EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS003-00416 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A549 
Coordinate
chr1:16513060-16517620 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6656611chr116515805hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:16514416-16514435TGCCGCCCTCTGGTGGCTG-8.01
FOSL1MA0477.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.62
JUNDMA0491.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.02
KLF4MA0039.3chr1:16515443-16515454CCACACCCTGC+6.62
POU2F2MA0507.1chr1:16517059-16517072TTATGCAAATCAA-6.03
Pou2f3MA0627.1chr1:16517057-16517073CTTTATGCAAATCAAC+6.21
TP63MA0525.2chr1:16514924-16514942AGCATGTTGGCACATGCC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23091chr1:16513017-16513608Colon_Crypt_1
SE_23091chr1:16515057-16516232Colon_Crypt_1
SE_23751chr1:16515130-16516087Colon_Crypt_2
SE_24743chr1:16513042-16513547Colon_Crypt_3
SE_24743chr1:16515648-16516115Colon_Crypt_3
SE_26540chr1:16512848-16513779Esophagus
SE_26540chr1:16513910-16517815Esophagus
SE_28102chr1:16515172-16516184Fetal_Intestine
SE_29455chr1:16515096-16516063Fetal_Intestine_Large
SE_31527chr1:16515204-16516074Gastric
SE_34268chr1:16514127-16516193HCT-116
SE_34628chr1:16512910-16513730HeLa
SE_34628chr1:16513819-16517068HeLa
SE_36144chr1:16514154-16516161HMEC
SE_47150chr1:16512880-16515228Panc1
SE_50427chr1:16512935-16513663Sigmoid_Colon
SE_50427chr1:16514084-16516281Sigmoid_Colon
SE_52536chr1:16514970-16516287Small_Intestine
SE_56795chr1:16512885-16513659VACO_400
SE_56795chr1:16513668-16515000VACO_400
SE_64726chr1:16514111-16515805NHEK
SE_65472chr1:16516042-16517079Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr11651535416516020
chr11651402316516800
chr11651310716513257
chr11651634816517102
chr11651732916517466
chr11651414216514842
chr11651710616517195
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I016186chr11651284916513779
GH01I016189chr11651624316516615
GH01I016187chr11651384116516098
Enhancer Sequence
CTGGGATGAC AGGTGTGAGC CACTGTGCCC GGCCTGGGCA GAGCTCCTCC TGAGAGCCCG 60
TCTGAGTGGG CTCGGGTACA GCACTGGCAC ATCCTCCGTG TCTTCACTTC CAGCCTCTCA 120
AGCTGTTGTG AGAATCCTGG GGGCTGGGGA ACATGCTTAC ACTTTGAGCT GGAATCGCTG 180
CAGAGCTAGG GTCGGGGAAG TTGTGATAGT CAAGGGCTTC GGGGAGTAGG CCTAGGTCTG 240
GTGGGTCTGG TTTCAAAGAA GCTCTGCCTT TTACTTGCTG TGTGACTTCA GGCAAGTCAC 300
TTCTCCTCTC TGAGCTTCCC TTTCCTTCTT AGTAAAGTTT GGCTGAGTTG AACAGAACCT 360
GCTCCTAGCA GAGTTACAAG GATTAAAGGG CATAATTGGT GCCAATGGAG TGGTAAACAA 420
