EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS026-00269 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CNCC 
Coordinate
chr1:12233510-12236760 
TF binding sites/motifs
Number: 39             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB3MA0638.1chr1:12235443-12235457CTGCCACGTCACCC+6.73
RESTMA0138.2chr1:12235219-12235240TTCAGGAGCAAGGCCAGAGGC+6.06
SP1MA0079.4chr1:12235246-12235261AGTGGGCGGGGCCTG-6.76
SP2MA0516.2chr1:12235245-12235262GAGTGGGCGGGGCCTGG-6.64
SP4MA0685.1chr1:12235244-12235261GGAGTGGGCGGGGCCTG-7.2
Stat4MA0518.1chr1:12233725-12233739CGTTTTCCTGGAAG-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:12234302-12234323TTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC-6.47
ZNF263MA0528.1chr1:12234206-12234227TTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:12234209-12234230TTCTTCTTCTTCTCCTTCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr1:12234212-12234233TTCTTCTTCTCCTTCTCCTTC-7.12
ZNF263MA0528.1chr1:12234215-12234236TTCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.13
ZNF263MA0528.1chr1:12234299-12234320TCCTTCTCCTTCTCCTTCTTC-7.15
ZNF263MA0528.1chr1:12234221-12234242TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234227-12234248TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234233-12234254TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234239-12234260TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234245-12234266TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234251-12234272TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234257-12234278TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234263-12234284TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234269-12234290TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234275-12234296TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234281-12234302TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234287-12234308TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234293-12234314TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC-7.65
ZNF263MA0528.1chr1:12234218-12234239TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234224-12234245TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234230-12234251TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234236-12234257TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234242-12234263TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234248-12234269TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234254-12234275TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234260-12234281TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234266-12234287TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234272-12234293TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234278-12234299TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234284-12234305TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234290-12234311TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
ZNF263MA0528.1chr1:12234296-12234317TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC-7.89
Number of super-enhancer constituents: 48             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00369chr1:12226565-12247198Adipose_Nuclei
SE_01471chr1:12232095-12234188Adrenal_Gland
