EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-02514 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr1:156456140-156458840 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1156456600156457200
chr1156456267156456663
Enhancer Sequence
TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA CAAATAGTTG 60
GCTTTTTAAA TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA 120
GGAACTGCTG AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT 180
CCCTCTCACC ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG 240
ATGACCAATA CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC 300
CTCAGAAAAG TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT 360
TCTGTGCTTC TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA 420
TCACATCTGT CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT 480
TGAAAAGAAG AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT 540
AACCTCCAAC AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA 600
ACCCTTGCTC TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT 660
GGTATCCCAG TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT 720
AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC 780
AACTGTCGCC TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC 840
CTCATGCTGG GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA 900
GAGATTCACT GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC 960
TATCCCCACT CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC 1020
CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT 1080
GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT 1140
ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC 1200
TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA 1260
GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT 1320
CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG 1380
CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA 1440
GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT 1500
AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA 1560
CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG 1620
GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG 1680
GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG 1740
GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT 1800
GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT 1860
GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT 1920
CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA 1980
TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA 2040
ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG 2100
GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA 2160
AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT 2220
GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA 2280
CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC 2340
TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC 2400
TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC 2460
TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT 2520
CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT 2580
GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC 2640
AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC 2700