EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-03380 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr1:204252380-204259660 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4548504chr1204254762hg19
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:204252632-204252650GGAGGGAGGCAAGGAAGG+7.36
Foxd3MA0041.1chr1:204259598-204259610AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:204259602-204259614AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr1:204258016-204258027TATTGTTTATA+6.32
Gata4MA0482.1chr1:204258631-204258642TCTTATCTCCT+6.14
MecomMA0029.1chr1:204258626-204258640CCTTATCTTATCTC-6.42
SCRT1MA0743.1chr1:204255242-204255257AACAACCTGTTGCTA-6.13
Sox6MA0515.1chr1:204254536-204254546CCATTGTTTT+6.02
Sox6MA0515.1chr1:204252483-204252493AAAACAATGG-6.02
ZNF143MA0088.2chr1:204253519-204253535AGGTGGATTGTGGGAA-6.06
ZNF263MA0528.1chr1:204255556-204255577AGAGGAGGAAAGGGAAAGGGA+7.28
ZNF263MA0528.1chr1:204255120-204255141GGAGGAGGACAGGGTAGAGGA+7.5
ZNF263MA0528.1chr1:204255057-204255078GGAGGAGGAGGAAAGGGAGGT+8.16
ZNF263MA0528.1chr1:204255054-204255075GGGGGAGGAGGAGGAAAGGGA+8.28
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_06666chr1:204255504-204259003Brain_Hippocampus_Middle
SE_08425chr1:204252370-204254130Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08425chr1:204254857-204257802Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_28816chr1:204254505-204259219Fetal_Intestine_Large
SE_31690chr1:204252679-204254144Gastric
SE_31690chr1:204254586-204258901Gastric
SE_37243chr1:204250800-204254742HSMMtube
SE_37243chr1:204255433-204258878HSMMtube
SE_50227chr1:204255241-204257792Sigmoid_Colon
SE_52903chr1:204252775-204253949Small_Intestine
SE_52903chr1:204254784-204257672Small_Intestine
SE_65374chr1:204252908-204254233Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204254475-204257762Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204258084-204259097Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1204257000204257857
chr1204254999204255106
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I204281chr1204251088204254008
Enhancer Sequence