SE_01471chr1:12234592-12236046Adrenal_Gland
SE_04546chr1:12232368-12233932Brain_Anterior_Caudate
SE_04546chr1:12234570-12236102Brain_Anterior_Caudate
SE_06521chr1:12231395-12234253Brain_Hippocampus_Middle
SE_06521chr1:12234379-12243644Brain_Hippocampus_Middle
SE_09154chr1:12224797-12249846CD14
SE_10696chr1:12231624-12233979CD19_Primary
SE_11902chr1:12231048-12236114CD3
SE_11902chr1:12236130-12240197CD3
SE_14553chr1:12231008-12236205CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14553chr1:12236294-12240694CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15480chr1:12231304-12235464CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16369chr1:12231214-12235920CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16946chr1:12231228-12235850CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16946chr1:12236405-12240609CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17650chr1:12231292-12241643CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17827chr1:12231021-12246713CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18389chr1:12226183-12250288CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19117chr1:12225970-12243644CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20048chr1:12231058-12236137CD56
SE_20048chr1:12236164-12241732CD56
SE_20873chr1:12231198-12236438CD8_Memory_7pool
SE_22347chr1:12226250-12242299CD8_primiary
SE_26251chr1:12232165-12234254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26251chr1:12234361-12236001Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27503chr1:12231615-12234368Esophagus
SE_27503chr1:12234497-12236079Esophagus
SE_30788chr1:12232018-12234343Fetal_Muscle
SE_30788chr1:12234469-12236114Fetal_Muscle
SE_32030chr1:12231844-12234207Gastric
SE_32030chr1:12234507-12236040Gastric
SE_38661chr1:12234401-12236100HUVEC
SE_41498chr1:12232230-12236136Left_Ventricle
SE_42336chr1:12231389-12236106Lung
SE_42336chr1:12236353-12237180Lung
SE_48967chr1:12232188-12234263Right_Atrium
SE_48967chr1:12234520-12236102Right_Atrium
SE_50250chr1:12231283-12234299Sigmoid_Colon
SE_50250chr1:12234498-12236097Sigmoid_Colon
SE_52522chr1:12231293-12236092Small_Intestine
SE_53313chr1:12231250-12236109Spleen
SE_53313chr1:12236233-12237192Spleen
SE_55394chr1:12233345-12234247Thymus
SE_55394chr1:12234547-12235437Thymus
SE_55394chr1:12235467-12236045Thymus
SE_61096chr1:12184746-12245090HBL1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr11223360012234159
chr11223460012236012
chr11223507012235463
chr11223353112233800
chr11223632612236421
chr11223380012234000
chr11223400012234197
Enhancer Sequence
CTTCATGAAG GACATGGTGG AGCTCCTTAG GCAGAACTGG GGTTTGTGGA TGTCCTGCCT 60
CTCTGCCCCT TGGTACCTAG GTGGCACCTT TTCAAGTTCG GGAGCTAGAT CCTTTCCCCT 120
TCCCCACACT GTAGGAAAGT CCTTACTGTA GGCAGGCGCT GCAGAGCCTG CTGTCTGGGA 180
ACCCACAGGT TCAAGGAAGC CTTGAGCAGG AAGGGCGTTT TCCTGGAAGA AGCCCTTTGT 240
CGCTGGTAAT GGGTGCAGGC TGCTCTGACC CGGTTCTGAG TCCTGCCCCC TTCCAGGCCT 300
AGGGCTTTGG GCCTTGATCA CCTCTGCTGA GTAGCTGACT GCGGGGCTGG GGCTCTGATG 360
CTCAGGACCC ACCTCTCTGG GACCCACAGT CTTTTTCCAC TGTGGCGTGT AGTGATGTCA 420
CAGGTGGCAG TGATGTCACT GTGGTTTGAG GTACTTGGCT GTGAGCCCCG GAGGAGGAAG 480
TGTCTGTTCG CTGATGGGGG GTTGGAAGAG ATCATTGACT TCTGCCCCAA GCGTGAGCCC 540
