chr1:12231615-12234368Esophagus
SE_27503chr1:12234497-12236079Esophagus
SE_30788chr1:12232018-12234343Fetal_Muscle
SE_30788chr1:12234469-12236114Fetal_Muscle
SE_32030chr1:12231844-12234207Gastric
SE_32030chr1:12234507-12236040Gastric
SE_38661chr1:12234401-12236100HUVEC
SE_41498chr1:12232230-12236136Left_Ventricle
SE_42336chr1:12231389-12236106Lung
SE_48967chr1:12232188-12234263Right_Atrium
SE_48967chr1:12234520-12236102Right_Atrium
SE_50250chr1:12231283-12234299Sigmoid_Colon
SE_50250chr1:12234498-12236097Sigmoid_Colon
SE_52522chr1:12231293-12236092Small_Intestine
SE_53313chr1:12231250-12236109Spleen
SE_55394chr1:12232096-12233341Thymus
SE_55394chr1:12233345-12234247Thymus
SE_55394chr1:12234547-12235437Thymus
SE_55394chr1:12235467-12236045Thymus
SE_61096chr1:12184746-12245090HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr11223360012234159
chr11223460012236012
chr11223507012235463
chr11223353112233800
chr11223380012234000
chr11223400012234197
Enhancer Sequence
GCTGTTTTAC TGGCTGTGTG ACCTGGGCAA GTCTTTCTAT CCCTCGGAGC CTCTGTGTTC 60
TTATCTGTAA AATGGGAGTA ATCCTAGCCT CACGGGCTGG CTGTCAGGAT TAAAAGTGCT 120
TTCTAATCCT GGCATTGGCA GCTATTTGAG CCATTGGTGG CTTTGCAGGT CTGACCCGAC 180
TCTCTGGGCC ATGGGGTGGT GCTCGGGCCT AGGTGGGGAC CCCTGTGGAG TCAGACTGTC 240
TGCTCTGAGC CCCAGGGCCC TGAAGCTTGG GTGGCAGCCC TGCAGTTGCC CAGAGTTCCT 300
GTCTAAGTGG CTTTGTTGCC CATCATCTCA GAAAGCAACT TCTTTCCTCC CTGCCTTTTC 360
CTGTCTGTGC TTCTGCCCCA GTGCCCCCTG GCTGGGCTCT CAAACCCACT GCTTGACAGC 420
CTGGTCTTAG GACACTGTAT TGTGGCAAAG GCTGTGGGGT CAGGATATCC CCTCCCCTCC 480
CTTTGCCACC CCTTTTAGTG AGTAACAGGT GCTGTGTGTT TTGGGGATGA GTGAAGGGTA 540
CATTTGGTGA AGCACAGAGA GAGTGCACAA GGCTTCAGTT TGCAAGATGG GCACGGGAAG 600
ATTCCAGGCC ATCTCCAAAA CCTCTTCCAT CTCCAACCTC TGTGCTGCTG AAGGTTCTGT 660
TTACTTGTGA CCCTGAGAAG GGGATGCCCT ATGGGGGCTC TTCTGAGATC ATGCTGTCCA 720
TTTTCCTGCC TCCAAGTGAC TTCTAAGACA GCATGGCTCT GAGGAAGGAG CACTGACTTG 780
GGTGTTGGGA GATCACAGTT CCCATCTGAG CACCGTCACT GGCTTGCTGT GCTACCTTGC 840
TTGGGTTACT TAACCTCTCT GGGCCTAAGC ATCCCTATCT ATGAAACCTA ACAACCCTGG 900
TTCCAATGCT TTCCTAGAAT ATTGGGGAAG TGTCGGCTTT GAGTATACTT GACAAAGGCC 960
ACAGATTGGG GGTGGGGTAT ATAAAAGTCT ACAGGAAGGA GAGCCCAGGA CTCCCCACTG 1020
TCAATATCTT GGTTCCCCAG CTTCTCTTCT TCTTGCTGAC CTCAATCTCA CTTGCTTTGG 1080
GTGGATTGAT TTCCTGACTC AGGCTCCAGG GCCATCAAGA ATTCACGGCT GCCTTTCAGC 1140
CTTCATGAAG GACATGGTGG AGCTCCTTAG GCAGAACTGG GGTTTGTGGA TGTCCTGCCT 1200
CTCTGCCCCT TGGTACCTAG GTGGCACCTT TTCAAGTTCG GGAGCTAGAT CCTTTCCCCT 1260
TCCCCACACT GTAGGAAAGT CCTTACTGTA GGCAGGCGCT GCAGAGCCTG CTGTCTGGGA 1320
ACCCACAGGT TCAAGGAAGC CTTGAGCAGG AAGGGCGTTT TCCTGGAAGA AGCCCTTTGT 1380
CGCTGGTAAT GGGTGCAGGC TGCTCTGACC CGGTTCTGAG TCCTGCCCCC TTCCAGGCCT 1440
