EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-03839 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr1:223910390-223916940 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:223910663-223910674ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:223910663-223910673ATGACCTTGA-6.02
FOSL1MA0477.1chr1:223914582-223914593GGTGACTCATC+6.32
FOSL2MA0478.1chr1:223914581-223914592GGGTGACTCAT+6.14
JUNBMA0490.1chr1:223914581-223914592GGGTGACTCAT+6.32
JUNDMA0491.1chr1:223914582-223914593GGTGACTCATC+6.62
KLF13MA0657.1chr1:223911722-223911740AGACCACGCCCCTATACG+6.08
Klf12MA0742.1chr1:223911723-223911738GACCACGCCCCTATA+6.57
MecomMA0029.1chr1:223911750-223911764TCTTATCTTGTCTC-7.06
NKX2-5MA0063.2chr1:223915940-223915950CTCAAGTGGT-6.02
SP1MA0079.4chr1:223911721-223911736CAGACCACGCCCCTA+6.23
SP4MA0685.1chr1:223911721-223911738CAGACCACGCCCCTATA+6.26
TBX20MA0689.1chr1:223912814-223912825CTTCACACCTC-6.02
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_00224chr1:223912311-223916909Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223913738-223914955Aorta
SE_02306chr1:223913344-223915961Astrocytes
SE_04026chr1:223913451-223915326Brain_Anterior_Caudate
SE_05036chr1:223913560-223915403Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05972chr1:223913207-223916372Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223913125-223915466Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09681chr1:223908083-223912580CD14
SE_09681chr1:223912826-223918041CD14
SE_19702chr1:223910355-223912486CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19702chr1:223913106-223916325CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26209chr1:223912988-223915695Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223913192-223915372Esophagus
SE_31491chr1:223911144-223912177Gastric
SE_31491chr1:223913141-223916265Gastric
SE_34545chr1:223913070-223916058HCT-116
SE_34979chr1:223912930-223916086HeLa
SE_36294chr1:223913510-223915892HMEC
SE_37129chr1:223899390-223911201HSMMtube
SE_37129chr1:223913319-223916436HSMMtube
SE_38254chr1:223913007-223915923HUVEC
SE_38957chr1:223913198-223916265IMR90
SE_41495chr1:223912854-223916323Left_Ventricle
SE_42269chr1:223910669-223912331Lung
SE_42269chr1:223912507-223916406Lung
