EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-10004 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:66284900-66290970 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr12:66286154-66286165TTTTATTGCTT-6.32
GATA2MA0036.3chr12:66289743-66289754TTCTTATCTGT+6.14
GATA2MA0036.3chr12:66288115-66288126TTCTTATCTTT+6.62
Gata1MA0035.3chr12:66289743-66289754TTCTTATCTGT+6.62
IRF1MA0050.2chr12:66290294-66290315TCTCTCTTTCTCTTTCTCTCT+6.65
Lhx3MA0135.1chr12:66286238-66286251TAATTAATTAACA+6.12
ZNF263MA0528.1chr12:66290320-66290341CTTTTTCCTTCTTCCTCCTCT-6.51
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02499chr12:66284529-66288046Astrocytes
SE_02499chr12:66289210-66290915Astrocytes
SE_32830chr12:66285808-66287020H1
SE_32830chr12:66287048-66291390H1
SE_34269chr12:66283219-66291902HCT-116
SE_35398chr12:66285112-66292459HepG2
SE_38126chr12:66283924-66287896HUVEC
SE_44338chr12:66282989-66288567NHDF-Ad
SE_45560chr12:66282479-66292664Osteoblasts
SE_47171chr12:66282476-66298578Panc1
SE_52144chr12:66284514-66287877Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52144chr12:66289398-66290729Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55829chr12:66283472-66288702u87
SE_55829chr12:66288798-66290813u87
SE_63908chr12:66284500-66288016HSMM
SE_63908chr12:66289335-66290819HSMM
SE_67652chr12:66283472-66288702u87
SE_67652chr12:66288798-66290813u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr126628584466286273
chr126628669866286979
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I065888chr126628267066294672
Enhancer Sequence
ATGTAAAGTA TAGAAACTCA GCCGCTCTGA CCCTGTTTTG ATTCCAAACC CTTGTACCTA 60
CCAGACCATT TAGGAAGACT GGGATAAATA AGCATTATAA CTCCAGGGAG CTTTCTGATT 120
TCATGATCCA TTTCTGTTTC TTAGGGGCCA GACAGTGCTA GGCTTACAGG AGACTCAAAA 180
TCTGTAGTTA ACCACAGCAA TAAATGAACA CAAAGGAAAT GCAGATGTAA GTAGGGGATA 240
AACTTTGAGT GGTTCCATCA GTAGTGATTC ATGATGTTGA ACTACAATAA TATTTTCCTC 300
CACACACTCT CCCAGTTCCC ATTGTGACAC TGGAGCAGCA TTTAGGGAAG ACAGTTAGGC 360
TTGGGGGTGC GTTCTGTGGT CATGGCTGTG GAAGATTGGT CCTACGGCTG TTAATCTGGC 420
TGACAAATGT TTCATCAACA TGCATTGTTG AAAGTGACAT GATGCACAGT GCTGGTTAAG 480
AGTCGCGTAA ATAATAAAAT GCCCAAGATG GGAGAAGAGC AGTTTTCCTG GCTTCTCCAA 540