CACTCAGTGC ACAGTGGCGG TGATTTTTAT TGTCCCCTTA TTCAGTCAAG AACTTGGCAT 480
ATCCGGGGCA GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTTTG GAATGCCGAG GTGGGTAGAT 540
CACCTGAGGT CAGGAGTACG AGACCAGCCT GGCCAACATG GCAAAAACCC ATCTCTGCTA 600
AAAATACAAA AATTAGCCTG GCATGGTGGT GCATGCCTGT AATCCCAGCT ACTCAGGAGG 660
CTGAGGAAAG AGAATCGCTT GAGCCTGGGA GGCGGAAGTT GCAGTGAGCT GAGATTGTGC 720
CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGCGA GACTCTTAAA AAAAAAAAAA AAAAAAGGGA 780
GGCATGGGGG GCTAGGGAAG GGATAGCATT AGGAGAAATA CCTAATGTAA ATAGCGGGTT 840
GATGGGTGCA GCAAACCACC ATGGCACGTG TATACCTATG TAACAAACCT CCATGTTCAA 900
CACATGTATC CCAGAAATTA AAGTATAAAA AAAATTACAC CAATATAAAG AATGGATACA 960
TTATGTGAGT TACTGTGCCA TGTGATAATG AAGTTCAAAT TGTAAATACA ACCACTAACT 1020
ATTTCTGTGA TTCATATTTT TATATAAGAA AAATAAAAAG AAGAAGAAGA ACTTGACATG 1080
AAGGACTGGG ACATCATAGG ACCAAGGGGG TGGTCTCTGG AGCCTCTGAG CATGTTTCAG 1140
ACTTAGGAAC CCTCACAGCT GAGGCCAGGA CTGGCCATGT GCTCCTGTCT CCAGGGCTCT 1200
ATGCCCTCCC TTCCCTCTAC CCAGCCCACT GCCCCTGCCC CTACTCCCTA CCCCTGCCCC 1260
ACAGACACAG CCAAGCCTCA GGAGGACTCA ACCCACAGGA ATGTGGGCAA TGAGCAGGCT 1320
GCGCTCGGAG GACCCCGCTA TCCCAGCCCT GGGCTCTGCC GCCCTCTGGT GGCTGGGCTG 1380
GGAAGGATGC TGCTCCCATT ACTGCCGTTG TAGAACCGCA ATTGCCCTAA AAAAATAAAA 1440
TGCTGTTGCT GCTACTCATG ATGATGACGA TGATGGCGAT GACGATGATG ATGATATTCA 1500
TTGCTTTATG GTTTGCCAAG TACCTTCTCC GTCAATCATA GGCTGCACCA AACAGAGTGC 1560
AGGGTTCTGG ACTGAAATCA GATGGGAATG TAAGTCCCTA GTCAAGTTCC AACTGATTAT 1620
GTGACCTTGG GCAAGTCATG TCACTTCCTT GAGCCTCAGA CTCCTCATCT GTGGAACGGG 1680
GTGACAAAAA TAGGGTTGTT ATAAGGATTA AAAGACCTAA CACCTGGCCG GGCGTGGTGA 1740
CTCATGCCTG TAACACCAGC ACTTTGGGAG GCCGAGGTAG GAGGACTGCT TGAGCTCAGG 1800
AGTTTGAGAC CAGCCCGGGC AAATGGTGAA ACCCCACCTC CACTAAAAAT ACAAAAAATA 1860
GCCAAGCATG TTGGCACATG CCTGTAATTC CAGCTACTCA GGAGGCCGAG ACTTGAGAAT 1920
CGCTTGAACC CAGGAGGTGG AGATTGCAGT GAGCCTAGAT CACACCACTG CACTCCAGCC 1980
TGGGCGACAG AATGAGACTC TGTCAAAAAC AAAACAAACA ACAACAACAA CAACAAACCA 2040
TCTATTGAAC TAAATTGGCC TCCAAAATAT ACCCTTCTGG AATTTAGGTG GCTATTAAAA 2100
GACCTAACAC CTGGCACTTG GGTTGGAGAG AATAACATGG CTGTCGTTAT ATACTAATCC 2160
TTGGCCAGTC TGTCCTGGGA GATCAACTCC CCTTTGCATA GGGCTTTTTC GAAGTCCTTT 2220
TCCAAGGCAT CACCTTCTTG TAGCTGCATT ATCATGCCCG TTTACCAGAT GAGGAAACTG 2280
AGGCTCAGAG AGGGGAAGCA GCTTGCCTAG AGCATCGTGG CTTATAAGTT AAAGCAAGAC 2340
TCAAGCCAGG TCCACCTGCC TCCAAACCCG GTGCTGGACT TTCCCACACC CTGCTTTGGA 2400
AACTCTAAGG AACCTTCCAA TCCCCCAAAT CCTATTGCCT CATTTAAGTA AAGCAGGCCT 2460
