EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-17268 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr20:30281550-30284690 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77962418chr2030283169hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr20:30281637-30281647AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr20:30281637-30281647AACATATGTT-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr20:30284057-30284071AGGAAATGACTCAG+6.73
POU6F1MA0628.1chr20:30281652-30281662ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:30281652-30281662ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 69             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30281696-30285303Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30281733-30283797Aorta
SE_03156chr20:30281999-30283103Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30281567-30283497Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30281270-30284805Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30281178-30285014Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30281314-30284637Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30281635-30284666Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30282048-30283284CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30281409-30284791CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30281400-30284483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30282128-30282868CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30281650-30283580CD56
SE_20764chr20:30281711-30283729CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30281489-30283485CD8_primiary
SE_23622chr20:30281755-30283243Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30284033-30284548Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30281085-30284597DND41
SE_25933chr20:30282095-30284805Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30280920-30284601Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30281639-30284593Gastric
SE_33407chr20:30278956-30284610H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30283535-30284639HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30282089-30285312HUVEC
SE_39443chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_39443chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_39853chr20:30282007-30284720K562
SE_40644chr20:30281708-30285386Left_Ventricle
SE_41648chr20:30281806-30282228LNCaP
SE_42121chr20:30281738-30285363Lung
SE_43515chr20:30277822-30284499MM1S
SE_44365chr20:30281743-30284710NHDF-Ad
SE_44995chr20:30282790-30284602NHLF
SE_45708chr20:30282527-30285331Osteoblasts
SE_47264chr20:30281358-30285573Panc1
SE_48182chr20:30282429-30283232Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30282722-30283493Right_Atrium
SE_48890chr20:30283773-30284597Right_Atrium
SE_50155chr20:30281748-30284675Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30282135-30284696Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30282308-30284717Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30281728-30285346Small_Intestine
SE_53471chr20:30281646-30284749Spleen
SE_55108chr20:30281743-30283556Thymus
SE_55770chr20:30281854-30284727u87
SE_56767chr20:30281105-30284651VACO_400
SE_57375chr20:30281767-30282407VACO_503
SE_57375chr20:30282804-30283747VACO_503
SE_57375chr20:30284121-30284654VACO_503
SE_57919chr20:30281815-30282417VACO_9m
SE_57919chr20:30284048-30284520VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30282201-30284731HSMM
SE_65412chr20:30281477-30282819Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_66334chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_66898chr20:30278956-30284610H2171
SE_67146chr20:30277822-30284499MM1S
SE_67821chr20:30281854-30284727u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203028176830282654
