EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-17270 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr20:30292040-30297290 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6060821chr2030294034hg19
rs80054178chr2030294682hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr20:30295800-30295813AGGAGCAGCTGCT-6.11
TFAP4MA0691.1chr20:30293234-30293244AACAGCTGAT+6.02
ZNF143MA0088.2chr20:30294777-30294793TTCCCACAATGCCATG+7.06
Number of super-enhancer constituents: 104             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30292383-30293830Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30293974-30296822Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30293288-30294321Aorta
SE_01656chr20:30295753-30297464Aorta
SE_02627chr20:30291813-30293615Astrocytes
SE_03109chr20:30295668-30296248Bladder
SE_03156chr20:30292475-30293118Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30293152-30295232Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30295499-30297228Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30293076-30297376Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30292005-30297574Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30296331-30296936Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30294062-30295511CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30295550-30297154CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30292092-30297225CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30292973-30294930CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18483chr20:30295500-30297239CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30295673-30296770CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30292149-30295366CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30294469-30295251CD8_primiary
SE_22440chr20:30295774-30296556CD8_primiary
SE_23622chr20:30291926-30293145Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30293276-30294340Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30295644-30297320Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30291945-30297378DND41
SE_25933chr20:30291811-30295349Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25933chr20:30295533-30297299Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30291662-30293146Esophagus
SE_26879chr20:30293157-30294278Esophagus
SE_26879chr20:30295600-30297395Esophagus
SE_27731chr20:30291257-30297421Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30291565-30297515Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30292078-30302768Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30291980-30293111Gastric
SE_31430chr20:30293220-30295196Gastric
SE_31430chr20:30295525-30297479Gastric
SE_33407chr20:30292055-30302718H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30291507-30295446HeLa
SE_34643chr20:30295497-30297120HeLa
SE_35852chr20:30291735-30295247HMEC
SE_35852chr20:30295533-30296546HMEC
SE_36989chr20:30291921-30294611HSMMtube
