EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-10972 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:92995840-92999100 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr12:92998747-92998758ATTGCACAATC+6.32
CTCFMA0139.1chr12:92997599-92997618TGGCACCCCCTACTGGCCT-6.59
HLTFMA0109.1chr12:92998511-92998521ATATAAGGTT-6.02
HNF4GMA0484.1chr12:92996951-92996966TGGACTTTGCCCTTT-7.46
Hnf4aMA0114.3chr12:92996949-92996965TTTGGACTTTGCCCTT-7.01
JUNMA0488.1chr12:92997178-92997191ATGATGATGTCAT+7.52
JUND(var.2)MA0492.1chr12:92997177-92997192GATGATGATGTCATG+6.71
LMX1BMA0703.2chr12:92997238-92997249GATTTAATTAA+6.02
MEF2AMA0052.3chr12:92998679-92998691ACTAAAAATAGC+6.18
MEF2BMA0660.1chr12:92998679-92998691ACTAAAAATAGC+6.62
MEF2CMA0497.1chr12:92998677-92998692TAACTAAAAATAGCT+6.44
RESTMA0138.2chr12:92997768-92997789TTCAGTACTAGGGACAACTCA+6.01
RREB1MA0073.1chr12:92998464-92998484ACCCCACCCACCCCCTTAAA+6.02
RREB1MA0073.1chr12:92998523-92998543TTTGTTTTGTTGTTTTGGGG-6.37
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_18822chr12:92995603-92999147CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19666chr12:92995576-92998952CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_36309chr12:92994826-92998556HMEC
SE_46616chr12:92995528-93001316Osteoblasts
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr129299584992996628
chr129299691492998321
chr129299751492998213
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I092601chr129299510092998321
Enhancer Sequence
CGTGATGATG AACCCCAGGT TTATACCCCA GACAGCATAG CCGCTTCACC ACCAGTTCCC 60
TCTCTTGACA CATGGGGATT GCAATTTGAG ATAAAATTTG AGTAGGGACA CAGAGCCAAA 120
CATATCTCCC TCCTTCCCTG ACCATTTATG TAGGGCTTCC TCTTTATTAT CCATCATCAT 180
TTGGTCTCTA GTTGACACCA TTTTTTCCAA TCTACAAGTA CATACTTATG TATGTGTTTA 240
CCTACTGATA GTCTGTTTTC CTTACTAGAC TGGAAGCTCC CTGAGGGCAG AATCTTCATG 300
GATATCTCTG ATTTCTCTGG TCAGAGGACC ACTGCTTTTG TCACATTATG TCCCCATGTG 360
TGTACTGCAG ATGGAAGGTT AGAGAAACCA GGGCCCACCA TGCCAACACT CCAAGATGTT 420
AATCAACTGT TTCAAAGCTG CCCTGGGTCA TTTGCAAAAT CTAAAAACTG ACTCTTTGAC 480
TCAGGTTTGC CCAATATATA AAGCCACATT GTCTATTGTT CTATAGTTAC AAGTCTTAGC 540
CAGTTTAAGG TTAGGCAATT TATAAAGAAG AAATGGGAAT TACTTCATGT GAGAAAACAA 600
TTTATTGCCT TACATAGGAT TTTTTCAGCC TGAGTCACTG GAATGTTTTC ATGTACATTT 660
GCATCATCGT CATTCTCCTT ACAGACCCAA TCATATAACA ACTAAAATGT ATAAAGAGCC 720
TATTATGTGG TAAACACTGG GGCTCTCTCA GGGAATAAGA CCAACTAGAC CTCATCTTCA 780
CTGAATTTAT CGTCCAGCAA GTAATAAACA TAAAGAGTGG TGAGTGAGAA GAACACAGTG 840
TGACAGGAGC ACATTGCAGG ACAATTGAAC ATATTTTAGG AGTTGGGGAA GATTGGCACC 900
AGAGGATGGG TAAGACACAA ATAAAGAGGG TAGAAAAGTG ATTCAGACAA CAGGAGGCTG 960
GTGAAGGGCC AAGGAATAAG AAAGGACTTA TAAATTCTAG CATCTAAAAA AGTCCAAGAA 1020
