EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS024-00052 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr1:2229500-2234410 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11576356chr12233961hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.06
ArMA0007.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.17
NR3C1MA0113.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.03
NR3C1MA0113.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.23
NR3C2MA0727.1chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.08
NR3C2MA0727.1chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.2
RREB1MA0073.1chr1:2230472-2230492TCTATGTGGTTGTTTTGTGT-6.35
TFAP2AMA0003.3chr1:2233512-2233523TGCCTGAGGCT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01499chr1:2230890-2232649Adrenal_Gland
SE_10605chr1:2230613-2234200CD19_Primary
SE_11303chr1:2229194-2235579CD20
SE_12227chr1:2230249-2234208CD3
SE_16839chr1:2230637-2234084CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17322chr1:2224537-2236334CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18225chr1:2229290-2235668CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18345chr1:2229268-2234646CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2229524-2234390CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20385chr1:2230482-2234122CD56
SE_23033chr1:2230059-2233784CD8_primiary
SE_31962chr1:2230626-2233595Gastric
SE_33669chr1:2230327-2233314H2171
SE_41586chr1:2230182-2231307LNCaP
SE_46124chr1:2230507-2233519Osteoblasts
SE_54996chr1:2230147-2233027Stomach_Smooth_Muscle
SE_55573chr1:2231182-2233462Thymus
SE_68719chr1:2229029-2232774H9
SE_68719chr1:2232808-2234035H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr122332002233593
chr122308362233000
chr122316912232185
chr122324282232896
chr122306782230895
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I002298chr122301062234390
Enhancer Sequence
ACGGAAGCCT GACCCACAGA GCTTGGTGGT GGCCCCTGGA CTGACCTGTG GGCTGCTCAA 60
CCGCTCTGCC ACTGTGCGTT GTTCACATGT GAAGCCGGCG TCACAAAGGC CTCAATGTCT 120
GTTTCAGCTG GATACATGCG CGCCCTCGTG GGGGCTTGAG GGCACACTGG CCGCTGGACA 180
CTGGGGTCCC GGGGTGACTG AGGCTGGTGC CCTCCTGACA GGTTGCTGGG CTGCAAGTTG 240
AACAGAAAAC TGGTTTTCTT CACTCTGCGA AGTTCCCTGT GGTTGTCCCT GGGGTTGGAG 300
GGAGTTGTGT TGACATCATC ATGGCTGCTG CTGTGCGCCT CTCCCTTGGA GCAGGTGTGG 360
TCCCCGGCTC CTGGATTGGC TGCCCATGCT CAGGATGGTC TGGGGTGTGG CCGTGGCCTG 420
TCCCCGGGCC GGATGGCTTT CTCAGCAGCT CCCTGAGGCA GCATGAGCAG AGGCGGGACC 480
CTGCCCGGGT CCTGTTTCCC CCTTGTATCC TTTGGCCCTA ATACGGGGTC CCGTTTACCA 540
