Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS012-08053 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | Caco-2 |
Coordinate | chr12:20530550-20535100 |
SNPs | Number: 1 | ID | Chromosome | Position | Genome Version |
|
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
IRF1 | MA0050.2 | chr12:20531806-20531827 | CTTTCATTTCATTTTCTTTTT | + | 6.05 | NFIL3 | MA0025.1 | chr12:20532749-20532760 | ATGTTACATAA | - | 6.32 | Nkx3-2 | MA0122.3 | chr12:20534097-20534110 | TTTAAGTGTTTTT | - | 6.64 | Nkx3-2 | MA0122.3 | chr12:20532046-20532059 | TAAACCACTTAAA | + | 7.04 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 2 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_29164 | chr12:20534568-20536693 | Fetal_Intestine_Large | SE_40912 | chr12:20532002-20532660 | Left_Ventricle |
|
| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH12I020379 | chr12 | 20532003 | 20532660 | GH12I020381 | chr12 | 20534569 | 20537060 |
|
Enhancer Sequence | ATACAGTCTT TAAAATTATA TGTGTAATCT TGATAGCTCA TTTTTGTACC ACTCTAATAG 60 TTGCCAAGTC TATTTGCCCT TTTTTCTTCA TTTCTCATTA TTGCATTTAT TTTAAAATAT 120 GATTATTTTC ATCGGAGGGG GAGATTTAGC AGAGTTCCTT AATAAAAGAC CTTTATATTA 180 ACCTGATTTA TAACACAGTA TCAATATTTC CAGTTAATTA TGAATTTGCC TTTAGGAGTT 240 TGGTATGTAA CAGGGATTGC TTATGGATAC ACTGTAAACA CAACACATGT TCATGATGAT 300 TAGTCTATAA TTGGGTTATC TAATGTCTCT TTAGAAATGA AAGTGCTTAT GTTTGTAGGT 360 CATTATCTTT GTAACTTAGG AAACTAAAAG TCACAAGCCT GCTCCTAGCT TTAATGGATG 420 AAAATTGTAA CAGTGTCTGT AAAGGGCTAA CTTTTCACTA CTGTTTATAT AAATACCACT 480 TTCATGGAAA CACAATGAAA ATGGTTCATT CTGTGTATAG AGCAGATTGG AGATTTTGAT 540 AGTGTGGAAT TTTTAAAGTA GGAATTTAGA TTAGGTGAGT TTTGGAGCCA TTTTCTGAGT 600 TCACTCCGGT TTGCAATTTC AAACTGATTT CAGATGAAAA AGTCTGGAAA TGTTTAATGT 660 CATGTCCTCT CCATCACCTT TCCTTATACT CTATGAATTC GTTAACAATA GCCGTAATTC 720 CAATTCTACA TCAAGAAATA AAGAGAAAAT TATATATGGC ATTTTACTTT ATATATAGAT 780 ATATAGATTA ACTTTTAAAA ATACATTTAT TATGTGTATA ACGTTTATAT CTGTGTGTGA 840 TGCTTTTAGT GATTGGGACA GGGTATATTA CTTATTTTTA CACTGCAGAT TAATATAGAC 900 AGATTTTATA TCATAGATAC ATAGATTTTC ACTTACTAGA AATTCTAAAA AGATCAAAAG 960 GCAATAGAAT CATGGTATAC