EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS022-00468 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CD4+ 
Coordinate
chr1:40507840-40510350 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:40508870-40508882GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:40508874-40508886GTTTGTTTGTTT+6.32
Gfi1bMA0483.1chr1:40510026-40510037TGCTGAGATTT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04621chr1:40504387-40508977Brain_Anterior_Caudate
SE_09462chr1:40503165-40512252CD14
SE_11290chr1:40498854-40511770CD20
SE_13580chr1:40504190-40508691CD34_Primary_RO01536
SE_13580chr1:40509554-40510451CD34_Primary_RO01536
SE_14500chr1:40501672-40509273CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14500chr1:40509536-40510545CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17728chr1:40503252-40512050CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18663chr1:40503186-40518279CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20876chr1:40501712-40509197CD8_Memory_7pool
SE_20876chr1:40509205-40510446CD8_Memory_7pool
SE_22570chr1:40501660-40508911CD8_primiary
SE_22570chr1:40509401-40510629CD8_primiary
SE_26225chr1:40504106-40509062Duodenum_Smooth_Muscle
SE_50937chr1:40504074-40508819Sigmoid_Colon
SE_52954chr1:40507754-40508726Small_Intestine
SE_53653chr1:40504044-40508995Spleen
SE_60101chr1:40499989-40553062Ly4
SE_62827chr1:40499695-40532104Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I040043chr14050920640511990
Enhancer Sequence
GCCCGGCCCC ACCAGACGTT TATTAAGACC TTAATATGTA TGAGGCACAT TTTAATGAGA 60
TAGCCTTTGT GGCAAAGAAT ACAGTTCTTC TGGAGTTTAC AGTGGGAGAG GAAATAGACA 120
AGTAAATGAG GGATGGCTTA CAGTGTCATA GTGCATAGCA CAGGGCTACA AGAGCACAGT 180
GGAGAAATAC CTGAGCCAGG TGCCCAGGGT TCCAGGAGGA AATGGGAGGC TAACTCTTGA 240
AATATTTATT TAGCTACATA GGGAATCCGG AAAAGGGATT TCCAGGCAGA GACTACTACA 300
GGTGCAAGGA CCTGGAGAAC CGGACAGCTG AAAGACCATG ACGAGTTCAG TGTGACTGGA 360
ATTCTAGTAA TGGCTGGGGA AGTGGAGGAA GTGAGATGTG GTCAGGTCAG TCATATGTGG 420
AGGACATTGT AAGTCATGCT AAGGAATTTG GATTTTTACC CTGAAAGCTA TGGAGATGCT 480
TTGAAGGGTT TTATGCAGGA AAATGATGTC GTCAGATTTA TATTTCAGAA AGTTCATTCT 540
GTCAAGTAGG AGGGGACCAG CCCTGTGGGG AAGTAAAACA GTGTTTGGAA GCTCTTGCTG 600
TAGACATGGC CTGAACTAAG ACAGTGGAAA TGGGAATGGA GAGGAGGCAT CAGATGTGAG 660
CAATATTAAG AAGATAGAAT CCATAGAATT GGAGGCTGAT TATGGGAATG AAGAGGTAAG 720
AATAGCGCGA TTGCCTGGCT TTCTGGCTTA GGGAACTGAA TGGGTAGTAC CATTCAGATA 780
GAGAGTATGA GAGGTAAATT AGGGAAGTGA CATGGGAAAA AATGCATTTT GAATGTTTTT 840
AGTTTGAGGT GTTTGTAGCA CATCCAGGCA AAGATGTCTA ATAAGGTGGG TCAGCTAAAG 900
GAAAGAGCAA GAGTAAAGAT ACGGAGGCAG GAGAGGGCCT AAATTGTTCA GTGATACTGG 960
GGCCTGGAGT TTTGCAGAAG ACCAGACTGC AAAAAAGGTT AGATGTCGGC CAAGTTGTGA 1020
AGGGCTTTTT GTTTGTTTGT TTGTTTTGAG ACGGAGTCTT GCTCTGTTGC CCAGGCTGGT 1080
GTGCAGTGGC ACAATCTCGG GTCACTGAAA CCTCCACCTC CCAGGTTCAA GGAATTCTCC 1140
TGCCTCAGCC TCCTGAGAAA CTGGGATTAC AGGCGTGCGC CACCACGCCC GGCTAATTTT 1200
TGTATTTTTA GTAGAGACGG GATTTTACCA TGCTGGCCAG GCTGGTTTCG AACTCCTGAC 1260
CTCGTGATCC GCCTGCCTCG CCCTCCCAAA GTGTTGTGAT TACAGGTGTG AGCCTCCGCA 1320
CCCGGCGTGA AGGGCTTTTA ATGCCTTGTT GAATTTGTTT GGATTTGATT TTGTGGGTGG 1380
CAGTTTGCTA ATTGATTTGC CCAGGTCCAG CATAAAGAAA TTTCTGGGCT GGGCACAGTG 1440
ACTCACGCCT GTAATCCTGA CACTTTGGGA GGCTGAGGTG GGCAAATCAC TTGAGATCAG 1500
GAGTTCAAGA CCATCCTAGC CAACATGGTG AAACACCATC ACTACTAAAA ATACAAAAAT 1560
TAGCTGGGCG TGGTTGTGCA TGCCTGTAGT CCCAGCTACT TGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 1620
CTCGCTTGAA CCCGGGAGGC GGAGGTTGCA GTGAGCTGAG ATTGCACTGC TGCACTCCAG 1680
CCTGGGTGAT AGTGAGACTC TGTCTCAAAA AAAAAAGAAA AGAAAAAAGA AATTTCTCGC 1740
TTTTTCCAGA AATACTTCCT CAATTGGGTA GGCATAATTG ATATCTCAGA GAAGTTTAAA 1800
TAAAATGGTA GCAGCAAAAG TACTTTGTAG AATACAGCCT GATGTGCAAA CCAAAAGTGG 1860
TGATATTGTT AAGATTCAGT GAGTATATTT TTGCTTTGGA GTTTAGCTAT TGAGTCTGTA 1920
AAATGTTTTG TTTCCAACCT AGGGATGATC TTTTATTCTC ACCCTTTTTC CTGGTTGCAG 1980
TTATTTTTTT AGCTTTTAAA AAGTGACTTT CTTGAGGCTG AGTTAGAGAC TAGCCTGGTC 2040
AACATAGTGA GACCCCTGTC TCTACCAGAA AAAAAAAAGG TGACTTCCTC CTTTCAGTTT 2100
TTTGTGAAGC ATTGTGAATC AAATTTTTTT TTACTTAAGC AAATGCAATG TGTCACTGGA 2160
AGCCGAACCT CTGGTTTGAA ATTTAATGCT GAGATTTGAA ATATGAGAGT TCTCGAGCGG 2220
TATCTTACCC AATTTTAGTG ATTATTACTT TGAAATGTTG ACATCAGTTT CTTTCTTTAT 2280
TTGTGCTAAC CTGGCTTTCA TGACCTATAC TTCAGTTTCT CTATGACAAC CAGACAAATC 2340
TTTTTAAAGT TCTCTAAGAA GAAGCATTTT TCATCTTGTT AGTCTTCACT GACTTCATAT 2400
TTACAAAGAA TAAATTCTGA ACTCTTTTTT CCATCTTACA GAATTCTCTA CAGTTTAGAC 2460
CCTTATCTTA ATTTTTATTA GATGATACAG GTTGACTTTC TAATTTAGAA 2510