EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS024-01408 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr1:223891980-223894690 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr1:223894355-223894366AGGAGATAAGA-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:223894565-223894580GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SP2MA0516.2chr1:223893170-223893187ATGTGGGAGGGACTTAG-6.73
ZNF263MA0528.1chr1:223894171-223894192GAAAGAGGGAGGGGAAGAAAA+6.35
Number of super-enhancer constituents: 34             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223891964-223894610Aorta
SE_02306chr1:223892116-223896302Astrocytes
SE_04026chr1:223892317-223894515Brain_Anterior_Caudate
SE_05972chr1:223891995-223895701Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223892580-223894588Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23408chr1:223892519-223892911Colon_Crypt_1
SE_23408chr1:223893759-223896170Colon_Crypt_1
SE_26209chr1:223892263-223896172Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223892455-223896502Esophagus
SE_31491chr1:223892450-223896280Gastric
SE_33950chr1:223892039-223897144HCC1954
SE_34545chr1:223893587-223897272HCT-116
SE_34979chr1:223893945-223896369HeLa
SE_36294chr1:223892209-223896197HMEC
SE_37129chr1:223886879-223896561HSMMtube
SE_38254chr1:223892197-223897487HUVEC
SE_38957chr1:223892076-223894679IMR90
SE_41495chr1:223892178-223896347Left_Ventricle
SE_42269chr1:223892060-223896221Lung
SE_44530chr1:223892152-223896327NHDF-Ad
SE_44904chr1:223892205-223896189NHLF
SE_45872chr1:223889824-223896323Osteoblasts
SE_49408chr1:223892167-223893562Right_Atrium
SE_49408chr1:223893604-223894625Right_Atrium
SE_50365chr1:223893595-223896281Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223892369-223896155Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223893884-223894596Small_Intestine
SE_55958chr1:223886755-223897239u87
SE_63671chr1:223892313-223896169HSMM
SE_65644chr1:223892460-223893201Pancreatic_islets
SE_65644chr1:223893499-223896161Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223886755-223897239u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1223892629223893260
chr1223893295223893662
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223704chr1223892008223897501
Enhancer Sequence
AGACTCTATC TCAAAACAAC ACCAAAAAAC ATTGAACTGA AGACCCCTAA AGTTCCATCC 60
AACCCTGAGA TTCTTTCATA TGAATCTCAA AGTGTGAAAC GCCTCAGTCG CCTAGGGCCT 120
TATTCTACAG AAGGGAAGTC CAAAGGCTCA TTTGAATTGC ATTAGCAACT CGAGCTATAT 180
TTGTAAGTCT CCTCCCATCT GAGAATTTCT TTGTCAGCAA CGTTTTCCCT ATTCTACAGA 240
TGGAGAAATT GAGGTCTAGG AAGACCAAGA CACTTGTCTC AGACCCACAG TTGAGGTCTT 300
AGTTTGCCAC TGAGTCACGG TCCGTGTGAC ACAAGGATGG AAAACCAAAG GGAGCCATAG 360
CTGAGGGAAG GGAAATGAGA AGGGTATCTG AAATGTCGGC CCTGCAATAA GGTGGGCCAC 420
