EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-03287 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr11:34660860-34664170 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs286905chr1134662961hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr11:34660862-34660872TCTAATTAAA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr11:34661272-34661285GAAACCACTTAAT+6.24
PPARGMA0066.1chr11:34661711-34661731CTGGTTCAGGGTCACCCACA+6.17
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23244chr11:34659677-34665466Colon_Crypt_1
SE_26655chr11:34659651-34665775Esophagus
SE_31738chr11:34660855-34665575Gastric
SE_33847chr11:34659645-34664811HCC1954
SE_34914chr11:34660867-34667652HeLa
SE_35339chr11:34660917-34663091HepG2
SE_41618chr11:34660873-34662895LNCaP
SE_41618chr11:34663453-34663963LNCaP
SE_50680chr11:34659625-34665670Sigmoid_Colon
SE_52951chr11:34659748-34665510Small_Intestine
SE_57552chr11:34660932-34661997VACO_503
SE_57552chr11:34662250-34663406VACO_503
SE_58084chr11:34660939-34661282VACO_9m
SE_58084chr11:34661295-34662036VACO_9m
SE_58084chr11:34662158-34662847VACO_9m
SE_64547chr11:34661580-34664931NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr113466100034663600
chr113466139034661585
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH11I034638chr113465983134669583
Enhancer Sequence
TTTCTAATTA AAAGGATTGC TTTTTATACC CCAGAAAGCA ATTACTATAT ACTACAGAAA 60
GTCTACATTA GCATATGGGA GTATGGGTGA GTTCGTTATA ATAAGGTTTT TTTACAATTC 120
TCAAGTCACA TTTGTTATCC ACGATCTCAT TCCATCTCAA CAGTCCTGTG AGGCTGTTGG 180
GGCAAGTGTC TTCACTCTAC GCCTGAAAAA CTATGCCTCA GAGGAGGGTA GGACTCGGCC 240
AAAGCCCTTC TGCTACACTG GCCCTGGGCC TCATGTGCCC ACCCTGAGGA CATCTTTCCC 300
TGCAGCTCCC TGCCCAGTTG GAAATGCTGA CCTTCTTTGC TTACAAGCCC AGGTGAGCTC 360
AAGCGAACTC TGACTCACTA AGGGTTAAGC CACACAAACT CTTTTATGAG TGGAAACCAC 420
TTAATGTGCC CTGTAAAAAA GGGCCCCTCA CCATGCTGGC TGCTTTCCCT TGGAAAGGGA 480
GTGCCAGCAG GGAGCAGGGC TATGCACAGG CCATCTTTTT GCAGGAGGAT GGTGATGGGG 540
CAGCTGCCAC CCTGTAGTCT TAAAGGCATC TCTGGGGGTT GGGAGAAGTT CTGGATGTTT 600
CCAGAAGGTC ATGGTGGAAA ATGACGTCGG CCCTGAGGAG AGGGGCTTGT GGGCATTTGG 660
CCACAGGTGG AGAACTGGCC CATATTGTTC TGCAACATTT ATTAAATTCT TTTTTTTTTT 720
TTCACTACTT GCCAAGCTCT CTATGTGCAT GACCTCATTT GATTCTTACA GCCCTTTGAG 780
TTTGGTGTTG TTCCCATTTA TCAGGTACAG AAAGTGAGGA ACAGAATGTT TGCGGCTAGA 840
CAGATTTGGC ACTGGTTCAG GGTCACCCAC AGTAAGCAGG GGAACTGGAA TCTGAGCCTG 900
CATCTCTCCA GCTCCAAAGC CTGGGTGCAC AGCCTCCACG CCACCCTGCT TTCTGCTTGT 960
CAGGAAGCAT AGCTGGCCCA GGCAGGTGCT GCCACTGAAA TGACCACTTT GAAACAACCC 1020
TGCAGGCAAA TCCTTGTGAA AGAATTTGAG AGAAGCCTTT CCCTGCCTGT CCTCCCTAAG 1080
