EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-16098 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr2:54799110-54802870 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10181201chr254799174hg19
rs10205410chr254799599hg19
Number of super-enhancer constituents: 63             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54799791-54802361Adrenal_Gland
SE_02562chr2:54796678-54802057Astrocytes
SE_04102chr2:54799690-54802108Brain_Anterior_Caudate
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_12885chr2:54798660-54800004CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54800577-54801934CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54797492-54801918CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54798186-54800123CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54797995-54802474Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54799575-54801320Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54801348-54802387Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54797970-54802593Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54797867-54801835Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54798932-54799520Gastric
SE_31545chr2:54799542-54802418Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54795734-54802579HUVEC
SE_39396chr2:54795484-54802646Jurkat
SE_40773chr2:54796706-54802488Left_Ventricle
SE_40773chr2:54802491-54803321Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_43945chr2:54794597-54799592MM1S
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54799847-54801132Pancreas
SE_47832chr2:54801568-54801965Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_56813chr2:54799680-54801306VACO_400
SE_56813chr2:54801496-54802415VACO_400
SE_57612chr2:54799687-54800303VACO_503
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54795484-54802646Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr25479924154799892
chr25480004554800558
chr25480140654802103
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
TTTTTGATAA AATGAAGTTT AATATGACCC TAGTGACAAC CTCCCCTCAT CCCCTTAAAG 60
CTCAAATTTA GGGAACTCTT GTGGTTGGAC TCTCACATAC TCCCTAGGAC TCTGCTGGGT 120
GCTGGGGAAT TTACTAAACT TTGGTGAGGA GAAGAGGAGA GGAGAGGGAA GCCACGGTAC 180
TAAGGTACTT AGGGAGACAG AAACAGTTCC CCTAGAAATT AGACATCACA TTGTCTTTTT 240
CCCCCCTTTC TTTTGAATGA GATGGGGCAA GAATATTTGG ACCAGGATAA AGTTTTAAGA 300
TGCATTTACA CTAATGTAAT CAGGTTACAT AGCAAAAAAA TGTTAAAAAT GTACCCTGGG 360
AAATTGAAAT CTATCCATTC TTCTAGGTGT GGCAGCTTAT TCAGATTTTT ATGTTGTGTG 420
ACCATAAAAC GAACACAGCT TTTCTAACCG CGAGTGTCTT TGTTTACAGA GATAACAGTG 480
TGAGTAATGC TTTGCTAGAA GCCAGGCAGT TAAATCACAC TCTGAGCAAA TAGAGGCTGG 540
GCTTCAGAAA CTTAGATAGC ACACGAATGT GCAAACTTGG TCTTTTAAAC TGAAGACATA 600
TCTGAAAGAA AACTGCTTTT GGCCCATGAA CTACTTTCCC AGCCCTTTGT GCCTCCCAAT 660
CTCTGCCCCC CTTTACAAAA AATCTTTGTT TTTCCTCTAC AAATATACAT ATATGATTTC 720
AATTTGGAGG TGGGATGTTA TTTTTTTCAC TTGAAACACA AGGAAGCAAT TTTTAAAAGT 780
CATACTCGTT CAGCAGTGGG CTTGACTGTA GCCAGTTTGA CTAGGAGTTC TTGGCTACAG 840
AACCATACAC TTGCAGTCTT TATCAGGGTA GTAAATTCAG ATGGGTTTTT GGAAAGGGAG 900
AGGGCTGGAG TTGAGGGAAG GGCACTAGAG CAGTGTGACC CACGGCCCAG GAGCAGTGTG 960
AGTGGGAAGG GGCTCTAGAA GCTGACTGCC TTTGTGTTTG CCACAGCGTG CTGGGAATCA 1020