GCTGGAATGT AAAATATGGA GAAGGAAAAG ATAAGGAGTC AGGTTGTAGG AATAGCCAAG 1080
GGCTAGATCT TGTGTAGCAT AGCCAGGAAT TTGGACTTTG CCCTTTTAAG CTGGGGCATA 1140
ACATGTCCCA CCTTCTGTTC CCTAACCTTT TACCTATAAT TTCCTATATT TACCTATAAA 1200
TTGCTTAAAA TATTTTACCT ATAAATTGCT TAAAATACTT GCTAAATATA TGTTACATAT 1260
TATTAGATGT CTATCAAAGA ATGCAAAGCA ATGGAAAAAA ACTGAGACAG TATTGACATC 1320
AGGGGAAAAA AATTGTAGAT GATGATGTCA TGAGTATGCT AGATGGCTCG GCTATGAGCC 1380
ATGGTAAACA CTAAAAAGGA TTTAATTAAA TATGCTATAT TTGAAAGATT TGTAGACAGT 1440
CAATAGATAG TATCTAAAAT TAAAAACTCA AATATTTGTA GAAACACATT ACTGAGAAAT 1500
AAAAAATACA TATTCGAACA AAAATTGAAA GATGTGCAGT TACTTCTGAG TCAATGAGCA 1560
AAGGGAGATG GAATGGAGTA AGCTGAGGCT GGGGATTGTT TTTGATTATA ATTTTTGTAT 1620
ATGTATTATT TTGTTATTTT TACTATTGAA TATGTGGGGT TTTGACAGAA GCATAAATTG 1680
AATGTGTGTG CATGCATGGA CTCACACACC CACACACCCT GCAAATCTAA ACTTAGAAAG 1740
GAACAGTGGG AGGCAGCCAT GGCACCCCCT ACTGGCCTTC TCATGGATGG TCTATTGATG 1800
GGTCTCACTA CCCTGTCCAG ACCTGCCCCC ATTGCTGAAC CAGTCATGTC TCCACAGGAA 1860
AACAGCAGCC TCTGACCTTC CATTTCTTAG AGGTTTCATG AACTGGACTG CCAAGCAACA 1920
TTTGGATTTT CAGTACTAGG GACAACTCAT AGGTACCTGC TTAGATTCTG AGTTGGCTCC 1980
ATCTAATGAG ATCCTGAGGA CACATCAGGG CCCAAGAGGA GCTGATTCAC TGGAAGTTCA 2040
GGGCACTCTG GTTTTTCCAA GCAGGCTAGG ACAGCATGGA AGTTTAAACT CTCAGTACAG 2100
TGAAGCATGA GCCAGAGATG GAGTGCCTAC TCTCTTTGAT TTGAGTGAAA CATTTACTTA 2160
TGAGAAGTAG ATTCAGCATC TGAGTCACCA GACACTGAAA TATTACAGCA AAGATCTTTA 2220
CGTGTTTCCT ACCTCATCAC TACATACCCA CTCATCTGAG ATGTGTGATG CTTGACACGG 2280
ACAGAACTCA AACTGTCTTT TACTACCTAT GAAGGAAGAA ATGATGATAG ATCATAATTG 2340
AAACAACCTA CTGAGGAGAG GAAGCTGTTT TCAAGCACCT TCAAGAACTT TAAAAGGGCT 2400
CGTTTTATCA ACAATGTTAA TTAAAAATCA TTCTTATTAA AGCAATTCCT CTAATTTTCT 2460
CTACCAGATA AAATTGTATT AGGCCACTTT CAGTGACAAG ATATGCTTGA CAGAAGAAAA 2520
AAGTGTTAAA ATGTTTTACG AATGAGATTT TAACTCTTCA GAATAAGTTT TACATGCATT 2580
GATTTTTTTT TTAAGTAAAG TGTTACATAT TCTAACACAA TTTCACCCCA CCCACCCCCT 2640
TAAAGTCAAT GAGGATATTT ATCTCCTCTC AATATAAGGT TGTTTTGTTT TGTTGTTTTG 2700
GGGGTTGGGT TTTTTTGTAA AAACTTTTGG ATATTTTTCC AAAACTAATG CCAAACATTT 2760
CTTCATTATA TCCTAAAAGA ATCACTTTCA TCAAAGTAAA TGTTCATGAT AAATGTTATT 2820
AAGTATAACC AGAATAATAA CTAAAAATAG CTCAAATTGT CTAGCTACAT TTTGTCAACA 2880
ATCTTGCTCT AGCCAAGTTC CCCATTCATT GCACAATCTA TATTTTGGGA AGGACAGAAC 2940
ATAATTGCTT CCAAACAAAA TTTCAAGCCT GTGTACATTT CCTTCCCACC ATCAGTTTCA 3000
GTTAAATGAA TTAATCTTTG AAAAGGGGGA AATGCAGAAA GCAGGACTTC TCCCAAAAAC 3060
ACATTTAATG TGTATTTTAT CAAGGGCTTT AATTATAAAG TTGTAATGGG TGATTTTTGT 3120
TATAATCATC ACTGGAGAGA TTTCAGTGTT TTAGAGCAGA GATCCCCAAC TCCTGGGCCA 3180
CAGACCAGTA CCAGTCTATG GCCTGTTAGG AACTGGGCTG CACAGCAGGA GGTGAGCAGC 3240
AGGTGATCAA GTGAAGCTTC 3260