SE_44530chr1:223913197-223916987NHDF-Ad
SE_44904chr1:223913680-223916262NHLF
SE_45872chr1:223913083-223917105Osteoblasts
SE_49408chr1:223912976-223915760Right_Atrium
SE_50365chr1:223911011-223912456Sigmoid_Colon
SE_50365chr1:223913039-223916033Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223913896-223915223Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223913106-223915207Small_Intestine
SE_55958chr1:223911472-223912472u87
SE_55958chr1:223913015-223914574u87
SE_55958chr1:223914578-223916004u87
SE_63671chr1:223913673-223915261HSMM
SE_64794chr1:223908347-223911615NHEK
SE_64794chr1:223913313-223915321NHEK
SE_65644chr1:223913370-223915937Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223911472-223912472u87
SE_67677chr1:223913015-223914574u87
SE_67677chr1:223914578-223916004u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1223914239223914747
chr1223913851223914937
chr1223913235223915200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223722chr1223910120223916233
Enhancer Sequence
AAAGCTGAGA TGATAATACA GGAAGTTCCA GATACCTCAT ACCCAGTTTC CCCTATTATT 60
AACATGTTAC ATCAGTGTGG TACACGTGTT ATAATGAATC AGCATTGATG CAGTATTATT 120
AAAGTCCATG CTTTATGCAG ATTCTCTTAG TTTTCCCCTA AGGTTCTTTC TCTATTCCGG 180
GATCCCATCC AGGACCCCAC GTTTCATTTA GTTGCCAAGT CTCCTTCGGC TCCTCTGGGC 240
TGTGACAGTC TCTCAAGTCT TTCCTTAATT TTGATGACCT TGACAGTTTT GGGGAATATT 300
GATCAGAGAT TTTGTAAGAT GCCTGTCTAT TGGAATTTGT GGTGCCTTTT TAATAAGTAT 360
GCAGTGGCTC ACACCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCT GGGGCAAGAG GATCGCTTGA 420
ACCCGAGTTT GGGACCAGCT TGGGCAACAT AGCAAAACTC TGTCTCTACA AAAAAATTAC 480
CTGGGCTTGG TGGCACATGC CTGTCGTCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAAG CAGGAGGATC 540
ACTTGAGCCC AGGAGGTAGA AGCTGCTGTG AGCCGTGCAC TCCAGCCTGG TTCTGGAGCC 600
ACTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAGAGGGAA AACTTATCTC AAAAAGTAAA TAAATAAGTA 660
CCCATGTAGT TAAAATGTTT AAAGACTAGC AAATAGATGT TGGCTGGTTT GATGGAGAAA 720
GTAAATCCAT TCTTTTTCTT AAAAATGATC TCTTCACCAC CAGTCCCAGC ACCCCCCTTA 780
CCAGCCTCCC AGGGCACTGT CCATGGCTAC ATTGTCCATG GGCCATCATG TCCCCTCGGC 840
TTCTCTTCTG GTTGTAAATG CTCTTGCACT TTTCTCCCTT GTGGCTGCCG TCCACACTCC 900
CAGCTGCCTT CCCTCTGCAC TTAAGATCTA AGATCTTAGA GACGAGATGA GACATCTCTT 960
