EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS023-12780 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CD8+ 
Coordinate
chr19:19482820-19485030 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2905432chr1919484295hg19
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr19:19483171-19483184TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483175-19483188TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483179-19483192TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483172-19483185AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483176-19483189AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:19483180-19483193AATTAATTAATTT-6.92
Nkx3-2MA0122.3chr19:19483728-19483741ATTAAGTGGATTA-6
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:19484855-19484870TGAACTCCTGACCTC-6.22
POU6F1MA0628.1chr19:19483173-19483183ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483177-19483187ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483181-19483191ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483173-19483183ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483177-19483187ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:19483181-19483191ATTAATTAAT-6.02
SREBF1MA0595.1chr19:19484692-19484702GTGGGGTGAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09215chr19:19483114-19484967CD14
SE_14988chr19:19483154-19484492CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21339chr19:19483111-19484446CD8_Memory_7pool
SE_23432chr19:19483389-19484372Colon_Crypt_1
SE_23432chr19:19484383-19484690Colon_Crypt_1
SE_32412chr19:19483362-19484659Gastric
SE_40222chr19:19483245-19484320K562
SE_43282chr19:19483235-19484514Lung
SE_50929chr19:19483247-19484750Sigmoid_Colon
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr191948362919484204
chr191948334719484384
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I019370chr191948137819484648
Enhancer Sequence
CACGGGTCAT AATTTGGGGC CAAAGTAGAG TTTTTTTTGT TTTTGTTTTT TTTTTGGTAG 60
CGATGAGGTC TCACTATGTT GCCCAGGCAG TTCTCAAACT CCTGGGCTCA AGCGATCCTC 120
CCACCTCAGC CTCTCAAAAG GCTGGGATTA CAGGCATAAG CCACCGTGCC CAGCAACATT 180
TTTAACTCTT TTTTTTTAGA GAAAGGGTTT TGCTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG 240
CACAATTGTA GCCTACTGCA GCCTCGGCTT CCTGGGCTCA AGGGATCCTC CAGTCTCAGC 300
CTCCAGAGTA GTTAGGACTG CAAATGCACA CCACCACACT TAGACAGTTT TTAATTAATT 360
AATTAATTAA TTTTGAGACA GAGTCTCACT CTGTCACCCA GGCTGGAGTG TAGTGGTGTG 420
ATCTCTGCTC ATTGCAACTC CCCATCCCAG ATTCAAGTGA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCA 480
GAGTATCTGG GATTGCAGAC ACATGCCACC ACGCCTGGCT AATTTTTGTA TTAATATTTT 540
TAGTAGAAAT GGAGTTTTGC CATGTTGGTC AGGTTGGTCT TAAACTCCTG TCCTCAAATG 600
ATCCATCTAC CTTAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG GGTAAGCCAC CATGTCCAGC 660
CAATTTTTAA ATTATTTTTT GTACAGATGG AGTCTTGCTT TGTTGCCCAG GCTGGTCTCA 720
AACTCCTGGC CTCAAGCGAT CCTCCTGCCT CAGCCTCCCA AATTGTTGGG GGGTTACAGG 780
CATGAGCTAC TGTGCCTGAC CTGGAAGTGG ATTTTGAAGT GGATTTTGCA GCCTGTTTGT 840
GTCTCCCAAG CCACAAAAGA CTCTGACCTT CGTGTTTGAC CAGTTCCTTG GAAGGCACCA 900
GTCTGTGTAT TAAGTGGATT ATCCAAACCC AGACTGACTC CTGGCACATG GAAGATGCTT 960
TGGGATACAC TTATACTAAA AGGGTATTCA TTCGTGACTG ATCTGAAATC CAAATCTAAT 1020
GGGGCATCCT ATATTTTCAC TTGCTAAATG TGGCCACCCT AGATGCTCAA TGACATCCTT 1080
GAATAAAGGA AGCTGATGAA GTTCAAACAA ATAATTTTAC CAGCGGGGTA AAAAAAGCTC 1140
AAAGCTCAGT GCACTTTGCG AAACAGTCAT TTCCTCTTCC GGTCAGAATA AACTCCTGAC 1200
TCCTCCCAGG CCCAAGTGAT CAGCCACTCC CTCCTACCAG CTGGCTGGGC TGCTGTGCTC 1260
AGTCCCAACT CAGGAAGGAC AAGAGTAGCT CCTGTGACCA TAATGCCTGT CCACAAGCTG 1320
AGGCCCCACC CCACTCCGCC TCCTTTTCTT TTTCTTTGAA ATGGAGTCTT GGTCTTTTTG 1380
CCCAGGCTAG AGTGCAGTGG CGTGATCTCG GCTCACTGCA ACCTCCACCT CCCAGGCTCA 1440
AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAACA GCTGGGATTA CAGGCATGCA CCACCACCCC 1500
CAGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGACA GGGTTTTCAC CATGTTGGTG AGGCTGGTCT 1560
CAAACTCCTG ACCTCATGAT CCACCTGCCT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG 1620
TGAGCCACCG TGCCTGGCCA CCCCCTTGCT TTTTAGACAC AAGGTCTTGC TCTGTCACCC 1680
AGGCTGGAGT GCAGTGGCAT AATCTTGGCT CACTGCAGCC TTAAAACTCC TCAAGTGATC 1740
TTCTGTCTCA GCCTCCCAAG TAGTTAGGAC TATGGGTGCG TGCCACCAAC GCGCCTGGCA 1800
CTGAGACCTG GATTTTTTTT TTTTTTTTTT TGGTGAGATA GAGTCTTGCT CCGTCGCCCA 1860
GGCTGGAGTG CAGTGGGGTG ATCTTGGCTC ACTGCAACCT CCGCCTTCCA GGTTCAAGCG 1920
ATTCTCCTGC TTCAGCCTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG CGCCCGCCAC CATGCCCAGC 1980
TAATTTGTGT ATTTTTAGTA GAGACAGGGT TTCGCTATGT TGGCCAGGCC GGTCTTGAAC 2040
TCCTGACCTC GTAATCTGCC TGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC 2100
CACCACTCCC GGCCTGAGAC CTGGATCTTA AAAAGGGCTC AGCTGGGTGT AGTCACACAC 2160
CTGTAGTTCC AGTGACTTGG GAGGCTGATA TAGGAGGCTA GCTTGAAGCC 2210