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EnhancerAtlas ID | HS012-20636 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | Caco-2 |
Coordinate | chr6:37475480-37476780 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475630-37475650 | TAGGTGGTGGTGGTGGGGGT | - | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475669-37475689 | TAGGTGGTGGTGGTGGGGGT | - | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475688-37475708 | TAGGTGGTGGTGGTGGGTGG | - | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475485-37475505 | TGGTGGTGGGGGGTGGGGGT | - | 6.06 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475523-37475543 | GGGTAGGTGGTGGTGGGGTG | - | 6.37 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475526-37475546 | TAGGTGGTGGTGGGGTGGGG | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475572-37475592 | GGGTAGGTGGTGGGGGGTGG | - | 6.43 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475620-37475640 | GGGTTGGGGGTAGGTGGTGG | - | 6.4 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475537-37475557 | GGGGTGGGGGTAGGTGGTGG | - | 6.51 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475604-37475624 | GGGTAGGTGGTGTTGGGGGT | - | 6.74 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475544-37475564 | GGGTAGGTGGTGGTGGGGGT | - | 6.97 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475736-37475756 | GGGTAGGTGGTGGTGGGGGT | - | 6.97 | RREB1 | MA0073.1 | chr6:37475691-37475711 | GTGGTGGTGGTGGGTGGGGG | - | 7.32 |
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| Number of super-enhancer constituents: 11 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_11858 | chr6:37475678-37476529 | CD3 | SE_14556 | chr6:37475765-37476750 | CD4_Memory_Primary_7pool | SE_15586 | chr6:37475735-37476821 | CD4_Memory_Primary_8pool | SE_16914 | chr6:37475739-37476619 | CD4p_CD225int_CD127p_Tmem | SE_17841 | chr6:37475681-37477146 | CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory | SE_19097 | chr6:37475730-37476803 | CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th | SE_22421 | chr6:37475619-37476832 | CD8_primiary | SE_31044 | chr6:37475600-37481215 | Fetal_Thymus | SE_47334 | chr6:37475850-37476605 | Panc1 | SE_55352 | chr6:37475829-37476966 | Thymus | SE_63149 | chr6:37456974-37486547 | Tonsil |
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| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH06I037506 | chr6 | 37474671 | 37475508 | GH06I037507 | chr6 | 37475746 | 37476841 |
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Enhancer Sequence | GTAGGTGGTG GTGGGGGGTG GGGGTAGATG GTGATGGGGA TGGGGGTAGG TGGTGGTGGG 60 GTGGGGGTAG GTGGTGGTGG GGGTGGGGGT AGGGGTAGGT GGTGGGGGGT GGGGGTAGGG 120 GTGTGGGTAG GTGGTGTTGG GGGTTGGGGG TAGGTGGTGG TGGTGGGGGT AGGTGGTGGT 180 GGGTGAGGGT AGGTGGTGGT GGTGGGGGTA GGTGGTGGTG GTGGGTGGGG GTCGGGGTAG 240 GTGGTGCTGG GGCTGGGGGT AGGTGGTGGT GGGGGTGGGG GTAGTTCTGG CAGGTGTCAA 300 GTTCTTTGTT CTCTAACGCA ATTACCTTGG GGTGGGGGAT GGTGGCTACA GTGAGGCCTT 360 CACCAGCTGC GCACCCAGGG CAGGTTGCTT TTCTCAGTTT CCTCCTCTGA TATTTATCTT 420 GTATGTGTAA AGTGCTTAGA GCAGTGTGCA GCAATGCAAG CTATTTATTA TGTGAGTAAC 480 CTGCTTTTTA AAGATGGCAT TTGCCCACAA AACCTTCTTA GACCCTTAGT GTTTAGCTTT 540 CACTCACATC TCTCTAGCTA CTGTAATTGC AGCCTGGAAT GATTACATTT TCAGCAAAAA 600 ACAAGTCACA TTCAAAGCCC AAGTGTGATA ACCACATGAA AAGCAATCAG TCTCTGTCCT 660 TTGACACACC TTGATATGAA GGCTGTACCT GTGATAAGGT AGTTGTCTCA GCGTATACAT 720 TCCCTAGGAC AGGAGCTGAC CAGCTTGATT GAAGTTTCTC ATGAAACTTT CATTCAACAA 780 TTATTTGCTA AGTGCCTGGG CTGGGGGACA GGGGCTGTCT GTATGGTGAC AGATTAACAG 840 ATAAATACAA TACCAGGACT GTGAGAGAGG CAAGTGTAAG GAGCTATGGA TGCAATGAGT 900 ATATGGACCC AGTTCAGATG GGGGCATTAG GGAAGGAGGC CCAGAGGAAG AGAAAGATGA 960 GTAAGAGTTA GATGGGCAAT GGAATTTTAC ACCCACAGAT CAGCAGACAC CTGACAAAAC 1020 CAAGTGGGTA CAAAAGTCTG GAAAGCAAAT CAGCATTAAC TAGCAAAGTT GAAGATGCAT 1080 TTGTGCACCA GTTGAGGTAT ATGAGCGTGA ACTTTGTTGC AACAGCGAAG AATCAAAAAC 1140 GTAAATGTCC ATTGTATTCA TTAGCTGCTG CTGCAATAAA GCTGTGTAAC AAACAATCCT 1200 AAGAATATCA TTGGCTTATA ATGACAAACA TTTATTTCTT GCACACAGGA GTGCAGGTGA 1260 GCTGGGGTGA ACTCACGTTC ACATTGGCTA CAAGTAGCTC 1300
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