EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-09234 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:46884980-46885780 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr12:46885575-46885586TCCAATCCACA+6.62
Foxq1MA0040.1chr12:46885683-46885694AATAAACAATT-6.02
Lhx3MA0135.1chr12:46885124-46885137TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:46885128-46885141TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:46885125-46885138AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:46885129-46885142AATTAATTAATTT-6.92
Lhx3MA0135.1chr12:46885121-46885134ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr12:46885126-46885136ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:46885130-46885140ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:46885126-46885136ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:46885130-46885140ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_34391chr12:46885653-46887936HCT-116
SE_34804chr12:46883060-46889265HeLa
SE_38100chr12:46884272-46889072HUVEC
SE_39348chr12:46883198-46889668IMR90
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I046489chr124688293546889569
Enhancer Sequence
CCCCAGTGAT CTCAAGGTAA GATAAATATT TTATAATTGT AATGCATGGT GTCTTTAAAG 60
AATGTACAAT TCTCTGCAAA ATTTATAACC CAGAAATGCT TTCAGGTACA TTTAATCTTT 120
ACAATTCAGG TAAAGATTGT TATTTAATTA ATTAATTAAT TTTTTGAGAC AGGGTCTCAC 180
TCTGTTGCCC AGGTTGGAGT GCAGTGGCAT GATCATGGCT CACTGCAGAC TTGACCTCTC 240
GGGCCCAATT GATCCTCCCA CTTCAACCTC CCAAGTAGCT GAGACTACAG GCACAAGCCA 300
CCACACCTGG CTAAGATTGT TATTTATGCT ATATATGGAA ACTACCAAGT AAGAGAGAGT 360
GGCTTGGTCA AGGTTTCTAA AAATTGAAAC AGACTTAAAA AAGATTGGGT TTTCAATTCC 420
ATTCTTGGAG TTTTTAAAAA TGCAACATGA AAATTGATAT TTAAGTATTT TTAAAAATGA 480
GTATTAGTCA TGGAGATAAG ACTGTCCCTA CTTCCCTCCT TTGTTTGGCT CTAAGCTGAT 540
GCTGGACTCT GCCCTAGTGT ATCCTTAAAA GCTGATGTTC ATGTCACGGC AACATTCCAA 600
TCCACAATGG ATTGAGTTTT CCAGTTCATC AACAAAATCT CACTTACTTG AGAAAGGCTT 660
GTCTGAAATC AGTAGTAGTG GTAGTAATAA TAATAATAAT GATAATAAAC AATTGATATT 720
TATCAAACAC TGATTGTTTC CAGGTTCTGT TCTAGACACT TTACAGGTAT TAACTGATTT 780
GATCTTTCCG GCAAGCCTAT 800