EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-03237 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr1:200872860-200876960 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs35730213chr1200874229hg19
rs374827chr1200874327hg19
rs55838263chr1200874728hg19
rs12132349chr1200875242hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:200875430-200875445GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
PLAG1MA0163.1chr1:200872997-200873011CCCCCTTGGGCTCC-6.39
TCF7L2MA0523.1chr1:200874195-200874209AAAGATCAAAGGCA+7.73
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23181chr1:200873416-200874006Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200874081-200874690Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200874811-200875442Colon_Crypt_1
SE_23181chr1:200875626-200878812Colon_Crypt_1
SE_24573chr1:200876333-200878783Colon_Crypt_2
SE_25202chr1:200875656-200878870Colon_Crypt_3
SE_27435chr1:200873387-200874956Esophagus
SE_27435chr1:200875065-200878791Esophagus
SE_28769chr1:200876016-200879782Fetal_Intestine_Large
SE_33981chr1:200873398-200878744HCC1954
SE_50836chr1:200873411-200875646Sigmoid_Colon
SE_50836chr1:200875691-200878781Sigmoid_Colon
SE_52641chr1:200873442-200875476Small_Intestine
SE_52641chr1:200875601-200878779Small_Intestine
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1200873042200873235
chr1200874896200875384
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH01I200904chr1200873417200874006
GH01I200905chr1200874082200874690
GH01I200906chr1200874781200875150
GH01I200907chr1200876801200876990
Enhancer Sequence
GGCGGAGGTT GCGGTGAGCC GAGATTGCAC CATTGCACTC CAGCCTGGTG ACAAGAGCGA 60
AACTCTGTCT CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGGGAAAAAA GCAAACAACC CAAAAACCGA 120
AATAAAAAAC CACCCTGCCC CCTTGGGCTC CATACAAGGG TAATTTAGTT TGGGAAAGTA 180
ACTGCTAGGT GAGAGTCATC AGCCATACTT TGCAGTGGCA GGGAGCAGTC AGGTGTTGAG 240
CTCATTTACT AGAGTGAACC GCATGAGGGC CACCCAGCAC CCACCTGTGC AATGTAATAG 300
GCACTCTGGA TGCATCTGTT GATCAACAAC ACCAGCCATT AGCCACATCC TCATAACATT 360
TTTTTTTTTT TTTTGAGACG GAGTCTTGCT CTCTCATCCA GGCTGGAGTG CAGTGGAGCC 420
ATCTCAGCTC ACTGCAACCT CCACCTACCG GGTTTAAGCG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC 480
TGAGTAGCTG GGACTGCAGA TGCGTGCTGC CACGCCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 540
GAGATGGGGT TTCACCAAAT TGTCCAAGCT AGTCTCGAAC TCCTGACCTC AAGGGATCCT 600
CCCGCCTTGG CCTCCCAAGT GGTGGGATTA CAGGCGTGAG CCACTGCGCC TGGCCGCTCA 660
TAGCATTTCT GAGATGGTGG AAGTGTTCTG TATCTGTGCT GTCCAATACA GTAGCCACTC 720
GCTGCATGTG GCTATGGAGC ATTTGAACTG TGCCTAGTGT GACTGAGGAA CTGACTTTAT 780
TTAGTTTTAA TGAAAATAGC CACATGCGGC TAGTGGCAAC TGTGTTGGAC AGCATAGCCT 840
TGGGGGAAGC TCAGCATTTG TGAGTAAAAT CTCCACCGTT ACCCCTCTGT CTGGGGTGTC 900
CTGCGATGCT GCTGCGGGGC AGGGGAACGC TGAGCTAGGG CAGGGTTGGG ACAGTTGCTG 960
AGATAGTGAG CAGCTCTCAG AAACCTGAAT CTTTTTTTTT TTTTTTCCAA TCTTTTTAGA 1020
GACAGGGTCT TGTTCTGTTG CTCAGGCTGG AGTGCAGTAG TGTGATCATA CCTCACTGCA 1080
GCCTTGAACT CCTGGGCTCA AGTGATCTTC CTTCCTCAGC CTCTAGTAGC TGGGACTACA 1140
GTCATGTGCC ACCACACCCA GCAAATTAAA ACAAAACAAA ACAAAAAAAC TATTTTAGAG 1200
ATGGGATCTT GCTATATTGC CCAGGCTGGT CTCAAACTCC TGGTCTTAAG CAAACCTCCT 1260
GCCTCAGCCT CTGGAGTAAC TAAGATTATA GGTGTGCCTG GCCCAATGAA AATCTTTATT 1320
CCTAAGGTTT TTATAAAAGA TCAAAGGCAG GAGACCAGAA TTCAGTAAGA GGGGGTCTCT 1380
TTAATTGAAC CCTAAAGCAA AGGCTACTTG TGAGCCAAGC AAAGCATGGG CTGGCTGGCT 1440
