EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS026-03215 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CNCC 
Coordinate
chr1:230237130-230241200 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10746509chr1230237282hg19
rs3811489chr1230239259hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:230239421-230239442AAACAGAAAATGAAAGAACCC-6.65
PLAG1MA0163.1chr1:230241093-230241107GGGGCCCACTGGGG+6.86
RREB1MA0073.1chr1:230239920-230239940GGTTCTGGGGTGGTGGGGGG-6.25
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01245chr1:230239641-230243336Adrenal_Gland
SE_01785chr1:230239049-230240587Aorta
SE_01785chr1:230240637-230243187Aorta
SE_02496chr1:230239508-230241945Astrocytes
SE_25348chr1:230236453-230250730DND41
SE_31112chr1:230237380-230238272Fetal_Thymus
SE_31112chr1:230238334-230250198Fetal_Thymus
SE_34791chr1:230236741-230238102HeLa
SE_34791chr1:230238329-230243364HeLa
SE_36634chr1:230239950-230242005HMEC
SE_37247chr1:230239177-230242475HSMMtube
SE_39241chr1:230238979-230242188IMR90
SE_39366chr1:230237178-230238108Jurkat
SE_39366chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_39366chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_43672chr1:230238380-230242897MM1S
SE_45047chr1:230239152-230242696NHLF
SE_45719chr1:230236856-230242994Osteoblasts
SE_49908chr1:230237167-230243238RPMI-8402
SE_50426chr1:230239072-230243127Sigmoid_Colon
SE_51846chr1:230239549-230242044Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_63637chr1:230239456-230242241HSMM
SE_65792chr1:230239400-230241648Pancreatic_islets
SE_66256chr1:230237178-230238108Jurkat
SE_66256chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_66256chr1:230239361-230243263Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1230237370230237414
chr1230238379230241057
chr1230239370230239686
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230101chr1230237569230243904
Enhancer Sequence
CCAGCTCCTG TCGGATGCCC CCGTGTTCTG GTCACTCGTG TGCCCGTCTC TTCACACTCA 60
GTTTTCCCAC CCCTGAGCAC CTCAGGTGCC AAGGTGTGTT TGTTGAACTG AAATTCTTAA 120
GCCTGCTGAG TACATTCTCA GTTTGTCAAG ACAGATAAAC AAATACCTTT TTTAGATGAT 180
TTAAAAGATT CTTGACACAG TCCCAGTGGT GTTTTAACAA CTTTTCAGGT CCTGATCAGC 240
CAAACTCTGG GCCAAAAGTA AATGTTTAAT AAACAACATA AGAGTGATGG AGGAAAAATG 300
