EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-23726 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr19:44255800-44258800 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr19:44257542-44257554TTCTGTTTACTG-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr19:44257365-44257379GGAAAATGACTCAT+6.76
KLF16MA0741.1chr19:44258732-44258743GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr19:44258733-44258743GGGGCGGGGC-6.02
SP1MA0079.4chr19:44258731-44258746CGGGGGCGGGGCCTG-6.11
SP4MA0685.1chr19:44258729-44258746GGCGGGGGCGGGGCCTG-6.26
ZfxMA0146.2chr19:44258732-44258746GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02767chr19:44256100-44260167Astrocytes
SE_09619chr19:44255368-44262466CD14
SE_10575chr19:44256833-44260060CD19_Primary
SE_11483chr19:44255253-44262275CD20
SE_13735chr19:44255931-44257680CD34_Primary_RO01536
SE_13735chr19:44257681-44261073CD34_Primary_RO01536
SE_14657chr19:44256014-44261046CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18182chr19:44255605-44260321CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18680chr19:44255276-44260362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19217chr19:44256242-44260273CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20985chr19:44256876-44261109CD8_Memory_7pool
SE_23510chr19:44257834-44261164Colon_Crypt_1
SE_23897chr19:44258182-44260089Colon_Crypt_2
SE_27247chr19:44256975-44262719Esophagus
SE_31804chr19:44257590-44260338Gastric
SE_32542chr19:44255365-44264271GM12878
SE_33868chr19:44256868-44261203HCC1954
SE_34298chr19:44255426-44256716HCT-116
SE_34298chr19:44256799-44272203HCT-116
SE_34813chr19:44256968-44262677HeLa
SE_36558chr19:44255760-44264581HMEC
SE_37675chr19:44254852-44262981HSMMtube
SE_39921chr19:44256960-44261248K562
SE_50403chr19:44256946-44260066Sigmoid_Colon
SE_53073chr19:44256976-44257621Small_Intestine
SE_53073chr19:44257665-44260035Small_Intestine
SE_53761chr19:44256508-44260208Spleen
SE_56117chr19:44257406-44262941u87
SE_59025chr19:44248893-44290143Ly3
SE_60730chr19:44257018-44289948DHL6
SE_62525chr19:44242576-44303622Tonsil
SE_64692chr19:44256932-44264220NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr194425584344256372
chr194425638044256453
Enhancer Sequence
TTGGCAGCTT CCAGAAACTT CCCTTCACAG ACTCTGGCAC ATGCCTTCTG CCCCTTCCTC 60
CCAGTGACAG GAATGTGGGT GTGGAGGTTG GAGCTCAAGC AGCTATCCTG GGCTGTAAGG 120
CAATTTAATG GAAGGTACAA TAAAACAAGA CACAAGGTTG GGGGGTTCCA CGTTAACCTT 180
GAATTGCCTA CTTCGAGAGG CAGTGAAAAA CAAATACACA TCTATCTCTT ACTTGCAGCC 240
AAAACTATTC CCAACTATTA AAATGCTCCA ACATAAATAA ACTCACAGGG GCAAGTTCAC 300
ATAAAAATAG GATATTCTCC TTACCAAAAT GCAGCAAGGC ATTTGCTTAC AAACCAGCAA 360
TGTGATCCTC AGTCCAACAG CTACTCTTGA TTAGTCATTA CTAGTGTATG TCATGGTGGG 420
GCTCCAGCCA CTTACTAGTG TATGTCATGG TGAGGTTCCA ACACTCAAGG GCCTATTTTC 480
ACCTGGTATC CCACTACATT TCAGTGTCTG TCTGTCTTCC GTTCCTGACG GTCTGCCTTC 540
CCTCACAGTG AATTTCATTT CAAGGTGTCT CCAGTGTTTA TTCTATTTGA GATGTTATAT 600