chr203028173330282000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
CTAGTCTCAA ACTTCTGGCC TCAAGCATTC CTCCTACCTC AGCCTCCCAA GTGCTGGGAT 60
TACAGGCATA AGCCATCATG CAAGGCAAAC ATATGTTTGA TTATTAATTA ATCTGGGTGA 120
TGAGTTTACA AGTGATGATT TTCCTATTTT TAAAATTGTA CATATGCATT AGATATTCTC 180
TGTTGTATTT ATGATAAATT TCTTTAAAAA AAAAAAGTGT ACTGAAACAG TGCAATACTC 240
TGAGCCAGAA CTGTAACAAC TAACTCAACA TATGCAGTGT CCGAAGGGTT AAGCCTGTTT 300
CTCTGCCTGT GGGTGGGAGG GCAGGCAGCA GCTGGGGCAC AGTGGGAGTT CCTGGCTCCA 360
GCTGGCTCCA GCCTGGATCA AGCACCACGC CCAGGAACTG GCACCTGTAG GGGGGGCTTC 420
TGGACAGGTG GCACCTGTAG CCCTTGGTGA CCTGATACAT GTGAGAGGCT GGGCCCAGTC 480
AGATGGGTGG TGGGCTTCTG TCAGAGCCCC TCCATCTGGT AAGGAAGTTT GCTGGTGGCA 540
GCTTGGAGCT GGTGAGAAGG GGAAGAGGGT CTAGGACACA GGATGGGGGT GGGGAAGGAA 600
GTGGGTGGGC TGGGCTCAGA TACCAAGGGA GGGTGGTGGG ATTAGCACCT GCTGAGAATG 660
AGATTAGGTT TCTTGGGAAG GGCTCATCTA TCTAATGCTC CCCGAAAGCT GTCTCCCTGT 720
GGCTTTTCTC TGCTGGACAG ATGGTGTCTG AGCTGCCTCT TGGAGGGCGG GCTCCTTGAG 780
GGGGTGGTGG AGGTGGAGTG TGACCTGCTG CCTGCTTTCC AGAGGACCTT GAGGCCCTGG 840
GACTTCTTGT CTTCCAACAA TAGTAATAAG GATTAGAGCT AACTCTTACT GAAGGTTTAC 900
CATATGCCAG GCATTGTCCT AAGCCCTTCA TACAAATTAC CCTCATTTAG TTTTCACAGC 960
ACCCAACTGC CTATCATCTA GACAGTAGGC TTACATTGAA GGAAACTAAG GCTTGGCAAA 1020
GTCAAACACT TGCTCAAAGT CAAACAGTAA GCAGGGCCTG GTGGCGTACC TATAATCCCA 1080
GGAAGATAGA GGCGGGAGGA TCACTTGAGC CCAGGAGTTC GAGACAAGCA CAGGCAACAT 1140
AGTGAGACCT CATCTCAAAA CAACAACAAA AACAAAACAG TAAGCAAACT AGGACTTGAA 1200
TGCAGGCAGT TCAACTCCAC AGCCCTAGCA GGAAATCACT ATCAGCCAAG GCATCTTCCC 1260
CTTATTAAAT GGCAGTAAGG ACTTTCCAGT TTCTTAAGCC AAAAACCTGG ACTCCTTTCT 1320
CTCTCACCTC TTATCCAGCA AACATCAGCA AATCCAGTTG GTCCAACCTT CAAATTGTAT 1380
TGAAGCTCTG ACCACTGCTC GCCACTTCCA CCACCCATCC ACCCTGGTAT AAACTGCTGT 1440
TATCACCCAC CTGGCTTCTC ACTGGTCTCC TGCTCCCGCT CTTACCCATA GAGTTTGTTC 1500
TCCACATCAG AGAGATCCTT CTAAAACCTG TCACTTCTTT GCTTAAAAAT CCTCCATGCC 1560
TTTCCACTGC CCTTAAAGCA AGGTCCCATG TGGCCCTACA AGACCTGGCC CCTGGTGACG 1620
TCTCAGACCT GATTCCTACC ACTGGCTTAC TCTACTCTGG CCATACTGGC CAACTTGCTG 1680
TACTTTAAAT ATGTTGGAGA GTCTTTTTTT GTACTTGCTT TATTTTTTAA TTTTTTTGAA 1740
ACAAGGTCTT GCTCTGTCAG CCAGACTAGA GTGGAGGGAC AGGATCATAG CTCACTGCAG 1800
CCTCAAACTC CTGGATTTAA GCCATCTTCC TGCCTCAGTG TCCCGAGTAG CTAGCTAGGA 1860
CTACAGACAT GCACCACTAT GCCCAACTAA ACTCTGGCTT TGTCGCTCTG GCTGATCTCA 1920
AACTCTCAGC ATCAAGTGAT CCTCCTGCCT TGGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTATAGGCG 1980
TGAGCCACTG CATCTGGCTT TTTTTTGTTT TACGGCTTGC TGTTCTCTAT GCCTACAACA 2040
CTATTCCCCC ATATATCCGC ACAGCTCATG CCCTCACTGC ATTCAGATCC AATGTCACTT 2100
TATCAGAGAG GCCTTCCTAA CTACCCTACC CTTCCTTTTC CCATCCCTAA TCCCTTTTCT 2160
CTGCTTTATT TTTCCCTATA TCACTAAATA CTACCTCACA TGTTATTTAT TTTTTAGAGG 2220
TGGGTTGTCA CTATGTTGCC CAGGTTGGTC TCGAACTCCT GGGCTCAAGC AATACTCCCA 2280
CTTCAGCTTC CCAAAGTGCT AGAATTAAAG GCGAGAGCCA CCATGCCTAG CCCTGACATG 2340
TTAATTTACT TAAAATCTGT CACCCACCTT GGAATGTCCA CTGGGTGAGA ATAGGGACTT 2400
TGGTTCGTTC AGACTGTATG TCCAACCTTT AGCTCAGTCC CTGATATATG ACAGGAATGC 2460
AATAAATACT TGTTAATGAA CAAATGAATG AATGACCAAT ATCCCTCAGG AAATGACTCA 2520
GACTCAAAGG GGAGTAAGGC TGCCTGAGTG TCCTTGGCTT TCACAGCCCT GATGACCTTT 2580
GGTACCCCAT GGCAGCGGTC AACGTCCTTC CCTATTATGA AATGTCCTGG GTGCATAGCA 2640
TCACCACTGT GTCATCTACT TGTGCCTGCA CCCATGCAAA CACACAGGGA CACAAAGCTG 2700
GAAAAGGGCT GGTTTTGAGA AGGAGTAAGC CTGGGCAGTT GAAACCCAGG TTCGGTGTAC 2760
TCTAGGGCAC TTACTTCTAG GTGACTGTCC TTGCCACTGC TGGCGTACCA AGGTCTCCCA 2820
GTCATATGCC CATGCACTGT ATACATTTTG GCATTTATTC TCATGAATAA AGTGTCATTA 2880
GAGGCCAGAC ACTGCTGGCT AACGCCTGTA ATCGCAGCAC TTTGGGACGT CAAGGTGGGA 2940
GGACTGCTTG AGCCCAGGAG TTAGAGACCA GTCTGGACAA CACAGTGAGA CCTTGTCTCT 3000
ACTAAAAATT TAAAAATAAG CTAGTCGGCC GGGTGTGGTG GCTCACACCT GTAATCCTAG 3060
CACTTTGGGA AGCCGAGGCG GGTGGATCAT CTGAGGTCAG GAGTTCGAGA CGAGCCTGGC 3120
CAACGTGGTC AAACTCTGTC 3140