EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-12151 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:123624150-123628620 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1106241chr12123627016hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr12:123624794-123624805TTAATCCTCTT-6.14
FOSMA0476.1chr12:123624975-123624986AATGAGTCAGA-6.32
LMX1BMA0703.2chr12:123624472-123624483GATTTAATTAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr12:123624475-123624486TTAATTAAATC-6.02
PLAG1MA0163.1chr12:123624702-123624716CCCCTTAGGCCCCC-6.18
PLAG1MA0163.1chr12:123624701-123624715CCCCCTTAGGCCCC-7.73
RREB1MA0073.1chr12:123626543-123626563TTAGTGGGGGTGTGGTGGGG-6.28
ZNF263MA0528.1chr12:123627655-123627676CCATCCCTATCCCCCTCCCCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr12:123627662-123627683TATCCCCCTCCCCCCTCCCTC-6.3
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00887chr12:123623920-123625542Adrenal_Gland
SE_00887chr12:123625548-123628756Adrenal_Gland
SE_04257chr12:123624226-123626789Brain_Anterior_Caudate
SE_04257chr12:123627079-123628684Brain_Anterior_Caudate
SE_07864chr12:123623990-123629156Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_24428chr12:123624436-123625426Colon_Crypt_2
SE_24428chr12:123625509-123626895Colon_Crypt_2
SE_24428chr12:123627398-123627964Colon_Crypt_2
SE_24428chr12:123628126-123628620Colon_Crypt_2
SE_27393chr12:123623926-123628610Esophagus
SE_30893chr12:123613994-123629243Fetal_Thymus
SE_31658chr12:123624306-123628942Gastric
SE_33499chr12:123623933-123625969H2171
SE_40642chr12:123624032-123628833Left_Ventricle
SE_42198chr12:123623905-123629124Lung
SE_50147chr12:123623954-123629108Sigmoid_Colon
SE_51287chr12:123623975-123628667Skeletal_Muscle
SE_52704chr12:123623927-123629069Small_Intestine
SE_55090chr12:123623948-123625464Thymus
SE_55090chr12:123625608-123626243Thymus
SE_55090chr12:123626458-123628949Thymus
SE_58453chr12:123525091-123639368Ly1
SE_61481chr12:123525299-123637192Toledo
SE_65404chr12:123623682-123626796Pancreatic_islets
SE_65404chr12:123627115-123628622Pancreatic_islets
SE_66671chr12:123624014-123625778Jurkat
SE_66671chr12:123627953-123628591Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr12123624628123627214
chr12123627221123628486
chr12123624692123625312
chr12123627000123628600
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I123139chr12123623879123629128
Enhancer Sequence
CCCTTCCTGT CCTCTCCCAC ACACCACATC TGCTGGAATC TACTGCATTT TCTCTCTGCA 60
TCTGAGGCCT TAACATGGCC AGAAGCTTAG AATCTTTCTG GGTTATTCTA AGCACCTAGG 120