GCCTTCGTGC ATCTAAGACA GCTCATCAAC AGGTCCAGGT GAACTGCTAA CACTGCTGTG 1020
TTGCTTGGAG GCCCCTGTCC CACCCTGGCT GCCTCAGCTT TGGCCATGGT ACCCACGGTC 1080
TCCAGCTACA TCAGATGCCT GAAGAACAAA TCTCTCCTTA GCTCTCCCTG CCCCCTCTCC 1140
AGGAATAGGA GCAGTGGGAC CCCCTTCAAG AATCCCCCAT TTCCCATATA CTTTCCTGCA 1200
AAGCCACAGG GCGTGCAAAG TGGGATTCCA GGGCTCCAGC CTGCTCCCCA TGGGCCTCTG 1260
GATCCAGGGG TGACTCTTTG CCTGTTTGGG TGCCTCTTTA GATTTTCCAC CAGCTTCCTG 1320
TGGCCAGGAG CCAGACCACG CCCCTATACG GCCATAGTTG TCTTATCTTG TCTCTGAGAT 1380
TAGAAGGTTG GAACAGATTT TCCTGATGCC CCACTACTTC TGACATTCTG TGACTTTAGA 1440
ATGTTACCTT CCTCGACAGC CCCCTGCACC CTCACACATC TGGCTTTAGC TGGACTGGTG 1500
TTTGTGAGGA ATTATATCTC CACCTTGTTC AGCACCAGTC CCCAAGAAGA CCAGCCAAGG 1560
GACACTCATC TGGGGATTTG AGAAATGAAG GACCGTGGGT TCCATGAGGT CTGTTGGGGT 1620
CCTGGCTAGC AACACTGTCT GGATGATTGA GCCCCAGGAG GAGGTGGCCT GGCCAGCAGG 1680
TGTGCAGTGA GGCCACTTCT AGACCACCCC TGTCCCATAG AGCTTCTAGT GATGATGGAA 1740
ACCGTGTATA TCTGCACTGC TCCAAACAGC AGCACTAGCC CTGTGTGGCT GTGGAGCACT 1800
TGAAATATGA CTCATGCAAC TGAGAAACTG AATTTGTAAT TTTATTTAAT TTAAATGTAA 1860
ATAGCCACAT GTTCCTTGTG GCTGCTGCAC TGCACAGCAG CAGACTGTTG CGCTCTGGAA 1920
TCCAGCCTCT CAGCCTTTAC TCTCCAAAGC GGGATAGTAT TCACATCAGA GCCAAACAAT 1980
GCACAGACGT CAATAAACAG GCAGGGCATG GTGGCCCATG CCTGTAATCC CAACACTTTG 2040
GGAGGCTGAG GTGGGAGGGT CCCTTCAGCC CAGGAGTTCA AGACCAGCCA AGCAACATAA 2100
TGAGAACCCA TTTCCACAAA AAAAAATTTT TTTAATTAGC TGGGCATGGT GGTGTGCACC 2160
TGTAGTTCCA GCTACTTGGG AGGCTGAGGT GGGAGGATCA CTTTGAGCCC AGGAGGTCAA 2220
GGCTGCAGTG AGTCGTGATT GCACCATGAC ATTCTAGCCT GGGTGATGGA GTGAGACCTT 2280
GTCTCAAAAC AAACAGCTAA ACCTACATCA ATAAACATCT GTAAATATCA GGGTAGCGAA 2340
TGAGGACTTG GTGTCTGGCA GTTAGGGACT GGCCTCTTAT TCTGCCACAT ACTGGCTCTG 2400
TCATTTTGAG TGGATCACTA TCCTCTTCAC ACCTCAGTTT CCTCATCCGT GAAATGAAGA 2460
TAATAATAGT GCCTACTATC AAGACCATCC TGGCTAACAC GGTGAAAACC CATCTCTACA 2520
AAACTACAAT ATGAAATACA AACAATTAGC CGGGCGTGGT GGCATGCACT TGTAGTCCCA 2580
GCTACTCAGG AGGCTGAGGC AGGAGAATCG CTTGAACCTG AGAGGTGGAG GTTGCAGTGA 2640
GCCATGATCG CACCACTGCA CTCCATCCTG GGCAATAGAG CGAGACTTCA TCTCAAAAAA 2700
AAAAAAATTG TGTCTACCTC AGAGGACTGT AAAGATGAAA TGAAATAATA GACATATAAA 2760
GCTCAGAGCT CCAGAGGCTG GTACATAGTA AAGGTTTAAT CCATGCAGAT TGCACGTTCT 2820
