EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS022-00842 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CD4+ 
Coordinate
chr1:115640180-115643370 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:115641047-115641065CTTTTCTTCCTTCCTTTC-7.38
IRF8MA0652.1chr1:115641759-115641773TCGAAACCGAAACC+7.73
IRF9MA0653.1chr1:115641758-115641773GTCGAAACCGAAACC+6.93
ZNF263MA0528.1chr1:115641039-115641060TCTTTTTCCTTTTCTTCCTTC-6.48
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01910chr1:115641368-115642575Aorta
SE_01910chr1:115642642-115643195Aorta
SE_12264chr1:115640516-115643864CD3
SE_12941chr1:115640570-115643877CD34_Primary_RO01480
SE_13473chr1:115640089-115643878CD34_Primary_RO01536
SE_14129chr1:115640687-115644134CD34_Primary_RO01549
SE_14940chr1:115640204-115643730CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16080chr1:115640579-115643628CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16535chr1:115640570-115643712CD4_Naive_Primary_8pool
SE_20532chr1:115640528-115643812CD56
SE_21790chr1:115640612-115643429CD8_Naive_7pool
SE_54685chr1:115640225-115643565Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1115642414115642600
chr1115642865115643000
chr1115641423115642360
Enhancer Sequence
GCTTCCCAAA GTGCTGAGAC TACAGGCATA AGCCACCACA CCCGGGCAAA AATCACTAAC 60
TTTTCTATAA ACTGACAACA GTCAAGCCGA GAGCCAAATC AGAAATGCAA TCCTGTTCAC 120
AATTGCCACA CACAAAAAAT AAAATACCTA GGAATACAGC TAACAAAGGA GGTGAAAGAG 180
CTCTACAAGG AGAACTATAA AACACTGCTC AAAGAAAGCA GAGATGACAC AAACAAATAG 240
AAAACTTTCC ATGTTCATGG ACGGGAAGAG TCAACATTGT TAAAATGGCC ATACTGCCCA 300
AAACAATTTA TAGATTCAAT GCTATTCCTA TTAAACTACC ATTGACATTC TCCACAGGAC 360
TATGAAAATT ATTTTAAAAT TCATATGGAA CCAAAAAAGA GCCCAAATAG TCAAGACAGC 420
CCTAACCAAA AATAACTAAG CTGGAGGCAT CACATTACCG GACTTCCAAC TATACTATAG 480
GGCTACAGTA ACCAAAACAG CACAGTATTG GTACAACAGT AGACACATAG ACAAATGGAA 540
CAGAATAGAG AATAGAGGCT GCACACCTGC AACTATCTGA TCTTTGACAA ACCTGACAAA 600
AACAAGCAAT AGGGAAAAGA CTCCCTATTC AATAAATGGT GCTGGGAGAA CTGGCTAGCC 660
ATATGCAGAA GATTAAAACT GGACCCCTTC CTTACAACAT ACACAAAAAT CAACTCAAGA 720
TGGATTAAAT ACTTAAATGT AAAACCCCAA AGTATAGAAA CCCTGGAAGA CAACCTAGGC 780
AATACCATTC TGAACAATTG CTCTTTCAAG AGGCTTAGTT GTGAGTGGTG CAGCAAGATG 840
AGTGGAAGCA AGCTTCTTTT CTTTTTCCTT TTCTTCCTTC CTTTCTTAAT GGGGAAGATT 900
TAAATGTGTT CATAGTCCTG GGGGAAGGTG CCTGGGGAGA GAGAGGTTGA AGGAGAAGAA 960
AAGCGAGAGC AGTGTTTCTG CAGAAATAGA ATGGGACTGA GAACCAGACA CTGATGGGGG 1020
CTTGCATTTG GAAACAAGGA AAATAAGCAA GGGTGGAGTT GTAGTACCAT TTTGTATTAT 1080
