EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-15554 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr19:39142610-39144640 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MSCMA0665.1chr19:39144132-39144142AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr19:39144132-39144142AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr19:39144132-39144142AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr19:39144132-39144142AACAGCTGTT-6.02
TCF7L2MA0523.1chr19:39144625-39144639AAACATCAAAGCAA+6.76
Number of super-enhancer constituents: 72             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39138153-39152329Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39142329-39143608Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39143656-39144114Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39138141-39146483Aorta
SE_02393chr19:39137796-39144896Astrocytes
SE_02946chr19:39142855-39143504Bladder
SE_03166chr19:39142650-39143267Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39144238-39144889Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39142528-39150950Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39138188-39150664Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39137791-39163220Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39142593-39150737Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39138293-39150177Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08790chr19:39142814-39143113Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09404chr19:39137974-39145150CD14
SE_13490chr19:39138005-39144412CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39138225-39144515CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39142532-39143433CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39142573-39143597CD56
SE_20865chr19:39137887-39143909CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39144224-39144833CD8_primiary
SE_23062chr19:39138178-39143522Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39143670-39145150Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39142618-39143505Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39143685-39144006Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39142498-39143651Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39143732-39145139Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39138146-39159498Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39138079-39146443Esophagus
SE_27614chr19:39137681-39163004Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39138161-39147807Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39138278-39146703Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39137765-39144241Gastric
SE_31384chr19:39144242-39146459Gastric
SE_34299chr19:39137954-39144133HCT-116
SE_34681chr19:39137956-39143965HeLa
SE_35812chr19:39138217-39145058HMEC
SE_36926chr19:39137778-39163235HSMMtube
SE_38012chr19:39137938-39147548HUVEC
SE_38896chr19:39141590-39143587IMR90
SE_38896chr19:39143642-39145023IMR90
SE_40018chr19:39141704-39143768K562
SE_40594chr19:39137778-39152373Left_Ventricle
SE_41601chr19:39142875-39143542LNCaP
SE_42097chr19:39138003-39147895Lung
SE_44161chr19:39138251-39151170NHDF-Ad
SE_44797chr19:39138303-39143554NHLF
SE_44797chr19:39143748-39144356NHLF
SE_45660chr19:39138201-39152333Osteoblasts
SE_46686chr19:39142908-39143490Ovary
SE_47108chr19:39136358-39164169Panc1
SE_47461chr19:39142504-39143484Pancreas