SE_36989chr20:30295237-30297458HSMMtube
SE_38141chr20:30291885-30293880HUVEC
SE_39443chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_39443chr20:30295619-30296905Jurkat
SE_39853chr20:30292057-30293062K562
SE_39853chr20:30293169-30295459K562
SE_39853chr20:30295594-30296586K562
SE_40644chr20:30291815-30295345Left_Ventricle
SE_40644chr20:30295475-30297500Left_Ventricle
SE_41648chr20:30295850-30297257LNCaP
SE_42121chr20:30291801-30295313Lung
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_45708chr20:30291884-30293174Osteoblasts
SE_47264chr20:30291858-30294978Panc1
SE_47264chr20:30295479-30296870Panc1
SE_47861chr20:30291945-30292571Pancreas
SE_47861chr20:30293292-30293942Pancreas
SE_47861chr20:30295737-30297223Pancreas
SE_48182chr20:30293240-30294390Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30294514-30295218Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30295496-30302360Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30295793-30297174Right_Atrium
SE_49886chr20:30295531-30297118RPMI-8402
SE_50155chr20:30291979-30293164Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30293172-30295195Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30295533-30297457Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30293396-30302434Skeletal_Muscle
SE_52373chr20:30291702-30295310Small_Intestine
SE_52373chr20:30295497-30297438Small_Intestine
SE_53471chr20:30292078-30292710Spleen
SE_53471chr20:30294485-30295159Spleen
SE_55108chr20:30293280-30294299Thymus
SE_55108chr20:30294451-30295219Thymus
SE_55108chr20:30295622-30297363Thymus
SE_55770chr20:30292264-30294885u87
SE_56767chr20:30292607-30295221VACO_400
SE_56767chr20:30295601-30297377VACO_400
SE_57375chr20:30292729-30294334VACO_503
SE_57375chr20:30295642-30297287VACO_503
SE_57919chr20:30292049-30292581VACO_9m
SE_57919chr20:30293234-30294355VACO_9m
SE_57919chr20:30295614-30297374VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_64478chr20:30291827-30294478NHEK
SE_65412chr20:30291566-30292774Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30293264-30294304Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30295708-30297841Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_66334chr20:30295619-30296905Jurkat
SE_66898chr20:30292055-30302718H2171
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30292264-30294885u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203029218730293046
chr203029349330294957
chr203029568830297247
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031702chr203029062130297397
Enhancer Sequence
GGATTACAGG CGTGCACCAC ACCCGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGCAGAG ACGGGGTTTC 60
CACCACCTTA GCCAGGCTGG TCTTGAACTC CCGACCTGAT GATCCACCCA CCTCGGCCTC 120
CCAAAGTGCT GAGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCAG CCTGAACTTG GTTTTTAAAA 180
GACCACTTTG GCTGGAGTAT TGGGCAAGAG TGATTTTCTA AGGTCCCTTC CCAGCTTTTT 240
CCCTGTCATT CTAGGCTGCC ATGAACTGGT TGCCTGAGCC ATAAAGACAC AGTTTCTGGA 300