AATGTCTGGC TACCTATGCA ACCCACTCTC CACCATTTCA GTATCTGTTT ACAGGTCCTT 660
AGAGAGTTTT CCCAGCTGTT CACACATCAG TCTAGGGTGG TATTTGACTA CTTAACTGTT 720
TGTAGAACTC AGTGGGGCTA TCTGCTCAAG CTCAGAAGTC AGGTTGACAA AGTGTGGCCT 780
AGGGGCCAAA TCTGGTCTGC TTTCTGTTTT TGTAAATAGA AAGTTTTATC GGAACATGGC 840
CACATCCATC AATTTAGAAA CTGTCTGTGG CTGCCTTCTT GATGCAATGG CAGAGCTGAG 900
ACAGACAATA CAGTCTGCAG GGCCTAAAAT AATTATTCTC TGGCCTTAAC AGAAAGTTTT 960
ACTGAATGGC CGAGTATGGT GGCTCACACC TGTAATCCCG ACACTTTGGG AGGCCGAGAC 1020
AGGAGGACTG CTTCAGCCCA GGAGTTCGAG ACCAGCTTGG GCAACATAGC AAGATCCTGT 1080
CTCTATATAA CATTTAAAAA AGAAAAAAGT AGCTGGGCGT GGTGACATGC ACCTGTAGTC 1140
CCAGCTACTT GGGAGGCTGA GGTGGTGGGA TCACTTGAGC CTGGGAGGTC AAGGCTGCCA 1200
TGATCATGCT GCACCACTGC ACTCTAGCCT GGGTAACAAA GCAAGACCCT GTCTAAAAAA 1260
AAAAAAAAGC AGAACCCTGT CTCAAAAAAA CAGTTTGCTG ACCCTTGCTT AGCTTGGAAG 1320
TATCTGTTAA ATCCCTCCAT GAATCCTCCC CTGCCCCACC TCATAATGAC ATAAACAGGT 1380
CCCTCCGAGA CTCTCCAGAA TGGAAGGGTC TGTTTACAAG ATGCAGTCAT AATTTTGCTA 1440
GCCAGACAAG TGGCTTGTCT AGCTCCTCTC CTACTGTGCT ACATGACCTC TCCCAGAGCC 1500
ACAAGCCAGG CTGAAGACTG CTTTCCTAGA CAGAGGAGGA CAAGGGCCTG TTTACAGCTG 1560
CTTAGGGAAA ATGACTCATT CCATACCGAA ATGACTGCTT AGTCTGGGAT GGAGATTCTC 1620
CCCAGAATCT GAGACTCCTC CCTCACTTGC AATTAAGTGT CTTTACACAT TATTCTGAAA 1680
TCTACCCAGT GCTTAAGTAC TTGTCTTCAT GCCTCAATTG GGATACTGCC CAGCCCTGAG 1740
GTTTCTGTTT ACTGGCCTAT GAGGATGCCC TTTCCTGTGC AAAGTAAGCG CCCCTGTGTG 1800
AATGCTTTTC TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTGAGACGGT CTTGCTCTGT TGCCCAGGCT 1860
GGAGTGCAGT GGCACGATCT CAGCTGGCTG CGGCCTCTGC CTCCCGGGTT CAGGCAATTC 1920
TCCTGCCTCA GCCTCCCAAG TAGGTGGGAT TACAGGTGCA TACCACCAGG CCGGGCTAAG 1980
TTTTGCATTT TCAGTAGAGA CGGGGTTTCG CCATGTTGGC CAGGCTGGTA TCGAACTCCT 2040
GGCCTCAAGT GATTCGCCAG CCTCGGTCTC CCAAAGTGAT CGGATTCCCC GGGTAAGCCA 2100
CCGCACCTGG CCTCCCTGTG CCCTTTATTC TGGGAGCTTC CACAGTATCT GAATGTGGGG 2160
AGTTCCTTGG AACTTAAAAG CCCACCTAAA CCAGGTGTGG AGGATACAGT GAGCCGAGAT 2220
CGTGCCACTG CACTCCAGCC TGGGCGACAG AGCGAGACTC TTGTCTCAAA GAAAAAAAAA 2280
AAAAACCCCA CCCACATGCA AGCTGGGGAC TTCCAATGCT GTTTCCGGGC TCCTTTGGGG 2340
ATTACCCCCA AACTTAGGAA AGCTGGTCTA TTTAAGTGTC TGCTGATGGA CTTCTAGGGT 2400
GACTTCCCGA AAATTAACAA ATCGAATTTA CATATTTTTG GGGAGTGTCT CCTCAGTATT 2460
TAGGCATCGC TTCACACACT CCCTTCGGGG ATCTCCCAGA ACCTCACTAT TTGCAAATAT 2520
TTGGGGAGAC TCTCCCGATT CCTGAGTATG TAAGCCCACT TCGTGGGGCA CTCCCCAGCC 2580
CAGAACTGTA GTCGATTTGC ACATTTTCCT AAGGACTCCC TAGGATTTAA ACTTCTCTCT 2640
ACGGGGTTCT AGAAGGGAGC CTCCCCCGGA TTTAGGCATT GCTTTACAAA GCTTCCCTCG 2700
GGGAACCCAA CTCAAGTTTC TCGTTACACG TTATTGGGGC GGCCTCCCCA GTACTTGACG 2760
GGCAGTTTGC AGGCTGTACT TGGATCTCGC AGAGCATAAG TTTCTCATTT ACACGTTATT 2820
TCCGTCCCCC GCCCCCATTC CTGCCAACCC AGTATCGAAT TGACGGTCGC CGGCCCCCTA 2880
CTCAGTGCCG CACCCCCGCC GGACGTCCCA GCGACCTTTC AATGGCCAAG GCGGGGGCGG 2940
GGCCTGCCGG AGCGCCCCGC CCGCCGCCGG TGCGCTAGCC TCGCGCGGGC TCGCGGCCCC 3000