CCTGGAAGGC CAATCCCTCC ATGCAAATGG GCTGGGCTCT GAGCTTCAGC CCTTTCAGGG 1140
TTAAACAGTA ACCTTTCCAC TGCTTGTGGT TGAGCAAATG CTAGCAAGGA ACAAGCCCAG 1200
CCTTGAGCAA ACAAGACACT GGGCCCTGGG CCCCCCTCCT TCCACCAGCC ACCCGGTCTG 1260
GGGACTTAGA GATTTTCTTT CGTCTTGAAG TTCCCAATCT GATTTCTTAG CTTTAGGGCA 1320
ATTGCTCTAC AAAGTTGGAT GGGAAAATAC CCAGTTATTA TGAAAAAGGA AAGAAGGTTT 1380
GACTTGAGGT TGTTTTCTTT CTCTGAGGGT GAGAATCAAA GAGCTTTTCA GAAAAGGAAC 1440
TTATGATCAG TATAGTCACC ATCTGTAAAT TTTCAAGTGG GGAAACTGAG GCCCAGCATC 1500
ATTTCTGGTT CAGGCTATCC ACAGAGCTAG TGACGCTCCT CATGATAACA CCTGACGTGT 1560
ATTCGTGCCC TACTTTGTGC CAGGTGCTCG AGGTACAGAA ACTCATTTAA TCTCCAATCA 1620
ATGTACAGAC GAGGTATGAT TAGCTGCATT TTGCATATGA GAAAACTGGG GTTCAGAGAG 1680
GTTAGGTAAC TTGTCTGGGT GAGTACTAAC CTTAGCTAGT AAGTAGGAAG GCTTGGAATC 1740
GACCCCAGCT CTTCTGGCTT CAAAGCTCCT ATACATGGTG CCAGGACATA TAATCCAGTC 1800
CTCCTATCTT CCCACCCAGT GGCTCTTTGC TGTTATAATG TCCATCATCC CTACCCTGTC 1860
TTTCCTTCTC CACCTTCTAC TTAGGCTGGA TTCAGTCCTA ATTATTTACC AAGCAACAGT 1920
GATGATGAAG CTAATAATCA TCATACATGT TTGTGTGTAG CCTAGTTCAA CCTTTAATTA 1980
CTGCTCTCTC CCCAGCACCT AGAATAGTGC CCAGCCCATT ATTGGGCTGA TAAATATTTG 2040
TTGAATAAAT GAATACATGA ATATATTCGT ATGCCTTTTG CAGACCCCTC TTCTCCCCCA 2100
ATAGGCCTTA CTCAGAACAA GAGGAGCCGT AGCTAAATTA GGGGAAGGAA TGCCAAGGGC 2160
TGAAAATCCT CTGGGTTGGC AATTGTAATC CTGTGGACAT TGGTAATACC CGAGGATGCA 2220
AAATTTCCCC AAAACAAGCA GAAAATTTTC CATGAATTGC TGCTATAAAG CTGAATTCCT 2280
CTCCCCACCC CAACATTTTA TAAAGAGCAA GTGACTTTTA CAGCCTCTGG GTATTGCCCA 2340
ATAGCGATCT GGAAACAGGC TGCTCTTCGT TTAAATGACT GAACACACGG TTGGGGATCT 2400
GTTCTGAAAG GTGGAGGGTG CCCGCTTGGG AATAGGGACA TTATAAATAC TGGACAATTG 2460
AAGACAATAT TTCTGAAGTG TAAAATGTTT GCATTGTTAT AAAATAAACC CAAACAGGCC 2520
CATGGAAGAA ATCTCTTCTC CCAAGTCCTT TACTGAAAAA ATGATCCCAC AGACTGAGAA 2580
AGCCACTTTG ACTTAGGTCA GCTTGGAAAC CCACTAAATT CTCCAGGTCT CTAACAGGAG 2640
AAAAAAAACT GGTTATAATT GTTACCAGAA AGGAAAAATT TTTTTCTTTA CCAGAAATGG 2700
GCAGTGTCTG TCAGAGAAAC CAACTGATTC CTGATATTAT CACAAAGCCA GATACTTGAA 2760
GAGCTCTATT AAAATATGAC TGAGGCCCTT TGATGACCAG CCCAGCCTGT GGCAGATACC 2820
CGCACTGAGG AAACTTGTTA CTGGGTGTGC AGGTGCGATT GCAGTCCGAG CTCCCACACA 2880
GGTGCTGGGG CTGTGCTGCC ACCAGCTTGG ATTTTCATTG TTTGAAATTG CACTTTAAAT 2940
ACTTTAAATA AAATCTCCTT GGCATTTTCA CTTTTGTAAA AAAAAAAGAA AAAAAAAAAC 3000
TGCTTGGATG CCAGCCAGCC TCGCCCTGGG AGCAGGTATT GCATTTTCCT CCCGCTTCAT 3060
TCCTGATCAG AGATTATTCA TTTATGAATG GGTGGCTGTA AAAACTTGCC TCATGCATAT 3120
GAAAATTGAA CCTGGAAATT TTTAATTGCT GTGAGTTTTG CTTTTACAAA AAACGCTTTG 3180
GCAATGGGTG GCAGGCAATG GGTGGAAGGA CAAATTCTCT TTATTTTCTT CCTAAATTTA 3240
CTCTGTGATC TGCACTTTCC AATGACATTT GTCCAAGAGG CACTGACTGA ACAGGCTGTT 3300
TGATCCCCTA 3310