EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-18531 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr3:149118690-149120620 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:149119042-149119056CTTGTTTACCTTTG-7.03
IRF1MA0050.2chr3:149120522-149120543AAGAAAAAAGTGAAAGCCTAT-6.12
Lhx3MA0135.1chr3:149119706-149119719AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr3:149119705-149119718AAATTAATTAATT+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:149119336-149119351TGTTATTTTTAGAAA-6.17
POU6F1MA0628.1chr3:149119707-149119717ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:149119707-149119717ATTAATTAAT-6.02
TFAP4MA0691.1chr3:149119330-149119340ATCAGCTGTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27098chr3:149118857-149119346Esophagus
SE_27098chr3:149119605-149120202Esophagus
SE_28499chr3:149118460-149120176Fetal_Intestine
SE_32147chr3:149118866-149119456Gastric
SE_32147chr3:149119595-149120590Gastric
SE_33885chr3:149118040-149120708HCC1954
SE_34635chr3:149118220-149120867HeLa
SE_38218chr3:149118769-149120838HUVEC
SE_45806chr3:149118827-149120740Osteoblasts
SE_47116chr3:149118550-149120863Panc1
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I149400chr3149118137149120952
Enhancer Sequence
AACAATACTT CTATTTATAT AAACTTCTGT GGTCTTCAAA GCCCTTCTAA ATGTATAACC 60
AAAATGTTGA GAAAAGGCTA TATGGTTGTT ACATTTACTG ACCAGAATTG AGCTATTTTG 120
TTTGATGCTC AAAACAATGT TTGATATAGG TAGAGAAGGT GTTTTATTAC TTCATCGTTA 180
TTATTATTAT TTTACAACTG GAAAAACTAA GAGAGTTCAG ATGACTTGCC CAGAATCCAG 240
AAAAAGTAGC AAGACTGGAA GTAAACCTAT GTTTCCAATC CTAGTACCTT TTCTCTCCTA 300
ATATATCATA CAGTTTCTAA GATAATTATG AAAGGTGATT GACTTGAAAT CACTTGTTTA 360
CCTTTGAAGA GAGATTTTCT TTCCAGATCT CCAGTTGCCT GTCACTACCC TCTGTCAAGA 420
CCCTTGGAGT CATGACTAAC AGGAAGGGAG CAGGTGGCAG CGTGGCCACC TGCCATGCAG 480
AAAGACTGGG TCACTTCCTG TTGGTAAAGG GTTTCCTGGT TCAGGTTTGT TAGGCATTCT 540
AAAATGGAGA GAAAAACAAA TGCACCTCTA AAGTACATGG AAAAATAAAC ACCAAAGTCA 600
ATGTTTTTGT GTTCCAAATG AAAATGTCAC TCTAAAGAGA ATCAGCTGTT ATTTTTAGAA 660
AGAAAGAATA AAATTTCAGC TCTGTATACC AAAACTATAG CCTCATCCAT TAGGGACACT 720
GATGTAGAAG CAAGTAGAAA CTATCCAAAG TCTGCAGTTC CTACCTGACT AGGTAATGCT 780
TAAATAAATA ATCAGTTCTC ATCATGCAAC TCAATGTTTA GCTGAGTCCA AACATACTGC 840
TGCCAACATT TTAAAGTCAA CAACGATATC TAAAATAAAC ATAGGCTGAC TAACACACAC 900
TGGTACTTTA ATGAAAATAT ATTGTGAAAT AGCTCCTTGC CAATAGAAGT TCTTGCGCTC 960
CTTCTTTGGA TAACTGTGGA CTATTCAACA GAATGTTAAG CCACCTATAT TTTTTAAATT 1020
AATTAATTCA ACAACCTCCC CCCTTTTTCG AGCACTTACT CTTAAGAATT TGAAGGATCT 1080
GAGATTTTAG CTTATTTTAT CCTATTTTGA AGCTATTTGT TAGCTTGCCA GTTTCAAAGG 1140
AACTGGTAGA AGTCATGAGA TTCTTGGGTC AGAGACAAGT GACTTTGTTA CAGCAGTAGC 1200
AGTAGCCAGT TTCAGCATTT GAGAGGAACT CTGAGCTTAG GGAAATCAGG CCTTTTACAC 1260
CGAACAGGAA GCATGCCTAC TCATTACTCT TGAGACACTT TTTCACTCTT CCAAGGTGGT 1320
TTGCTACACA AACACCCTTG AAAAATAGTC CAGAACAAAG TCAGTCAATC CCTTTACTCA 1380
TGAGACATGT AGAAATGTGA GAAATCCAAG GAGAATTGTC TCCAGACACT TACTCTCTAC 1440
CAGACATTGT AATAGATGCT AAACATACGA AGATAGAAAG AAAGAACATG CTACCTAATT 1500
CTTGATAAAT ATAATAGTGC TAATAAATTC AACTGACATT AAACTCTCAA GTTCTGTCCA 1560
TAGAAAATGT AGGAAGTTCA GTTTGTTTAG TAACCCTCTT TAAATTCTTC TAATCAAGAA 1620
AATTGGTGAA GTATTCACAA GGCAGAAAGC CTGCCTTTTC ATCACCAGCT TGTTTGCCAG 1680
TGAAGTGTTG AAGTACTATG TGTTGGCAAA ATGGAACTAA CGCATTACAA TTACATTAGA 1740
GTGCAATATC TCCGCACTTT CCAAAGTTTT CAGTCTGTGG CATAATGATC AAGATGACAT 1800
AAAGGCAAAG GTCACTGGCA GGGGAAGTAG ATAAGAAAAA AGTGAAAGCC TATAGAAAAA 1860
TATTATCAAG GAAACCTTTC TTAATTGTAC TGATAGGACT TTGCTATAAA AGAAATTAGA 1920
ATTAAGCCAC 1930