Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS012-02577 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | Caco-2 |
Coordinate | chr11:16313070-16323080 |
SNPs | Number: 1 | ID | Chromosome | Position | Genome Version |
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TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
ALX3 | MA0634.1 | chr11:16314609-16314619 | TCTAATTAAA | + | 6.02 | IRF1 | MA0050.2 | chr11:16315495-16315516 | GCTTATTTTCTTTTTCTCTTT | + | 6.04 | IRF1 | MA0050.2 | chr11:16313739-16313760 | AAAGAAGAACTGAAAGTATAT | - | 6.15 | IRF1 | MA0050.2 | chr11:16320081-16320102 | GAAATAAAAAAGAAAGCAACT | - | 6.22 | IRF1 | MA0050.2 | chr11:16319520-16319541 | TTTTACTTTCTTTTTCTTTAA | + | 6.49 | Lhx3 | MA0135.1 | chr11:16321422-16321435 | TAATTAATTATTT | + | 6.71 | Lhx3 | MA0135.1 | chr11:16321419-16321432 | AAATAATTAATTA | - | 6.71 | MEOX1 | MA0661.1 | chr11:16321523-16321533 | GTTAATTAGC | - | 6.02 | Mecom | MA0029.1 | chr11:16322433-16322447 | AAGATAAGATAAGG | + | 6.87 | NEUROG2 | MA0669.1 | chr11:16314182-16314192 | AACATATGTC | + | 6.02 | Nkx3-2 | MA0122.3 | chr11:16316061-16316074 | ATTAAGTGTTTAA | - | 6.19 | PHOX2A | MA0713.1 | chr11:16317730-16317741 | TAATTCAATTA | + | 6.14 | POU4F2 | MA0683.1 | chr11:16320741-16320757 | TTAATCAAATATGCAT | - | 6.56 | Phox2b | MA0681.1 | chr11:16317730-16317741 | TAATTCAATTA | + | 6.14 | SOX10 | MA0442.2 | chr11:16313734-16313745 | AAAACAAAGAA | + | 6.62 | TBX21 | MA0690.1 | chr11:16316605-16316615 | AAGGTGTGAA | + | 6.02 | TBX2 | MA0688.1 | chr11:16316605-16316616 | AAGGTGTGAAT | + | 6.02 |
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| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr11 | 16317160 | 16317445 | chr11 | 16321195 | 16322245 |
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| Number: 4 | ID | Chromosome | Start | End |
GH11I016292 | chr11 | 16313723 | 16315993 | GH11I016294 | chr11 | 16316207 | 16317562 | GH11I016297 | chr11 | 16318911 | 16319510 | GH11I016300 | chr11 | 16321907 | 16322179 |
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Enhancer Sequence | TTCTCAATTC TAATGGCTCC AGCCTAAAGG TGCTATTTAA ACTGAGTTAT TTACCATAAT 60 ATAGGACCTA CATATGCCAC AAAGTTAAGA GGCAAAAGCA GAATTTTGTC TATAAACAAA 120 TATATATTGA TGTCATCTTC TTAGGTAGGC AGGTAAATTA ATGGCTAAAA TAATGCTATT 180 GTGAGGCATG TGCGTACACA TTTTAAATGA CTTCAAAATA TCAGCGAGGA GAATTATAAC 240 ACATATGGGA TTTTGTGTAT TTGTTGGTAT TAATGTAATA AATATGTACT GTAAATGATG 300 ATAACTTAAG TCTATTAGTC TTTTTTGCCT TTATGAAAAT GGAAGGATTA ACAATGGAGG 360 GTATGTGCAG ACTTAATATT GGGGATGTTT CTTTACCACA TGGTCTGTGA CCTTATCATC 420 CAGGCCACAT TTCTTTCTGG CATTAATGCA TTTGTTAGTC CCAGAGGCTT AAACTACAGA 480 TGTTTAACAT CCTGCTTATG GGCAGATCAT CTGGAATACA AAGTGAGAAA TCTATACTAC 540 TTATTAGTAT ATATTATGAG TGTAACAGAG ATTTAATAGC CCATTCAAAC AAGATTAGTG 600 AAACCATAGC TCAGGAAAGG AAAAGTATCA TCTTAACTCA GATATGTTAT CAAACCTGTG 660 GGGAAAAACA AAGAAGAACT GAAAGTATAT TTTCAGCTGG AATATGTTTT AGGACATCAA 720 AAGAAATTGC CACTAATTAA TGTTGTTTAT ATAATAGCAT AAGAAACATT AATTATATCC 780 TTCAATGTAA ACTTAAAACC TTTTTATGGA AAGGGGATTT ATAAGTAAGG TGGTAATCTG 840 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