EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS020-09625 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
CD34+ 
Coordinate
chr12:7016710-7018610 
Target genes
Number: 54             
NameEnsembl ID
TNFRSF1AENSG00000067182
RP1ENSG00000213942
CD27ENSG00000139193
LOC678655ENSG00000215039
TAPBPLENSG00000139192
VAMP1ENSG00000139190
NCAPD2ENSG00000010292
MRPL51ENSG00000111639
SCARNA10ENSG00000239002
RP5ENSG00000255966
GAPDHENSG00000111640
IFFO1ENSG00000010295
NOP2ENSG00000111641
SCARNA11ENSG00000247853
CHD4ENSG00000111642
LPAR5ENSG00000184574
ACRBPENSG00000111644
ING4ENSG00000111653
ZNF384ENSG00000126746
COPS7AENSG00000111652
PTMSENSG00000159335
MLF2ENSG00000089693
LAG3ENSG00000089692
AC125494.2ENSG00000244532
CD4ENSG00000010610
GPR162ENSG00000250510
U47924.11ENSG00000256010
LEPREL2ENSG00000110811
GNB3ENSG00000111664
U47924.25ENSG00000237240
CDCA3ENSG00000111665
USP5ENSG00000111667
TPI1ENSG00000111669
DSTNP2ENSG00000248593
SPSB2ENSG00000111671
ENO2ENSG00000111674
ATN1ENSG00000111676
C12orf57ENSG00000111678
PTPN6ENSG00000111679
U47924.27ENSG00000257084
SCARNA12ENSG00000238795
EMG1ENSG00000126749
PHB2ENSG00000215021
U47924.19ENSG00000255896
C1SENSG00000182326
LPCAT3ENSG00000111684
RP3ENSG00000239701
C1RENSG00000159403
ABC12ENSG00000205885
C1RLENSG00000139178
RBP5ENSG00000139194
CLSTN3ENSG00000139182
RP11ENSG00000256967
PEX5ENSG00000139197
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr12:7017201-7017212GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:7017202-7017215ATTTAATTAATTT-6.07
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_68053chr12:6999072-7081180TC32
SE_68054chr12:6999072-7081180TC32
SE_68055chr12:6999072-7081180TC32
SE_68056chr12:6999072-7081180TC32
SE_68057chr12:6999072-7081180TC32
SE_68058chr12:6999072-7081180TC32
SE_68059chr12:6999072-7081180TC32
SE_68060chr12:6999072-7081180TC32
Enhancer Sequence
ATAATAACTG GTATTATTAT CAAGACCATA GTTGGTTCCA GATGCTGTGG AGATACACAG 60
CCACCTAGCA GGGCTGATAA TATATAATGT GTGGATAATA CAGAGATAAT TTACCTTGAT 120
ACAGGTAGTA GCAAAATGGA CCATAATTGA GGTACAAACA TCAGTCTGTG GAAATGTTTT 180
AGGAAAACCC TCCTCTCAGA CTGGGTTTTT CTTCAGCTCT TACACTACCA CCACAACAAT 240
CATCAACATA CGACTTCCGG GACCAAAGGT GTGGGGGTTT CTCCCCATAC ACCAAGTAGT 300
AGACACCAGC TGGGTGATCT CTAATTCGAT TCACTGTCTA CCTGGGGATG GCATCAAATC 360
CCACAGATTG AGGGCTCGGT TCCCAAGAGT GACCCCTACA CCGCCCACAT ACACCAGTTG 420
CAAGTCCAAG CCTCCAGAAC TTCTGACACA CCAGCTTCAA CATGAAGCTG GTTCCCATGA 480
CCTCTTCTCT GGATTTAATT AATTTTCTAG AGTGGTTTTT ATTAGTTTAT TGCAAGGGCA 540
AAGGATACAG ATGAAGAGAT GCTTAGGGCG AAGTATGGGG ATATGGGTGC AGTGCTCCAT 600
GCCCTTCCCA GATGCATCAC CCTCCAAAAG CTTTCACGTG TTCAGCTACC CAGAAGCTCT 660
CTGGACCCAG TCCTCTTGGC TTTTCATGGA AGCTTCATGA TCTTAGTATT CCTTCCCCCA 720
GGAAACTGGG GAGGCTGTCG CTGGGGAGGG TCTTAAGAAC CACAATCAGG CCGGGCGCGG 780
TGGCTCATGT CTGTAATCCC AGCACTTTGG GAGGCTGAGG CGGGCGGATC ACCTGAGGTC 840
CGGAGTTCGA AACCAGCCTG GCCAACATGG CGAAACTCTG TCTCTACTAA AAATACAAAA 900
ATTAGCCCAG TGTGCTGACA TGCGCCTGTA ATCCCAGCTA CTAGGGAGGC TGAGGCAGCA 960
GAATGGCTTG AACCCAGAAG GCAGAGTTTG CAGTGAGCTG AGATCACGCC ACTGCAATCC 1020
AGCCTGGGAG ACAGAGCAAG ACTCCATCTC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAACCAAAG 1080
AAAAACACGG TGAAACCCCG TCTCTACTAA AAATACAAAA AAAAAAAATT AGCTGCGTGT 1140
GGTGGCAGGC ACCTGTAGTC CCAGCTACTC GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TGGCGTGAAC 1200
CCAGGAGGCG GGGCTTGCAG TGAGCCGAGA TTGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA 1260
GAGCTAGACT CTGTTTCAAA AAAAAAAAAA GAAAGAATCA CAGTCAGAAA GAGGGAGTGG 1320
GGGGAAAGAT TAGCGCTTTC TCTTGGAGCA GGTGAAAAGA CGGCTGGAGA AGTTCCTGAG 1380
ACCTGCCCCT GAGGCCCAGC ACACCCAACT TTATAACAAA AGACTGCAAG AAGGGCTATT 1440
ATGGGGGTTA TAAGCTAGGG ACTGTGGATG AAAACCGATA TATATATTAT ATATTATATA 1500
ATTATATATT ATATATAAAT ATATATTATA TATTATATAA TTATATATTA TATATAATAT 1560
ATAATTACAT ATAATATATA ATATATAATT ATATATTATA TATTATATAT TATATATAAA 1620
ATATATAATA TATAATTATA TATTATATAT AATATATAAT TATATATAAT ATATATAATT 1680
AGATATAATA TATAATTATA TATTATATAT AATTATATAT AATATATTAT ATATAATTAT 1740
ATATAATACA TAAATATATA TAATAGTATA TATTATATAT AATATATATA ATATATAAAT 1800
ATATATAATA GTATATTATA TATAATATAT TTTATATAAT ATATAAATAT TATATATAAT 1860
AGTATATTAT ATATAATATA TAAATATTAT ATATAATAGT 1900