GTTTGAGCTG CAGAATCAGA AGCAGTAGAA TAGAGAGAGA AGAGACAGGA CACTAGCTTG 600
GGTTCCAGCC CCAACTCTGC TGCCCTGTGC TGCGTGGCTG CAGCAAGTGA CTTATCTAAT 660
AACTGTGGGT CTCAGTTTCC TCACTCATAG TATTAATGAT CATTTCTCAG GAGTATTAAA 720
TAAGAGCATG AGTTTAAAGA GCCCAGTCCC GTGCCCAGCA CAACGGAGGC TACCCTCCAA 780
AGGTCAGTCC CTTTTTCTGT GTGTTTCATC CTCTCTTGGC AGCCTGTTTG CTGCATCTCT 840
CAGCTGACTT TTGTCCCTTC CTGCTCACTT AGTCAATTCA GAGATTACAG TTTGTACAAT 900
AATGCGCTGC CTTGTCTTCT CGCTGGTGAA TCTGGACCGG AGTGCTCTGC CTCTGCGCCG 960
ACACTCACTC TGATGGTCTT GGCTGGAGGA CAGAGGCTGC TGGCAAAAAC CTAAGAGGGA 1020
ACATACCGTG GTAGCAGCAT GAAAGAATTT GGCAAGGAGG TGCTCGTCAC ATGATTGTGA 1080
TTCATACTGT ACTCTCAAAA TGTGGCAGGA GGGCTAGGAG AGACTTTTAA TGCCAGCACA 1140
CAGAGCAGAG ACACTCATTT TCAAACATCA CATTCTTTTT ATAGTACAGG CATGCCTCAC 1200
AGGGAAAATA TTGAACTTGG CCTGCCAGCA CCACGAGAGT CGTCCCAACT GTGATTTTAT 1260
TGCTTGAGTC ACTCCCTGAA TCAGATACTG GCTGCACGGA GGAAGTCTTC TATTAGGGAT 1320
GCTTTGAAAT TGTGTTTTTA ATTAATTAAC ACCAACTCTG GACAGGTTTT TCATTTACTC 1380
CTAGCTGACT CTTTTTTGTC TTTTCTTTTT TTGCCTGAAA CTTGTTAGAC ATTTTTGTAA 1440
GGTCTCAGTT GGATCGCTTT TAAGTATCCT GGTGAAAGAG TCATCTGTGT TGGGTGACCA 1500
AAGCGAGGGG ACCCTTCAAA GTAGAGTTTG TCATCTCCGA GAGAATCTGA TCCATGGGAA 1560
TGGGGTCGTC AGGAAAACGG TCCCTAAAAG TCTGGCATAG CACTTTTTGA TGCCTTCAGC 1620
CGTCCTCAAT CCATTCATCC TGTTGTTAAA ACTTAAAACT AGAGCTGGCC AGCTGTTGAG 1680
AAAAGTCCTC AGTTTTATTT CAACCAAATG ATGCTGCCTC CTGGGGCTGG AAGGGGGCTG 1740
ACTTCAAGCA CAATTATAAA TGTGTAGCTC TTTCAAGCGG CGGAAACCTA CAAAATGGCC 1800
TTGATTCACA GGGCCCCTCT GGCTCAAAGA CTCTCTGCTT CCCGTGTGTC ATAAATCTGT 1860
ATCTGCATCA AAAAGTGTAA AGACGGCAGT GTATGGAAGT CCCTCTTCCT CTGCGAGTGT 1920
GTCTATGACA GATTTATACT GATGGCTACA CTGCACCCCG GTCACAGGCT CCTATTATAG 1980
TCATGCCCCA CTGACTCAGC CCCCATTTCC TGTGGAAGGG GAGACAAGGT CCTGCATGAA 2040
GGAGGGTGAA ATTACAGCTC AACTCTCGAA TTGCTGTTAG TACAGGAGGA CCTTTAAGGG 2100
CTGCAGCAAG ACCCATTTTG TTCATAGCAA CATCTACTGT CTCCTCACCC CAGTGTGGTC 2160
ACAGCTAAAA CCTAAGGCAT TTAGTTTCAT GACAAGATAT GCCATGACAG GGTACTCCAG 2220
AATTCAACAA GGCCAAATGG ATACATGCGA AAAGAACAAA CCACCTCATT TGTTATAATT 2280
TTTGTTTCTT CAAAGTGGTT TTCTTTTTCT TCCTGAGGGT ACAAGTTTCA AATGTGGAAA 2340
TTTTTTAAGG TAGCATTTGA ATCCACCTCT CTATTAGTAT TTGCAAATGG ATGCAGAACA 2400