CTTTGGGGAC AGTACAGCTG GAGGGGAGTA CTGTCAAATG AGGTCGCGTC GCTGAGGTGG 2880
AGACACATTG TGGCACATCT TGAATACCCG ACTGGGTCCC AGCTTTAGCA CTTGACATTG 2940
GCGGCCACCT AAGTTTTGGA GAGGGGTATG ACAGAGGAGG TGGTGTCCCA GGGGGAAGGT 3000
CCGGAAACTC AGAGGAGTTT CCTGCTGTAA TTTTCTTTGG TCACACAATG GTCATGGCCT 3060
CCTGATGTTT CCCACAAAGG GCCAGAGGCC CTTCAGTGCC AAGGAACGTG GACTCTCTCC 3120
TATCCCAGCA CATACACGTG CTTCCAGTAC CTTGTGATCT CTAGCCATAA GTTTCCACTC 3180
ACCCATCTGC GAAATGGGAA CAATGACGAT GTTTGCGTCC TTTCTTTTTC TTTTCCTACA 3240
ATGCAGGGAA CTTTAAGACT ATGTGACAGA AAGGTGCCAC TGGAACCCAG GGCCTCGTGG 3300
GTTTCCTCCG TCTCTCGGGA GACCAGGATC CGAGTGAGAA AGTTTCCCAC GTTCATTCTT 3360
GTTGGGCCCA TTCTCAGGAT GATGTTTCTC CTGTATTTTG CTACCCCAGC CCAAGCAAGA 3420
CTAGTAGTTC AGCTTTGTGA ATCCCCTCAG GAAGTCAGGA AAATAGATAC TGTCTTTGGG 3480
CTTCCTCCAG GAGCTAAGAA AGGAGAGTTC CTGAAGAGCA GGAATTTAAG ACAGGAATTG 3540
GCAGCCGAGG GCAAGGTTCC ACCTCCTCCT CCCTTCTTCT GTGGGGTCTG TGATGAGAGC 3600
AGGGATGGGG AGGAAGAGGG TGGGTTTGCC TGCGCCTGGG GGGAGGGCAG CCATCAGGAA 3660
GGAGCAGCCA CCTCTGCTGG GGTACTGGAG ATAAAAACTC TGATATTGAC TAGTGACCGT 3720
GGGGGCGATG GCCCAGGAGG GTCAGGGCTG CAGGGAACAG GGACACAAAA ACGACAAAAC 3780
ATGCAACAGG TTATGTCCTT CTGGTCCAGG GCACGGCTGA GACAGGCAAG GGACTAGAGA 3840
GAGGAAGAGT GAATGTCAAG CCCCAGCACC CTCGCCTCCC TCCCATCCTC CCTTTTAGGG 3900
CCTCCCTTCT GGCAGATAGG GCAGGGAGAA GGGAAAGGAA AGGCCTGGGA CACGTGGTTT 3960
GGATCACTGG CTGTGGCTCA CAGTTCTGAT GTGTGTGCAG TTTAGGGAAG GAGGCTGAAG 4020
ACTTCTTGTT AATAAGGGTG GGGCATGAGT AAAATGGAGG ATCTGCCCCC TCCCCTCCCA 4080
GCCCCTGATA CAAATGAAGG ATGATTGTAC ATGCATGGGG AATTCCACTT TGGGGGTATC 4140
CTTTTCTGGG CTGCTGCCAG ACTCTGAAAT GAGTAACAAA GGGATGGCCC AGGGTGACTC 4200
ATCAGCTACC CTCTCGCAGG CCTAGCACGC TGGCGGGGTG TGCATTTCCT CTAGAGAAGC 4260
CCCTCCCTGC CAGTTTCAGA GGGATGGCCC TGAATTGGCT TTTCAGAGGT TCCTTCTCCT 4320
CCCTTCCAAA GCGAAGACCC ACAGCTGCCT GAAAATGTGG CTCTCCGCCT TCTTGGGCTG 4380
CCTAGGACCT TGAGAGATGT GTCTCTCTGG GACAGGGTGT CAGGTCTGCT GGAGATTGTT 4440
AAAATGCTGT TGTCTCAGGA AGGGTGAAAT TTAGCCAGGA GCAGTCTTCA GTAGCTTGGT 4500
CTGTTTATCG TGTATCTAGC TGTCAGCATG CAAAACAAAA GAACAAAAGG TCTAAAGAAA 4560
TATAACGCAA AACAGGTACG ATTTGAGATC CATCAGGGTT TCTCAACCTT GGCACAACTG 4620
ACTGGATAAT TGTTCATTGT AGGGGGCTGT CCTGTGAATT ATAGGATGTT TAGCTGCATC 4680
