EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-10954 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:92529720-92532220 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr12:92530025-92530040GTTTAATAATTAACA+6.15
HNF1BMA0153.2chr12:92530026-92530039TTTAATAATTAAC-6.14
NFICMA0161.2chr12:92530531-92530542TACTTGGCACA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00236chr12:92523370-92541163Adipose_Nuclei
SE_09656chr12:92524467-92543122CD14
SE_11000chr12:92523228-92559492CD20
SE_12185chr12:92529465-92533121CD3
SE_14446chr12:92524641-92542050CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15421chr12:92529825-92541442CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15827chr12:92529464-92541929CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16358chr12:92530457-92541339CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17147chr12:92529861-92539831CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17454chr12:92521650-92543631CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18021chr12:92524422-92541160CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18354chr12:92521877-92543309CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19242chr12:92524617-92541115CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20436chr12:92529471-92533094CD56
SE_20870chr12:92529799-92542067CD8_Memory_7pool
SE_21490chr12:92525933-92542040CD8_Naive_7pool
SE_21941chr12:92524300-92542205CD8_Naive_8pool
SE_26051chr12:92529637-92542095Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28508chr12:92529483-92532987Fetal_Intestine
SE_32121chr12:92529999-92531197Gastric
SE_33247chr12:92530216-92532088H1
SE_36510chr12:92529614-92539838HMEC
SE_42960chr12:92529873-92531306Lung
SE_50641chr12:92529770-92531351Sigmoid_Colon
SE_50641chr12:92531806-92532350Sigmoid_Colon
SE_53194chr12:92529921-92531870Small_Intestine
SE_53719chr12:92529912-92530648Spleen
SE_53719chr12:92530690-92531343Spleen
SE_55389chr12:92530094-92530602Thymus
SE_55389chr12:92530698-92531306Thymus
SE_55389chr12:92531342-92532485Thymus
SE_58457chr12:92525538-92580458Ly1
SE_59112chr12:92526989-92581851Ly3
SE_59621chr12:92468237-92586020Ly4
SE_60728chr12:92526624-92567417DHL6
SE_61720chr12:92517504-92567402Toledo
SE_62204chr12:92517326-92581744Tonsil
SE_64392chr12:92527314-92539721NHEK
Enhancer Sequence
TGTTTCATAC ACCATGAAAG TGACTCTAAT CTAGTAGCTC ACAATAAAAT CCATCTTTTT 60
ATGCCAAACT TTTAAAACGT TAAAGGGTCA CTAATATCTG TATCGGGAAA AAAAAAATCA 120
ATCTAGCCGT TTGGAAAAAC CCAGCCTTTG AGTTCCATTT GGGTCCTTTT TGGACCAACT 180
CCCTGACACC TTCATTAGGA AGTAAACACA CTGCTGGTTG CCAACGCTTT AAAAAGAGAT 240