GGACTGGTTT TTGAAACCAC CTCCTTGTTA GAGATTTTTC ATCCTTTGCA AACATTGTAG 2460
GGTTTCAGAG GTAGCGGCTG GTGAGAACCC TCTTGTGTTT GACTGCAGCC TTCGAGGTTT 2520
AGAGCTGTCC TGCATTTCAG GGGGTGAATG GCTACTGGTA AAGAGGTCAA AATGAGCTTT 2580
ATTCCAAGAG TTAAGCAATG AAGTTGCAAA GTTTAATTGG TGTAATTTTG GGAGATAAGG 2640
ATGGAAAGGG AAGGATGTTA GGATAGTTTG AATCCTCTAA GAGGAGAAAA GGCAAAACTG 2700
ATATTTGACT TTCCCACTGT ATTTAGAGTA TAGCCTTCAT GGGGTAGCTG TTTCTTCTTG 2760
TGTTTGGTAT GGCTCAGAGC ACTTGAAAAT GTCACTGGCT GAAGAAGAGT GCTTGTGATG 2820
ATATTTTTTA ATTCACTTTT TTTGTAGACT TTAGTACTAT AAAGAAATGA TACATAGAGG 2880
GGAGTAAAAA CTTGTCTAGC TAACAATTGG TATTATAATG GTTTTGAATG CACAGTTCTG 2940
ATTAAATTTT ATACATTTCT TCCGTTGGCC AACTTATCGT GAGCCTGGTT GTATGCCTCT 3000
GGTGTTTGTA TGATATTCAC TGCATTTTTT TCTAACGTGT TAAGGATTCT ATTTTAAATA 3060
GAAAATCAGA TTGCAGTTTG AAAAACTTAG TTTTAAAACT CTACCATCTG CTAGATTTGT 3120
GGAAGAGGAT CTGGTAAATG AAAATTGTGT GTGTATGTGT GTGGTTTATT TTATAGGCAC 3180
TGCATATTTC TTTGATGATC TATTTTCCAA GCTCATTCTT ATCTTTTAGA AGATGTTTCA 3240
AGGATTTATG CATCTGGCAA GATTTCAGAG AACTCTATAG TGGTGGAGAT GTACACTCCA 3300
TTTATAGGGA ATCCTGAATC AGGGTCATTG AGAGCATTTA TTTTGTTTTG CGCTTAAATT 3360
TATTTCTGCT CTGGACATTT CTTTCAAATG GATCATTTTT ACATGGTCAA ATCTAAGCAT 3420
TTTATTCATA AGAACTCTAA TAATAAAGCT TTTTCAGTCC AGACATAGGT GGAAATTTGC 3480
AAAATGCATC AGGAAAGTAT GGCAATTGCT TTTCAAGCCA TCTTGTATTT GAGAAAGTAT 3540
TGCATTCATT AGTGTTTGCA AAACTACCTT TAATGGTGCA AAAGTAAAGC TGACCTCTCC 3600
CTTTTGGTGC ACAGATGTAT AAACTTTATG GAAGTACACC CCAAGGTAGA GACTTATTGG 3660
AGTAACTCTT AGAAAGGGCA AAGTTGGCCA TAAACAGTGA TGCAATAACC CCACAATTAT 3720
GTATGCTCAA TTATTTGGAA GGGAAGTCTG GGAGAAGTGT TTTATATGAT TACATGGGCA 3780
AATAAGAAGT GAGTGTGGAG AAGCACGGTC CAAAGGTTTG CATTTGTTGT GTATATCCCA 3840
AATAGCACCC TAATACAGCT TTATAATGTA AATCCACCGG TACCAGTAAA ACAGCATTTA 3900
AAACAAATTG TAAAATGAAC AACATTTGCA AAGCAATAAA GAAACCACCT TTGCAATCAC 3960
TTTACTACAG TTTTGAAAAA TGTTAGTGAA TAGCTCTCCA AAGATGCAAG TAAATAATAT 4020
TTTATTAGAT TTCAGCCTAG GAGAAAGGGG AGGAAAACCT TCAACTAGAA TTACATGATT 4080
ATTGCTTTGC TCCTCCCTCA ACCCAGCAAA CATTAAAATG GAACATAAAG CAAGTCTATA 4140
ACAAGATTTA TGAGGAAAGG TATTACACTT AGGGGCACAT TGTGCAGAAA AGTCATTAAA 4200
