EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS002-00765 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
A375 
Coordinate
chr1:155945940-155947850 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PLAG1MA0163.1chr1:155947698-155947712GGGGACAAAGGGGG+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155947633-155947653GGGGTGGTGGTGGTGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr1:155947542-155947562ACCCCAGCCACCCGCCCACC+6.3
ZNF263MA0528.1chr1:155947307-155947328GGAGGAGGAGGAAGGGCAGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr1:155947310-155947331GGAGGAGGAAGGGCAGGGAAC+7.1
ZNF263MA0528.1chr1:155947304-155947325GGGGGAGGAGGAGGAAGGGCA+7.39
Number of super-enhancer constituents: 58             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155943468-155954747Aorta
SE_02626chr1:155944686-155950278Astrocytes
SE_03231chr1:155943838-155950206Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155943981-155947946Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155944922-155954549CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155943238-155950634CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155943527-155950426CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155943689-155952043CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155944387-155954735CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155943880-155954619Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155943540-155954349Esophagus
SE_29653chr1:155943497-155954685Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155943835-155950402Gastric
SE_34744chr1:155944639-155954826HeLa
SE_36575chr1:155944054-155950067HMEC
SE_37367chr1:155943411-155954717HSMMtube
SE_39002chr1:155943945-155954683IMR90
SE_40164chr1:155944018-155954524K562
SE_40938chr1:155943868-155954680Left_Ventricle
SE_42293chr1:155943432-155954731Lung
SE_43728chr1:155943835-155954686MM1S
SE_45406chr1:155945111-155946504NHLF
SE_45406chr1:155946520-155950447NHLF
SE_47089chr1:155944170-155950162Ovary
SE_48803chr1:155943444-155951076Right_Atrium
SE_50236chr1:155943456-155954539Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155944861-155946413Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155946616-155947212Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155943486-155954414Small_Intestine
SE_53512chr1:155943435-155954278Spleen
SE_55468chr1:155945161-155949969Thymus
SE_56150chr1:155944721-155954706u87
SE_57594chr1:155947238-155949021VACO_503
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_60754chr1:155943974-155952549DHL6
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155944167-155946550HSMM
SE_64071chr1:155946602-155947446HSMM
SE_64071chr1:155947589-155948406HSMM
SE_66797chr1:155945231-155946165Jurkat
SE_66797chr1:155946303-155950580Jurkat
SE_67350chr1:155943835-155954686MM1S
SE_69165chr1:155944816-155949957H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1155946363155946660
Enhancer Sequence
CCCCAAGGAG GTAGCAGGGG ACACCATCTT CTTCAAATAA TGTCTTTTCC AGCGGGTGCC 60
CCTCTACTTC CCACCACAGT ATAAAAAGAA AGGAGACAGC TGGTGTGCTG GGGGGAGGGG 120
GAGAGGGGAT CCAGGGTTTG TTGGCTAAGA ACCAACTCCC CCTTCTGTAA CCACAGTTTT 180
CCGGAGGTGG CCCTCCCCTT CCGACCGGCC CAAACTGACA ACCACCCTTC TCCGGTGGCC 240
TCTTTGCCCT CTCAGATCCA CCCACTCAGC CCCCGACTCC CTGCTGCCAG CCAGATTCCC 300
AAATTACCTG CCCCACACAG CCAGCCCCCA TAGTAGAAAG AAGAGCCAGT CCCCCCACCA 360
CCAAAAACAA AAACAAAAAC AGAGCATGAA CACCCAGATG TCTGACGTCC CAGCTCCCCA 420
CAATAATGGA AAAGGGATCC CAGTAGCTAC CTGCCCCCAC AGAACCGCTC TCTATACCCC 480
CTAGCCAGGT CTTCCCCCAA CCAGCTCCCC CATGGCTTTC CTTTTTAGGG TGGAACCAAA 540
TTTCTGCGGT TTCAAAAAAC CTCCCCCGCC CCCCTTGGCT CTACTCCAGG GTCTCAGCTC 600
AAACGGTTGA AAAAATAAAC AGACTTTTGG AGCTGGGGCC TGGGCTGGCG CAGGCTGTGA 660
AGAGCCTGTC TGCCACCCCA CTGTTCCACC ACACTTCAGC CACCTCACCC CGGCCCTCTG 720
TTTGTCTTAG GCCCTACTCG AATCCCCAGT TGCTTTCCAG ATAGCAAAAT CTAATCCCAA 780
CCCCCTAAGG AAAGTCCTTT TAAAGCTGCT TTCCCTGGCC CTCCACCCCC AACCCAGGAT 840
GGAACCTCTG TCTCTCCCAG TTTAGCATCA AGACAGGTAG CCTGGCTAGG AACTACCAGG 900
GAGGTGGAGG GGAGGGCTTT CCATCACCCT TAAGGACTCC TAAGGGGTAC TGCTCCCTTG 960
GCTGAAGTTG GTGATCAGCA TAGGCTGGCA CCAGGGTAGT AGGGCACTCA GGTTGGAGAG 1020
AAGCCAGAGA TTAAACCAAC TCTGGGCTGG GACCTGTCCT TTCTGATAAT GGGTACAGTG 1080
CGGGGGCCCC AAAGGAGCTG GGAGGTGCTG TCTGCAGGCA CCACCTTCCT TTCAGCTCTG 1140
ACTTATTCAC CTGCAAGTCA GCTTCATCAT TTCCTGGGGT CTGGGTGTGG AAAGGTCAGG 1200
GCACTTGGGA ATGGGGCTGG GTACAAAGGC AGGGATAAAG GGTACTTGGA GAGGAGTGGC 1260
CAAGAGGTCA TGATGGGGGA GGCGTGTGGA TAATTATACA CCCAGACTCA TGAAATGCTA 1320
GGTGAAGGGA CCCCAAGACG AGCAGATAAG AGAATGAGAG CGCTGGGGGA GGAGGAGGAA 1380
GGGCAGGGAA CACAATGCAT AGTGCCAGGT GTGTCAGCCT AAGGGTTTCA GGTTGGGAGA 1440
AGGAAGAGCT AGGAGGCTGG CGGGGCAGAT AGGGATGGAG GCCCTATGTT CCAGGCAGAA 1500
GGGCTCAGGA TGGAGGAAAG GAGCCCAGCT ACACAAAGAC CTCTGCTCCC TTCACCTAGA 1560
GGTGATGGTT TGGGGGAAGT AAGCCGTCCC TCGGCCGTCC CGACCCCAGC CACCCGCCCA 1620
CCCAGAGGGG AGAACTGAAT CACAGCTGGA AAGTCCATTT GCGAGGAGAG GAGGAGCTGA 1680
CTTTTGTCTT GGAGGGGTGG TGGTGGTGGT GGGAGGAAGC CGGGAAACCA CCCCCTCCCG 1740
TCCCCTCCGC CGGATGGCGG GGACAAAGGG GGAACGACCA AGCCAGCGAT TGGGGAGTGA 1800
TGGGGGGTCG CCACGCCAAG CCCAAGCCGG TGGGGCCCGG GGTGAGAGGA GGTGCCGGAG 1860
CTTCCACCGC CCCCACCCGC GAGACACACA CCTCCCTCTT CCCGCTCCGT 1910