AATACTGTTA ACAAGGCCTA TAAAAGCGAG GTGACCATAT GTCCTGGCTG ATGCTTATAG 300
TCTGTGTTTA ATAATTAACA GCACCCTCTT TTACTCTCAA GAATCACGGT TTGGTTGATA 360
AAATTCTCAA ATTTTATCAA CCAAAATGGT CACTCAAATG GTTATCAATC AAATGGACAC 420
GCTACCTGTA AAGCCCCACG ATTTGGCCTC ACTCCCATTA ATTTCTCTCC ATTCCAGTTT 480
CACTGGTCTT TGTCCAACCC CTCCTGTTCA CCATTACTCT TGAGCCAGGT TTTGTGCATA 540
TTCCTCTCTC TCTCTCGCCT GCCTTCTCCA CTTAAACCCC TACTCATTCC TCAGATCTCA 600
GCTCAAGTGT CCCTTCCTCT GGGAAACCTT TCTATGGCAG TCCTATCTCT CTATTAGAGC 660
TCTCAGGACA CCACTTCACC ACTTCCCTTT TCCTCAGCAT GTCTCAGATC CAGCCCAACA 720
TTTGTTGGAT AACCCTCTCT CTGCCACTAG GTTCCAAGCT CATTGAGGGC AAGCACAGTG 780
ACTATTTTTG CAACCCTAGT GCTTATCACA GTACTTGGCA CATGGAGGGA CTCAACAAGT 840
ATGTGTTTAA TAAATGAATG TAAGAGATAT AGGTGATAGA CACAAGACAA AACACCACTT 900
GTATATTAAT GACCAGAAAA TATCTTAAGA AAGTTAAAAA ATAACTGAAA GACTTAAAGG 960
GTAGTGGAAA AAAGTGCAAG AATCTGAGAG GGAAAAAGAG CTTGTATCTA GTGATATTAC 1020
CTAAGAGCTC CATCCTTAAT TGTAACAATG ACTACCGGCT TGAGAGAGAG AAATATTCCT 1080
GACAACACTG GCCACCTAAC CCTTGTTTTA ATGGGTTCCA AACTCTTATT CTTACATCAC 1140
AATCTTAAAC ATTATAGGGG CACACTGACT GACTTATAAG GCTACACACA TAGGTTCAAG 1200
CATGGCCTGA ACCACACACG AGCTTTAAGA TGCAAGACTT CTGAAAGGGT CAGAGGCTGA 1260
TTTTCCCTAG AAGTCTCTTC AGGTTCAACA AAGAATGGGT CCTTTGTTTC CTATAGGATT 1320
GCAAAATAAA TTAGCACAAA GCTCTGCTGG CTATCTACTT CCCTGATGTA AACCATAATG 1380
CTATACAAGC CCAACAGCAA GCTATTCAAT GAGGATATCT GCACACAGAA AAAGCAACTT 1440
GAGTATAAAC TAAAAGAATC CGTGATCACT GACTCATTTA TGACTGGCTA GGGGAAATCA 1500
GTTACATTAT TAGTGATTCA GGCAAACATT GCATCAGGTT ACATCACAGG AAGAAACTCA 1560
AATTCAAACT GACAATTTAT AAAAAGGCTG CTTTTCTTTG CAGTAAAGGA AATACTCACA 1620
CCACTCTAGA TTAAGAAGAT TGAGAACCAC TGAGTTCTGT TTAAAAATCA CTGTTTGAAA 1680
ATCTCTTGCA AAAGCATGGC CAAATACCAA TGGTTTGAAG GACTAAAAAC CCTGGGAAAA 1740
GTCAACTTCA TATAGCAAAG GGTTGTTGTG AGGATTAAAA AACATAATGG AAGCAAACAT 1800
GCTTTGTACA GGGCTACATT GCTATATATG TTCGGTTGCA TTACTCCATC TCTCAACTTA 1860
AGGTGTCTTC AATATAGACA AAGGATCTGA AGGACTCTTT TTTTACTGAG AAAATAGCTC 1920
TGAAAACCAC AATGTTAGGC ACACAGCTCA GGAAAGCTCT ATAAAATAAG ATGCAAGGCC 1980
TGTGTTGTCT ATTTCCATCC TTCACAATGG AAAAGCAGTT CATTTTCCTT CCTATATTAT 2040
TGTATTTCAA AAACGCAAGT ACATTTCTTG CAGCTATAGG CTAAAGCAAT CTTTCAAGAA 2100
ACTCCTAACA ATCATACTAT GATCAAATTG TTAAAACACA CACACACACA CACACACACA 2160
AGAAAACAAT CAGCTATATT TTGTTGGCCT CCATGATAGA GTATTCAAAT TCCAAGAATC 2220
CAAACATTCA CTAGCTATAT GATTTCATGT TTACCTTGAC AACAAATGAC TTGTCTCCAT 2280
TATTACACAA GGAATGATGG GCTCAGAGAG GCTAAGCAAC TGGTCCAAAG TCACAAGTTG 2340
GTACAAGTCA AGATTTCAAC TTATTGGTCT GAGTCCCAGA CTAGTATTCT TTATGCTAAA 2400
TTCCAACTGC CTCTCAAAGA AAGGAGCCTA ATTGTAGACT GCTATATGCC TCCGGAACAT 2460
AGTGAAAGAG TTTCAAGGCT GAAAATAACC AAAGATGGCC 2500