EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS002-01523 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A375 
Coordinate
chr10:82230410-82234250 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10788639chr1082233225hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr10:82232550-82232561TATTGTTTATT+6.62
TP63MA0525.2chr10:82230982-82231000AACATGTAGAAACAAGTC+6.14
ZNF263MA0528.1chr10:82234219-82234240AGGGGAGTGAGGGGAGGGGAG+6.17
ZNF263MA0528.1chr10:82234214-82234235AGGGGAGGGGAGTGAGGGGAG+6.22
ZNF263MA0528.1chr10:82233998-82234019GGAGAATGAGAGGGAAGGAGA+6.3
Number of super-enhancer constituents: 54             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00012chr10:82211895-82238814Adipose_Nuclei
SE_03133chr10:82230494-82230892Bladder
SE_03133chr10:82233554-82234319Bladder
SE_03722chr10:82231107-82231504Brain_Angular_Gyrus
SE_04012chr10:82230555-82232069Brain_Anterior_Caudate
SE_04012chr10:82232412-82233504Brain_Anterior_Caudate
SE_05643chr10:82230303-82231484Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06016chr10:82230402-82232079Brain_Hippocampus_Middle
SE_06016chr10:82232402-82234764Brain_Hippocampus_Middle
SE_08270chr10:82230129-82233057Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09209chr10:82229932-82235735CD14
SE_12039chr10:82229990-82234392CD3
SE_14580chr10:82229955-82234989CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15608chr10:82231206-82233215CD4_Memory_Primary_8pool
SE_17018chr10:82230423-82233756CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17363chr10:82212715-82235520CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17861chr10:82212598-82235299CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18324chr10:82213958-82235661CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19180chr10:82229982-82235429CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20438chr10:82229998-82234467CD56
SE_20998chr10:82230763-82234536CD8_Memory_7pool
SE_21854chr10:82231383-82233412CD8_Naive_7pool
SE_22113chr10:82229957-82234520CD8_Naive_8pool
SE_22394chr10:82214028-82235411CD8_primiary
SE_23676chr10:82230918-82231729Colon_Crypt_1
SE_23916chr10:82230638-82231921Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82232609-82233391Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82233506-82233960Colon_Crypt_2
SE_26561chr10:82217136-82235180Esophagus
SE_31654chr10:82230322-82232049Gastric
SE_31654chr10:82232885-82234295Gastric
SE_36281chr10:82230016-82234949HMEC
SE_38806chr10:82230322-82234505HUVEC
SE_39636chr10:82232391-82234235Jurkat
SE_40835chr10:82230258-82232219Left_Ventricle
SE_40835chr10:82232399-82235288Left_Ventricle
SE_42164chr10:82230274-82232167Lung