ATGAGGGCAA AGAGACCAGT CTAAGGGGAG GCTGAAAACT CACAGGCAGG CCTGTCTGGC 600
CTTGGGGTCT GGGTGCTGCT TCCAGGCAGA CCACATCCCA GGTGAGGTGC AGACATTCAG 660
AGACAGACGT GGCCGATCCT GGCTGCTGTA TCAACGCGCC CACCAAATGG GGCCTTCTTT 720
GATCATCAGT CAAAAGCAAG AATGTGCCTG TGGTGGGCGG GCGCGTGTGC CAGCTTCCAG 780
GCCGTGGGCT CCTTGGTGCC CAGAGCTCAC CCTGTGGTGC TTGCCCACTA CTCACTCCCG 840
CCTCCCCGGA GTCTTGCCCT GGGGGGTCCT GGTGTGGGAG CTGCCTTCTC TAGTTGGGTG 900
GAGCCTTGCC TGCTGGTGCC TGTGAGCCCT GGGTGGGTGG ATGCCGGGTG GTCGTGGAGG 960
TTCACAGCAG GCTCTATGTG GTTGTTTTGT GTGGATTTGG GGTGTGAATT CTCTCAGCAA 1020
AGGCTGACTC AGACCCCAGT GTTCAGAAGG TTCAAGGAAG CGACCGTCAG CGCCGAGTGG 1080
CCAGCAGGGC GGGGATGCGG CGTTGAGCCC CGTCATTCAG CTTCAGTGTG GAGAAGGCCC 1140
GGAGCTGTGG GCATCAGCTC GGGGACCCGA GTGACTGTCC CTGCCTCGGG GAGGGGGGGG 1200
GCCACACGGG CAGGCGGGGC AGCAGCTTGT GCCCATGTCC TCCTCACGGA CTCTGGAAGT 1260
GAGAGGCGCT GAGGCCACAG TGGGGGAAGT GGCCCAGCTG ACGACCCGGG CTCTCGGTGC 1320
CCTGGGAGGA GCTGTTGTTA GGACATGTGC AGACTGGGTT CAGCCTGTCT GGAGTGGCTC 1380
AGGTGCCTGG GGACAGAGGC CAGCTGTAAC CGCTGCTGCA CTCGGTTCTG GATTCAGTGC 1440
CCTCCGCCTC TGCGGCGTCT CCCTCGGCAG CTGTCCAGGA CTCCAGCCTC CCTGCCAGGG 1500
TAGGGGACAT GGAGCGTCTC CTTGCTCTGG GGGGTTGAGG TCTTCTGTGT TTGGACCCTG 1560
TGGGATCTGG CAGGAGAAGC AGCCCCCACT CATGTTGTGC CAGGGGCCTG GGGAAGGGAG 1620
ATGGCAGTTC TGTGACCTCC AGACTCCCTT TCCTTATTGC AGGGGATGGG CCAGCGTTTC 1680
GCCCTGAGCA TCTGCACGTG TCAGGCAGGA AAGGGTCCCC AAGGCCTTCT CAATGGCTCT 1740
TCTCTGTTCC TGGCACCTTA CAGGCCTGAA ACGCAGGGCC CCCAAGGGTG GGGTGTGCAT 1800
TTTTGGAGAG CGTCTTTTCT GAGACTCCCC CATGGGGAGC TGGTGGCTTG CTTGTGGCAG 1860
TGTACTGTGG CTGCCCAGTC CTCGGCAGGC ATCCACTGCT GGCTCACCTG TTTGGGCCAC 1920
CGCCTCTGCA TAGGTCCTGT GGGCTTTGCT CAGGAACTGT TCCGTCAGAG GGCCTAGGGT 1980
GTCCACAGTC TTGGGCCCGC TATTCCTCAG CCCAGCCCTG CCCTGCCCTG GCAGGGGGGC 2040
ACCTGTCCTT GGGTGCAAGC TCACACGCGT TGCCCGGGTG CCTGCTGGCC AGGTAGCTTG 2100
CCTGGTCATC CTCGGGGTGT GGGGAAGGAC CCCAGGAGGG GAAGTGGCCG CGGGGCAGCG 2160
CGGTGTGTCG TCTGGCCTCC GCTGTGTAAG CTGACAGTGG CCTGAAGGGC TTTGGGATGG 2220
GGCAGCCCCT TGCAGGCCTA TCCAGGCCCA GCCCCATTGC TTTGGTGTGT CAGGTCCAGA 2280
GCCGTGCTCC TGCCTCGTGG CCTGTGGGCT CCAAGGGCGG GTTTTGAAGC CCCAGGAAGG 2340
GTCACACCAG AGGCAAGCGG TCGTAGCTGC TCTTCCCAGA GTAAGACTCA GCCGTCTGTC 2400
ACTGGGTGTG GTTTTGTCCC TGACCGACAG CTGACACTGG GGCCCCCAGG GGCCTTGGTA 2460
GGGCGGGTGG CATCCCAGGC CTGAAGACGG CTGTCTGCTT CCTGGGGCTT TGAGAAACCA 2520
ATACTGCTCA GGTGACAGTC CCTCTGAGAG TGTCACTTCC TCCGCCCACA GGGGCGCAGA 2580
CACCTTCTAT TTTACACGTT TCTCTCCGTT TCTCTGATGC TGCAGAGAGC CCGCCCTGAG 2640
AGCCGGGAGT CGCCTGATGA GGGGTCGGCA GGGGTCTTAA CGGAGTCATG TCTCCGAAGG 2700
CTCGTCCTGG CTCCCTGAAG ACCAGGAGCG TCCCTGGCCC CAAGGATGGC CCTGAGCCCA 2760
