EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS012-00496 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Caco-2 
Coordinate
chr1:95534250-95535780 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:95534461-95534479CCTTCAGTCCTTCCCTCC-6.55
HES2MA0616.2chr1:95534765-95534775GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:95534765-95534775GGCACGTGCC-6.02
LMX1BMA0703.2chr1:95535604-95535615TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:95535598-95535611AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:95535597-95535610AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:95535601-95535614TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr1:95535599-95535609ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:95535599-95535609ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:95535605-95535616TAATTAAATTA-6.62
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr19553456695535413
chr19553434195535469
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I095066chr19553190095536373
Enhancer Sequence
AAACTGCTTA TTTGATTACA AGTCTTCCTT TAATTGGCAT GGTTCTTTCA GGCCCTTGAT 60
ACCTTCCTAC CCTCAATAAT CTGAATGAAG GCACCATTTG CCAGGTGAAT TATCAACCTT 120
AATTTTGGTT TCTAGTCCAC CAAATGTAAC ACTATCAAGT GAATGGTTCT AACATCCATC 180
CATTTGTTCA AGTCAGAAAC CTGGAAATCA CCCTTCAGTC CTTCCCTCCC ACATCCTCTA 240
CTTTCAATCC ACAGTTGTGG ATTTAACTCC TAAAATCTTC CAATCTCATC TGAATGCGAT 300
TGCTTTTCTC CAGCCCCACA CCTATCACTC CAGTCAGACT CCAGTCTCTC AACTCTGGCC 360
ATTCCAAGTG CTATCACCTT CTTTTCACAT CCTTATCTGA AATATTCAAA AGGCTCCTAT 420
TTGTTTCTCT ACTTCGGTCT TTGTCAAGAC ATTCTTTTGA CAATGCAGGC TTGAAGTGGG 480
TGACTCTCCA CTGAAAAAGA TAAGTCATGT GCGGTGGCAC GTGCCTGTGG TACCAGCTAC 540
TCGGGAGGCT GTCTCAGAAT CGCTTGATCC CAGGATTTAG AGGCAAGCCT GGGTACATAA 600
CAAGAGTCTG TCTTAAAAAC AAAAACCAAA ACAAAACTTC AAAAGCTCCT TTTGCCACCA 660
AGACTAATAA CAGTAACCAT TTATTAAATG CTTATGTAAA AAGAAAAGAA AATGTCAAGA 720
CCTTCCAAAT TTATTATGCC AAGGGGAAAA GCTAAGCCCT GGAAACTGAC TCATGTAACA 780
TGGCTTTTTC TCTTTGGTGT ATGTCTGTTG CTTCCTGACC TTTGTGTTGA GATGTTATAC 840
ATTAACCAGA TTCCCTAGTC TTTATTCAAA CCTAGACTAA ATGACATTGG AGATAGAGGC 900
CTTTGTGATT GTTACCTCCT TATACCAGAA TGTTAAACAA ATCCCTTAGT GTGTAATCAA 960
TAGTAGTGTT GGGACTTAGA AAATAATATC CCAAAATGAA GGCCTTAGAA GCAAAAATTT 1020
TTCTCTGGCC TTCTCCTGTC CTCTGTCTCT CAGTCCCATA CTCCCCTGAG GCTTGCCATA 1080
GAAACTAGAA TCTCTCTTCC CCAGGGCGGG TCACAGAAAC CAAGAACTCC TTCTCCCAAA 1140
AGCTGGTCAT AAAACCTAAA AATACTACTC TAATTTTACT CCACCTTTCT GTGTAAAAAC 1200
TGGCCATAAA GAAATTATCC GAGCTGGGGA GCTGGGCGAG GTGGCTCACA CCTTTAATCC 1260
CAGCGCTTTG GAAGGCAGGA GAATTGCTTG AGGCCAGGAG TTCAAGACCA GTCTGGCACA 1320
CATAGCAAGA CACCATCTCT ATTTTTAAAA TTAATTAATT AAATTAAAAA AATTATCTGA 1380
TCTACCTTGT TTGACGGTAG GTCATAAGAC CCCCATTCCA GAGAGGGCCC TACCCCACAT 1440
CCAGAAGGAA AGGAATGCAT GCTCAGAGAG ACCAAGAAAA ATCTAGACAG GCCTTGCTGG 1500
GCTTCCCTAC TGTCTATTAG CATTAAATTA 1530