SE_48075chr19:39137690-39146503Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39138009-39144794Right_Atrium
SE_49449chr19:39142843-39143506Right_Ventricle
SE_50056chr19:39137733-39146496Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39137722-39163232Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39138189-39151169Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39138135-39147829Small_Intestine
SE_53291chr19:39137688-39144172Spleen
SE_54534chr19:39138178-39150778Stomach_Smooth_Muscle
SE_56336chr19:39138259-39144926u87
SE_56725chr19:39138263-39143522VACO_400
SE_56725chr19:39143684-39145129VACO_400
SE_58002chr19:39142728-39143508VACO_9m
SE_58002chr19:39143680-39144976VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39138189-39145042HSMM
SE_64225chr19:39138225-39144984NHEK
SE_65266chr19:39137877-39144047Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39144107-39146086Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39142834-39143554H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr193914266939143457
chr193914371139144221
Enhancer Sequence
TGATCCGCCT GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACA GGCGTGAGCC ACTGTGCCCT 60
GCCTTGTTTT TCTTGAAGTA GATCTTTTTT TCTTTTTAAA GGCTGATAAT GGAGGCCCCA 120
AAGTAGCCAT CTGTTACTTT GTTCCATTAC TCTAATTGCT TGCCTCTTAG GATCTGGCTA 180
GGACTAACAG TTTTCAAAAT TGAGTAACAC ACTTGACAAA AAAAAAGGAA CCAAACTCAA 240
ACTCAACTGT TATCTAGAAA AAAGACTGTG TAAATATGTG TGAGAGGCAA GTATACTCTG 300
TTTGCCCTCT TGTAAGAGGG ATAGGGGAGG CCACTCAGCT GCTAGCACTC TGTTCTCTCC 360
CCTCATCCTC TCCAGAATGT ATTTTAGAAC TTGACTCTTC TAATGACTGA AGAAAAGGTG 420
GGGTATGGGA AGATGGCCTG GGACTGCAGG GTCACTTACA CTCACCTGGC TAAGAGTTGA 480
GATCTGGCTG GTGCCCTGGA GTGGCACCTG CCACTCACCT AATCCTAAAC AATCCAGGGT 540
GTGGGCCCAG GATTGCCCTC TGCCTTTTGA AACACCCTCC CTGGTTCCGG CTTCTAAGAC 600
CAACAGGGAG GCTACTTTGG TGGCAGGGAG CTGACTCACC CTCCAGTTGG AACTGGTGCT 660
AAAAGCCTCC ATTTAACGGC AGCCGACTGC TTGGCCCCAA GTGGGCTGCC TTGTGGGGGG 720
GAAAGTTCAG TGGAAAGTGT TGGAGGAAGC AGGGTGGTGT GTGAATATCC AAGTAGTGCT 780
GGTGCTATTA AGCTCTGACA CAGTCAGGGA GGTCAGTTAA AATGTGGTCT TATGGCCGGG 840
CGCAGTGGCT CGCGCCTGTA ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC TGAGGTGGGC AGATCACCTG 900
AGGTCAGGAG TTCGAGACCA GCCTGGCCAA CATGGTGAAA CCCCGTCTCT ACCAATAATA 960
CAAAAATTAA CTGGGCATGG TGGCAGGTGC CTGTAATCCC AGCTACTTGG GAGGCTGAGG 1020
CAGGAGAATC GCTTGAACCT GAGAGGTGGA GGTTGCAGTG AGCCAAGATC GCGCTACTGC 1080
ACTCCAGCCT GAGTGACAGA ACAAGACTCC ATCTCAAAAA AAAAAAAAAA AATCAGATGA 1140
CAGAGGGGAG CGGGGACAAG TTTTAAGTCT AAGCCTCCTG GGTGGGGAGT TCTGCTGTTT 1200
CAACATATGC TCCAGTCATG GCAGACTTTG GCCAGACAGC GCCCTTTTTC AGAGTGAACT 1260
GAGTGTAGCA CAAGTTATCT GCCAGTGCTA GTTAGCAAAC AGAATGGAGC CAAAAAAGAA 1320
TTGATTTGGG AAGGCCCAAG GAATTTGAAA CCGTTGAGAT GAACACTTTC CGTTTTTGCT 1380
ACACTGATTT ATGTTGTGCT GGGAATTGTA CAAGCCTTTG ACCAGACCTT AGGGTTGTTC 1440
TTTAAAAAAA AAAAAAAAAG ATTCCCTTGC TGCTGCTTTT ACTTTTTTGA AGGGCAGAAG 1500
GGAAGGGCAA ATATAATTAG TGAACAGCTG TTTGCTCTAG TATCACTTGC TCGTTCAGGT 1560
TTTCTGAATA GCTGAAATAT CAACATGTTT ATCTCTTCCC TTGCCTTAGT ATATCCTAGA 1620
GCAGTGTTTT CCCCGGCTTT ATCTTTATTC CTTCATTTAA TGAACTCCGT GTTTTCATCA 1680
CTCACATTTT GTTCCCTTCC CTCAGTTTCC TTCCTTTGCC TTCATTTATG TATTTAGTTT 1740
ACAGAATAAC AAAAGCACTC GTGTTACTTT TAAACAAGGT AAAACTTAAA CAGTTTTTTC 1800
CTCCGTTTCT TTTTTTATGG AAATAAGAGG CAAGTGATAG CAAGTGGGTA ATTCAATGGC 1860
AGTGGTAACT GAAGCACTGA CCTGTTACAA GAGAGACGGA AGCTTCTACT TGAGCAGATA 1920
CAAATACTGT CATCCGTGGA GATTTGAAAG AAGTCTTTCT ATCACTGGGT AGTTTGAGAG 1980
CTCATTAGTC TTCTTTAGAA TGGGTTTAAA CTTGGAAACA TCAAAGCAAG 2030