ATTGTTTGGG CCTTAAGAAG GGGAAAAAAA AAACCTTTTG AGAAAAATGA GAAACTCAGA 4260
TGTATCAAAA TGCCTTCCTT ATGATTACCT GAGGCTTTAG GTTTTTAAAA GCCTTTGTAC 4320
CTAAAGGTTC TGATTCATTC TCTATTGTGG CAACTTTTTC CTACCAGACA AAACTGAAAG 4380
ATTTTGTTTC TCTAGGAAAC ATACTTAAAG AAGTATAGTA GACCTGGCAT TCCTTTTGCA 4440
TGCTCTGGTA GACCCCGGCT CTTGTATAAT AAAAACAATA TAGGCATGTT ATATTTGCCA 4500
TATGTTAGTT AGGGGGTTTC AGCAAACAAA TACCTCCTTG TGCACAGAAG TAGATGAAAG 4560
CAAAGCTTAC TGATGTCTAC TATGCCTTAA CTTACCTTCT TTGTCCTACA TAGTCTGCCT 4620
AGCAGACTTC TTTCTGGTTG GTTGTATGCA TATTTGGATA ATGGTGATAG CTCAGCATAT 4680
TCTTTATGCT TTGTTCCGCT CTGAGGACAG CTAGTACACT CGATTCAGTA TTATATGCTT 4740
TCCTATTTCC TTGCCTGATG CTTCTGTGTT ATGCTAAATC TCAGTTTATT CTGTCAGTAA 4800
AGTTGAGGAG AGTGAGTGAG GAGTGCGTTT GCATGTGTGT GTTTTCTTAT CTGTAAAGTT 4860
TTAACTTTGG CTTACTGTTT AACCAGGAAA CTCAGCAGGA CAAAGGAGAT CTAAATAAAA 4920
CTATATTCCT GTTGAGAATC TCCAAGGTTA TGCAATACTA TAAAATGGTG GTTTGAGTAG 4980
AAGTTCTGTA GTTCATCCTT ATCAGACTAA TGGTTTTGGG GTTTTTGAAA AGGAATGTTT 5040
CAAGGAGGTC TTTGAAAACC ATTTTCTTCA AATGTTCATT GCATCTGAGA TCCCATTTTT 5100
GTCCCTTTAT TTGCTCCAGA ATACCGCCCA ACTGCCAACA AAGAAGGGCT TGTGCTCCCA 5160
GGAATTTTCT GCATTCCTCT CTGGAGTAGG CATTTTTCTC AGCTACAAAG GCCCTTTGGC 5220
GAATTCCCTC TAATCATTGG ATTTGCCCTG GGCTCTGATA GGTGCCATTC ATGGACTTGG 5280
TCTGCTGTTT GATGGGGCTG AGGCATTAAT GGGATCTTTT CATGATAAAC AAAACTGGGT 5340
AACATTACCA GAGGGATCAC AAAGCTGCTG TTGTAGGGGG AGTGTGGTGC TTTCTCTCTC 5400
TTTCTCTTTC TCTCTCTCTG CTTTTTCCTT CTTCCTCCTC TTCTCCCTGT TCTTTTTATG 5460
AACGCACATT TGTGTGCGTG TGCAGCATGG CCATTTCTAG AAGCAGATCT TCTGACCTTT 5520
GCTGCTACTC GTAAGTCAAT GGCCAATGGC AAGGCCTTTG TTGAACATAA GATGATTCTA 5580
TATACTGATC TGATCTACAG TAGCTTCACA GCCTGCGGGG AGGTCTGTGT TTTCTTAATT 5640
GATTAAACGT TGGAAGAATA CTGCATGAAG AATCTGATTT TGAGATCTTT CTTACATGCT 5700
GGCATTTAAT TACTGAAAGT ATCTGGTAGT TGAGATGAAT GAGTCTGGGG GAATAAATAC 5760
TTAACACAAG AATTCAACTT CATGTGGCTG CTGTGGTGGT ATATCCCTGG CTGTGTTATC 5820
AATGCCAGAC TGAATGGGGT AACTCGTCAC TGTTGTTGTA TCCTATTTGC TTCTCAAAAG 5880
AATGCAAAAA TGGTTAGTTG AAACCTGATT CCTGCAATAG TGAAGAAGTG AAATTAGAAT 5940
TATTTTAGGT GATGAACACT ATTTTTTTAA AGTTTTTATT TTTGTGGGTA TGTAGGTGTG 6000
CATATTTGTG GTGTATGTGA GAGATTTTGA TGCGGGCATA CAATGCTTAA TAATCACATC 6060
AGGGTAAATG 6070