CTCTCCTTCC CCATCCTCAA AAGCTACCAG TGCCTTCTTG GTTCCCAATC CAGCAATTTG 60
AGAATCAAGC TGTCTGGTAT CTTAGTTTTC TCATTTTAAC AGTAAAACAA TGGTATTGAG 120
TGATGCCTTG TTGAGCAGAC AACACAAATC TCCCACTGGA CCAGAGAGCA GAGGAAGAAA 180
GGTTATGATG CTCTGAAGGC ATGTGGAATG AAGAGAAAAA TAAAACGCAT GCAATCTCTG 240
GTCCTTACAC TGGGAGGGAG GCAAGGAAGG CCCATTTTAG AATCAGGGAA GCTGAGGTGC 300
ATTGTCCCAG CTATAGTGAC AGGAGAGGTC AGAAAAATTT GAGTCTTGGG CTCCCTTCTT 360
TCTGTTCCTG CGATGCACCC AATCTGAGCT CCCTGCCCCT AGGAAAGCAG GAGAGAGCTT 420
CATGGTTCAG GGGGAGATGC CAGCTTTTCA AGGTCTGCTC CAAGAACACA GTAATGAAAG 480
CCACAAACTC TTTCACTGGT AATATCTGTG GGCTACAGGT CTGGGGACTG TGTGTGATGT 540
GGGCTGGGGG CTACCCACAA ACTTTAGTCT GACAACAGCT GCCTGGATGT AGGGGCATGG 600
AAGGGCAGCC ACACAAACAC TGTCCACAGC CTGGCCTTTA TTGCTGTGCC CCTGCCCAGC 660
ACCTCACACA CAGGGGAACT GAATAACTGT TTGAGTTTGA TGGAGCAGCT GTAGGGCAGG 720
CCAGCAGGCT CACCACTGCC TGGAGGAGGG GGCACGTGCT GTTCCAGTTG GGATGCTGAA 780
TAGCGGCTGA AGGAGACAGG AGCTCAGCCT CAAATCCCTC TCGCCGGGAT CAGTGTGCAC 840
AGTGCATCTG CTTCATGCCC CCTCCTGTCC CTCCCCTCCC TACTGGCCAG CCAGACTCTG 900
ATAAGAGTCT ACAAAGCAGA AGCTTTGCCC TGGGAAGAGG AAAGCAGTAA ACCAGCCAGA 960
GCTGGAGAGC AGGAGCCTCC TGGCTGGAGG GTAGCACAGC AAGGGTTGAG GGGCAACAGC 1020
AGGCTCTAAT GTAGTGCTGC TCCTCACCTG CCCAGGGAGA CCCATTCTGC CTCCGGCCCC 1080
CAAGGAGGGC TCAGCTGATG TTCTCTCTCA GACTGGGAGT AATAGGGTAA GCTGGAGCCA 1140
GGTGGATTGT GGGAAATTAT GAACACCTCC TTTTGCCAGG AGCAAGGAAT CTGGAACTTC 1200
CCCTGTACTT GGGGAGCTTG CCAAGGACTC TGAGGGCAAA GCGATATCCC TGCACTGCTG 1260
CCTGCTGGTG GGGGATCCAA AGGGAGCCTA GGAACAAGGG CCACCCAAGG AACCAGCCAG 1320
AAAATGACTG TGCCTAGGAG AGCACTTGCT GCAGACTGAG ACGATCCTTT GTGAGCTCCC 1380
CTGACGCCCC CGAGAGGAAG AGGGAGATCT GGAAAGGGAC TGGAGAGTTG TGAAAAAAGC 1440
TGGCACATGA TGGCAAGGAA TGGACAGCGT GTGGATTGTC CTTAAGGAAA AGGGTAAGGC 1500
CGGTGGTCTC AGAGTCAGGA GTCTTGGTAA CTGACCACTA CTGAGTCACT GTCCCTTTCT 1560
GGGTCTCAGT TTCCCCACCT GCAACATGTA ACGATACTGG AGTTGCTGGG AGGACTAAAT 1620
ATTTAAAACC TCTAGAAGAA TGCCTGGCAC ATTGAGTTGT TTAGTAGTGG CTAATGTTAT 1680
AATCATTAAT AAAATAAGGG AATACAATAA ATAGCACTAT CCTAAATTTG CACCAAGTTG 1740
ATAGCCACTA GCCGTATTCT ATCTTGAATA ATTAAAATTA AATAAAATTA AAATTTCAGT 1800
TCCTAGTTAC ACTAGCCACA TTTCACTGTG TCTCAAGAGC CACAGTAGCT AGTGGTTACC 1860