TCTGCCTCAA CCCTCCAGAT CTGCAGGGTC CTCGGCCACC CCCCACTGAG CGGATTGGGC 2820
TCGGGGCCCC GGGCCTACGG TCCTCCCGCC ACCTCCACGG GGCGGCTGTT GGGGCCCCAC 2880
CAGGCAGAGC CGTGTTCTCA GGCGTTGGCT CTCATGGAGG TGGCCTGAGG CATCTGACTC 2940
TTTCCCCTCA AGGAGTCTCT GAGTCTCCCG GAGTCAGCGC CGGCTGTTGT GGCTTTTCCC 3000
CGGGTGATAA CTGAGCCGAA TTTCCGCGCC CGCTTCAGTG GCTGCTTAGA CAGGAAGCTC 3060
CACCCAGCCG GGCGTCCTCG GCCTTCTGTG CCTCTCGGGA GGGTCCGCAT GATTCCGGAA 3120
GGGGCTCTGC TGCAGCTAGG ATGGCACCCG CCCCTGCCAG GCATAGGCAC AGCACCCTGC 3180
GGTCAGGGCC TCCGCCAGAC GTCATCAACA CTCACTTCCC CTCGAAAGCC GCCACATAGA 3240
GGGGGTATTT TCAGTGTCTT TTTTCCTGAA CAGCTATTTT AGTGTCTCTG AAAAAAACCA 3300
TCCACAGCCG TGAGCCTTCA GGGGCTGCCT GCCCTGCGTC CCCGGCCCTG TGCGCCCGAG 3360
CACTTATCTT TCTCCCTTGG GCCCAGGTCA GAGCCAGGCA CCTGCCCCTC CCCTGGCCCC 3420
ACCCTGCTTG TTCCCTGAGG GCTGCAGGGT GGGTGCACGT GCTGCAGGGG AGGCCACGGG 3480
CTTTGGCCAG ATCTTCCCCC AGGGCCCTCC ATCCCCATAA TTGGAGCACC TTGATGGACA 3540
GCCTGCCCTG CGCCCCATCT TCCCCCTAGG GAAGCAGGGT CCCTGCTGCC TCCAGGAGGC 3600
TGGTTCCTGA TGCAGCGTCT TCTCCTAGAG TCCTGGAGGT GGGAAGAGCC CCCGGCCCTG 3660
AGTGTGCTCT GTCCACCAAG GCTTCCTGGC TGAGGGCAAG GGCGGAGCCC CCACCGCCCG 3720
ACTTTGCTGC CTCCTCTTGA GGTTGGCCTC GGCAGAGTGA GTGGGACCTC ACCCCTGTGA 3780
AGGGCCCCTT GCCCTGTGTG GCCTGTTCTG CATTGGCCTG TGGTGTAGAC CTGGTGCCAG 3840
CTGCCCTGGA GACTCTGTGC TGTCCTGTGG GGTCTTTGGC AGTAGAGGAA TGGCCCATTT 3900
TACGGAGACT GCCCTGTGAT TTTGCTTGGG AAGAGACCTT GGGTCTCAGT TGTGCCTTGC 3960
GGGCAGCACC GTCTCAGGGG TTTCCAGCCG CAGGGCTGTG GGAGTTCACG TTTGCCTGAG 4020
GCTGGATGTA CCGGCTCAGG CCCCCAGCAC ACAACCCACA TCACTCACTG GCTCTTGGGG 4080
GATGTGCCTC AGCACCTGAC ACACAACACC TGGTTCTGAG TGGGCTGGGT CCAGGCACCT 4140
TCGCTAAGCT TCCTCCACCA GCGGGACCTG GTTCTGGGTG GGCTGGGTCT GGGCACCTTC 4200
GCTAAGCTTC CTCCAGCACC GGGGCTGGCA AGGAGCGAGG CAAAGGTGTG TGTGGTGCCA 4260
TCCTGTAGGA GCCAGGCTCC TTGGGGATGG TGTCCTTCAT TTTGAAAATG TTTCCTTCCC 4320
ATGGGGAGGG GGCAGCCAGA ATGCCCACTC TTTAATGCAC CTGTGCCAGT GGCCCACAGG 4380
GACACGGTGT CCCCTCCCCG CGACCACCCC TGTGCCGCAG CTGCCCTTCC CAGACGCATC 4440
CGTCGTGAGT GGCTCTCGCC GTGCTGTGGC TGGTTGAGCT GAGTGCCCAG CGCTGGGCAC 4500
CCTCTGAGGA CACACTCGGG TTCTAGGAAA GGGGTTTGGC AGGAGAAGGA CGAGGGACTC 4560
CTGGCCAGGC TGAGCCGCTG TGGAAGGGGA GAGTGGGTCT TGGTGCTCCA TCCCAAACCT 4620
GCTGCAGCCG TGGGTGAGGT CACCCGGAAT GGCAGGACAA GGTCCACTCT GTTCTCTCGG 4680
AGATGACTTG TCCCTCAGCA CAGCCTCCAC GTGCCTGTTG CGCGTGGCCT AAGGGCCTTT 4740
ATGCAAAGTG AACTTGGTCT CCTGGGGGGT GCCCTGGAAT CTGCCTTCTG CGCCACTCAG 4800
GGTCGTTTGT GGCCGGAGTG CATGGGGCTC TGACTGCCAT GTGCCAGCCA CGGGGCTGGT 4860
GGAGGGACCC TGCCCTGGGA ACCACAGGTG CCAACAAAAC CTTTCATTGA 4910