AGGGCTTTGG GCCTTGATCA CCTCTGCTGA GTAGCTGACT GCGGGGCTGG GGCTCTGATG 1500
CTCAGGACCC ACCTCTCTGG GACCCACAGT CTTTTTCCAC TGTGGCGTGT AGTGATGTCA 1560
CAGGTGGCAG TGATGTCACT GTGGTTTGAG GTACTTGGCT GTGAGCCCCG GAGGAGGAAG 1620
TGTCTGTTCG CTGATGGGGG GTTGGAAGAG ATCATTGACT TCTGCCCCAA GCGTGAGCCC 1680
CAAGTGTGCA GGGGGGAGTG CGGGGGGAGG GCTGTTGGCG GCGCATCCCA GGGCTCTGGC 1740
TCTGCCCTTG CATCTAGCCT GTCTTTCCTG TGGGCTGTGA CAAGCCACTC TGCATCTCTG 1800
AGACTCCATT TCTTCTTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTCCTTCTCC 1860
TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC 1920
TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTTC TTCTGATGGA GTCTGACTCC GTTGCCCAGG 1980
CTGGAGTGCA GTGGCGTGAT CTTGGCTCAC TGCAACCTCT GCCTCCCAGG TTCAAGCTAT 2040
TCTCCAGCCT CAACCTTCCA AGTAACTGGG ATTACAGGCA TGCACCACCA CACCCGGCTA 2100
GTTTTTGTAT TTTTAGTAGA GATGGGGTTT CACCATGTTG GCCAGGCTGG TCTCGAACTC 2160
CTGACCTCAA GTGATCTGCC CGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGAATTAC AGGCGTGAGC 2220
CACTGCGCCC AGCTTCCATT TCTTCTTTGA AAAGTAGGAG GGGTTGGAAT TGTCACCCTG 2280
GAGGTTCATG GTTGCTAGAT TATTGATTCT GTTGCTGGAT TCAGGAGACC TGTTAGCTGG 2340
CTAGTTCACA GCAAGTATTG GGTGTTTGGA GGGGGGCTGC AGAGCCCCTT CTCAGGCCCC 2400
AGGAGGGCCA GCTGCCCTCC CTACCCCCTC TTTTGGACAC TAGTGGGCAT GTTCTGCTGG 2460
GAAAACAGAC AGTGTAACCT GACTTCGAGG GCTGCAGGCT GAATCTCTTT CAGATGTACT 2520
GGCTCCTTGA GAGGCCTAGC AGATCTCTAC TCTGTGGGTC CCTTTCGGAG CTGGGGCTCA 2580
GGTTTGACCC AGCCACTCTG ACCGGAGACA GCGCAGAAAT CACCAGGAGC ATTTGTTTGT 2640
TTTCCTTTGC TGTCCAGACA GTGGCCCACC GTCTGCTTCA GTCTGAGCGT GGCCCTGCAC 2700
TAGTGAGACT GATGTGGCCA CAGGTTCAGA GAATCAGTGC GCCTGAGTGG GAGAGCAGAG 2760
CGGGAGGGGA TTTGGAGGCA GGCGGGCTGT GGACAGGGAG GGGGGAGGAC ATCTTCCGAG 2820
CTGTCAGCGG GAGGCCTTCT TGAAGGTCTT TCAGGAGCAA GGCCAGAGGC CGTGGGAGTG 2880
GGCGGGGCCT GGGGCTGGGA GTCAGGGGTC TGAGGCCTCA TCTTGGCCCG GCCTCTGCTT 2940
CCGGGAGAAC TTGGCCAATT CCCTTCTCCT TTCTGAACCT TGGTGGCCCC AGCTGTCACT 3000
TGAGATTAGC AAGGACCTCC CTGGTCCCAG CAGGAGTGAG TGGCTTTGGG CAGGGGGTGG 3060
AGTGCAGATT GCACTGCCAC GTCACCCAGC TCAGAAGGCC CAGGTGTGGT CCAGCTGTGG 3120
ACTTGATTGT GAACTCCTGG GGAAGGGCTC TGGTCCTTTG CCTCAGTTAG CGGGACCCCC 3180
ACCAGTGCCC TGGGTGCCCC TGCTGGCCCC TCCTCTCGCT GACCCCAGCC CCAGTTTCTG 3240
GCTGCAACTC ACAGAGGCCC CAGGCTCCTG TGGCCCCATC ACCAGCAGCT CCTGCTGTCA 3300
TTTCCTGAGC CTCGCAAGCC CCTAATCCTG CTCCTTCCTG TCCTGGCCCC CAGCTCCCTC 3360
AAGCCCCACT CCTGCATCCC ATTCTCCCTG GACATCACCC CTCCCACCCC TTGGCTCAAT 3420
TTCCTTCCTG TCGTGGCTTG GTCCTTTGGT CATTGCCCTG GTCTTTTCTT GTCCCCTTCC 3480
TGATTCTGCC CTTCTCCAGG CCCACACGGG GAACCTCCTA ACCGCTGAGC CCTGAAAGGT 3540
AGGCGGGTTT AGGATGAGTG GCTACAGGGA GGAGAATGGT GTGGGGAGAG AGATATGGAG 3600
GAAAGAATAT TAGGGGACAG GCCGGGCACG GTGGCTCACG CCTGTAATCC 3650