ATGTCTCATA ACCCTAGTAT CTGAACTCTC TGTGATCAGA CTTTGCTGCC TGTGGACTTT 1140
TCTACGTATT GATTTTAGTG TCTTGTTCCT TGTGTATTAT GTGATTTTTT TAAAGCTGTA 1200
AACTGCTTAC TTTCCTTGGA AATTTGTGGG AATTCTTTGA GTCCTTAGTT GAGATTTTAT 1260
TCCTCCAGAG AGGATTTTCT TTGCCTTCTG CAAATCATCT CAAGGCAGTA CCATAGTGTT 1320
AATTCAGACA ACAAATCCAT TTGAAGGCTG GCTTGTGGTG ACAAGGTCTC AGGGGAGATT 1380
TTCCCCACTC CAACACCAAG TCCAAAACGT ATACATTTCT TTGTCGTCTT TTGCATGATG 1440
GGTTTATTTC TTGTCTACTC TTCCCTTGAG GGTGTATCCT TTGGGAGGAG GTACCAGGTT 1500
TGGGTGAGGT CTCCTAATAC ACTGTCTATA TTAATGGCAT TTTAGGCTTT ACTTCACAAA 1560
CCCCAAGCGG TTGCAGCTGT CGAAACCGAA ACCCAGGGCA AAAGGTGGCT TTGGTGCCTG 1620
CTTACTTCGA GTTCTTGCTT TCACTTCATT TTGGCCTTTG TAGATTCTCT TCCTTTTGTG 1680
CTAGCTCAAC GATGTGGTTT TATTTTTACA TTCTTACATA TTTTATCCAG GGTCTTAGTT 1740
TCAGTCGAGA AGGTAGTTCA GGATATCAAA TCTGCCCTAC TGCTAGAAAA GGAAGCCCGG 1800
TGTGCCTGCT ATCGTAACTT TGGTTTTGAT AAGCAAACAC GAGCAGTTTT TGACTGCTGG 1860
GTTTACAGCA TAGGAACCCT GTTGCTATGC AGCTGTTGTT GGAAAATAGT CTGTGGGCTC 1920
AGAGTTTCTA AACCAACCGT CTATTGGATG CCCAGAGAAG GAAGGAAAGC GAGGGCCCTG 1980
GCTTGCTGAT TACAAACCAT CTCCATGGTC ACAGGTTGCT GGGTGCTCCT TTTACGATGT 2040
TTTCCCAGCA GCATGCAGGC AGCAGTAGCT TCCTTTGATC ATTTTTCAGT TTCTGTTATT 2100
TGCTAGTGAG AGAAAGTTTA TACCTGCTTG TGGGGACATG AGTGAAGAAA GAGAGGGGAC 2160
TTTGAAACAA GAGAAGAGAG CAAACTCAAA AGGTAACTGT TTGTTTTCAT AGGACCCTAT 2220
GGGAACAACT AGCCCATTTT TGTTTTCACT CGTGCAGCCA GTTGGGGGAA GGAGAGGAAC 2280
ATAACTCATC CAGGTCTGAG GTCTAAGTCT GAATATTTAT TGTGCCTCAC AGATGATCCC 2340
CATTTGAATC ATCCAAATTA GGAAAGAGTT TAAAAAATTA CTGAGTAATA GTCTGGCAGA 2400
ATTTTAATGT GACTTCTCTT GTTGACTTTA AGGTTTAACA GAGGCCCCAA AGGCTGAGAG 2460
CAAAATTGTA GGTACTTAAG TACCTTTACA TTCTAAAGCA AGGTGCAAGA TTGTCTATAT 2520
TAGTCAGACA TTATATATTC ATATAAGAGA TTTATTATAA GGAGTTGGCT CATGTGATTA 2580
TGGAGGCTGA CAGTCCTGAG GTCTGCAGTC AGCAAGCTGG AGACCCAGGA GAGCTAATAG 2640
TGGGGTTCTA GTCTGAATGC TGTCAGACTC CAGACCCAAG GAGAGCTGAT GTTTCAGTTC 2700
AAGTCCAAAA ACAGGAAAAG ATCTATGTCC CAGGTCAAGC ACTCAGGAAG GAGTTCCTTT 2760
TTACTTGCAA AAGGGTCAAC CCTTTTGTCC TATTCAGGCC TTCAGCTGAG CAGATGAGAG 2820
CTGCCCTTTA AGAATGGTAA TCTATTTTAC TTGGTCTACC AATTTACACC CTCACAGGCA 2880
TACCCAGAAT AATGTTTGAC CAAATATTTG GGGCCCCCCT GGCCTAGTCA AGTTGACATG 2940
TAAAATTAAC CATCACAGAG AACAAAAGAA ATGTAAAACA GGTAGACTAA ATTGAAAACA 3000
TACAATGAGA TGGTAAATTT ATACCTAAAT ATATCAGTAA CTTCTGTTGA AAATAATCAA 3060
GAAAAAGAGA GATTGCACAA ATAACCAATG TCAGGAAAAA AAAAAGATTA ATAACTCCAG 3120
ATCTGCAGAG ATTTAGATAA TAATAGGATA ATATAAACAA CTGCAAATAA ATTTGAAAGG 3180
TAGGTAAAAT 3190