EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-04164 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr11:65212030-65214710 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR4MA0733.1chr11:65213509-65213525AGATGGGTGGGCGGAC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65212858-65212876GGAAGTAAGGAAGGTAGG+8.38
ZNF263MA0528.1chr11:65212657-65212678GAGGGAGGGAGAGCTGAAGGG+6.13
Number of super-enhancer constituents: 33             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00061chr11:65182163-65214870Adipose_Nuclei
SE_00899chr11:65210529-65214829Adrenal_Gland
SE_01675chr11:65210513-65214784Aorta
SE_03924chr11:65209094-65214529Brain_Anterior_Caudate
SE_04949chr11:65209079-65214439Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05878chr11:65208741-65215088Brain_Hippocampus_Middle
SE_06798chr11:65210463-65212569Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06798chr11:65212951-65214518Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07925chr11:65210315-65213030Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07925chr11:65213336-65214639Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09254chr11:65213334-65214865CD14
SE_10174chr11:65207517-65212474CD19_Primary
SE_10943chr11:65206800-65213034CD20
SE_17315chr11:65209851-65212312CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_19987chr11:65208296-65212359CD56
SE_34335chr11:65210979-65214617HCT-116
SE_34625chr11:65208143-65215077HeLa
SE_36987chr11:65207957-65217272HSMMtube
SE_41607chr11:65210971-65212388LNCaP
SE_41607chr11:65212475-65212898LNCaP
SE_41607chr11:65213148-65214694LNCaP
SE_44142chr11:65210242-65214886NHDF-Ad
SE_44763chr11:65210511-65212524NHLF
SE_44763chr11:65213146-65213907NHLF
SE_44763chr11:65214010-65214552NHLF
SE_45691chr11:65204708-65212667Osteoblasts
SE_45691chr11:65212923-65214859Osteoblasts
SE_47173chr11:65182160-65217345Panc1
SE_54628chr11:65213375-65214848Stomach_Smooth_Muscle
SE_58461chr11:65170809-65225246Ly1
SE_59648chr11:65169738-65223378Ly4
SE_60421chr11:65157742-65225276DHL6
SE_62214chr11:65170357-65224596Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH11I065438chr116520635365217050
Enhancer Sequence
TGAGGACAGC AGAGCTCGTG GGGGGCTCCC ACGGACCCGC CGTGGGCCCA GGGGAGGCAG 60
AGCCTGAGCC AACAGCAGTG GTGCTGTGGA CCGTGGATCC TGAGGGTGGC CTGGGGCAAG 120
TACCGGCTGA GGGTCCAGGT GGGCTTTGTG TACCTTTGGG TCCTGGGGCC CTGGTGACTT 180
GGACTCCAGG TTAGAGTCAA GTGACAGGAG AAAGGCTGGT GGGGCCCTGT GCTTCCGACT 240
TCATTTCGAG TGATGGCAGT TCCCAGGAAG GAATCCACAG CTGACGGTGG CTGACAGATC 300
AGAGAATGGA AGGCGAGGCA GGCGGGCGTC TGCGTGACCT CAGGTGCTTG GGGCCCAGCA 360
GACCCAGAGA ACCATTTCCA CTAGGCCAGG GTGCCGGAAG TGTCCACAGG TCTTAGATTC 420
