EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS002-06643 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A375 
Coordinate
chr3:15674700-15676930 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11915606chr315675162hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr3:15676853-15676864AAATCACAGCT+6.14
MafbMA0117.2chr3:15676335-15676347AGTCAGCAGTTT-6.22
RUNX3MA0684.1chr3:15675010-15675020TTTGCGGTTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00674chr3:15671117-15680751Adipose_Nuclei
SE_02404chr3:15675530-15678996Astrocytes
SE_30777chr3:15674765-15679025Fetal_Muscle
SE_34855chr3:15671286-15680476HeLa
SE_37315chr3:15674556-15681131HSMMtube
SE_37991chr3:15670990-15681194HUVEC
SE_44420chr3:15674765-15679663NHDF-Ad
SE_45314chr3:15675439-15678511NHLF
SE_45947chr3:15674663-15681448Osteoblasts
SE_51797chr3:15674790-15680179Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56316chr3:15674985-15680844u87
SE_63585chr3:15674657-15680179HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr31567635015676528
chr31567477415674981
chr31567502015676294
Enhancer Sequence
TGGGCTCCCT CCTCCCCCTC CCACCCCAGT AATTTCAATC CAAGGTTGGT GGAATCCATG 60
GATGCAGAAA CAATGGATAC TGAGGGCCGG CTGACTAGAC CTATTTTTAT TGTAATTACT 120
CATTCTCTTC TACCTCATTA AGCTTGGTTC TTTCAAGCAT GAATACCTGG TTGAATCTGC 180
ATAACCTCTT ATTATCGACC TACCTTTGTT CACACACAAA TGATTGCCAC TTAGAGCTCT 240
CCTACCGGGC TCCTTTTGTA AAATAAATTT TATCTTCTCC AGATAGAAAG AAATGTGATA 300
CCTTGCGGAT TTTGCGGTTT CCTTGTTTTG CTGGATTGCA AGTCCTTTAG ACATAAACAA 360
ATGTTCTGTA CCCCGACATC GGTGGTACCC AGCTCTCAGT TGAGAAAGAG ATGTAATGTG 420
AATGCCACTC TTGGCCCCAG GCACTCCTCA CTTGCCCCCA CTGGGGACTG GTTCATACCC 480
TCCTCTCCTG GCCTCAGTTT CCATACCTCT TAGTGAGGCC TTTGCGTTAT ACTTCAGAAA 540
TATTGTCAGT ATGACTTTGA AGATGAAAGT TTGCCCCCAA AATCACTCTC TGTTATCATT 600
GTGAAACCAG AGATGGAATG GAAAAATGGG TTTCTGAGAC ATTTTAAATT ATTCCTTGCT 660
TGTCTTTAGA GGCAAAATTC AGATAAGAAA GCTTATCAAT TATACTTTTG TTTCTACTCA 720
AAAACTCATG ACTGCTCACT CAAAGACTCC TTGTTCTTAT CTTAAAACAT TGTTTACAGT 780
GTCCCAGATG AATGGCAACA AATCCTGGGG TTTGGTGTTT GGATGGTACA TTTCCCTGGG 840
GAAAGAAATA ACAGTTTGAG ATGGAACCGG GTTGGGGTGG GAGAATACTT CTCATTCTGA 900
GGAATATTTA ATTTTGCCAA GATGAGCATT TCTAGTTCTT AGTCTGTTGA CGAAAAGAGC 960
TATGGTTTGT TTCTGGAACT TTTGATAAAA AATAAAGAAA TTTGTAGCCT GGGGAGTTTG 1020
GTTTTAAAAT GCAAACACAG GAGTTATGAG TTGAGACTTG GACAGGGTGT CATTTTCTTT 1080
TTAAAGGGCA GCAATATGAT TCTTTGATTT GTCTTTGTTA TCTTGACTTT TAATCCGGAT 1140
TCCTGGGCAG TTGTTCAGCC CCAGGACATC TCCATGGGCA GGTGGCCTGG CCTTGGCACA 1200
CTACCCAGTA AATCTCTGCC TGAGAGGACG CTTTAGCTGG GAGGCCAGGC TGATTTTTAA 1260
AGGCAGAATT GGACTATTTA CTCTAAAACA GTAATGCACA CTGTTTAGAA AGAAACATTC 1320
CTATTCTGGG AGGAAGGAGG AGACACACAG AAGTATCATT TATTTCTAGT CTTTTCTGGT 1380
AGAAGCTATG AAGCTGAGTT TACTCTCTGG AAATTTGTAG TTTATTTTCT AGAAAATTGC 1440
ATTTTATCAC TGCAAAAAGG ATTTTATTTC CAAATGAGTA GGCTTTTGAG CAAGAGTTTT 1500
GGAGTCACAG AGATGGGGTT AAGAAAGTGA TAATGTGCAA TGGCGATTCT CAAGTTCAAG 1560
GAGAAAAAAT AACATGCTTT TATTGGGATA CTTTGCTTGT CTATAAAAGA AAGTAGCTAT 1620
TGGCATTTAT GTAGAAGTCA GCAGTTTCTT GGCACCAAAT AAATAATTTT GTGCTGAATA 1680
AAGGGAGAGT TATCCATAGT ATTTATTACT AACCAAAGAA ATGCAGGGAG AATTGTAATT 1740
CATTAGGTTT TGATGGCCAG GAAAGCCAAG CTGTGTTATT AGGGTCATGA CAATCACAGA 1800
CATTACGGAT GGCTGACCTG TAGTATGGAT AGAGGGCAGA GGGTAGAGTG TGAAATATAT 1860
CACAGAATTA TGTCAAATAA TCTGGATAGT TACTACTGCT TAAAATCTAA GTGCACAGCT 1920
AGAAAAGTGG GTAGTGACGC ACTACAGTCT TGCTGAACAC TGGGTAAGAA AATCATAGCA 1980
AACGTTGAGT CTGTTTTGGA AATGTTCTAA AACCAGACTA TTAACACAGT GAGCCATTTT 2040
AAATGTGGCT TGCTACGTGT TTGGAGAGAA ACACATACTC TTTTATTAGG AACATGAAAC 2100
AAACTCTTTG AGCCGCAGTA TCACTGCGAG TGAGTTTAAT TGCTGGGATT AATAAATCAC 2160
AGCTGCAAAC GTTAAATTCT TGGCAGGATT CTTTATTCAG CTGTTTTCCC CTTGCCCCAT 2220
TACATTCCAG 2230