GATGAGAAGG CGGGCCCAGA CCCCACCAGA TACTCATCTC AGCCATTGTT GTCATTAAAT 1080
GACTCTGAAA TGACCTTTCT TACCTCAGTT TCCTGTGAGC TCATAGTTGT CTGCAGATGT 1140
GAATTATGTC ATTGATCTTT GCTCCCTCTT TGCTTATAAG GAGTAGCTGT TCTGCTCCAT 1200
GTTTCTGGAA GAGGAAAGTG ATGCACAGGT CACTTAGTAA AGCGGTCCCC AGCCTTTTTG 1260
GCACCAGGGA CTGGTTTTGT AGAAGACAAT TTTTCCACAG ATAGGGTGGA GGAAATGGGG 1320
AGTTGGTTTC GTGATGAAAC TCTTCCACCT CAGATCATCA GGCATTAGAT TCTTATTAAG 1380
GAGTGGTAAC CTAGATCCTT TGCATGCACA GTTCATGATA GGGTTTGGCT CCTGTGAGAA 1440
TGCTGCTGCT GATCTGACAG GAGGCAGAGC TCAGGCAGTA ATGCTTCCCA TCCACCACTC 1500
ACCTCCTGCT GTGTGGCCGG TTCCTAATAG GTCACGGGCC AGGACCAATA CCGGTCTGTG 1560
ACCTGGGGGT TGGGGACCCC TGACTCGGTG ATTCAGCAGT TGATTTGGGA TCCTCTGTCT 1620
TTGTTCCTCC TCCCTCAGCG GGAATTCACA GTGTAACTCA TTTGCTAAGG TTTTCTGCGT 1680
TAGAAACAGA ACTCCTTTTG GACTACTAGG AGACATGGTC ATTAGAATAA TTATGATTCT 1740
TAGTATGACT CAACCCCTTT TTAATATTCA GCCTTATGGA GGGCCTCTGC CTGCGGCTCT 1800
TTGCTCAGGC ACTAGGGCCA CAGGGGTGTA ATTTCTATCT CTGCCCTCAG GAAGCTCACA 1860
AACAAGTCAA GAGACAGGAA AACGGATCCT GTTTTTCTAA TGGGATTTGA ATGGATGTAT 1920
TTATGGGAGG GGGGTGCTTT GTACACCTGC AAAACAGAAC ACCAGCCCTC CCTTCTCCTC 1980
TGGGGTTGCT GTGAGAATCA GTTAGAATAA TGTGCATGAA CCCCGTATGG AAAATACAAA 2040
CTCATAATTA AATCTAAGAA ATTTTTGTGG GGGGACACAA ATGTTGGGGT TGTCTTTGTT 2100
CTCAGGTCCC CTCAACTGGT CTAATGAAGG AAACAGACAC CTTTCCAGTA ACAATAGCCA 2160
ACATTTATTG GACACTTATG TACCAGACTG TGCTATTTAT GACATACATT ATCTAATTTC 2220
ACAATCAGAA GAATGCTAGA GATAGGGTCA GGCGTTATCT CTGTTTACAG ATGAGGAAAG 2280
CAAGGCTTGG AGAGAATGCC ATACAGTTAT TAGTGTGGCG GAGCCGGCCT TTGCACCTGG 2340
CTGTTGACCA CGCCCTAGCA TTAAACCATT ACCTCACACT GCTTCTCCGA GATAGTTATC 2400
TTCTTGGGAT CATTTAGGTG TGGCAGGATC TGGAGGGAGC AGTTGGACCC AAGTCTCCTA 2460
GCAGCAGCCT ACACGTTTCT TGAGTCTGTT TTGAAACAAC TTCCTTAGCC CTAGCTGCGC 2520
AGAAAGCATC CTCCCCTCAG AGTGATGATT TTTATCATGT GGTTTCCTTC CTCCTGCCTT 2580
TGGAGGTCAG GTCTTCTCAC CCAGGGTCAG AAAGCCCATC AGTTGCTGAT AAGCTGCAGC 2640
ACTTGAGTCA CAGGGTGCAG GCCTGTGTTT AGAATGGGTC ATGCTCATGT CAGGCACGTG 2700
GGGAATCAGT GATCCCATGA GAGCTCGATC AGTGCAGTCT GGTTTGGAAT TGCAGGTCAC 2760
ACCCTTCCAC CACTTTGCTC ATGTGTCTAC TGATGCCTGT GATGTAGTTA GTTAAACCAC 2820
TGACTTCTTT CTCCTGCATC AAACATGACT TTTTGAAAAA GTGTGTGGGG GCTTTCCAGC 2880
ATGAACCAGG CATAAACCAG GTACCTTCAT GAACATATTA TTTATCCCTT CAGTCACCCT 2940
GTGTGCTAGG TGGTATCATA ACTGCTTTGT GGATTGAGGA ACCTGAGGAC CAGAAAGATG 3000
ACTTGAGGTG GCAGCCTCAT TTAGCCAGCA AGTAAGAAAA TGGGTGATGG TGAACTTCTG 3060
CAGCAAGAGG GGGCCGTTTT CAACATTTCT GTGAATTCAA GGCGTGTGCT TCGTCTAAAT 3120
AGGTGGAGAC ACGTAGGAAG GCATAGTGTA TACATCCATC AGCACATGGG TAGATTTTGA 3180
GGTTTTTTTT GTTTTGTTTT AAATCCAGAG CGTTGTGTAT TTGATCATTC TTGGAGATTC 3240
AGCCACATTC ACAGGTGTTA AGTGTCACAC CTAACCTAGC AATACAATAC ACAGCTGAAA 3300
GAAACCAGTC AGGTTTTCCC AATATCAATT TCTTTTTATT TTCTTTTCTG CAACTCCAGA 3360
GGATTCAATA ATGTCAATTT CTGATAAAGC TTTTGCTATT GATGAGTAAA TTCTTCCATT 3420
AAAAAGATAA CAGTCTGCTA ATTTGCTTAT CATTGATGTT GCAAGAGCGT AACATTGGAG 3480
GGATGAGTAA TGCATCTGCA TATCTCGAAG GACAAAACTG ACGTCCACCC ACTTGTGGAT 3540
ACGGTATTTG GTAAAAGTAA CTAAGGTAAA ATTGCCTAAG GGCATTTAAC TTGAGCCATA 3600
GCTTAAATTC AGGTGATATT GAGCGTTGAC ATATCAGGAT TCTTTTGTAC ACAGAGACGT 3660
GGATGTAGAC CCACTGGTAG CAATTGCAAA GGCTCTGGAT TTTTAGCTGC TGGATGAAAT 3720
ACCTGCAGCT GAACATCTGT TATGATGCAA TTAAGCAGTG 3760