EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-09350 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:49593970-49596260 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr12:49595308-49595319TATTATGCAAT-6.02
LMX1BMA0703.2chr12:49596123-49596134TTAATTAAAAT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03427chr12:49595019-49595876Brain_Angular_Gyrus
SE_04162chr12:49594617-49596362Brain_Anterior_Caudate
SE_05204chr12:49593668-49596426Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06899chr12:49593746-49596355Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08188chr12:49594603-49597243Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_29656chr12:49593963-49596586Fetal_Muscle
SE_33510chr12:49593654-49597101H2171
SE_37133chr12:49594312-49596564HSMMtube
SE_55070chr12:49594108-49596490Stomach_Smooth_Muscle
SE_63429chr12:49581126-49628992NCI-H69
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr124959576549596022
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I049200chr124959384849596754
Enhancer Sequence
ACCACCACAC CAAGCTAATT TCTGTATTAT TAGTAGAGAT GGGGTTTTAC CATTTTGGCC 60
AGGCTGGTCC CGAACTCCCA GCCTGAGGTG ATCCACCCAC CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG 120
GGATTACAGG CGTGAGCCAC CACGCCCAGC CTTGACCAGT CTTATTAGCC AAAGGGCCTA 180
CATCAAGGGG AGGACGTGGC AGAATATTTA GGTTGGGCTT TGAACCTCCC TCTTCAAGTG 240
TTACAGGCAT AAATCTAAGA CTAAAATAGA AGATACCCCC CTATAACATG TTGGAATGAT 300
CATGTACACC AGTGTTTCCT AAATGTGCTG AAGTAATTGG GGTGCTGGTT AAAATATGGA 360
TCCCCAGTTC CTCCACCAGA GAGTCTGATT CAGTAGGTCT AATTCAGTAA ATAATACTCT 420
CCTAGAATTA ATAATTTATC ATTTTTGAGC TAAACAATTT TAGTGTGCTT GATGTGGTTC 480
AGCTATTTCT AAATTCTGAT ATCCGCTCGA TAAATTTACT GAAAATTACT TTATTTATGG 540
TTGTTAACCC TAAAGACACA ACTCCTAGTG AAGCCTAGCC TCAAAGAGCA TTTTAAGAAA 600
TGTCTCTCCA TATTCCCTTT TTAAAATATT TTTTCTTTTT TTTTTTTTTA AACTTCTCTG 660
GAGATAATGC TGGATCCACC TTCCTTTAGA TTTAGAAATC AATTATGCAC AGGCAAAAGA 720
GAACTTAGAA AAAGCTGCCT AGCTTTTTCT TCATCTGCCT AGCCTAAAAG ATCATTTAGC 780
AAACATTTCT CCATTTCCCT GTGGATGTAA ACTTTGATTA TACATGTGTA GAAGAGAAAG 840
GCTTAGAGAA CGCTGTGGGT TTTTTCCTTC ATCTGCTTAT GTGAACAGCA ATCTGTTGTT 900
CTAGTACTGT CTACAGATTA TAAGAGATGT AGAGTTTCAC TCAAGATAGC ATAGCCTGAA 960
ATAAGTCCCT TATATGGCAA GACTATTTAT GGATTTAGTA TATTTTAATA AATAAGCCCA 1020
CTATTAATCT TTTTAAAATG ATTTCAGTAT TTTTAGATTT GTAAGAGCGA CTTCACTCTC 1080
ACCCCCATGT TACTAAGCAA CGTATTATAC AGTTGCTAGG AGACAGACTA GCAAGGTTGG 1140
GGGTATTTCA AATTTCCGTT GTCACCTTGC CTATCACATG ACTATACCCT AGAGAGTTTT 1200
ACAGCCTTAG AGAAAAGAGA AAAAAGTTAA TGGCACATAG AAAAGAAGGA AAGAGAGATG 1260
AGGTTGAGGA ATAAAGGAAT AGAATAAGGA AAATTGCAAG GTATTTGAGA AGAGTCTGTG 1320
AACTTGGCAG GGAAAGGCTA TTATGCAATT TCCTTGAATG AGTCATGGAA AAACCTTAAA 1380
TTGCCAGTGC TGTATTTCAT ATTCTGTATG CTTCTACCTT TTCTAAAAAC AAAATAGAGA 1440
ATAAGCTTGG AGAAGAAGAT CTTTCAGATA GTTTTTCTGA ATATTTTCAG AAGAGTGGAA 1500
ATCAATTATA ACTCTTACAG AAGACAGGTA TTTACAAATG AGTTTTTCAA AGTCACACAT 1560
AATTTAAAAT CCCCAAGTCA GATAAACAGC TTATTTCCTT CTATTTCTCC CTCAAAATAG 1620
TAAAAAAATG ACAGTACTGA GAGGAAGGTT AGAATACAAG TGTTCTTAGA CAAATTGAGC 1680
AGCAAGATGG TCATATAGGC TCTTGGGCAG TATGTGTTTC TGCACACAAT TTAAAAAATT 1740
TAATACAAAG GAGAGAGAGA AGAAGCCTTT GTACTGTATC TCAAGGACTC TGTATCTGAA 1800
ATAAGAAACC AGGCTCCAGG TCTCATTGTG TGTATGTGAA AAGTTGAGTC TTTGTGTCAT 1860
TGTGTCTTCA TGGTATTTAC TGTTGCTAGC AACCAGGAAG CTCCCTAGTG ATTGTCGCTA 1920
GGTCCTCCAT GCCTCTGTCT GCCTGAAACC TTAGTCAGTG CCAGAAACAC CAGAGATAAA 1980
AATCGTTGCA AAAAATCCAG CGCACATCAT CCCCAGTGGT TTTATAGAAG ACGGTTCATC 2040
TTGTGTTCAG TGAAAATCTG TGTAAAATGG AGGCTTCACA CAGAGCTCAT CCTCAGCTTC 2100
TTCTTCATCA ATGCCAATCT TTCCGTGCAG AGCAGAGTGG ACATTGTGAT GGTTTAATTA 2160
AAATAAGATT TATATCCTAG CGTCATCAGC TTTAACCAAT AAAATAATAA ATAAATAAAT 2220
CAGACAGCCG GGCGCGGTGG CTCACGCCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAGGCAG 2280
GTGGATCACC 2290