EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-13705 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr15:78348310-78349550 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr15:78348601-78348616AAAGAACAAAGGTCA+6.08
JUN(var.2)MA0489.1chr15:78349522-78349536CTGAGTCATCTCTC-6.02
KLF5MA0599.1chr15:78348904-78348914GGGGCGGGGC-6.02
RREB1MA0073.1chr15:78349163-78349183AGTGTGTGTTTGGGTGGGGG-6.26
Number of super-enhancer constituents: 42             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00036chr15:78338858-78353262Adipose_Nuclei
SE_01217chr15:78348070-78348454Adrenal_Gland
SE_01217chr15:78348484-78349541Adrenal_Gland
SE_02978chr15:78349054-78349461Bladder
SE_04222chr15:78347280-78349574Brain_Anterior_Caudate
SE_06568chr15:78347997-78349859Brain_Hippocampus_Middle
SE_09546chr15:78347465-78352898CD14
SE_11926chr15:78338641-78349745CD3
SE_14673chr15:78346117-78350074CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17236chr15:78347568-78349647CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17926chr15:78323932-78352597CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18315chr15:78336039-78353185CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19203chr15:78336308-78352772CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20589chr15:78346328-78349870CD56
SE_20939chr15:78346285-78349377CD8_Memory_7pool
SE_22426chr15:78335948-78352210CD8_primiary
SE_24395chr15:78348500-78349056Colon_Crypt_2
SE_24395chr15:78349058-78349462Colon_Crypt_2
SE_25887chr15:78348161-78352872Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27498chr15:78347587-78349592Esophagus
SE_28079chr15:78348229-78350460Fetal_Intestine
SE_29002chr15:78347646-78350018Fetal_Intestine_Large
SE_29765chr15:78348372-78350530Fetal_Muscle
SE_31025chr15:78347300-78353029Fetal_Thymus
SE_31530chr15:78348513-78349540Gastric
SE_37093chr15:78339542-78353274HSMMtube
SE_39399chr15:78347585-78349516Jurkat
SE_41909chr15:78348053-78349473LNCaP
SE_42294chr15:78348433-78349712Lung
SE_44239chr15:78348130-78352460NHDF-Ad
SE_45154chr15:78348449-78349480NHLF
SE_45919chr15:78347482-78350798Osteoblasts
SE_49295chr15:78348394-78349535Right_Atrium
SE_52200chr15:78348322-78349824Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52418chr15:78347627-78349694Small_Intestine
SE_53347chr15:78347474-78349790Spleen
SE_55168chr15:78348460-78349553Thymus
SE_58686chr15:78308448-78366082Ly1
SE_59991chr15:78347710-78381328Ly4
SE_62500chr15:78323819-78370858Tonsil
SE_64065chr15:78348322-78349838HSMM
SE_66351chr15:78347585-78349516Jurkat
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH15I078046chr157833854478352822
Enhancer Sequence
AAGGACAAGG TACTCAAAGT TCAGGACACC TGCCATAGGC AGGTTCAAAA GCTTCAAAGT 60
ATAGGTTTAA TGTCTATCTT CTCCAAGAAA CAAACTCCAA GTTGTCTCCA TTTCTCTAGC 120
ATCTAGCTCA GTGTCAGGCA CATAGTAGGT CAGTATTTAC TGAATACATA TATGAAGGAA 180
TAAGTGAATG AATGAATAAT CAGAAAATGA TACAGGAGAA CTTGGTCTTA AAGGGGAAGC 240
AGGCAGTGGC CAGAGGAAAA GAGATTCCAG GGAGAGAGAG AAGTGTCTAC AAAAGAACAA 300
AGGTCAGAGA GCAGGAGTGA GGTGAGGTCA GTGAGTGGCA AGGACCTGGC CCTGAAGGGA 360
CTTGTGTGCC TTCCTAAAGA GATGGAATGG GGAACTTAGC AGGGCACTGA CATTATTAGA 420
CAAAGGTACT GCTGGTGAAA ATGGTGGTGA GGGAAAGGCA GGTGCACAGT TTGCATAGGA 480
GGAGATTAGT TCAGGCCAGA GGCCGTGAGC CCACTTGGGA GATCCATGAA TTGCAGCCTG 540
GAGTTTGGGA GGCAGGCTGG TTGCAGTGCA GACACAGGAG CTCAGCCTGG CCCTGGGGCG 600
GGGCAAAGAG CACACAAGCA TTTCCACAGG AAGGGAGAGA AGAGTCACTA GGCAAGTCAG 660
GAACTGAGAG ACACAACCAG AGCCAAATTC AGAGCCCAAA GCCCACCCAG TCCTCCTCTT 720
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG CAGATGAGGG GACAGAGGCC CAGAAAGGGA 780
AGTGACTTGT CTAGGTCATA CAGGGAGTCA ATACTGTGAG CCCAGTCTGC CAAACCCCCA 840
ACCCTTAGAG GCAAGTGTGT GTTTGGGTGG GGGAATGTGC GTGTGTGGTC CTCCCACCAG 900
CTCCCTGACT ACCTGGCCCC TCCATCCCCA TGCCACAGGT GAGCTAAGCA CCCTGGGAGC 960
CTTCTGCTCC AGCCAGGGAG GTGCCCAGAC ACTTCCTCTT GTTCAGCCTG CATATGCAGC 1020
TGTGTTTCTA TTTATGCTCG GGAGCCACAG GCTGCTAGAG AAGCTGGCAC ATACTCACTA 1080
GGGCATATCT GAACCAACCT CTCCAGCTGC CTCTGACAAT GCAGGCACCA TGAAAAATCT 1140
GCTTTTTACA AGAAATCCTT TTCACTTTAA ATCTTTGAGT ATTAAATGTA ACTGGGAAAC 1200
AATCAGTAAC CTCTGAGTCA TCTCTCACTA AATTCCTGAG 1240