CCTGTTCAGA TGAAAAGATT TGTGCCTTTA ATGATAAAAG TGATCTGCAT AGAGTCAAAA 480
ATTCAAGCCA TGGGTATAAA ATGCAAGTAA AATCCCTGCC CTCACCTATC CCACCCTACT 540
ACACAGAGAT GTCCTCTCGA GTTTCCTAGA CTCACTCTGG AAATTTCTGT ATACACACAG 600
AAGCTTGTGC CTCTGCTCGT GAAGGCAGAG GGAGGGAGAG CTGAAGGGCC AGCACCTTCT 660
CACCTGTGGG CCCCCTCAGT GCTCGGTCCC AGAGCATGCA GGACTGTGCC TCGTGTTCAG 720
TTTGCTGGTC TGACTTCATG CTCCTTGGGC AGGATATGCA TGTGCCATGC TAGGAGACAT 780
GTGGATGTGA AGCTGGGGGA CAATGTCCCC TGGCTATGCC TTTACAAGGG AAGTAAGGAA 840
GGTAGGAGGT GAGCCTGGGA GGGAGGGAGG GAGGCGCGGA GCCGCCGCAG GTGTTTCTTT 900
TACTGAGTGC AGCCCATGGC CGCACTCAGG TTTTGCTTTT CACCTTCCCA TCTGTGAAAG 960
AGTGAGCAGG AAAAAGCAAA AGGCGCTGGT GGTGGCACGT CCAGCACGGC TGGGCCGGGG 1020
TTCGAGTCCC CGCAGTGTTG CTGCTTCCTT CCAGCTCCCT CCTCCAGGCC TCTCCTCCCA 1080
CCCCACCAGG GATATCTTGT CTCCTAGAGG GGTAGCATTG GGTGGGGCAC CCCAGGCCTC 1140
TCCCAGAAGC CCTCCTGCCC TGCTATCCCC TCCCTCATCC TCTGGGGCCC TGGGAATACA 1200
GCAGGGGACG TGGGGCCACA GGCAGCTGAT AACTTAGCCC CCTCAGCCAC TCCTGTGGGA 1260
GCGGGAGGGG GACAGCTTGG CGGCTCTGCA CCCAAAGCTG TGGGGCCTAC CTGGAGTGTC 1320
CCCACCCCTC AGGGCATACT CCCCACTGCC CTCTTCTTCC CAGGATCAAC TCACCGCTAC 1380
CCTCCTCTCC ACATCTGAGG ACCAGCGTGG CTCTTCCAGG GAGGGCTTGG GGAGATGAGG 1440
TCCAAGGGGA GAGGCCAGAA ATCCTGAGGC CTGGGCTGGA GATGGGTGGG CGGACAGGGC 1500
CCAACGAACC GGCCCTTGTG CAGGAAGGCC AACAGCTGGG ACCACAAGGT GCCGGGTGGG 1560
ACAGGGAAGT CAGCCTGTGC TCTCCAGGCA CCTGGGACCC AGGAGATCCC CCCGGCTCAG 1620
CACCAGCAGA GGCAGCTGCT GTGATCCTGG GCAGGCAGTG TCCTCCTCCC TCAGTCTCTG 1680
CCCCCTCCCA TCCCCAAGAG GGAGGCCAGG GGCTCACAGT CCATTTCATG GGCCATGATA 1740
CTGATGCTGT CTGCAGTTGG GGCAGCTTGC CTGACCACAA GGCTCTCCAG GGAGCCCCTG 1800
CCAATCACTA TAATAATCTC CTTTAACGAG TCAGGCCCCA TAAGGAACAG CCAGAAGCAG 1860
GAGAGAGGTA TGCAGAGCTG GCCTATGGAG GCTTGCCATC TCTTCTGACC CCACAGAGCC 1920
CACTCAGAAT ACCACGCCCT AGTGGGTCTT CCCAGCCCAA ACTCAAGTCA CAGGATGGCA 1980
CAGGTCCTCT AGGGAGAGCT GGGCTCCCAT GGGGTGGAGG GAGCCCCAAA CCTCAACAAG 2040
GCTGAGGGGA TGCAGTATGC AGGGCCAGGG AAGGGAGCCA GGAGACAGAG GGGCCGAAAG 2100
CCAGTCAGCT TTGGTGGAGA GAACCCTTCA TGAGGAGCCC TGGCTTGGGC CTCCTGGTCA 2160
AGGAGTGTTT GCAGCAATCT GTAGTCCCTT AGCCCCTGGC AAGTTCTGGT GCCAGAAAAT 2220
CCCCTCCGGA GCTGGTGTCT CTCTCATTCA AGGGGTGAGA AGAGGCAGCG TGAAGCCGAG 2280
GTCTTGGCCG GCCATGCCTG GGTGGTGAGG CCACAAGTCC ACCCCTGCAA CTGCAAGGGC 2340
AGCAGGGAGG AGCTGCAGGA TCTGCTGTCC TTGGATGTGA TCAGCCTGCC ACTGGGGACC 2400
AACAGGCCTA GACTCATACA TGAGCCAAGG CACAGAGCCC AGGACTGAAG ACAGAGAGGA 2460
GCCACCACAC GGCAAAAGAG CATGGACATC TGAGTGCCAC CTAGCCTGTG TGAGACTCCG 2520
TTTCTCTATC TCTAAAATGG AGTCCGCCAG GCGCAGTAGC TCATGCTTGT AGTCCCAGTT 2580
ACTCAGGAGG CTGAGGTGGG AGGATCACAT AAGCCCAAGA GGTTGAGGCT GCAGTGAGCT 2640
ATGACTGCAC CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGTGA 2680