SE_42164chr10:82232412-82235182Lung
SE_48782chr10:82230277-82232015Right_Atrium
SE_48782chr10:82232543-82234223Right_Atrium
SE_50150chr10:82230256-82234172Sigmoid_Colon
SE_52532chr10:82230419-82233435Small_Intestine
SE_53353chr10:82230912-82232251Spleen
SE_53353chr10:82232428-82235111Spleen
SE_55160chr10:82230335-82231856Thymus
SE_55160chr10:82232514-82233439Thymus
SE_55160chr10:82233455-82234326Thymus
SE_56703chr10:82231482-82234541u87
SE_57601chr10:82230467-82231528VACO_503
SE_57601chr10:82231686-82232253VACO_503
SE_57601chr10:82232614-82233409VACO_503
SE_58559chr10:82213055-82265607Ly1
SE_62319chr10:82212748-82296810Tonsil
SE_64280chr10:82229986-82235045NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr108223297682233446
chr108223119482232549
Enhancer Sequence
ACTGGAGCAG CTCCTGTAAC AGCCAGCTTT TAAAGACCCA GTTATTGGAG CAAAGTTTGT 60
TTCTCCCCAA GAATGGGCCA CTCATCACTT GGAACATCTA TGGTGTTCAG GAGTGGCTCC 120
CACCCCAATG GTGTCAGCCC TGCAAGGATG ACCATGCTGG TTTTGTCTTG GTATCATCTG 180
CAGGGCCCAG CCTGGAGCTG GGGATGCACT GAAGGCTCTG TTAATAATCT TCATTGGAGG 240
GTCAGTCTCG GGGTGAAACA GTTGCCTGCT GCCAGGTCGG GTTGCAGTGT GTCCCTCCCT 300
ATCTTTAGGC ACAGCTCTCG ATCCCAAACT GGGGAGCTTC TAGATGTGCT GCCCTCATCT 360
AGTACAAATT TAAACTAGCT GCTTTAGGGA GCATTTCCTG ACCAGCTTGC CACCACCACC 420
ACCTCCTTCT CTCTGCCCTC CAGCACCTAC TTGACTGCAC TTAGTGAAGG GAGTCATGTT 480
CTGAGTTCCC TGAGTCAGGC ACAGGTCCCA CTCTGAGTTG GTGTTTGTCT CCACGGCCTC 540
ATTCTCGGTG TCTTACATGC AGCAGTGCCC TGAACATGTA GAAACAAGTC TTTAGGTGTT 600
TGTCTCCCAC AGCAAAAGTC TTTTCACCCC ATGGGCTTGG CAGGCGAGCC TGTGCACTGA 660
TGGATTGCTG GGTGGTTTGC TTCAACCTTG CTGATCTAGG GAGGCCACAG GGCCCAGCCC 720
AGTCCTCCTG AGGTCTGGAG GCACAGCACC TTGGACTCCC TGGGTTCTTG TTCACATTGG 780
GAATACTAGT GTAGACTGGG CCCAGACTCT CCACGTTTGT TTGCAACTAG CTGAGGAAGA 840
GGCTCTGATG TGCTCTTACC AGGGGCATAT AAAAGGATTC TGTGTATAGA CATTTCATGT 900
AGACTTAGAT TTTCAGAAAC AGGCCTGTCA TGATGATCAG GGTATGGGTA TAGGACACGT 960
GCACTATGCC TGCTTTGGCC TAGCATCCTC CCTTGAGTGG GCAGCTTCAC CTTCAATGGC 1020
AGAGGGAAGT AGGTTGGGAC ATCAACTTGG AAGTCAAGGT GCCAGGCCTC CTTTTGCCTA 1080
GCCATTTGAG AAGTGGGGGT GGGGTGGGTA GCAGGTGTGG GGTGAGTGGC AGGTGTGGGT 1140
GACCAGGCCC TGCCTCACCT AGGTGGGCAG GTGTTGCCCT GAGGCTGCTG GTGCAGTTGA 1200
ATGAGCTGCC TGATGAATCA TTCTGAAAAT CTCTCATGGG TGCTGGGCGT GGTGGCTCAT 1260
GCCTGTGATC CTAGCACTTT GGGAGCCCGA GGCAGTAGGA TGGCTTAAGC AGGAGTTTGA 1320
GACCAGCCTG GGCAACATAG GGAGACCCCA TCTCCCTATG TAGCTGGGAC TGCAGGTGTG 1380
CACTGAGGTA GGAGGATCAC TTGAGCCCAG GAGGTCAAGG CTGCAGTGAG CTGTGACGGT 1440
GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GTCACAGAGT GAGGCCCTGT CTCAAAAACG TAAAAGTGAA 1500
AATCTCCAAT GGGGCCCAAG GCCTGAATGT TTTGTTTGCT TTTTTTTTGT TCCTCCAAGA 1560