ATACGGGACA GAATAGTCAC AGGACATTCC ATCATTGTAG AACATTCTAT TGGACAGCAC 1920
TAGGCTAGAT GTTCTCTAAG CCACCTTCCA GTTCTAATAG TTTTGAATTC TATGAAATGC 1980
AATTCTAAGC CAGTGTATCC TTCCACCAGC TGATGAGCTC AGTGTCTTCA GTAAATACAA 2040
GTTCCCTCAT AGACCTAAAC TAAGCTAAAA AGAAAGGAAA ATCTGCTGTC AACAACAAAA 2100
AGTTAAAAAT CAGAAATGAT ATACTCCAAA GTTCACTCAG AATTAATCTG GACAATCCAT 2160
TGTTTTCGTT TTTTTGGGTT TTTTGTTGTT TTTGTTGTTG TTGTTGGTTT TTTTTTGGTT 2220
GTTTTTGTTT TTGTTTTTTT TGAGACACGT TCTTGTTCTG TATCCCAGGC TGGAGTTCAG 2280
TAGTGCGATT TTGGCTCACC GCAGGCTCCG CTCCCTGAGC TCAAGCAATT CTCCCACCTC 2340
AGCCTCCCCA GTAGCTGGAA CGTCAGGCAC GGGCCACCAC GCTTGGCTAA TTTGTTGTAT 2400
TTTTAGTAGA GACACGGTCT CGCCGTGTTG GCCAGGCTCA TTATTTTTAA ATCACATGCA 2460
TTAAGACTCC TCTGCACAGT TTGAAAGTAT CATTACTAAC AGCACTGGCC TGGTAGGAAA 2520
CACTGGAAAA GGTCATCCAG CAGCTTAAGG AGGCTGGGAG AGAAGAGTTG GAGAAGGAAG 2580
AAGAGTTGGG GAGGAGGCTG GAGACACAGA GGACCTGTTC CTCCCTCCTG CTTTCCTTTT 2640
CCTTCCTGGA TTGGCCAACC TCTAGCTGAC GCTTGGGGGA GGAGGAGGAA AGGGAGGTCT 2700
TCTGTGGGGC CATTTGGTCC AGAGCAGGAG AAGCTGGCAT GGAGGAGGAC AGGGTAGAGG 2760
AAGTACCACC AAGGACAGCA GGCTTAGGAT TCTTCCTTCC CTGCACCTCC CCTTCCCCAC 2820
CCAGCACTCA TCCAGACCTG GATCCTATGG AAATCACAGG TAAACAACCT GTTGCTAAGC 2880
AGACATCACA AGAAGCAGGT GCCAGAGAGC ATCCACTGAT AACCGGGGCT TACAGAGGGG 2940
AGGGAAGACA ATCTCAGAGG AACGGAAGAG GTGCTCCTAG GCCTAGACCT AGCCTAGAGA 3000
ACCTGCTGGC TATAGCCCAG ATAAGGAAAA GAGAGGGCCT GAGAAGGAAG GCAGGGAGGC 3060
AGTCAGACAA GGGACACTGC TGTTCCCACC CCTGTCCTGC CACGCAGCAG CCGTGAAGAA 3120
AGACTGGGCA TGGAGGCTGT GACAAGGAGG AATAGAGTAC TCTGGGAGGG GAACAGAGAG 3180
GAGGAAAGGG AAAGGGATGC AGCACAGGTG CCAGCCGGGA CAGAAGCCGG CCTCCATAAG 3240
TGACACCTGA GTAACAGGTG AGCCTGCCTA CACCTGTTGG AGTATATGAG CAACTATTCT 3300
GCACCTGCAA CTTCTGGCTG GGCCAGGAAA TAAGACCAGC TGCACAATTT GCGGGCCCCT 3360
TGTGCAAAAC TTAAGGATTT CAAGACAGCA ATAGCAGAGC ATTAAACCAA GCATGTGGGG 3420
CAACTGCACA GTTTGCATCC CCCATGAAGC CCCCCTGCCC TGCCTGGAAA TAACAATCCC 3480
AGTATACTTC TCCTGGGAGT GTAGGGATGG AGGTTGGCTA GTCACATTTG TGGCTGACTC 3540
TCAATATGAG GCAGAACACA ACAAGTATCC CCGTTCCTCT CCTATACTCT ACTTCCCCTT 3600
CTTTCTTGGC CTCAAATGCC CAGAAACTTG GCTGCTTCTG CTCTCGCCCT GCTGGGTCTA 3660
