EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS022-00334 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CD4+ 
Coordinate
chr1:28571950-28576070 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:28575155-28575174TGGCCTGCAGGGGGCGTTG+6.36
Gfi1bMA0483.1chr1:28575846-28575857AAATCACAGCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:28572493-28572504AATTTAATTAA+6.32
Nfe2l2MA0150.2chr1:28575358-28575373CATAATGACTCTGCA+6.15
PHOX2AMA0713.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
RUNX1MA0002.2chr1:28573301-28573312AAACCACAGAG-6.14
SNAI2MA0745.2chr1:28572942-28572952AACAGGTGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:28575393-28575404TTCTTTGTTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr1:28574936-28574946AAAACAATGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15081chr1:28571965-28577001CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21005chr1:28572183-28576988CD8_Memory_7pool
SE_29182chr1:28569155-28576849Fetal_Intestine_Large
SE_40167chr1:28572835-28576978K562
SE_64750chr1:28572499-28577008NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12857218328572244
chr12857230028572395
Enhancer Sequence
AAAAAAAAAA AAAGTTTTAC AATTAGCATT AAGAGTCTTT TGTTTTTTGG GTTTTTTGTT 60
TTGTTTTGTT TTGTTTTGAG ATGGAGTTTT GCTCTTATTG CCCAGGCTGG AGTGCAATGG 120
CGCGATCTCG GCTCACCGCA ACCTCTGCCT CCCGGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC 180
CTCCCGAGTA GCTGGGATTA CAGGCATGTG CCACCACGTC CGGCTAATTT TGTACTTTTA 240
GTAGAGACGG GGTTTCCCCA TGTTGGTCAG GCTGGTTTCA AACTCCTGAC CTCAGGTGAT 300
CCGCCCACCT CAGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCA TGAGCCACCG TGCCTGGCCC 360
AAGAGTGTTA AAGTCTGGTG CAGTGGCCTG TAGTCCCAGC TACCCCAGAG GCTGAAGCAG 420
GAGGATCATG TGAGCCCAGG AGTTTGAGAC CAACCTGGGC AACACAGCAA TACTCCCTCT 480
CTTAAAAAAA AAAAAGCCTT AAATTTATTT GTTCATAGTC TTCAACTCAC GAATTTTTCT 540
AGGAATTTAA TTAATCAGGA ATATAATTAT TTAAGAGTTT TATCTCATCT TGAAATATGT 600
GAAAAATTGG GAAGAAAACC CTAAATGTTC TCAATAAGGA TTAATAAATT ATAGCATACA 660
TGAATAGTCT GCAACCATTA ACAATTATAT TTAAGGAATA TTTAATATTA CAAAAATTAT 720
GAAATGTGCT AAGTGGAAAA AGCAGGCTAT ATAGCTATAC ATTATTAATA CGGTATATAA 780
ACTTATATGC TATAAAAATA ACCAACATGT TGGTTTCTCT TTGTAGTGCA ATTGGGATTT 840
GAGGGAGTTC TCCCTTCTCT GTTTAAAAGG ATCTCTTTAA AAAACAACAA ATGTAATACA 900
ACTTAGCACA TAGATAGATA TTAAATAAGT GTATTATATA AAGAATCTTA AAACTTCTCC 960
CTTCTCCGTC CACCCCAGAG CTAACCAATG GTAACAGGTG CAAACTACAC ATCTTTCCAG 1020
ATCTTTGTTT CCTCTGTGTA ACTATGTATA CAACTATGAG ACTGTTCTAT ATGTATCATT 1080
GCGCAACCTC GGTTTTTGCT TCGTTCTGTT TTAACCTAAC AGGAAATCCT GCATACCTTT 1140
CCATTTCAGA GCACTTGGAG CTACCTTCTG TTTCTTTGCT GTAGAAGCCG TTGTGTGAAC 1200
AAATCCGTTT ATTTCTCTCA TCAGTCTCCT TTGATAGACA TTTGGGTCAC GTCCGGTTTT 1260
ACGCTTTTAC AATACATCAG TGAACAGCAG TAATACGAGC TCAAGACAGA AGGCCTGAAA 1320
AACATTGAAA AACACAGAGA CGGAAAAAAA AAAACCACAG AGGGGGAAAT ATAATTTCGG 1380
GTTATTTCAG TTTCACCTTT ACACTTTGTT ATATTCCACA TTTTTTGCAA TAAATATAAA 1440
TTTGGAAGTA AAAGCATAAA ACGAAAATCA AACGATTGAT TGATTGATTG ATTGACTGAG 1500
ACGGAGTATC ACTCTCGTCG TCCAGGCTGG AGTGTAGTGG CGCGTTCTCG GCTCACTGCA 1560
