EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS008-00263 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
BJ 
Coordinate
chr1:159890730-159893220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6427499chr1159891917hg19
rs2789422chr1159892088hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr1:159892832-159892845AGCAGCTGTTTCT+6.28
Tcf12MA0521.1chr1:159892831-159892842CAGCAGCTGTT-6.32
YY1MA0095.2chr1:159892039-159892051CAACATGGCTGC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159887204-159896462Aorta
SE_02391chr1:159891163-159896016Astrocytes
SE_09609chr1:159888811-159896163CD14
SE_10233chr1:159889294-159896142CD19_Primary
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_11910chr1:159890466-159896330CD3
SE_12862chr1:159890202-159896191CD34_Primary_RO01480
SE_13325chr1:159887045-159896510CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159890274-159896187CD34_Primary_RO01549
SE_14513chr1:159890132-159896515CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15769chr1:159891344-159896220CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15949chr1:159891339-159896140CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16460chr1:159890826-159896099CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16913chr1:159890317-159896307CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17500chr1:159889525-159896840CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17880chr1:159889025-159896700CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19597chr1:159888663-159896506CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20057chr1:159890184-159896627CD56
SE_20849chr1:159889345-159896337CD8_Memory_7pool
SE_21561chr1:159891197-159896204CD8_Naive_7pool
SE_22506chr1:159889745-159896593CD8_primiary
SE_23567chr1:159891451-159896346Colon_Crypt_1
SE_23939chr1:159892115-159896031Colon_Crypt_2
SE_25013chr1:159890918-159896336Colon_Crypt_3
SE_30108chr1:159891067-159896091Fetal_Muscle
SE_31985chr1:159891083-159896707Gastric
SE_34858chr1:159890807-159896516HeLa
SE_36438chr1:159891272-159896570HMEC
SE_38165chr1:159890321-159896029HUVEC
SE_40207chr1:159890880-159896228K562
SE_41182chr1:159890906-159896421Left_Ventricle
SE_42315chr1:159887173-159896572Lung
SE_44957chr1:159891221-159895990NHLF
SE_47692chr1:159891560-159896059Pancreas
SE_48986chr1:159891201-159896458Right_Atrium
SE_49778chr1:159891574-159893172Right_Ventricle
SE_50509chr1:159888888-159896553Sigmoid_Colon
SE_52604chr1:159889149-159896485Small_Intestine
SE_53483chr1:159887801-159896526Spleen
SE_55434chr1:159890662-159896015Thymus
SE_58180chr1:159892507-159896090VACO_9m
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159890244-159896649NHEK
SE_65431chr1:159891110-159896368Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1159892447159892988
chr1159891200159891400
Enhancer Sequence
TGAACAGGTA AGGATTGCAC ACAAAGAATA CTAAAGTGCA CAGTTCAGAT CACATGTTGT 60