TTAGAGTGAC TGAAGAGCTT AGAGTGGTTC CTTGCCCTTG GCCGGAGTAG GGAATCTGTG 360
TCACCTTGTT CTGCAGGAGA TGGAGGAAGT GACTCCCTCA GGGAGGGGTG GGAATCCCAT 420
CTTGGAAAAC ATCCTCAAAC CACCTGTATT GTTTCTGCCT CCTGTGTGGA AGTTTCTGCC 480
AATGACACAG TGCTCTCTGG AATGCACCCC CCCAACGCAC ACACCCAATC TTCCGTTTAC 540
ACAGGCATAG CTGTACTTTG CATTCCTCCT AGGATTTAGT TCAAAGCTAG CCTACAGGAA 600
CTGGTCGATA AAGAGTTACT GATTGATTAC TAAAGAAAGA GAATATTCTC AGCCATTAAG 660
CAAATATTAA TGAGTTTTAT GAGTATTATG TTGGTCTCTG GGGGTGCAAG GTGATTAAAT 720
GGGTTTCTAG TCTTCACTGA GCTCAGAATT CAGTGGATAG ACCAAAAACT ACAGACAACT 780
ACAATGCTGG ATACAATAGT TATAACAGCA ACATTTACTA GGGCCTTCCT TATCCAGGTA 840
GGACAAGTTG GCTTTGGAGC CAGACTACCT GGGTTCAAAT CATGGTTTTA CCACTTACTC 900
GCTGTGCATC TTTGAACAAC TTTCTTAACT TCTCTATAGG AATAATAAGA GAACCTACCT 960
GAGTGGTACT ATTTTGAGAA TTCAATGAAC TATCTCATAT AAAACACTTA AGTGCAAGTG 1020
CTCATTGTTA AATATTACTA AAATTACCTT AATACCTGCA CCATATGATC TTACATACAT 1080
TCTTACAAAA GGCTCTTAAA TCCTTACAAA AACCCTATGA AGTATTATTA TTATCCCCAT 1140
TTTTCAGATA GGGGGACTGA GGCTCAGAAA TGGAAAGGAA TGCACCCAAA ATCTAACAGC 1200
TGATATGTAA TAGAGACCAG ATTCAAACTC AACTCTGTCT GATTCCAGAG CCCATACTTC 1260
CAATTAACAA AATGATCCCC TTTTCATAAA GAGCCCCAGC ACAGTGCCTA ACACACAGCA 1320
GAGACTTTAT AAAGGGAGCT ATGGTTATTA TGTCATTGTC CCTGGAGTTT CCAGCTGTAG 1380
ATGCTGTAGA ACCCAGAGGA GGGGGCCTCT CTTTCACCCT AAAGGGATCT GAGAAGGGTT 1440
TAAAGGTGCT GGGTGCCAAC TACAGGCTTT GCTTGGGAGT CCCAAAGGTT TCCCTCACTG 1500
GGGCTTGGGA TACTAATATG GAACCTACAC TAGCACCACT AAATCAGACC CAGAAAGTTC 1560
CCCCAGGTGT CCAAACACCT GCATGAACAA GCAGGCAGTT TCCTCTAGGT TGACTTCTTG 1620
TCTGGCCCTA CACATCTCTC AGTTTCATCA CTCAGCCACC AGCCCTGGGT CTCATGTATG 1680
CACCTGCTGC TTGACCCAGT CCCAGGAGAC ACTGAGCCTT AGAATTGGGC TCCTTCTCTG 1740
GACCTTGCCC CAAAGGCTAT TTCTGAGTGA CTCCCTGGGA CTTCCCTGAC ATGGTAACCC 1800
CTAGGGCTCC AACTGAACAT GGGTGCTGTG AGCAAGGGGA AATTCTTCTG AGTAGCAGAT 1860
GGAGAGTGGG TAGAACAAGA GGCAGTTGTT CTGGATCAGA GATAAGCATG GGGTGAGAAC 1920
CATAGTACAC TGGATTTTAT GTTTAAGCAG CACTGATCCT CGATAGTTCA GAACTCCCGC 1980
ACTGAAGTCC AGCGTAGGCA GGTAAGGACA ACCTGGAGCC AGGCATTAAT ACTCACTTCT 2040
ACTTCCCATC TGAGTCATAT TCAGAGTCTG GCCTTGCCTG GTACTTTGAC TGCAGAAGGC 2100
AACCCATGGC TAAATCAAGG CACCTCAAGC CTCATAGAGA AAAGGGAAAG ACTCAGCATT 2160
TGCTGAGCTT TTACTCTGCA CTAGGCAATG TGTAAGTGCA CTTTACATGT ACCATTAATT 2220
ATTAGGAATG TTTGTTAATC CAGTCACTAA ACACTCAGCC ACCAAGTACT AGGCCCAGCA 2280
GTAGCTGTTA AGAGTGAATA AGACATAGTT TTTATCCTCA GTAAGCTCAG AGCACCTCGT 2340
TTAGTCTTTC TCCCAACAAC CCTCTGAAAT GAGTATTACT TCCACTTTAT AGATCTTCAG 2400
GTTTACAGAG GGAAGTAACT TGTCCAAATT CATGAAGCCA GTTAAGTGAT AAGATATTGC 2460
TTCTACTCAA AAAATGCTTG TTGACTGAAT GAATGAATGA ATGACACAGC TATGGCTGTG 2520
ACTTTAGTCA AGGAGTAGCA ACAAGACCAA ATATTTATAG TTCTCAAAGT GCTTTTTCAT 2580
CTATCATCTC TTTGGGCCTC CCTGCTAGCC CATGAGGGAG GCAAGGCGGG TGTTATCTTT 2640
CTTCAACATA TGAGGCAACA GGCAGAGCTT GGGCAAGAGG CTTGAGGCCA CAGAGCAAAC 2700
AAGGAGTGAG TGGGGCCATC CTGGAAAAAC TCCAGAGTTC CCACAATGCC ATGTTTAATC 2760
ATTCAAACCC ATGTCAAGCA CCTACTGTGT GCCAGGCATG CTCCTACCCA CTTTAAATAC 2820