ACTCAGGAGT CAAGCCCAGC TCCTGGTACC GTATGTCCTA GAAATCTACT GCCTGCTCTG 1500
GGTAAAGATT TTTTCATTAA ATTGCGGAGC AGGCTGAGCA TGTTGGCTCA AGCTTGTAAT 1560
CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGCAGGAGG ATCTCTTGGG CCCAGGAGTA TGAGACCTGC 1620
CTGGACCACA CAGGGAGACC CTGTCTCTAC AAATAACTAA AATAAAAAAA TTGGATAGGC 1680
ATGGTTGTGG ACACCTATAG TCCCAGCTAC TCAGGAGTCT GAGGTGGGAG ATTGATTGAG 1740
CTCAGGAGGT CAAGGCTGCA GTGAGCTGTG ATCGGGCCAC TGCACTCCAG CCTAGGCAAC 1800
ATTGTAACAA CCCATCTTTA AAAAGATGGG TTAAACCTTT GTGGAGCAAA GGTTAACAAA 1860
CTTTTCCATA AAGAGCCAGA CAGTACATAT TTTAGTCTTT GTAGGCTCTT TGGTCTTTAT 1920
CACAACTGTT CAACTCTGCT ACTTCAGTGC TAAAACAGCC AGACATTACA TAAACAAATT 1980
CATAGCCGTG TTCCAATAAA CATTTATTTA CAAAAGCAGC TATTGAACTG GATTTGACCC 2040
CTGGGCCATA GTTTGCTAAC CTCTGTTGTA AGGGATTTCA AGATGGTTGG AACTTTTTAC 2100
TTTTTTTGAA ACTTCCTGGG CAATGCCCAT GCATTTGAGA TGCAAGCTCA CAGGGGAGAG 2160
CCCATAAAGG GTTGTGGTTA AGAGCAGACT CCAGTCAGAC TGTCTGGGTG TGAATTCTGA 2220
CTCAACCACC TTTGTTGAAT GTATAACCTA AACCACGTTA CTCAACTCCT CTGAGACGTG 2280
GTTTCCTCAA CTGTCACTTG CAGGTGATAA TATCTACCTT ACGTGGTTGT TATGAGAATT 2340
ACCTGAATTA ATATATATAA AGTGCTGTAT TTAGAAATGT ATTGGCACAG TAGAAACATT 2400
AGCAATTATT ACTTTTTCCT CATCTTCATT CTCAAACACA GTTGAAAATG TTTCGTGAGT 2460
TCCATCCAGG TCACTTTAGG CTTATTCTCA AGATCTGAAG GCCTGGCCGG GTGTGGTGGC 2520
TCACGCCTGT GATCCCAGCA CTTTGGGAAG CCGAGGTGGG TGGATCACCT GAGGTCAGGA 2580
GTTCAAGACC AGCCTGGCCA ACCTGGCAAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAATTA 2640
GCCAGGCATA GTGGTGTGTG CCTGTAATCC CAGCTACTCG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT 2700
CGCTTGAACC TGGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGTCGAGAT CACACCACTG CTCTCCAGCC 2760
TGGGTAAGAG AATGAGACTC CATCTCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAATCTG AAGGCTTAAG 2820
TTTCTTCAAA AGCAATAGCA CAAATGAGTT CCCTCTGATT TCTTAGGTAA AAAGTGCTGC 2880
TATACCATGA AGTAAAGTCA CACTGAATTT CCTTCAGGTG ACTTGCCAGA TCACCAACTG 2940
AAGAAACTTC CCTGGGGCCA GCTGGCCAGA CCTTATCTTA AATTCAAATT CCTACCTTGC 3000
GTTCCTCTTG TTGTTGGTAA CACAGGAGGT CTCACATTGG GATCTTTGAA TTGTGTTTGT 3060
GATGTGAGAT GATTATACAA AAGTTAGAGT GAAATTCCCT TTTTTTTATT TGAGACAGGG 3120
TCTCACTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCGG TGGTGTGATC ACGGCTCACT GCAGCCTCGA 3180
CCTCCCAGGC TCAAGTGATC TTCCCATCTC AGGTTCCCAA GTAGCTGGGA CTACAGGCAT 3240
GCACCATCAT GCCTGGCTAA TTTTCGTATT TTTTGTAGAG ACCAGATTTC ACCATCTTGC 3300
CCAGGTGGGT CTTGAACTCC TGGGCTTAAG CCATCTGCTG CCTTGGCCTC CTAAAATGCT 3360
GGGATTACAG GCATGAACCA CCGCGCCTGG CCATGAAATT CTTTTTATCC TAAGGGCCTT 3420
CCAAAATGAC CCTTTGTCTT TCCTTTCCAC TACCAAGAAG CCCTGCCAGA GGACACCCTT 3480
TTTCTTTTTT TTTGACAGGT GGGGAAACTG AGGTCTAGAG CATTGAAATG GTTTATTCAA 3540
GGTTGCATAG CTAGTATCAG AGTCAGGATT AAAATCAGGT TTCCTGTCTC CTAGCTCTGC 3600
CTTCTATTTT TTTCTACTTC CATGTAGTAA GTTTACAGCC AGGCCAGGCA CAGTGGCTCA 3660
TGCCTATAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGTGGGATG ATCACTTGAG CCTAGGAGTT 3720
CAAGATCAGC CTGGGCAAGA CAGCAAGACC TCTTCTCTAC AAAAAAAATA AAATAATTTA 3780
GCTGGGTGTG CTGGCATGCC CCTGTGGTCT CAGCTACTTG TGAGGCTGAG GTGGGAGGAT 3840
CCCTTGAGCC TGGGAGGTCA AGGCTGCAGT GAGCCATGAT CACACCACTG CACTCCAGCC 3900
TGGGCCACAG GGTAAGACCC TGTCTCTTAA AAAAAAAAAA AATCACTCCC AATGTGTATT 3960
TAGCACACAG AGGGTATTTC CTCATAACTG ATGCTGTCCT GGGGGAGTGA TCAGGCCTGA 4020
GCTGCTCAGC ACTGCTGGTT ACTCATATCT GTTTGTTCAT TTCTTCACTT CCTTCTCTTC 4080
TCTCCCCTTT GTCTTTCGCA 4100