CAAGACTATA GTGAGAGTAG GAATAAACTG GCAATCCACC ACCTGGAGAG AAGGGAGGCC 180
CAGCCCTGAG ACCTCATTGT TTGCTTTCTG GGGAATCCCT GTCCATCCCA GAGGCCAAGT 240
AGTCCACTTC TACTTTTCCA GGTATGACTT ATTATCACCC CTTCCCCACA GACCACCTCC 300
CCCAAGTTTT CTTTCATCCA GAGATTTAAT TAAATCCCTC TTTCAAATTT AGAACCAAGT 360
TAGGCAACCT GAGGAAACCT AAAAAGGGAT AACTCAGTGT CCCCTGGCAC CCCACAGGCT 420
GGCTGGGACA CCCAGGTCCT GGGAGCTAAA TCAAGAGGAC AGCAACGCAG GTCTGACTCT 480
AGATGGTCTG AGAAGTTCAA GGGATGTGTC TCTATCTAGA TCAAGAACCA GGTTCAGCTG 540
CTCTGAACAT GCCCCCTTAG GCCCCCGGGG AACGCAGGCC CTATAACTCC TGCTAAGGGG 600
ACCTGAGTCA GAGGTTCCCA CACTGGGACC ACCTGCATCA CCTCTTAATC CTCTTAGCCC 660
AGTGGCCACA GGCCCTTCTG CTCCTTCAGC CCAGAACAGC CCAGAGACAG CAAGGAAAGT 720
GGGCACCCCC AGAGGACACA GCCACCAGTT CCAGCCTCCT CCTCCCCAAC CTGGCTTCCT 780
GTTGCCCTAT TCATGAGGTC AGCTCTGGGC CCCTGCTCCT TCTTTAATGA GTCAGAGAAC 840
AAGGAAAAGA GCAAAAATGA GCAGGCTCAG GGAAAGATGG AGACTAAGCT GGCTCTGGCT 900
GGAGGTGAGC GAGGCCCCTC CTCCAGGACA AGCCGCTAGG AACTGTGCTC TTTTTAAAAA 960
AATCCCCTGC CCCACCCCCT AACAGAAAGG AGGCCATAAA CAGGGATCTG CTTGACCAGC 1020
TGTCACCCAG CCAGTCTGAA CGTTGTTCTC CCTTAAAGGG AGAAAAAGGC ACTGACTCTC 1080
AAGTAAGACT CCTAAACCCC CCAGGACCAC ACCCCAGAGG CCTAGCTAGA CCCCACTCCT 1140
GCTCTCTAAC CTCCAGCCTA CAGGTGCATG GCTGGACAAC TTCACAAGTA GGTCCAAATT 1200
TGGCCTCAAA GTCACATAGA CAGATGTGAT CCCAGAGCAT GTAATCCTGT CTTGGTGAAT 1260
CTGCTCTAAG TCCATGCATC CCTTTGGCCT CTTTGAAAAG GAAAAGCTAC AGAACAAACA 1320
GAAGAGGAAT TCTGTTTTCC TCTTGGAAAA AAGAAAAGGG AAAAAAAAAA ACCCCATACA 1380
AACCCAAATT GAAAGGTACT TTGTACTGCT TAGACTCAAC TAGATCAGGA AATACTGATG 1440
GATTTTTTAA AACAACAGCA CAGGCTGTGT AACAGAACAT GACCAAACAC AAGCATGAAC 1500
ATGAGGGATC AGGTCTAGAG TCCAGCCAGC AGTTAACTCC CTGTGTGGTG AGGCCTAAGT 1560
CATGACATCT CTGAGTCTTA GGGTCCCCAT CTGTGAGACA CAAAAAATGA AAGCACTGAG 1620
GGCCATACCA TGACTTCTCT GAGCCTCAGT TTCCTCACCT GTAAAATGGG CACAGCAACA 1680
TTTGTGAGAG TCCTGTGAAG CACAATGGGC AGAAGTATGC CATGCACTGC GGTGTCTTAG 1740
ACAAAAGGTG GGTAAGCGGG AAAGGCCCCT CCCCTCTGCA CCTCCAGCCA CTGCCTCTGC 1800
AAGAACAATC CACAGACGCT GGATCACTAC CATGCCACTG GGCCTGGCAC CAGCAACTCA 1860
AACACAAATA GCTAAGATCC CCCCAGCCTG AGAAGCAGCT GGGATACGCC AGGGATGCCT 1920
CTGGTTTGGA GGCTTCCCTG GAGAAAGAAG AGCAGCCGTC TCCTGGAGAG GGAAGAGCAG 1980
CCGTCTCCTG GAGCAGGAAT CTTAAGCACC AGAAAAGCCC ATAACACAGA GTCGACGAGG 2040
CTGGGTATGG TATAGGAGCC ACTGGCCTGA ACCCTGCAAG CACCAGTCCT GCAGCTCCCA 2100
GGCCACCAAG ACAAACCTGA GTGAGCTGCA CGTCCCAGAT TTTATGAGCC GGCCTCCAGC 2160
TCACTAGCTG TGTCCTTGAG TCTTAATCCC GCTCCACTGC CAACACCCCA CACCCAGCCC 2220
TGTGATCTCA GGGTTTCAGG GAAATGGAAA GTCATTCCCC TTTGTGGAAA GGTCAAACCC 2280
TTGGACTCGG TTTTTTCCAG TGCTCCTTCT GGCTCTCCTA TTTGTTTGAT TCTAAATTCC 2340
