EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR015-00194 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Red_blood_cell 
Coordinate
chr12:9094680-9095624 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:9095318-9095335GGATTTAATTAATTATT+6.18
DBPMA0639.1chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.18
HLFMA0043.2chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.11
KLF5MA0599.1chr12:9094996-9095006GGGGCGGGGC-6.02
LMX1BMA0703.2chr12:9095319-9095330GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:9095323-9095336TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr12:9095320-9095333ATTTAATTAATTA-6
SP1MA0079.4chr12:9094994-9095009AAGGGGCGGGGCTTA-6.51
SP2MA0516.2chr12:9094993-9095010TAAGGGGCGGGGCTTAT-7.61
SP4MA0685.1chr12:9094992-9095009TTAAGGGGCGGGGCTTA-6.57
TEFMA0843.1chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.22
Enhancer Sequence
GCGGACAGAA GCTACAGGTT AAATTTTCAG GGTGTTATTC ATAATATATC AAGCATTAAA 60
AAGTAAAACA TATTACTAAA ATAATTAAAA GAATATCATG TACATACCAC AAAGACAAAG 120
CCAGCAAAGT ATATGAGCTG TGAAGGCAGG ACACGGCATG ATTACTCTGC GTTATGGTTA 180
CATGTCTGGC GAACGACATG CCAAAAGATA AACTTGAGTT CCGCCCAAGT GGGCTGCATT 240
TCACTTTATC AGGACAAACC CAGAAAACTG AAAATATACG AAGAACGGCT TTCAGCGTGA 300
GACTGAAGTG AATTAAGGGG CGGGGCTTAT TTGCGTCATG TAGAAGCGAA ATAATAATAC 360
TCAAAATTTG ACAATTGTTA CTGTTTCATA ATACCTCCAA GTTAAAGCAC GGTTACTCAC 420
AGACATTCTA AAGATATAAA TCATTATCCA TTACGTAATA AAAAAATATT CCAGAGAAAG 480
TATGTCACGC GGCTAGTAAT ACCTTTCTCA GCGCTGAACG CGATGGACCA ATCACGTTCA 540
CTTCTGATTA CTCAATAAAG TGCGTTTGAT ATACTTTATT AGTGATTTGT TGGACGGGTG 600
TTCATTTTCG TGTTAAATTA CAGTCTTTTA AACTTATTGG ATTTAATTAA TTATTTGTTT 660
GGCGTTTTAA ACACTAAATG ATATTTAAAT GGAGCTCAAT GAAGAAATGG GTGATGTGGG 720
CCTCCCTCTG GTTGGCTCAT CGCACCGCTA CCCTTTTGTG GGACAGTCAC AGACCGCAAC 780
ACATCCCGTA ACGGCAATGA CTCATAATAT TACAGGAAAC ACTTATCATG CATTATTTCT 840
TATGGTTAAC ACTTAGTTGT AGCTTTTAAC CAGAAAACTT TTATTTTATC TTTAATTTTT 900
TCAAAACCTT CAAACGGATG TATCGTTTAT TTATGTTTTA TTAT 944