AGGACCACAA ACTCTATGTT TCAGTTACTT GAAGCCAGTT ATTTTGTAGT ATCTCCCTTA 1620
ATTTAAGTTT GTTTGTTGTT TCCTCATGGT TAGCTGCAAG TTTTGCAGTT TTGTAAGGAA 1680
TACTGCGGAA ATGGTGAGTT CTAGGTGCAT CCCCTTGGGA GGCACATGAT GTGGGTCTGA 1740
GTCATTACCG GTGATATTGA CAATGATCGC TTGCTTATGG TGATGTCTGC TGGGTTTCTC 1800
CCCTCTAAGT TACTATTTTG TTCTTTGTAA GTGTCCTGTG GGGAGATACT TTGAGATTAT 1860
GCAAATACAG TATGCTATTT CACATCAAAC TCATGACTGG TTTTAGGACC CATTGCAGAT 1920
TCTTGGCACA GTCGGTTGTT TCTGTCATGG GTGTTGAATG CGATGATTTA ATTCCATAAT 1980
TCCTTCTACA TTTATCATTT AACTATACAG AACTGCTGTA GCTATGTATC ATTGTGCTAC 2040
ACATAACTTT TCCTTCTTTC CTGTTTATTT ATCTCTGTGT GTGTATTAGA ATGGGCTCAT 2100
GAATTCTTAT TTTATTCAAT GAGTTAAAAT CCGTTGTTAT TATTGTTTAT TTTGCCGCTC 2160
AGATTGTTCC AGATTTGGCC AGTGGGGGCT TTTTCAAGCT GCTGTGAATG ACAGCTCTTC 2220
AAAACATGCA TTTCCAAGTC TATCACAGTT CTGTTGAACT AGTTGCCATA TGATTCTGGA 2280
GGCAGCTCCT GAGCCGTTCT GCTGTCCTGT GGAGCATGGC GTCAGTCACA GTAGGCCCAT 2340
GGTTTTTAGT GTGCACCTTG TGAAGCCTTC CTTTCCCCCA GCCACCTGAA GATAAAAGTG 2400
TCCTGCTCTG CCTGCTTCCA TGTTGGGTTT CTGGGTCAGA GTTTCTTTGA ACAAAGCCTC 2460
CTGTAGCTTA AAAAATAATA AAAATAGTAA GCTTGGAAGT CACTGGACTA GGTGACCTCC 2520
ATTCCAGGCC CAGTGCTTCT CCCACTGAGG ACTCCCCTGA CTCAAATCCA CCCACTCTGC 2580
TGCTTTCCTG ATGACAGCAC TGAGGTAGAC AGAGGCCTCC TCTCACCAGG TTAATGAGGA 2640
GGCCCCTCGG TGTCCTGAAA CTTGGCAGGT TTTGGGTTGT GAGTTTTTGG TGGTGGAAAT 2700
TCACAGTGTT TCAGTCACTA AGATCAGGGT TTTTACAGGA TGCCAGGCAC TGAGACCCTC 2760
AGACCCTTTG GAGAGCCTGG TGGAGCTCAG AGCTGGGGCC CAGCCTCTCC TGCACCTGCA 2820
TGTGGAGGCC ATCCAGGGCT GGCGGTCAGG GGCTTGATGG CCTTGGAAGC TGGGGGCCCA 2880
CCTTCCCCAC ACTGTGCCAG GGCAGTGTTT GTCACCCTGT GATAAAGGAG GGGATCCAGC 2940
CCCCCTGACG TTGTGCAGCT GTGTAGTGAC TTCCCACAGT AAAGAGTCAA ACTTCTTCAC 3000
TCCAGTGAGC GGTTGCTGCC ACCATGATGG GTTTTTTTTT TTTTTTTAAA TTAAAGTTTT 3060
TTTTTTTCTT TTTTGTTGGA AACCACAGGT TCACATGCCA CGGTGTCTGA TTTTGCAGTG 3120
TTTCTGGTGG CCCCTGGATT TGGCGTTTGG GTTAATGAGG GAATGGGTCA GGGATGTGCA 3180
TGGACAGTTC TGGCTCTAAG GGGTGAGTCA GAGAGAGCCG AGCCCCTCCT TCCATCCTCA 3240
GAGGGTGAGA TTGCTGTGGG CAGCTGAGCA GCCTGCCCTG GCCTGCCTTA GTGATTCTCT 3300
CTCCTACTGG GGCCCATTCC CTTTCATATT CGCCTGCCCC CTCCTAGGCT TCTCTCCCTG 3360
GGCCTGCCTG TTCCTTTGGC CTGTGAATGT TCCTCAGCAC CTAGTGGGCT CTAGAGACCC 3420
CCTTCTCAGA TGGTAGGAAT GTCTAGGCCC CAGGTGCTAC TAGAGGTGCA GCAGAAACTC 3480
CGCCTTCCTT GGGGGATGTG GCTGCCCTTC CTTGGGATGG GCCTGTGATC AGGTCAGAGG 3540
CCAGTTCTGG GAGCCTCAAA GGCCAGGTGG TGTTGAAGGA TTGGCTTCGG AGAATGAGAG 3600
GGAAGGAGAG ATAGTAAGGA TAATTTGGGG GCATGGGGTG TATGTAGCTC AGGATATGGG 3660
TGGTGGGTGT TGTCATTGTC ACTTGGGTCC TTAGGAAAAA GAGGGGCCAG AGGAGGGGTG 3720
GGGTTGAAGG TAGAGAGCCA GGTAAGAGAC CTTCAGACCT TCCCTGAGAG GTCATGAGGA 3780
ACTGACCTGT GCCCTCAGGA CGGGAGGGGA GGGGAGTGAG GGGAGGGGAG GTATTGGAGC 3840