AAAGAAGCAC ATTTGGACAA AATGAAATAA TGTGGATGCT 1020 GGCTCGCTTC TGGTAAAAGC TGACTTAATT TAGAGTTCTT GAAGAAGCTA GCTGAAGAAT 1080 GAAATGTCAT TGTAACACAC ATCTGTTTCT TGAAAGAGTT TATACTTGAA TGTAACTAGT 1140 CACTGTTAGC TCTGGCTAAT TTTGAAGTTG ATTTAAATTA ATATAGAGGT TGTTCTGGTA 1200 CTTTTTTTTT TGGTCAGTCT TTTTCTGTTC TCCATCTCTA TCTACATGCA CATTTTCTTT 1260 CATTTCATTT TCTTTTTACC TAATAGAGTC TTCTCCCTCC GAATGTGTTT AAAATTTTAA 1320 GGAATGCCAT TCTGTCTCTC CCAGTACCTT GTTAGAATAT TGAAATAATT TTATGCAAGA 1380 ATCTTGTGGT TTTGGTTTAA TAGGATTTTA GTAAAAATTT TCCATCTTGT GAAGTAAGTT 1440 TAAATAACTG AATATTTATG CTATGTCTGT GGCAAGTGTT TCCTCCTCTC CAGGTATAAA 1500 CCACTTAAAG AGACCTAATG GAAGTTTGAA GTCATAGAGA TATTATTCAG TGGGTAATGT 1560 TTAATTCTGT GGCAACAGTT ATACAGCTAT GTGGAATCAG CATCCTTAGC CCATTTTTAA 1620 GCTAGCATGA ACACAAATAA ATGAAATAGT TTTTATTTTT ATCGTATTTT AGAGATCCAC 1680 TTCAGAAATG CTCTTTAGTG AGCAGTGTTT GTCCTCGTGA TATGAAACAT CCCCTTGTTT 1740 GGGAGTTATT ATTTCAGGGT CCAGCCTCAG CAGCAGTCTC TCAGGAAGTT TGGAAGGGAG 1800 AGAGCCTGCT GAACTGCTTA TGCTGTATTG AGAATTTGCT TTCTAGTCTC AGGAACTAAG 1860 GAAGTCAGAT TCAGATTAAG ACAATTTTTA TTATAAAAGG AATCAAATTT TTGTAGCTTC 1920 CTTTTCTCAG CCATAAGCAT TTCATTTAGA AAATTCTGGC CCAGTGTCTT GCTTATTGTA 1980 AGTGCTGGCT GGATGGTAGG AAAAATGGAT GAAAAAGAAA TAAAAGACTT TTAACCTGAA 2040 ATATTTATCT CCCCATTCTC CTGAGGTTGA GGTAGTGACT AAGTTGATTT AAGGAAATTT 2100 CTATGGGAAG AAGAGAAGAA ATAAGACTAT CAACAAAGCT ATACATTTTC AGTTTTAGTA 2160 TGGTGTTTAC ATTTTTGTTA CTTAAATATT TTCTTGCATA TGTTACATAA GGGGTTGCAT 2220 TTGCCTGTGC CCTTACTGGT AGGAAATCCC ATGTTCAGCA TGAGTCCTAG ATAATTATTT 2280 TTAGCTCACT CTCAACTGAA AATAACCAAA GCTACCACCA AGATCATTGT AGTGTAAACC 2340 TTTGAAAAAT TTCTGAAATT TGGGTTCATA TTTTAGAAAA ATAAAATGTC AAGTGTTTTT 2400 CACATTCAAC TAATAAATTG AGAGAGAACA AACTCTGACT TTATTTTCTT CCATTCCATC 2460 CCACAGGGCT CTGACAGGTG CTCTTCAGCT ATCACCTTTT TTATACTCTA GTAGTCTGCA 2520 TTCTTGTTAG AGGTTCTTAC TGAATAGCTG TATTTTCTGA AAAGTCTAAT GTAAAGCAAA 2580 TGTTATCTCC TTAGCTTTTA ATTGTGATCA ATTACAAAAC AAAGTTTGAG ATGGTTGCTT 2640 CCAGAGATGA CATTGTGAAA TTGACTTTTT AAAAATGTCA TCCAACTGCC GTGCTAGTTC 2700 CATCATGTGG AATGATCTAG AAATTTGGTA GCATAATTGC AGAATCAAGT TGAACTGAAA 2760 AATCAGAAGC