GTGGCTGGCA CCTTCCCCCT ATTGTGCCTG GTTTCTGTTT GCCCATGGGC AGCCCAGCCA 3720
GAGGAAGCAC CACAGCTGAA AGCCACAAGG GGGTTGGGTT TACCTTATCG CTCGAATCTG 3780
CTTTCTAAAC TGGCACAGGG AGCACCCTGT TCCCACCTAA TAGGCTCTCC AGAGCCCCGA 3840
GTTCCTCCCT AGGTTCAACC TAGCATCACT ATGTCATCGA ATCTCTTTCC TCCCAAGAAA 3900
GAGGCAAGGG AACAAAAGGG CTCCTAGCTG GGGGCGGGAG GAGAGTAAAG TAAGCACTTC 3960
CTTTTTGGTG ACAGTCTCCC TCTTTTTTTT TTTTTTTAAA TCACGTGGGC ATTCATGAGT 4020
ACACACACAG AGAGATAGCA TCAGCTGAGA AAAGCCAGTG CGTCCACCTC CTCCTCCAAG 4080
CCAAGGAATT CTTGTCCACA CCCCCTCCAC AAAACTGTCA TTAGAAGGTG CCAGGGTCAA 4140
AGAGCACAAA TGTTTTGGAG GTTGAAGGGA TGAGGGACCT GAAGGGGAAG TTGAGGGAAT 4200
GGGGGCAACA GAAATCTAAA TGCAAAAGGT TGGTTCTCTT TCTCCCTGGA TTTCAGTTTT 4260
GTTCTCAACT GACAACCTTG TCTTCTTAAT GAGTGAAGAG TTCTCCCCGC AACTCTCTGC 4320
ACCCACCCCC GCCAGGTTCT GTCTTACCCT ACATCTCACC ACACCTGACT CTGCTAAGTA 4380
AAAGGATAAA ACCAGGAGCA CAGCCATGCC AGTCTCCTGT GGCTCTGTCC CCTCCACCTT 4440
CCTCCCGTGG CCCCATCCAG GAAATCGGCC CACAAGAGAG GCCGACGCTG CTTCTGACCA 4500
GAGCTACCGA GCGCCTCTCT GGAGACAATG GCTCAGAGAG AAGGAGGAAG ACTAGCAGCT 4560
CCAGCTTTGT GCTCAGGGTG GCCACACAAA ACCATTGTCT TGACATCAGG ACAGACAATG 4620
GTTTGTATCT CTGGCTTCTG CGCTGAGCAG TTCACTCCCT TGGACTAAGA TAATTTTAAA 4680
GATTTCCTTC TAATAAATAG TAATGATACT GGAATCTGGC CTCAAGCTGA GAATTTGTAT 4740
CTGGTTGTAA CAAAAGCCCA CTCTGGCTGA TAGAATGGGT ATATCTAGGC TTCCTTTTCT 4800
GTTCCAGAGC CACCCAGACA AACATAGACC AGACAGATAA CCACTTACTC ACCGGCTCTT 4860
CTTTGCTGTT CCCTCTGCTG CCTCTAGCCC TGACTCCTTT CACACTGAGG AGTAGGGAGA 4920
AGGTTTTCCT TTAATACTCA CCAGGTCCCT GGTGGGTAGC AATCATTAAC AGCCACACAT 4980
GCTGGCTGGC CTTAACCCCT TCAGTGCTGG GTTGCCTCAG CCAGCCGGAG CTGGCTGATG 5040
GACAGCCCTG TCCCTTCTAC TCTGCCCTGA GAAAGTAGCA ACTCCCACCT TGATGCCATC 5100
CACCTGAGTA ATGCTGCCGC CTCCCATGTG GAGAAGGAGA GCCCTCTAGT CCCACCCAGG 5160
CCGCCCCGCC TGATTGGAGC ACACTTGCAA CCTGAGGCGT TTGGCTCTGG CACGATGCCC 5220
AATTGGATGA GCCCACATTA TGAAATATTT GCCTGGCGGG CCAATAGAGG AACTGGGATC 5280
TGGGGGAGGG ATGATATTGT TATTTATTCC TGGAGGAAGG AGAGCAGACA AAGATAGTCA 5340
CAGCATCCCT AGCCCTGGGA TGGGAAGCAG TGGGAAGGTG GTCTTCAGAT CCATGGAACT 5400
GCCTCTAACT GCTCTGTCCA GGTAGAGTGA ACTAATTCTT GAAGCTTTCT AAGCAATTTG 5460
