EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-08459 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr12:27700930-27703550 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr12:27701863-27701877TATAAGTAGGTCAC+6.7
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_07252chr12:27701414-27711689Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08320chr12:27700805-27710329Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_35853chr12:27700865-27704826HMEC
SE_41040chr12:27699884-27703918Left_Ventricle
SE_43068chr12:27700969-27703795Lung
SE_44212chr12:27701114-27703880NHDF-Ad
SE_45579chr12:27698172-27710328Osteoblasts
SE_47027chr12:27701486-27701965Ovary
SE_47027chr12:27702011-27702459Ovary
SE_47027chr12:27702548-27702952Ovary
SE_47027chr12:27702985-27703379Ovary
SE_47349chr12:27700501-27711498Panc1
SE_55934chr12:27699789-27710279u87
SE_64268chr12:27701226-27704785NHEK
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I027547chr122770008327711987
Enhancer Sequence
TATATGGAAA GTTAGAAAGT CTGGATCCCT TAGCAAAACT GAGGGAAGAG ATTATAACTG 60
CTTTGTGAAC TATTAAATAA ACAGATCTCC AGCCTCTTGG AAGTTTATGA GATCCTTGGA 120
TAATATGTAC ACCTGATTAC GGTGTAACAG GGCTTAGCCT CTATATTTGT GAAATGACTG 180
ACCCATAATT GAATAATTTT CCCCAAGCAT GAATTACTGC ACGTTCAGAA TATTCATCCT 240
ATGTGTATAT AAATGCAGTT GAATGGGTCG CCGTAACAAA AGGCAAGCAA GTGAGTGAGG 300
CACACAAACT CAGACTTAGA ACCTTCCAGG GGGCCCTGGG GATGGAAGGC AAATATAGGA 360
GGTTATAGCT TTGGTTCCTG AATCACCTTA TGTGATATTT TAGTCATAGT CGAGGATAAT 420
GATTTAGGAG TTAAATTGCC AAAGGATAAG TCAATATGCT TTGGCGGGGG TAGGGAAGAA 480
TCAATTTTCT GGCATTTCCG AAAGCCAGTT GCACTGAACA AATGTCTAAA ACTGGCATGG 540
TTTGTTGTAT AAGTGGGATG AGTAGACAAA GCCAAAGTTA TACCTAATCT CTTTCCCAAC 600
TGCAGATTAA GTCATATCTG TAAAAGGCAA CATGGTTTTT CTTCTGCATT TTCTGCCTTC 660
TAGTAAGTGA AGGAGGCAAT GGGTTGTGCT CCTCCATCAT CTGAGTAGTT TGAGTGTATT 720
TTGGGGACTG GAGGTGGGGA AGCCTGATGA CTTCGTCGTG GCATAGAGCA AAGGTGATCG 780
GGGGTGTGTG TTCAGACCAT GGACTTCGCT TCCCAGTGAG CCCCCTGGAC TCTGTGTATT 840
CTTTGCCTTT ATCTGCATTG CCACCTGGAA GCTCCGTAAT GTCAAGTCCT GGAAGATATT 900
ACTAACCTGT TTCCATTATG GGTGTAGTAG AAATATAAGT AGGTCACTGT TCCTAATTCA 960
GAAACTGAAG AGAGTCAAGC TGCCATGGTG ACAGGTTCTG TATAAAAACA CCCACCTCTG 1020
AACCTCTTGG AGAGATGTGA TGATTTGGTC ATTGGATGTG AAGGGGATAA TCTGCCAGCT 1080
GGTTTATTGC ATTGGCTAGA AATAGGAGAT GCAGAAACTA AAAAGCTCTC AAGAAGTCAT 1140
CAGATGAGAA GGAAATTAAT GTAGCATAGT GATTCTGCTG TAGAGGAAAG GCTAAAGGTG 1200
AGACTCTTGA ATATGTGCAC CATTTCTTCT GCAGCTCTTG ACTTGGATGA TCCTTCTCAG 1260
TGTGATCCCA CGAGTGTTTG GTGATGATCT GATAGTAGAA AGGGCAGAGC GATTTAACTT 1320
TGTGCACATC TTCCTCTGAC TTCTCCATCT TTCTAACATG CCTGTACGTG TGCCTTTATC 1380
ATTGGCATTC TGGAGTTAGG GACATGACCT TTTCTACAGT CCGGATGAGG AATCTCCAAC 1440
TATGACTTTT CATTGTGACT CACGTCTGCA AAGAATGAAT AAAGAAGAAT TTGTTGGCCA 1500
GGAAGTGTGT ACTATGCAGA GAGAAATAAT TGTTGTTGGG AAAGAAACTT TTGAAGAACC 1560
AGAATTAAAA AAAAAAAAAA AAGAAGAATG AAGGAAGTCT ATCAAGAAAA GGAAGAACCA 1620
GAAGTGATCT GCAGGGTGTT GCCTGGAGAT ATGGGAAATA AATCAAGAAC AGAGAAATGG 1680
GAAAAGATAA AATAAAAAAC ATTGCCGGTT AGGACCAGCT GGGGTCCTAG GAAAGTGGCA 1740
GTTCCAGCGG GGCTTGGAAA GCTACTGAAC CACTCACTTA TGCACACACA ACTGCCCCGC 1800
CCTCTCCCCT TCTTTGGCCC CCATTCACCT GGTGTAGGAG GGTCTGACAC CCTCACCAGG 1860
GAGAGTGCTA TTTGGCTGTT TTGAAGGCGA GACCTTGAAG CGTGGGAGAG CTTCGCCTCT 1920
TTCGTAAGCT GATGTTGCGT AACCTCCCGG AGAGTCAGGA CCTAGTGGTT AAGGACACAG 1980
GCTTTGAAGC CAGGCAGATA GGGTGTGACT TAAATGCTGG ACCTCAGAAA AATGGCTTAT 2040
TGTGAAGGGT TTAATGGAGC ATAATGAAGT AAGTGCTCAA AACTGTTGTT AATATATGCC 2100
AAGAGTTATA ACTAAATTTG TAAAAAGCAC CTTCTTATAC TCTCAGGCAA ACTTTGAACC 2160
CGAGCTCGGC TTCAACAGGG AGCTGGACTC TATCAGTGGC CCCATGGGGG AGCTGGGCAG 2220
TAATCCAAGG CTCCGGGTGG GGTGTTTGAA GCAGCTGCAG ATCCTCGTGA AGGGCTCTGG 2280
GTGCCCATAC ATTGTCCCTA TGGAGTTTCT GTACTTAAAG CCCCTGATTT TTTTTGTAAG 2340
CTGCTCCAGC TGGGATGTCT GCACACTCAC ACATGTTAAC CTAGAATGGA TTCAGGAACT 2400
ATTTTAACAT TTACATGGAT AATGGGTTGC TTTGTTAAGT CATATGTAAA TTTTTATTTA 2460
GCTCCTAACC ATCTCCTGTA CACAAGACAC TGGACTCACA GGAGTGCAAA ATGCAATGGT 2520
GTTAGGGGTT TGTATGGATA TGTTATTCGT GCTTTATGAC AACTCAGAGA GAGGTAGGTA 2580
ATATTACCAG TTTTACAGAG ATTAAATAAC TTGCCCGAGA 2620