TTATAGGGTT TTATTGCAGT GATAAATTTA GCTTTTCAGT CATTTTTCTT 2820 TGGTCCACCT ACTTTTTAAT AGAACTTGAC TTGTGAAAAT CAAAAAATTT AAGTCAAATA 2880 AGAATGTTTT GTTGTTGCAG TTTTAATACT TAGAGAAGAT ACAGTATTGT TATATCCTCT 2940 CACTGAAATC AGAGACATAT CTTTTGAGTA TGTTAGGCAG ATGATCATGA CATTAGATGA 3000 ACTAGGAATA CAATATTTAG GAAAAAAGTG ATTTCGAACC TTATGGTGTC AAGTTTCTTT 3060 TTATCTGTAC ATGTCAAGTG TTCTCACAGG CAGACTTTTT AGAGAGATTG CTATCACTGA 3120 CAACTTCCAG AGTTTGAGAG TTTTTTGAAT ATACTACTTA AAAAAATCTC CATATGGTTT 3180 TCATTTGAAA AAACATATTA CAAACTGAGA CATTCACTAT AAATTAAATT GAAATAATCA 3240 AAATATAATT AAGCTATTTG TGAGTTTACA TTTTGCAAAA CATTTTAGAA GCAAAATCAT 3300 TTAACTTTGT TTGCATTTTG AGACAAGGAG CTAACTGTGT GTATCATCTT GAGTAGTGTC 3360 TGTTTTTATT CCTAGGGATT GTTTTCCCTA TAATTGGAGT TGTTTTTTGC TAGGTAAGTA 3420 GGATCCAAAT AACAGCATAG TTATTAAGGC AGTAGCCTCG TTTTGTCCAC TTCTCGTCAT 3480 TCCTTTTTAC TTAAATAACA ATTAGATTTG CTCATCTTAA CCCCTTTACA GAGCTACAGC 3540 TAGAGCTTTT AAGTGTTTTT GGTGGAACTT CCTTAAGCAA TTAACTAGTC CTAATAAAAA 3600 GTGTGAGAAT TAGATTGGGA ATGTTGGATA CATATATAAC TAAACACCGA TTAAGTAAGT 3660 TATCTAAAAA ATAAAGTGGC ATTCAGATAT GAAAACCACC ATAAAAATGA GTGCCAAAAA 3720 CTAATGGTAG TATTTTTGCT TGTGCACAAA GAAGACTAGA TCAAAATCAA ATGAATAATT 3780 CCTCAGTTTT CAAAAAATAT TTTATGGTCT TTTGAGGGCA TAATATTAGT GCATGTAAAA 3840 ACTAGAACGC TTTATGATTT GAAAAGAGGA GAAGATGCTG AGAGAGACAC TCTTGGAAGC 3900 TGGGCAGGAA ATCCAGCCAT GCATTGCCTC AAGGTCTGTC ATTAGATCAA AAGCACTCAG 3960 GGGACGATGG TCTGTGTAAG AGGTCCTAAT GCTATTCACG AACTCTCCTG ACATTCATTA 4020 GTTTCCAAGA CATTGATTCT TATTCTTTAA CTTTTTAGCA CATTTATCAT TTTCACTTAT 4080 ACATGTATGC TAATAGCAAT CTTATGTGAA CTTTTACCTC TTATATGACC AGAATTGATT 4140 AAAAATGTCG GCAAGTAAGT TTGTTATTTA ATATCTCTGA ACTTTCTCTA TTTTACATTG 4200 AATATTTGCT ACATTGTAAG CATTACAGTA TGACTAGATT CTTCTTTTTT TCTAACTTCT 4260 CCCCTGTTGA TAATTATTCT TATATAACTA TAATGCCATG TTAATCAAAC TATTGTTTAT 4320 GAATTATAAC AGTAAATGCC CCTGGTTAAT AGATTAATCA ACCTGCCTTA GATGCTTTTG 4380 AAGTCTGTGA GGACATTGCT TAATTTCACC TACATATAAT TACATATCAT TTGACACTCT 4440 CTAAATCGAG CTGTTTATTG TAGTTCTCAA AATTTAGTGT GAATAAAAAT TATTTGGGAA 4500 AACTATTAAA ATGCAGACGT TTAAATACTA GATTATAGAT CCTGTAACCT 4550
|