TTTATCCCCC CTGCTGGAAA GTCAGACAGA ACATTCCTCA GGAAAGAGAA CTTTTAGTGG 2400
GGGTGTGGTG GGGAGGAATA ATTGAAGTAA AATGAAAAAT GGGTGAAATC AGGTACTATA 2460
AAATCTTGGT ATTCAAAGAG TGCACGACAA ATTGCACCGG TCAGCAGTCA CTACCGTGAA 2520
CTCACAATGC TCTGGTGAGT CACCCAAGGC TGGGAACTGA AGTCAAACTA ATACTCTCTA 2580
TCACAGTACA GGACAGGAGC TCAGCTGCAT ACTAATGGCA AGAATCCGCT AAATGCATCC 2640
CTTGCTACTC CCAGCAGCAA ATGCATAAGC TATTTCACAC TCAAATATAA ATTAGTGAGC 2700
TATTTTCCTT GCTGGGTTAA TACAAATCGT GCTCTGGACC AATTAAGTAA GCCACTTCAA 2760
AACTTTGCTT CAGCGTATTG GAAAATGTCC CGCTTAGGGG AAGAATGAAG TCTCGAGTGA 2820
TGCATGCCCA ACTGATGGCG AAATAGGTGA GAGTGCTTTC AGAATTCTTG AGGATTTTGT 2880
TATTAATGGT GTTTTAGTGT TGGGTTCTTA AACACATCAA ACAAATTTCC TTTAAACTAG 2940
TAGTTCCTGA CTGCCATGGG GAAGGCTGCA GGCCTCCCAC CTCCCAGATG GTTCAACCAC 3000
AATAAACGTT TGGCCTGTCA GATGCACAAC ACTGATGAAC TAATTGAAAT ATGCTGCAAC 3060
AAGCAAACCC AAAATAAATG TAAAATAATT GTTTCCTTAC ACGATAACCC GCTGAAGTGC 3120
CTCCACGTCT GGCCACCCCT GCTGATTGAA TGTTCCCCCT GCTCCGTGAG CCTCACTTAT 3180
GTGTGGTTTT CAAAGGATTT AAATGCTTTT TTCCAGTGTG ATTACCCACA TGGGAAAAAT 3240
TCTAATTGCA AAAAATGTTG AGTTTTTCTC CCTCTTATGA AAAAAAAAAA AAAGCAAGTG 3300
AAAAGTCAAC TGTTATAAAG TACCAAGGAA AGCACTTAAA TGGGCCCTTC AGTGTGAGAG 3360
GAAGAATGTC CTCCTGTTCT CCAGAGCACC GTCGCCAAGC CAGTGTTAAG CACGCATCCA 3420
CACCTGTGGG GAAGCCCTGC CTCTCAGACA ACCTCACGCC ACTGATGAAA GCTGGGAATA 3480
GCCACCTATT TCTACCCTGA CACACCCATC CCTATCCCCC TCCCCCCTCC CTCGATCCCT 3540
CCCTCCAAGG GGCTGTCTAG AGAGACAGCA GAGGGTGGAG CCAGCAGCAC CCATAACAAG 3600
CTCTCCCACT GGCTCACCAC CTCATGCAGG ACACTGGTGC CCAGTGAGCC CTCCCTAGGG 3660
GGCTGGGAAG CCCAAGGGCC TGATTCTAAT CCCAGGAGGA CAACAGAAGC AAAGTGCACA 3720
GCCCTGCTCC ACAGCACAGC CTGTGAGTCA GACTTGGAAG GGAAGCCCCC CAGCTGCCAA 3780
AAGAGAAAAT TCAGGCCCTC CCCAGGAGCC ACCTCTCAAA AGGGGAAATA AACAGCTCTG 3840
CAGAGGAGAA ACAGTAATAA TCCGTATGAC GTACGTACGA ACTCTTAAGA GGGCACACAA 3900
CAGGCAAAAG ACTTGGGAAA GCTTCCTCTG AGAGAGCCCA GGCATAAGAA GGCCACAATT 3960
TGAGGCATGG GGGCCCCAGG AACCCCCCAT CTTGGCCTGA AACACCTCCG TAAGAGGATT 4020
ATTCCTTTGG GAGAAGGATT GGTCTCAGCT CCTAAGAAAG GCCAAGTCTA TTGCAGGGCT 4080
GCCGCCAGAA CCCACTGCAT GAAAGTACAG GGTCCCTCCT ACCTGTAGAC TTGAGCAGAG 4140
AGAGATGGGC ACCATTCTGC TGGCAGCAGC CCTTCTAGAA GAAGCTACAG CAGGGCTGAG 4200
GGAGGACAGC TTGTCTTTCT GTAGCACCTA AGACAAGCAA ACACAAGAAT CTGCCCACAG 4260
CCTCATCCCG CAGCTCCAGT CTTCATCCAT TAAGTACCAT CAGCATTGTG AGGTGCCCTG 4320
AGCTAGGCTG GATACACCGT GGGGGCTGAC ATGATGCCAA AGGTGGCAGA TCCTCACTAT 4380
CCATGGATTC CATATTTGTG AATTACCCTA GTCACTAAAA TTTATCTGTA ACCCCAAAAT 4440
CAATGCTCAT GGTGCTTTCA AATTCATTTT 4470