ACCTCCGTCT CCCGGATTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA GCTGGGATTA 1620
CAGGCGCCCG CCACCACGCC CGGCAAATTT CCAAACGTAT ATTTAAAAGA AGAAAAGGAA 1680
AAGAGGGGAA AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAT TAGAAGCAGA TGGGGCAGTT 1740
CAGCCTCTTC TCGCGGAGCG GGGCTAGACG GAGTCAGGGG CGGACCGCCA CAGCCTGCAC 1800
CAATCAGGAC CCGGTTGATA GGCAGAGCCT GGCGACTTCG AAGACTCGCC CCCAGTCAAA 1860
GAGCCCCGGG GATTCGTTTC CGTACGCAGC CTGGAAACCA GCCTGGGCCT ATCCTGCGCG 1920
CCGCTGCGGG CTACTATTGG CTGCCAAGAA ACCCCGCCCA TCTTCCTGCT CATTGGCCGG 1980
TGCGGTTTAC GTAAGAGGAG CCTGTTGCTG AGCGAAAAGT CTGTTCTGCA ATTTTCGCTA 2040
AGGAGTTGTT AACGCTGAAA CCGCACTGGG CGTCCTGGGG TCAAAAAAAC AATACTAGCC 2100
ACAGTTTATT AAACTGCAAC TAAATGCCAG GCTATGTGCG CCAAACTTTT AATATTAATG 2160
GTTGTAGGCA CCTTTCTTGA ACACCCACCA CTATCAGCCA GTCACTGAGC CAGATCCTTC 2220
AAAATAACAG TAAAAATATA GATAATCTAC AGTTTATTGA GCACTTCATC TGCATCAAGC 2280
CTTGTTAAGG GGTTTCCATG CATAAGCTCT CATTCTCACA ATAGAACGGT GGAGGTAAAC 2340
TATTGCCCCA TTTAACATTT AACATGCAGT CCTGTAGACC CAGCTACTCG GAAGGCTGAG 2400
GTGAGAGGAC CCAGGAGCTC CAAACTTAAG TGAGCTATGA TCGCGCCACT GCACTCCAGC 2460
CTGGGCAACA GAACGAGACC TGTCTCAGAA AAACAAAAAC GTAATAAAAG AAAAACAAAA 2520
ACAAAAAAAC AGGAAACGGG TTCAGAGAAG TGAAGTGTTT TGCTGAGGTT CACAAAGAAA 2580
GGGTTGGAAC TGGAACCTTC AACTCCGATA TCCTGATTCC AAGTGTGGCC TTTTTAGGGA 2640
GGGGGTCGGG GTACAGAATT CCGCTGGGGA TAGGGAAAGG TAGGACAGGA TGGTGGGAGG 2700
CCAGAGGCGT TGCTCCAGGG ACAAGCCTCA GGGTGGTTCT CTGAGAATAG GATGTATAGA 2760
GCCTCTAGGA GTGGAGGGTT GGGGAAGGAA GGGAGACCAG AGGAAAGGGA GAAGTTGTTC 2820
TTTCTGAAAA TGTGAGGCTT CTCTCCTGGG GCAGCCTATT AAGGTGTAGG TAGCCCTGGA 2880
CCTCGAGATT CTAGTCTCCA CTCTGTGGCC AACTTCCTAG GGAACCTTGG GCAAATTCCT 2940
CTCTCTCGAC CTGAGGCTTC CTGCCTTGTA AGAGAGGTAG TAAGCCAAAA CAATGGAAAG 3000
TGCATTCGGG CTGTGAAGTA TTTTAGGACT CTGGTCCTTG CTGGCAGCAG GGGGAATCTT 3060
CAGCAACCAC AGACCTTTAC TTAGCTGTTG CCTGGCCTCT TTTCAAGACC TTCAGGCGGT 3120
GACATGGACC CTAACAATCC TATAAACTCA AAACGGTTTG GGCCAGCCCT TTCCTACTCC 3180
ATTCTGACTT AGCTATAGCA GGATCTGGCC TGCAGGGGGC GTTGAGGAAC CACTCAGCCG 3240
ACAAAACTAA ACTAAATCAA CCAAGCAATT TGCCCAAAAG CACCCAGTGC GTTAGTTTTT 3300
GCATTTAAGA AGGGTAAACG TTTCCAAACC TGAAGATTTC TGTCCTCAGT ATGCAATCGA 3360
GAAGACGAAT TATATACACT GCCAGTTCTT TATGGCACCA GTTCTCTCCA TAATGACTCT 3420
GCAAGTTTAG AGCTAATTTC TATTTCTTTG TTTTACAGAT AGGGAAACAG ATTCAAAGAG 3480
CTGGAAAAAA AAAATTCAGT TTGGGTTACT TGGCTAAAAG CTGGCACCCG AATTGCCTGA 3540
CTCCTGGGAA GTGCTCTTAG GAGATAGTTG GCTTTGTTTC TGGGAGTCTG TGGTTGTACT 3600
GCCTGCTAAT GCACAACTCC AAAGGACAAT TTTGGTTGTG TAGCTTGACA GCTCGGCACC 3660
TGTCAGCTCT GTGCAGGAAG GACCTCCCTC CCCACCTAGC ACAATGCCTG CTTCATGAGT 3720
AATTGAATTA ATGTGTGACT AAGCCTTGAA GGATGGGTCT TCTTTGGCTT TATCAAACCA 3780
ATTGGAGTGG AACTTCTTTC CTGAAAGTTC CCCCTGGGCA GGAATTGTAT CTGAGATTAG 3840
TGGGTGGGGA GGGGGGAAAC AATAAGAAGA GCTCAGAAAA TGACATCTGG GGTGATAAAT 3900
CACAGCCCCC CGAATGGTCC CATTACAAGG TCATTATAGT AAAGTGATCT CAGAATTTGA 3960
GACTAGAAAA CTAATTCAGG AAGAATGAAT ACAGAACAGA TGACAATCAT ATTAGGGTCA 4020
TAATCTGAAA TGGATCTAAG GCTGAAGACA TCTCAAAAAC ATTTCAAATC CAGTCTAGGT 4080
AGGTGTATCT TTGGGACTGG AAGGTGATTG AGGAATATAA 4120