CAAGTGTGCA GGGGGGAGTG CGGGGGGAGG GCTGTTGGCG GCGCATCCCA GGGCTCTGGC 600
TCTGCCCTTG CATCTAGCCT GTCTTTCCTG TGGGCTGTGA CAAGCCACTC TGCATCTCTG 660
AGACTCCATT TCTTCTTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTCCTTCTCC 720
TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTCC 780
TTCTCCTTCT CCTTCTCCTT CTCCTTCTTC TTCTGATGGA GTCTGACTCC GTTGCCCAGG 840
CTGGAGTGCA GTGGCGTGAT CTTGGCTCAC TGCAACCTCT GCCTCCCAGG TTCAAGCTAT 900
TCTCCAGCCT CAACCTTCCA AGTAACTGGG ATTACAGGCA TGCACCACCA CACCCGGCTA 960
GTTTTTGTAT TTTTAGTAGA GATGGGGTTT CACCATGTTG GCCAGGCTGG TCTCGAACTC 1020
CTGACCTCAA GTGATCTGCC CGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGAATTAC AGGCGTGAGC 1080
CACTGCGCCC AGCTTCCATT TCTTCTTTGA AAAGTAGGAG GGGTTGGAAT TGTCACCCTG 1140
GAGGTTCATG GTTGCTAGAT TATTGATTCT GTTGCTGGAT TCAGGAGACC TGTTAGCTGG 1200
CTAGTTCACA GCAAGTATTG GGTGTTTGGA GGGGGGCTGC AGAGCCCCTT CTCAGGCCCC 1260
AGGAGGGCCA GCTGCCCTCC CTACCCCCTC TTTTGGACAC TAGTGGGCAT GTTCTGCTGG 1320
GAAAACAGAC AGTGTAACCT GACTTCGAGG GCTGCAGGCT GAATCTCTTT CAGATGTACT 1380
GGCTCCTTGA GAGGCCTAGC AGATCTCTAC TCTGTGGGTC CCTTTCGGAG CTGGGGCTCA 1440
GGTTTGACCC AGCCACTCTG ACCGGAGACA GCGCAGAAAT CACCAGGAGC ATTTGTTTGT 1500
TTTCCTTTGC TGTCCAGACA GTGGCCCACC GTCTGCTTCA GTCTGAGCGT GGCCCTGCAC 1560
TAGTGAGACT GATGTGGCCA CAGGTTCAGA GAATCAGTGC GCCTGAGTGG GAGAGCAGAG 1620
CGGGAGGGGA TTTGGAGGCA GGCGGGCTGT GGACAGGGAG GGGGGAGGAC ATCTTCCGAG 1680
CTGTCAGCGG GAGGCCTTCT TGAAGGTCTT TCAGGAGCAA GGCCAGAGGC CGTGGGAGTG 1740
GGCGGGGCCT GGGGCTGGGA GTCAGGGGTC TGAGGCCTCA TCTTGGCCCG GCCTCTGCTT 1800
CCGGGAGAAC TTGGCCAATT CCCTTCTCCT TTCTGAACCT TGGTGGCCCC AGCTGTCACT 1860
TGAGATTAGC AAGGACCTCC CTGGTCCCAG CAGGAGTGAG TGGCTTTGGG CAGGGGGTGG 1920
AGTGCAGATT GCACTGCCAC GTCACCCAGC TCAGAAGGCC CAGGTGTGGT CCAGCTGTGG 1980
ACTTGATTGT GAACTCCTGG GGAAGGGCTC TGGTCCTTTG CCTCAGTTAG CGGGACCCCC 2040
ACCAGTGCCC TGGGTGCCCC TGCTGGCCCC TCCTCTCGCT GACCCCAGCC CCAGTTTCTG 2100
GCTGCAACTC ACAGAGGCCC CAGGCTCCTG TGGCCCCATC ACCAGCAGCT CCTGCTGTCA 2160
TTTCCTGAGC CTCGCAAGCC CCTAATCCTG CTCCTTCCTG TCCTGGCCCC CAGCTCCCTC 2220
AAGCCCCACT CCTGCATCCC ATTCTCCCTG GACATCACCC CTCCCACCCC TTGGCTCAAT 2280
TTCCTTCCTG TCGTGGCTTG GTCCTTTGGT CATTGCCCTG GTCTTTTCTT GTCCCCTTCC 2340
TGATTCTGCC CTTCTCCAGG CCCACACGGG GAACCTCCTA ACCGCTGAGC CCTGAAAGGT 2400
AGGCGGGTTT AGGATGAGTG GCTACAGGGA GGAGAATGGT GTGGGGAGAG AGATATGGAG 2460
GAAAGAATAT TAGGGGACAG GCCGGGCACG GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTTTG 2520
GGAGGCCAAG GCGGGCGGAT CACTTGAGGT CAGGAGTTGG AGACCACCCT GGCCAACATG 2580
GTGAAACCCT GTCTCTACTG AAAAAAAAAA AAAAAATTAG CCAGGCGTGG TGGTGTGCAC 2640
CTGTAGTCCC AGCTACTTGG GAGGCTGAGG TATGAGAATC ACTTGAACCC CAGAGGCGGA 2700
GGTTGCCGTG AGCTGAGATC GCACCATTGC ACTCCAGTCT GGGTGACAGA ACGAGACCCT 2760
GTCTCAAAAA AGCAAAACAA AACAAAACAA AAACCGAATA TTAGAGGACA ATGTTAGGAC 2820
TGTCCCAGCT GTCCTAGCTG GAGCCAAAGG TTTGTTGGGG ACAGTGACAG CAGCACACGA 2880
GGCTGTAAGT TTAGGGCCAG TTTATGGAGG AGTAGTACCA ATTACATTGA GAAAACTGTA 2940
GCAACTATAA TTTGGGAGGA ATTTTCTAAA TACTTTACAT GTGTTATTTA ATCTTCCCAT 3000
CAGCCCCAGG AGGTATGTGC ATTTATCAGT CCCATTCTAC AGATGAAAAG ACTGAGGTCT 3060
ATGAACTCCT TTATTTAAAA ACAAAACAAA ACCCCCTCAA GGCTGCCTGC TAAGAGGGGA 3120
GGAGTGTGGA TTCAAGCCAG CATCCTTATT CCAGTGTCCA TGCTCTCAGC CACCACACAC 3180
ACACTCCTAT CAGGAGTTGG GGCAGTGGGG AGCCATTATA GTTTTTGAGC AAGAGAGTGA 3240
CAGGGCAAAG 3250