TATCTTAAGT GGAACTGTGT GTTCTGTAAA TCTATGACAG ATTACTGTTC CTGCTTTTGT 360
TGTGTATAAT TATTCTTGTT CCTCCTGAGA ATTGCCCTCT CTTTCATCAT GAAACGTATA 420
AGATGGCCTC CTCCTCTGGT AATTTGGAGC AATTGGCCTG GGAGAGGATT GATGTGTAGT 480
AAGGACAGTC CGTAGGAGAG ATTTAGTGGG GGCAGTTTCC TTATCTTCTA TTCTGTCCCT 540
TTGCCAGACA GAAGCACAAA AAGTAGTTGG ACTGAAAATG CTGCTTCCTA AAATTAGCTC 600
TCCTCTTTGT TTTCCGAATG GTTTTACTGG TTGATGCGGG CACAATTTGC CCTTCTTGGG 660
GAGCCTTCTG CATTGTGTAA AGTGCAAAGA CACATCTATC AGAGAAGCTA ATTTTAGGTG 720
CTAGTAAGTT TTAAGGGCAT GCAAAGCTCA AAACTTTGCC TGTTCTCTTG GAAGAAGATT 780
TTTCCCTCCT GAAAAACAAG CTTCCTTTCA AAGTCAGAAA AGGGGAGCTT AGACGAAGCC 840
CCAGGAGGGC AGGTATGTCT TGTTCACTGC AGTCTCCAGT GCCTTGCGAG GGCCCGGCAT 900
GCTGAGCGCT CAGTAACCCT TGGCCTAATG TACAGTTTTT CATTCTGTGA ATCAGGAATA 960
GAGCAACATA AGGGGAGCTT CTGCTTGAGA CAGCAATGGC AGCATCAAAA TAAACGTGGC 1020
AATTTTGGTC TTCAAGAGTG AAGTTGTGTC TCTGAAATTG TAAGCCCAAA TGGATCATTT 1080
CCTTTTTTAG GTTTTAGAAT TCCAGGTTTA TTTTCTGGAA GAGCTTGCAG CAGATGGGCT 1140
TCTGTAGGGG AACGTTTATA CCTTGGGGGT TCCGTTTCGA GAGTCCTTGA TTTATTATTG 1200
TTTACAAATG GTGGTTGGAA ATTGTTCATT GATTTGACAT AAAGCTGCCC AGGCTTATTG 1260
TAAAAACACC TCTGCATCCA ATTAGAATGA CAGACACTTA GTGTGATGAC TCAGGACAGT 1320
TGATGGCCTT AAAAAAAAAG CGAACAGATT AAATCACTCT CTGTTTTTTC ATAGCCATTG 1380
ATGGAAACAG ATTCTGTGGG GTAAATAACA GAGTCTTGGG TGGTGGAAAG GTTGAAGATG 1440
TCCAGTAGTT GTGGCAGGGC AAGGATGGAG GACTTTTTCT TTGCAGGGGC AGTGGAGAGG 1500
CGGGGCCATG GGTGAAGACT GGAGAATACT CAGAAGGTAG CATGGACGAG AGTGTTGTTT 1560
GATGACTCTG CATGTGACCA GTAGTGACAT TTTACTCACT GAGGCTCATA TTGAGGTTAA 1620
GCCCGAGGTC CATTGGCCTT GCTGAGATCG TGTTTAGAAC ACAGCACTGT GCAGTAAGAG 1680
ACTCCTATAA CTCTATCAAA TTTGCATTTG GAGGAATTGT AAAGAGCCTC TGTTACCTCC 1740
TAGGTGAGGC AGTCCAGGAA AACAGTTGCT AGAAGGAGCT ATCTGCAGAA ATAGACAGTT 1800
GTGGTCCTTT CATGTTTTAA TAATTGTTCC CTGGATTTCA AGGAGTCAGT CCAAAATCCC 1860
CGTAATAGAT TTTAGTAACG TTCATGGAAT CTCAGTTTGC ACATCATGAG ACCTTTAGTG 1920
TGGTGTTTAC TGTCTTCACC TTAATATACT TTGTATCCAT GAGCAACCTT GCTACAGTCA 1980
TGCAAAGATG ATTATTTTTT ATTCAGCAAT AATTAGCCAC AGTGTTGAGC ACCCAGATGC 2040
CTTCCTGCAG CAGCCCCCCT TTTCTCCCCA GCCAACATCT GCAACTGTGA ACAGATTTCC 2100
ATCTTCAGCC TTGGTGGTTG GAAAGAAATG TAAGTCACCT TTTTTTCTGG TTGGTTCTGG 2160