CTTGGCCTCT ACCCACACAC CCCCGTGTGC CACTCAAAAA TGTCTGCAGA CCTTGCCAAA 4740
TGTCCCCTGG GGGCTTGGCG GAGTTGGGGG GTGCATGGAA TGCCCCCAGT TGAGAACCAC 4800
TGGCAGAGCA GGAGTGAAGG GGGAGGTACT GTGGGGGTCA CTGGGCACAC AGAATGCCAT 4860
TTGGGGAGCC TGGTGCAAGG GAGTGGCCGG ATGGGAGGTA GGAATAGCAG TGGTAATCAG 4920
TAGGTGAGTT GCTGAAGACA AACTAAATAT TCTTTCCAGC ATTGCTTCAA TCTAATCCAG 4980
CCGCAAGTAT GAGTAAATAC TGTAGGAAAG GAGAAAACAT TGCATGTACG GGGTCAGGGC 5040
AGCATTGCTG GGATATTTGA GCCTGTGGGA GGGGAGCTTC AAGCTTCCCA CTAGCATTGG 5100
GAGGAACACA GCAAAGGAGG AGAAGGGCCC TCCCTGCTTC TTGGAGAATG GTTCCACTGG 5160
CAGGCCATTC CGTCTGCTCA GCTTCCTAGC TCAGGTGCCT TTCCAAACCA CACATCAGCA 5220
GGGAGACAGT GGGAACATCT CAGGTCCAGG GTACCTTGGG AACTGCAGAG CAGCTGGGTG 5280
GCCTGACACT GGCATTTCTC AGTGTTGGCT CCATTCTCTT GCTGGCACCC CCAGGTGGGA 5340
GACTCTGTTA GCAGGTGTAT CTTACTATCC CTGGCTCCCT GGTATGCGTT ACAGTTCAGA 5400
CTCCCAAGCA CAAGCTCCCT GTTTTGTCAC ACCTGTATCT AGTGTGTAAC AATCCACCCC 5460
AAAACAAATG GCTTGAAACA CAAGGCATTT TGTTCTCTCT CATGGTTCTG AAGGATGACG 5520
GGGCTGAGCT GGGCAACTCT CTCCCGCTCT CTCAAGTGGT TGCAATCAGA TGGGGATGGG 5580
GACAGAGTCA TCTGTAGGCC CCCTCAACCA CATGTCTGGT GCCCGGGCTG AAGGGTGGAT 5640
CAGCAGGGGT CCAGGGATCT CTGTCTCTTT TGTGGTCTCC CCATCACAGG GACTTGAAGG 5700
TAGCTGAACA TCTTACAGCA GCTCATGTCC CAAGAGAAAG ACCTGGGAGC TGTCTCATCT 5760
TTACGACCTA GGCTTGGAAG TCACATAGCA TCACTTCTGC CATATCCTAT TCATTGAGAT 5820
CAATGAAGGC TCACCCAGGA TCAAAGAGAA GGGACATGGA GCCCACTTCT AGATGGAGAG 5880
TGGCAGGGTT CTGGAAGAAC ATGTGAAACC AGAAACATTG TTGCCACCAT TTTTGGAAGA 5940
CACCACGATT CCTCCCCTTT GAATAATGGC CTTCTTGTCC TTTACCAGTA ATAACCCAAG 6000
CTGCTTGGAC ATTAGCTCTT CATGGTTTGC GGGGTGGGGA GGATGTGTTT TCTGGGACTT 6060
CCCAAGGTAC ACAGTAGTGA AGGACTTCAC AAGCTGGGCT GATGTGCCAG CTTCAGGACT 6120
CCACTCACCC CCAAGCGTTC TGAGATGCCC ATGGGGCTCA GGAGCCCTGA CTTGCACAAG 6180
CCAGCAACTG CCTTTCTGCT TCCATTCAGC CAGCTTTACT GGGCATCTGT TATAGGAAGA 6240
GCAGTGGGCT GAGACTTCAG CAAAAAAGAC AAAAGCAAAA CACAATCCCT TCTCTATACA 6300
AGGTTCTTCC CTTTCTGTGT CCAACCAGTC CCTCCATTCT CGGTCCTTAA CTCATCACCA 6360
AGCCGCCATT TTCTTCTATT CCCCCATTAC TCCAAGGCGG GCCTCAGTTC TCACCTGGAG 6420
TCTGGCTCAG GATGCCTACA GGTGGCCCCA GAATTGTAAT GGCTTGACAT GCAATTTTTC 6480
AGCTTTACAA TGGCATGAAA GCAATACACA TTTAGTAGAA ACTGTACTTG AAGTACCCAT 6540
ACAACCATTC 6550