AGGAGTTAAA AGAAGCAGAC GGGCAGAAGC AGCCTGGGAA GGCTTTCTGG AAGAGGTAGG 120
CTTGAATAGG TCCTTGAGGG ATTTCAGCAA ACAAATCGAA TTTCCTATGA AAAACCAGGC 180
AATAAAAACA AATTCTACTT TCCCCTCTAG GAGCTATGAC AGGCAGAATC ATGCCCCCGC 240
AAAAGGTGTC CATGTCCTAA TTCCCAGAAC CTGTGGATAT TGTTATCTTA TATGACAAAA 300
AGGGACTTCG TAGATGTGAT TAAGATCTCG AAATGGGGAG ATTATCCTGC ATCATCTAAA 360
TGAGCCCAGT GTAATCACAA GGGCCTTACT AACTGAAAGT GGGAGATAGG TGAGTCAGAG 420
TGGGAGAAGT AACAACAACA ACAACAAAAT GGAAGTAGAA GTCAGAGTCA CACAGGGCCA 480
TGAACCAAGC AATGCAGGTG GCCTCCAGAA GCCAGAAAAG GGAAGGAAAT AGATTCACCC 540
AAAAACCCCA GAAGGAACAC AGCTCTGCCA ACACCTGTAT TTTAGCCAGT GAGACCCCTG 600
TTGAGTCTGT AGAACTGTAA GATGCTGTAT TTGTGTTGCT TTAAATCACT AAGCTTGTAG 660
CAATTTGTTA CAGCAGAAAT AGGAAACTAA TACAGGAGCC CTGGGTGATA TTTTTGGGGA 720
AACCTGGAGA AGAGAAGGCA AGACGGGGAA ATACACAGGA GGGTTTCTTT AACTTCGTTG 780
GAGGAGCTTG ATTAGCAAGA ACTGGGTGGT TTCCCGACCA ATGGCCTGAG TTGGCGGACC 840
TCACTGTGGC AGTGTGTTCC CACCACACTC ACCACCTGGG TCTGACACTC AGGGGCTGAG 900
CAAGACCCGG GCATGGTATG GATGCCAAGG GGAGCCAAGA ACCAAGAATG GGCCACAGTC 960
CCCATTTTCT GTCCCATCCC CACCCTGGTT TGGCTTTTCT CTCTTCTCCA AAACAGAGCT 1020
AGCTGTCAGG CTGCTCACGA AAGGGGACCC CCAGGACAGG CATCTGCGTT CAAGGGGAAG 1080
AAAGAGAGCC ACCCCTTCTA ACCACATCTG GCTCCAGGCC AGGTTGGCCT TCAGGGATGA 1140
AGTCACTCCA GCTCCCCCTC TCCCACACAC CCAGGTTAAA CAATCCCGTC ACCCCCTCTC 1200
AATGGACCTT GGGGCTCTGC GAAATACAAG GGGACCAGCC TGCCTCAAAC CCTCAACACC 1260
TCTCGGCCGC AGAGGCTGTG TCTTGGGCCA GTCCCTCCCG TCCCGACTCC AACATGGCTG 1320
CTCCTTTTTA CCCCAGCTTA TCAAGCTGCA CATTTCCGGC AGATCCTCCC CTAAATCAGT 1380
TATTTTTAAA CCTCATTAAG AGCAACCCGC CCCCTCCACT TCCCCCAGCC CGAAAGCTGG 1440
GCCAGATAAA TGTCAGTCTG GGCCCCGACC CACAGCGCCA GGCACACACA CCATCAGCTT 1500
GGGGAAGGCA GGCGGGGTGG GGTGGCTGAG TTCTGAGGAG AAACCAAGAG AAGCATCCCT 1560
GCCCTTCCCA GAGGCCACTC CACCATAGAA ACCTCTAACC TCTGATGCAC AGGGGAATGG 1620
CTGGAAGACA GGTAGGAAGA GGAAGGGGCT AAGAGCTACT ACCACCAGTA AGCCCCCTTT 1680
CCGCAGCCCA GTTCCAGACC TCTCTCCTGG GAGTGGCTGT GCTCAGGGCT GTTTCCAGGG 1740
ACCAAGTGGC CTGAGGCTCG GGGATCACCA TGGCACAGGT AAAGAAAGGG CAGGAGAATG 1800
ATTAACCTAG ACACTGGGGT TAAGAGCAGA GAGAAAGGCC TGAAGCCAGA CACTTCCAGT 1860
GCCCCCCAAC CCCCCAAGGC AGGACAAACT TGGCCTCCCA GACCCACCAC TGGGTGGAAA 1920
GTGGATGCTG AGGAACCCCC TCCACCGCCC AACGCTGGGG CCTGGACACA GCTGGCAGGG 1980
TCACGGCCTC CAGCTGCAGT GTATCTGCTC CACTCTGGGG CCATTGCCCT CAAGCTCTGA 2040
GGTGCCAGAG CCATAGGGCG GGGTCCTGAG AAGGGGCAGT TCCAACCAGG CCAGGCCTGG 2100
TCAGCAGCTG TTTCTCTTCC CCACCCCCAC GGGCAGGCAG AAGCTGATGG GCTGCGGCTG 2160
CTGGAGCTGG GAAGGCCCAC CCTAGGGACA CCCAGGGGAC CTGCCCCTGC CTTCCCTCAA 2220
ACATAAAGAA AACAGTAAGC AAGTTGCCTA CCAGGGTGAG AAGAGATATG CCCAGCTGGA 2280
AGACAGGTGT GGGGGACCCC CAGAGCTGGG GACCCCAAAG GAAGGTGACA GCTGAACAAC 2340
CTGGGGGATG GACTGGCAGG GAGCAACCTA AACCCTAGCG CTACTGCAGC TGTGAGAACA 2400
ACCCTCACCC TCACCCTGGA GTTACAATAG GCGGGAAACG GGGAGGGGCC ACGCAAGGCA 2460
CTCGGCCCCA CCCAGACCCT GGGCTGGAAG 2490