AGCCTGGCTG TTCAGCTAGA GGGTTTGTTT TTATTTTTAT TTTTTTACCT TAATGTCTCT 5520
CTGCGCCACT CAGAAGTTTG GAGAGCAGCA CTAGGAATTG TAATAGAGAT TAAGAGGAGA 5580
AACACATTGT CAGTCAAGGA ACTGCTTCAT ATCTGCATAA ACTATGCAAC CACAGTTATT 5640
GTTTATAGTT CAAAGTTGCA GAAATTATTT TAGTGTCTTT GGAGGATACA GACGGAAGGT 5700
GAGCAAGAAC AAGAAGAGAT AAATTCCCTC TTTATCCTTT AAAAATAGGC AACTGATTTG 5760
GGGGAAATCT AAAAGTATCT ACAAGCAGGA CACATGCAAA TCTATGCAGA TGTGTGCAAA 5820
TGAGCAGCGC CGGGCTTGTG AGAGTAAGTC CTTGCCAGGA TTTTCCTCAT TTGAGGAAGA 5880
AATTAGGTAG TCTCTAAACC CCATATCAGA GCATCTCACT AGAGCATAAG GAACTCAATA 5940
AGCCTATATT TATTGAGCAT TTACTCCATA TGAAACAGAG TGCCTTTAAG TACAGCCCAG 6000
TAGGATTTTT CTTTTTTACC ATGATCATAA ATGGGATATA CAGAGAATAC AAGTTCCCTC 6060
TCCCTACACA CCCACAATTA ATAGCCCCTT CTCCTTTCAG GCCCCAGAGG AGTGATTTGG 6120
CTACTCCTCC TCTTGCCAGC CCGGATTTAG TAGCTGGCAC CTCCTCCTTA TCACCCCTGG 6180
TTCCTGTTTG CCTATCAGTA GCCCAGCCAC TGTGGCTCAG GACCCTGCTT TAAACCTGCC 6240
AGGGGGCCTT ATCTTATCTC CTGGGCTGCC TTCCTAGCAG CCCGCGGGGT GGCTGGCTGG 6300
CCGGGTTCCT TAAAGGGGCT GCACTGCATT CCCACTTGCT CCATTCACCC TCAAGAGTAC 6360
CCCAGAGATC TGGAGGTGTT CTACTTGTGT AGGGTCAGAA TTTACTATAC CACCCTTCCT 6420
TCCCATCCTT TACAGTCACA GCTACTGTAG AGCTGCTACT GAAATGATCT ATGACTTAGA 6480
ACAGAAAGAT GCTCATGCTT TTAGAGCCAT TGTAAATGTT TATCATGTCA TGCAAATGCC 6540
CTGCCCCTTG ATATTTTCAG GTTCCTGCTC TTTTAAATTC AATTTTCAAA GCAAGGGAGG 6600
AGAGGCTCAG GATACAAAGT CTATATAGAA AAATCAGTTG TATTTCTATA TACTGGCAAC 6660
AAACAATGAA AAAAGGAAAT TTTAAAACAC CATTTATAAT AGCATAAAAT TAAGGGATAC 6720
TTTTGACAAG GGATGTGCAA GACCTATACA CTGAAAACTA TAAAACATTG CTGAAAGAAG 6780
TGAAATAAAA TCCAAATAAA AGGAGAAAAA TACTGTTTTC ATGGATCAGG AGACTCAATA 6840
TTGTTAAATT GTCAACTCTC CCCATATTTT TCTATGGATA CAACACAGTG CCAACCAAAA 6900
CCCTAGCAGA TCTTTGTAAA GTTGACAAGC TGATTCTAAC ATTCACATGG AAATTCAAAG 6960
GATCCAGAAT ACTCAAAAGC TTTGAAGAAG AATAGGTTTG GAGGATTTAT ACTACCTGAC 7020
TTCAAGACTT ATTATAAAGC TACAGTTATC AAGACAATGT AGTGTTGGCA TAAAGACACA 7080
TATATAGATA AATGGAACAG AGTAGAGAGT TCAGAAATAA ATCCACACAT TTTGGTCAAT 7140
TGGTTTTTGA CAAAGGTATA AAGTCAATGC AAAGGAGAAT GACAGGCTTT TCAATACATG 7200
GTGCTGTAAA ACACATGAAA ACAAACAAAC AAACAACCTT GACCCTATCA TTAAAAAATT 7260
AACTCAAAAC GGACCATAGA 7280