AGCAATAATG AGATGTCACT GGGCTCAGCC CTGTGCCTGG AAGGAGGGAG GTGGTCAAGG 480
ATATCAACAA AAAAATAGTT GCTGATCCCA GGAGAAATAC AACACTGAAT TGAGGGGAAA 540
ACACAGAAAC ACATCTAGAC TGTCATTAAA CAAATGTAAC CGAGGCAGGG GAAATGTGGA 600
GCCCCAACGT GAGTAGGTGA TGGAGTTGGG TGACTGTCAT ATGTCACAGC AGGATGGGTA 660
GTTGGCTGCC CCCAGCCCCC TCCTGCCGCT CCCTGTTCCA GCACCCTGGC CCACCAGCCC 720
CTTCCTGGCA ACTCCCATAC TCCCCCAGTT CATCCACTAA AGGATTAATA GCTCACTCAG 780
GGGAGGCTTC CTGCCCCTCG GCCAACACCA ACTTCCCTTT CAGCAAGCCA GTGTCGGCAC 840
TACAGTGGTT TGGAATACTT TCAATATCAC TCCCTGTTAA CAAGCCTATC CTTGGACTGG 900
CTGAGAAAAG AAATGGAACG GGGCAAAGTA ACAAAACAAA GAGGCAAGAC AGAGCCAAAT 960
GTCTCCTATG GTTACCTAAA TCACAATTTA GACAAGCACT GGTGATTCTT GCACATAGAG 1020
AACCACCACT GAACTGTACA GGGGAAACTG GTTTCTGCCC CAGAGATGTG TTGGGGAAAT 1080
GACATACTGA CCACCATGAC TACATCCTCG GAAGACTGAG TGGCAGAGTG CTACTTTGGC 1140
TTTCTTACCA GGTGAACTTG AGCATATATC TGGGCAGTTC TAGAATTTCG ATGTGGGAGG 1200
GACTTAGGGA TGAAAAAAAT AAAATGTGGA TGGTAGATGG CATTTGGGGC AGGGGATTGG 1260
AGGCTTGTCT TGTAGCTGTT TCTGCTTAGT AAGCTCCCTG TTCTGGCTTA GAGACATATT 1320
TATTGGGGAG CTTGCTGATG GGAATTATGG ACGGGGCCAA CTCCTCTCCC AGCACCCTGT 1380
GGTGCTGACA TCTGAGGTGA TCACTTCCCA TGGAGTGGAG AAAAGCATGC TGCTCTATAT 1440
TTGTTCCCTA CAACAGGAAG CGTGAAAACA GGATTTGCTG CCACATGTCA AGTACTCATG 1500
TGCCTGTAGA AGAAAGGGGC CATTGCTGCT GATGATAACA ATGATAGCAT CTAAGGTTTT 1560
ATAGTTCCCC AAATAATTTC ACATACACTG TGATTTGATG CTTATAACAA CCGTGTGAAC 1620
TATGCAAAGT AGGTATTATT TCCCCATTTT AAGAGATGGG AGAATGGATA GTTAGTATTT 1680
TGAAAATTGC CAGACCCCAC ACTTATAAGA CTACATGTAT TATTAGTAAA ATTACTACTA 1740
GGGGACCCCA GCTATGAAAA CCTCTCTGGG AGATAGCACT GGTGGGTGAG GGGCAGCAGC 1800
TTCGGCTCTT GCCTCCTGGC AAGGGTGGGA TGTAATACCC TAAGCTCCAA CAGACTGGGG 1860
AAAGAGAAGG GGCTTAGAAA ACTGTCTGGG CTGCTGGATT TCTTTCCGGA GTTTCCCTCT 1920
CTCCTTCTAC TGTCAGCACG TCCCATCTTT TGCAACACCA GGGAGAAGCC TTTCCATGCC 1980
TCTTCAGCTC TTGGAATCCC TCCAGAAGCC CCCTCCCTCC TGAGTGGCAT CTAACAGGCC 2040
TGTCCAATAC TCATGCTACA GCTATGAGGA AAGAATAAAC CCTGCAGCTG CTTCAGAAGA 2100
GAAAGAAATC TCTTTTCAAA TGAAACCGTT TTTTGCAGCC CTGTGGAATT CATATTCTCT 2160
GTGATCTCCT TTGGATTCAA ATCACGGACC TGAAAGAGGG AGGGGAAGAA AACAGGTTCT 2220
TTTCCTCTGC CTGGGCCTGC CGTTCCCTCT GCCCTCCTAC ACTGGGTATG GACAGACCCC 2280
AAGGGACCAT GGTCTAGGTG TTGGCAGCCA GGCTGGCTCT ACAACACAAC ATGTCAGCTG 2340
CTCTGCTGGG CCTCTGTTTA CTCATCCATT AAATGAGGAG ATAAGATCTC CCTTGACTGG 2400
CTGTGAAGAT TAAGTGCACA AATATGTGTA AAGTGCACAA ATATGTCAAA TAAAAACTGA 2460
GACTGACACG TGGAGGTGCA AAATTAAAAA GGAAGCTTTG GTTAGTATCT CCAGAACCTG 2520
GCTAGGCACG GTGGCTCACA TCTGTAATCT CAGCGCTTTG GGAGGCCGAG ATGGGTGGAT 2580
CACCTGAGGT CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GGACAACATG GCGAAACCCC GTCTCTATTA 2640
AAAATACAAA AATTAGCTGG GCATGGCAGT GAGCCCCTGT AATCCCAGCT ACTCAAGAGG 2700
CTGAGGCAGG 2710