GGTTTCTGCC TCCTTCAGTG CCCCTCTTCT CCTCCCACAC CCTTCCAGCA GCCGAAACGC 2520
TAGACCCAAT AGCTTACCCC TTCCTCCTTC CTGACCAGCT CCCAACCCTC AGGGCAGCTC 2580
ATGAGCCAAG AGCTTGAGAG TGGCTTCCAA AGGTCATCCT CTCCACCCCG CTGTGCCCCA 2640
CCCAAGCAGA TGACTGTTCA TCCTGTTCTT CACGCTGCTC AGGGGAAGAA ATTCCCCAGC 2700
TTCACTCCCT CCACTCGCCC AGGTGTCTGA GACAGTTCCC ACAGTTGGCA AACTCTGCCT 2760
TAAGTCCCAC CAGAGTCCCT CCTGCTACAA CGTCAGCCCA TTTATTTTAG TTCTTTCTCC 2820
CAGTAGCATC AGAAATACAA TCTGGGGGGA GACAAACGCC GGGAGAGTGG GATCCTGGGA 2880
AGGGGAAGGC ACACTTGGGG ACAGGAAGTG AGAGCAAACC CAGGTTCAAA TCCCGGTCAG 2940
GGTGACAAGA GTGGCCAAGC GAGGCCAGGC GCAGTGGTTC ACACCTGTAA TCTTAGCACT 3000
CTGGGAGGCT GAGGGGGGCA GATCACTTGA GGTCAGAAGT TCGAGACCAG CCTGACCAAC 3060
ATGGTGAAAC TCCGTGTCTA CTAAAAATAT AAAACTTAGC TGGGCGCTGT GGTGGGCGCC 3120
TGTAATCCCA GCTACTCAGG AGGCTGAGGC AGGAGAATCG CTTGAACCCA GGAGGCAGAG 3180
GTTGCAGTGA CCCAGAATGG TGCCACTGCA CTCTAGTCTG GGCGACAGAG TGAGACTTCA 3240
TCTAAAAAAA AAAAAAAAAA GAGCGGCCCA GTGGGTCTCC TGGTGTCCAG GGCAGTCTCA 3300
GCCCAGATGG GGCAGCCCCG CCCACAGCCC GAGGGCATCC AGACCCTCCA CCCCACCATA 3360
CTGGCACCAA GTAGCTCAAA TGAGGGAAGA GAGCTGGGGT GGGACTTGGA AGCAGAGCGG 3420
GTCTGAGGGG CAATTATGAG CTCGGGCTCA GGGTTCATGC AGAGCCGGGC TCAGACCCAG 3480
CAACAAATAT TCACTGAGCT GCTCCTGGGT TCCAGGCATG GCAGTTGGCA ATGAGGCCAC 3540
AGCACTGGGA AGACAGCCAG AGGCCCTTTC TTCATGGATT TCACGGTCCA GTGGGGGAGA 3600
CAACAGAAAA CAGGTCACCA CATGGATCAA CAAGGAATCC CAGAGTGGCC ACTCGGCTCT 3660
GCACTGTCCC CCTCCTGTCA CCTCCATTTC AGCTCTCAGG ATGCAGCTTC AGTGGCACCA 3720
CCTCCAGGAA GCCCACCCTG ACTGCCAGTG AGGACAGGCT GCTCCCTTAT TTGTGCCCCC 3780
ACAGCCCCAC AGTTTGCACT GTGTAAGCTT TCAGCTGAAA TTTAACTCCC ATGCAGAAAA 3840
GCACACAGAT CTTAGGCGCC CAGCCTGATG GACTGGTCCC AAAGTGCACA GCCCTGTGGA 3900
AGCAACATCA GCAGTCCCTC CCTAAGCAGT CACTACTTCA GCTGCAGGCG CTCCCCACCC 3960
TGACCTCGAT CCATCAATTA GTCTGCCTGG TTTTGTACTT TATGCAAATC AACTAATTTG 4020
TTTTGTTGTT GTTTTTTTTT TTTTTTGGCG TCTGGCTTCT CTCACGTTCA GTCTAGATTC 4080
GCCTATGCAG ACACAGACAG TACTTGTAGT TGTAGACAGT TTAGTCTCGT GACTGTGTAG 4140
TGTTCCACTG TGTGAATATA CCAGGATTTT CATTTTACTA TTGATGAGCA TTTGGGTAGT 4200
TTCTAGCATT TTGGCTATTA ATGGATAATA CTGCTAAAAA CATGCTAATT CAGGTCTTTT 4260
TGGGCACATA TGTACCCATT TCTGTTGGGT GTATACCCAA AGAAAGCAGT GGAATGTCTG 4320
GGTCATAGCA TAGGCAAGTT CAGCTTTTGC AGATGCAGCC AAGCTGTTTT CCAAAGTAGC 4380
TGTGCCAATT CACACCCCAC CAACAGTGTA GAATTCCTGC TGCCCCACAT CCTGACAACA 4440
CTCTGTGTGG GGCCCTGCAC TTCACCTGTT TACTTGTCTG TCTCACCATT AGGGAGTGTC 4500
ACCAAGGATG GGGATGCTGC TGATGTCCTT TGGTCCATAG GTGACACAAT CAGAGAGGAG 4560