GGCAGATGCC ACCAGGCTGC AGAGGCAGTC TGTGTCTGTG GGGCTCACCA GGGCATGAGT 2220
TCTGCTCCCA GGAAAGAGAT TCTTGCAGGA TTTTGTCTGT GGTTCTAAGG AGACAAGTAG 2280
GTGGCACACA AAAACAGAAA ATGAAAGAAC CCATCCCTCC AAAACCACAC ACACAAAGCC 2340
AAAAGGAAAA AAAAAAAGCA CATAATTATC ATGTAGGCAC TGTTGCAGCT AACCCTGATT 2400
TTGGCCTCAA TTCTGAAACA AGTTAGCTGG TTTAGACAAA CCCCTTATTA GGTAATGGAT 2460
TGTTATTCAT TCCTCCCCTT CTCCTAGTCA TTTACTCCGT GAGAGCTGCT CCTACCTGAC 2520
CTTCCACTGA TTTTGGTAGC AGCATCTCCC AGAGCGACTG TTTCCTTCTT CAGCAGTGTT 2580
CCTTACTCAG GGTGTAAGAT CTTAACCCCA CAGAGCCCCG TATCAGGTTT AATTAACTAA 2640
TTGATTCAGC TTGTGCTTAC TGAGTGCGAG GCAGTCATGT GCTTCTGTTT GGTAAATGGC 2700
TTCATTTTCC CTCTAACTCC TGAGCGTCCT GAAGCTTCTC TTATGGTTCT CTCCAAAGGA 2760
GTCAGCAGGC TGGCTCTGCA AGGGTCAGTA GGTTCTGGGG TGGTGGGGGG CCGAGGGAGG 2820
CAGGGAGGTT GGCTCTGTCT TTATTTGGCA TAGAGCTCCC CGAACAGGGT CTCTCCTCCT 2880
TTCTCCAAAG GTTAATGGAA CCACTATCTT AAAAAGCTGA AATCTTATCT TCTGGGGTAT 2940
TTGGGTAGAG AAGGCTAGGG AATCCCTTTT CCATGGTGGT GCAGTAGGTT CTCAGAACCA 3000
GCTGGTGGGC CTCAAAGAGA GGCGGCTGTA TTTTAGCCTG ATAATCTTGA TTCCTGGTTT 3060
CCTGGCTCTG TAGCATCAGA AATGGGAAGC TTTAAAAGCC GTGCCTTGTT GGATGCACCG 3120
AGTCATAAAA TAAATGTGAT GTGCTGGGTG GGGGAAATGC GGGAGGAGGG AAACAGGTGG 3180
TTGGAGCTGC TTCGTGATGG CCGCCCACCC TGGCTCTCCT TTCTTAATAG GCTTCAGAAA 3240
TCCTGGAATG CGTAATTCAC CAGCTCACAG AGTTCCACCC ATGTCCCCAG TGGCTTCAAA 3300
ATGTAAATGA CATTTGCAGT GCTGGGAGGT AGGAGGGCGA TCCCGTTCCT TCCCTGGATC 3360
TCAGTCGCAG AGGTGCTGGC TCATGTGCCT GAGTGCAGCG GCTGGCCCGT CATTACTGGT 3420
CTTTGCAGGA AGCCACTCTG AAGGCACCTG GGCCCTTGCC AGGCTGAGTC ACAGCTGACT 3480
TAGGGAAATG CCACACAGGA CGCTTGCAGT CCCCCCGTTC TAAGCGTAGG TTTTGCAACT 3540
GCATACTCGG AAAATGAATC AGAGTGGGGG AAAGTGTCAG AGAAACAGCA GAAATGGAAT 3600
GTAGGCAGGA GGGCCACAGT GGCGCTGTGG ATTCAGACCA CACCTTCGGC TCTGTTTGGG 3660
GCCCTTCCTG TAAGGAGCGT ACTGATGCCA GAGGCTGGGG GTGTGGAAGG GAAGCTGCTG 3720
TGCTGTTAGA TCCATTCTGC TATTTAGCCA GCCTTCCTTT TCCCAGCTGG CACAGACAGG 3780
ATGTGTTAGA GAGGTGCTCA GACCTCCTTT CAGAGCAACT GAATCATTCT CCAGGAGGGA 3840
CAGGGAGTCT GAAATGCAAA CAGGTTCCCA GGGTTATTGA AGAGCAGCCA AACTGAACAC 3900
CCACTGCTCT GTGGACTCAA GCTGGTTTTA GACATTGTTT GGTCAGGACC AGAGCCGAGC 3960
TCTGGGGCCC ACTGGGGGCT CTTGTCGCAC CATATCATTG ATTCTACAAT GCACATTTCC 4020
CCCGCCTCTC ATGTTTTAAC ATGTCTGAAA TCAGGATGCA TCTTCCATGG 4070