TTAACTCATT AAGTCTTCCA CTCAGTCAAC AAACAAGGAG GACCCTGGGA AGATAAAACA 2880
AAATATGCCC CATTGCCAAA CGCCTAGTCA ACAACACTGG CCAAACCTCT ACTGTGTACA 2940
AGGTATGACT TGGGCCTTGT AGAGGAGGTA GGGGACAAGG TTGTGAGCCA AGGCCCCAAG 3000
CTTCAGGTAC CTTAAAATCT CTAAACTCTT GGTCCAAAGA TATCCACATA TTCTGTCAGC 3060
CTGAAAGTTC ACTCCTGGAG AGTAGATCCA ATAGCAATGA CAACAATTTG TTTACCAGTG 3120
ATTGCAATGT GACAATAACA GTAATAATAG TAGCTTGTTA TACTAAGTAA TTACTATATG 3180
CTGGGCTCCT TGGTAAGTGC TCCATGTATC TTTTCAACTA TTTTCATGCT CTCAAGAGTG 3240
TTTCAAGAAA AGCGCTGTAG GCCGGGCATG GTGGCTCACA CCTGTAATCC TAGCAGTTTG 3300
GGAGGCTGAG GCGGACAGAT CACCTGAGGT CAGGAGTTCG AGACCAGCCT GATCAACATG 3360
GAGAAACCCC GTCTCTACTA AAAAAACAAA ATTAGCTGGG CGTGGTGGCG CATGCCTGTA 3420
ATCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGCAGGA GAATCACTTG AACCTGGGAG GCGAAGGTTG 3480
TGGTGAGCCG AGGTGGCACC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAAGAGCGA AACTCTGTCT 3540
CAAAAAAAAA AAAAAAAAAG GAAAAAAGAA AAGCACTGTA TATTGTTACC TCTTTTCCAT 3600
ACATGAGGAA ACTAAGGCTG GGAAAGATTA AGTATTTGCC AAGGATAACT ATTAAGCAAG 3660
TGAGACTCAC CAACTCAACA ACGGTTTGTC AAATTTCGTA CCTGACTCTT AACAACGATG 3720
GAATTTCTCC CAAGGAGGCA AGGCAGACAC CAGGAATACC AGGAGCAGCT GCTGCCTGAG 3780
AGAGTGGGGG GCCTCCAGAG CCCCCAGAAG AGTCTTCCTA ACCTCTTTCC ATCAGGTTTT 3840
AACATCACAC TGAGATGGGG AGGTAAGGAA AGAATGGTTA GGTGTGCTCA ATCTATCCTT 3900
AGGGCAACAA GGGTCTGGCC CTCTTTGTTG ACCCTCAAGG GAAGAAGTTT GTGACTTCCC 3960
ATTTGTCACT CACCAACCCT CTAGAGAGAA ACAGAAGGGG GCAAGGGCAT GGGAGTATTT 4020
TCTCCCTGGG GTTGGGGGGC ACACACAAGG GAAGAAGCAG CAGCCTTACT GGCTCTTTCC 4080
TCCCCTGGGC AAGAAGCCTG TACATGTGAT ACAGTGTATG TCATTCACAT GGAACCCCCT 4140
TGGGGAAATG CCAAGGTACC TTTTGGACCC AAGAAGCCTC AGAGAGGAGA GACTGGCAAA 4200
GCCCTGAACT GCAAGCTAAG CTGACAATTT CTAAGCATTG TAACTAGGTC ATCAGGTTCC 4260
TGGAGAAGCC AGCTGTGGCT GGGGGATGGG GAGGAAAATT TTGCAGCCTA CCAAGATCCC 4320
TACTTCCCTT TAGGCCCCAC CCTCCCTGAA ATCTGCACCT GCTCCCAAAC TGACCCCTCC 4380
CCCCAGCTGA GCCCAGCTGT CAACGGCTCC CAATGCCCCG CCCTGCCTTC CTTAGGCCAG 4440
AACCATGGGG GCCTCTTGGG CAGGAGGTAC CTGATTGCCA CCTGAGCTTT GCAGAGAAGG 4500
AGCTGTGGGG CAGGGAAGGA TTGGCCTCTC CTAGAAGATA TTTCTTGCTC CACCAGGGCA 4560
GCAAGAAAGT TAGGCCCCTT TGGGCCTACC TAGGGTACCC TTCCTGGCAT TGTCACTGCA 4620
GGTGGCAGGA GACAGGTGAT GTTTACCCTG CTGAGGCCAG AGTTGCCAAA AGGCTTCAAT 4680
CAATCCTTTG AATCTGCACC TGGCCCTGAG TCCCAAAATA ACAACCAGGG CAGCTTACCT 4740
GATCTGCAGG TTGCAGGTGC CTCTGGCTTT TCTCTCCCTG CAGCTCTGCC TGCTGAGCCC 4800
TGGCTGGCAA GAGATTCTTT TTCTTAGGGG TTACTGAGAC CTAACTGCAT CCCACAGGTG 4860
CTCTGGGCCT CTCCCCATTA GGCCCACCTC TACCATCAAC CATCCCTCTG TCCAGAGGCC 4920
TCTGTCATCA GCCACCTGGT TTCTTCCCTG ACCAACTTTA TTGCTGACAC AGACCATCTT 4980
TGGCTCTAGC CAGTCTGCCT CCTCATGATC TCTCAAATGC TTCATACATA CTCCACCCTC 5040
CAGTTCTGTC TGGGTGGTTC TTACCCGTCT GGCCTGCTCG TGTGTGTGTG TGCGCGCGTG 5100
CACGCGTGTG TAACTAGCCT GATCTTTTTG GTGTGTGTGT GTGTGGCAGA GTCTCCCTCT 5160
GTCGCCCAAG CTGGAGTGCA ATGGCATGAT TTCAGCTCAC TGCAACCTCC ATTTCCCGGC 5220
CTCAAGTGAT TCTCCTGACT CAGCCTCCCA 5250