EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR015-00905 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Red_blood_cell 
Coordinate
chr23:2956849-2957695 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:2957365-2957382AGTAATTAATTAATACA-6.47
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
Lhx3MA0135.1chr23:2957367-2957380TAATTAATTAATA+6.25
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr23:2957434-2957444AACAGCTGTT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:2957369-2957379ATTAATTAAT-6.02
Tcf21MA0832.1chr23:2957432-2957446GAAACAGCTGTTTA+6.03
ZNF384MA1125.1chr23:2957448-2957460AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957449-2957461AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:2957446-2957458ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr23:2957447-2957459TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr23:2957445-2957457AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
GAATACTAAT ATTATGAAAT ATGATCACAT ATTATAAACC ATAACCACAA ACTACATCCC 60
CGCCCCTTCT TCCTGTCGCC ATTACAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 120
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTT TCCACGCATC 180
AGTGCAGTAT AAGCTGCTGT AATGATAGAT AGTGACGTCG TTGAGTAACA ATGAAAGTCG 240
AGCACAAACT CACCCGCGTG CACGAGCCAG ATGCCGTCAG AAACGCGCCA TACACACATC 300
AACGCTGGAA GATAGAAACA TGAGTGTAAC ACAAAGGCCC TTCACTCTTG TTTATGTCCA 360
GTCGAGTGTG TGTCTGTGTG TGAGAGAGTG TGTGTGTGTG TGTGTTAAAC GGGGAAAGAA 420
ACTCACGCCG TACGTCACCA GCAGCTGCGT CATGTGACTG TATGCGTCAC TGGCATCCGA 480
AGCTGTGATG ATCCGCTCAT GGGGAAACTG ATAATGAGTA ATTAATTAAT ACACAAACAC 540
GCACTGTTAT GACTGAATCT CATCTCTGTG TCCAGAGCAA ACGGAAACAG CTGTTTAATA 600
AAAAAAAAAA AAGTTCATGA TAGTTGAAGT TGTAGTGATG CCACCGGGTA AGCAGGTTTG 660
TGTAATTTGT TTGTGATTTG CTGCAAGGTC AAATGAGGTA TCCCTGCTGA AAAATCCAGC 720
TTAAACCAGT CTTGGATGGT TGGCGGGTTT TAACTGGTCG ACCAGTATGG TTTTAGAGGG 780
GTTTTGGACA CTTCCAGGCT GGTTTCCAGC CTGATTTTAG CTGGTCTGGC TGGAAAGTGA 840
CCAGTT 846